EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLBEG00000005875 (Gene tree)
Gene ID: 109983125
Gene Symbol: eftud2
Alias: wu:fi20f05|zgc:66214
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Labrus_bergylta
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12596 bases
Position: chrFKLU01000050.1:996107-1008702
Accession: 109983125
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLBEP00000007775	GTP_EFTU	PF00009.27	6.6e-45	1	1
ENSLBEP00000007728	GTP_EFTU	PF00009.27	8.2e-45	1	1
ENSLBEP00000007775	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.6e-12	1	1
ENSLBEP00000007728	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.6e-12	1	1
ENSLBEP00000007775	EFG_IV	PF03764.18	9.4e-25	1	1
ENSLBEP00000007728	EFG_IV	PF03764.18	1e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLBET00000008169	-	2520	-	ENSLBEP00000007775	839 (aa)	-	-
ENSLBET00000008120	-	3601	XM_020632664	ENSLBEP00000007728	932 (aa)	XP_020488320	-

Gene Model

Click here to download ENSLBEG00000005875's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLBEG00000005875's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLBEG00000005875	eftud2	68	30.263	ENSLBEG00000020327	gfm2	69	32.026
ENSLBEG00000005875	eftud2	79	36.792	ENSLBEG00000015269	efl1	64	36.792
ENSLBEG00000005875	eftud2	98	38.218	ENSLBEG00000001176	eef2b	98	38.218
ENSLBEG00000005875	eftud2	98	38.273	ENSLBEG00000016853	-	98	38.273

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSG00000108883	EFTUD2	90	100.000	Homo_sapiens
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.765	ENSAPOG00000002433	eftud2	95	98.596	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	95	91.909	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLBEG00000005875	eftud2	98	95.427	ENSACIG00000009096	eftud2	95	94.168	Amphilophus_citrinellus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	90.824	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	90.824	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.765	ENSAPEG00000003321	eftud2	95	98.488	Amphiprion_percula
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.412	ENSATEG00000000457	eftud2	95	98.056	Anabas_testudineus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	88.967	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	95	88.445	Anas_platyrhynchos
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	ENSACAG00000007637	EFTUD2	95	91.262	Anolis_carolinensis
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSANAG00000025320	EFTUD2	95	91.802	Aotus_nancymaae
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	ENSACLG00000001296	eftud2	95	98.164	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	96.118	ENSAMXG00000000568	eftud2	95	94.206	Astyanax_mexicanus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	95	91.694	Bos_taurus
ENSLBEG00000005875	eftud2	99	70.581	WBGene00001166	eftu-2	96	69.280	Caenorhabditis_elegans
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	95	91.802	Callithrix_jacchus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	95	91.909	Canis_familiaris
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	95	91.909	Canis_lupus_dingo
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	95	91.694	Capra_hircus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	95	91.802	Carlito_syrichta
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.824	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	95	91.694	Cavia_aperea
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.824	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	95	91.694	Cavia_porcellus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	95	91.802	Cebus_capucinus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSCATG00000035809	EFTUD2	95	91.802	Cercocebus_atys
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	95	91.478	Chinchilla_lanigera
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	95	91.802	Chlorocebus_sabaeus
ENSLBEG00000005875	eftud2	94	81.398	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	97	80.549	Choloepus_hoffmanni
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	95	91.802	Chrysemys_picta_bellii
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	79.484	ENSCING00000009372	-	95	77.694	Ciona_intestinalis
ENSLBEG00000005875	eftud2	99	79.671	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.469	Ciona_savignyi
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSCANG00000026557	EFTUD2	95	91.802	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSCGRG00001009904	Eftud2	95	91.370	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSCGRG00000003825	Eftud2	95	91.370	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.176	ENSCSEG00000016775	eftud2	95	97.624	Cynoglossus_semilaevis
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	ENSCVAG00000012537	eftud2	95	97.624	Cyprinodon_variegatus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	95.412	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.801	Danio_rerio
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.471	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	95	91.586	Dasypus_novemcinctus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSDORG00000011566	Eftud2	95	91.694	Dipodomys_ordii
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	76.146	FBgn0039566	CG4849	95	73.843	Drosophila_melanogaster
ENSLBEG00000005875	eftud2	91	97.842	ENSETEG00000005678	EFTUD2	87	97.842	Echinops_telfairi
ENSLBEG00000005875	eftud2	87	86.468	ENSEBUG00000004047	-	96	85.814	Eptatretus_burgeri
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSEASG00005010321	EFTUD2	95	91.909	Equus_asinus_asinus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	ENSECAG00000019363	EFTUD2	88