EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLBEG00000001154 (Gene tree)
Gene ID: 109985323
Gene Symbol: htatsf1
Alias: zgc:66252
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Labrus_bergylta
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9535 bases
Position: chrFKLU01000080.1:1499435-1508969
Accession: 109985323
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLBEP00000001464	RRM_1	PF00076.22	2e-16	1	2
ENSLBEP00000001464	RRM_1	PF00076.22	2e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLBET00000001569	-	5903	XM_020635621	ENSLBEP00000001464	451 (aa)	XP_020491277	UPI0009B34FEC

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLBEG00000001154	htatsf1	80	62.432	ENSG00000102241	HTATSF1	100	56.723	Homo_sapiens
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	80.828	ENSAPOG00000009823	htatsf1	100	80.744	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	77.970	ENSACIG00000020459	htatsf1	100	80.130	Amphilophus_citrinellus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	79.739	ENSAOCG00000020994	htatsf1	100	79.956	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	80.963	ENSAPEG00000016432	htatsf1	100	81.182	Amphiprion_percula
ENSLBEG00000001154	htatsf1	94	82.118	ENSATEG00000008903	htatsf1	94	82.118	Anabas_testudineus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	92	63.007	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.007	Anas_platyrhynchos
ENSLBEG00000001154	htatsf1	72	66.869	ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	59.398	Anolis_carolinensis
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	78.742	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	79.176	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	65.948	ENSAMXG00000008387	htatsf1	100	68.443	Astyanax_mexicanus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	88	60.000	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	50	61.697	Bos_taurus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	76	39.542	WBGene00022025	Y65B4A.1	76	39.542	Caenorhabditis_elegans
ENSLBEG00000001154	htatsf1	96	58.465	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	50	63.144	Canis_familiaris
ENSLBEG00000001154	htatsf1	79	62.740	ENSCCAG00000025329	-	54	63.446	Cebus_capucinus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	61.810	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	61.404	Chrysemys_picta_bellii
ENSLBEG00000001154	htatsf1	88	42.072	ENSCING00000005914	-	92	43.137	Ciona_intestinalis
ENSLBEG00000001154	htatsf1	88	42.933	ENSCSAVG00000000371	-	98	42.432	Ciona_savignyi
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	75.877	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	78.414	Cyprinodon_variegatus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	67.621	ENSDARG00000056649	htatsf1	100	67.550	Danio_rerio
ENSLBEG00000001154	htatsf1	77	46.154	FBgn0037081	barc	62	47.191	Drosophila_melanogaster
ENSLBEG00000001154	htatsf1	86	51.675	ENSEBUG00000001534	htatsf1	80	53.713	Eptatretus_burgeri
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	62.690	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	63.853	Esox_lucius
ENSLBEG00000001154	htatsf1	84	63.144	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	50	62.887	Felis_catus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	59.395	ENSFALG00000003728	HTATSF1	99	59.611	Ficedula_albicollis
ENSLBEG00000001154	htatsf1	97	58.969	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	51	62.438	Fukomys_damarensis
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	77.851	ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	77.193	Fundulus_heteroclitus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	80	76.033	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	76.033	Gadus_morhua
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	60.394	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.394	Gallus_gallus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	76.739	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	76.035	Gambusia_affinis
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	79.295	ENSGACG00000020459	htatsf1	100	78.634	Gasterosteus_aculeatus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	78.959	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	79.393	Haplochromis_burtoni
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	68.444	ENSHCOG00000009056	htatsf1	100	69.095	Hippocampus_comes
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	64.392	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	65.393	Ictalurus_punctatus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	88	62.439	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	63.753	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	78.289	ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	78.289	Kryptolebias_marmoratus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	60.398	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	59.735	Latimeria_chalumnae
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	45.203	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	45.243	Lepisosteus_oculatus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	83	63.708	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	54	63.185	Loxodonta_africana
ENSLBEG00000001154	htatsf1	96	59.685	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	55	64.781	Macaca_nemestrina
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	79.956	ENSMAMG00000021225	htatsf1	99	80.176	Mastacembelus_armatus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	78.959	ENSMZEG00005000485	htatsf1	100	79.393	Maylandia_zebra
ENSLBEG00000001154	htatsf1	94	62.125	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	98	61.343	Meleagris_gallopavo
ENSLBEG00000001154	htatsf1	80	62.803	ENSMICG00000009348	HTATSF1	50	63.239	Microcebus_murinus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	79.956	ENSMMOG00000011013	htatsf1	100	79.956	Mola_mola
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	62.031	ENSMODG00000014087	-	97	62.363	Monodelphis_domestica
ENSLBEG00000001154	htatsf1	55	61.479	ENSMODG00000000199	-	91	59.583	Monodelphis_domestica
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	78.728	ENSMALG00000019977	htatsf1	100	78.728	Monopterus_albus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	93	57.944	ENSMLUG00000009234	-	51	61.558	Myotis_lucifugus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	79	64.463	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	50	64.829	Nannospalax_galili
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	78.959	ENSNBRG00000003818	htatsf1	100	79.393	Neolamprologus_brichardi
ENSLBEG00000001154	htatsf1	86	65.743	ENSMEUG00000004133	-	92	66.751	Notamacropus_eugenii
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	79.826	ENSONIG00000008638	htatsf1	100	80.260	Oreochromis_niloticus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	91	61.962	ENSOANG00000011674	-	98	61.962	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	74.348	ENSORLG00000002356	htatsf1	100	75.000	Oryzias_latipes
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	74.026	ENSORLG00020017818	htatsf1	97	74.675	Oryzias_latipes_hni
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	73.536	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	73.536	Oryzias_latipes_hsok
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	77.342	ENSOMEG00000007564	htatsf1	100	77.342	Oryzias_melastigma
ENSLBEG00000001154	htatsf1	84	63.402	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	50	63.144	Panthera_pardus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	66.372	ENSPKIG00000024852	htatsf1	99	66.372	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLBEG00000001154	htatsf1	77	66.193	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	99	65.915	Pelodiscus_sinensis
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	73.144	ENSPMGG00000006172	htatsf1	100	73.144	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	86	65.423	ENSPCIG00000030173	-	88	65.500	Phascolarctos_cinereus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	98	57.965	ENSPCIG00000018896	-	98	57.743	Phascolarctos_cinereus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	78.242	ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	77.533	Poecilia_formosa
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	78.462	ENSPLAG00000007532	htatsf1	100	77.753	Poecilia_latipinna
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	78.022	ENSPMEG00000000352	htatsf1	100	77.313	Poecilia_mexicana
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	79.121	ENSPREG00000007811	htatsf1	100	78.414	Poecilia_reticulata
ENSLBEG00000001154	htatsf1	83	57.218	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	51	57.218	Procavia_capensis
ENSLBEG00000001154	htatsf1	80	63.342	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	50	64.010	Propithecus_coquereli
ENSLBEG00000001154	htatsf1	88	60.784	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	55	62.183	Pteropus_vampyrus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	78.742	ENSPNYG00000016693	htatsf1	100	79.176	Pundamilia_nyererei
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	67.511	ENSPNAG00000006166	htatsf1	100	67.932	Pygocentrus_nattereri
ENSLBEG00000001154	htatsf1	98	60.659	ENSSHAG00000018908	-	97	60.440	Sarcophilus_harrisii
ENSLBEG00000001154	htatsf1	85	65.206	ENSSHAG00000006440	-	97	65.206	Sarcophilus_harrisii
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	61.064	ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	62.766	Scleropages_formosus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	77.948	ENSSMAG00000002970	htatsf1	100	77.948	Scophthalmus_maximus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	77.632	ENSSDUG00000020002	htatsf1	99	78.070	Seriola_dumerili
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	80.921	ENSSLDG00000016880	htatsf1	100	80.921	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLBEG00000001154	htatsf1	93	57.710	ENSSARG00000005193	HTATSF1	52	60.870	Sorex_araneus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	60.129	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	98	60.307	Sphenodon_punctatus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	83.956	ENSSPAG00000000732	htatsf1	99	83.956	Stegastes_partitus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	79	63.562	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	54	63.708	Sus_scrofa
ENSLBEG00000001154	htatsf1	98	61.623	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	98	61.184	Taeniopygia_guttata
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	74.286	ENSTRUG00000013383	htatsf1	100	75.330	Takifugu_rubripes
ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	75.991	ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	75.991	Tetraodon_nigroviridis
ENSLBEG00000001154	htatsf1	77	63.662	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	58	63.662	Tursiops_truncatus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	84	63.144	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	62.887	Ursus_americanus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	97	60.179	ENSXETG00000019749	htatsf1	83	60.179	Xenopus_tropicalis
ENSLBEG00000001154	htatsf1	98	77.252	ENSXCOG00000006912	htatsf1	99	76.524	Xiphophorus_couchianus
ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	78.761	ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	78.049	Xiphophorus_maculatus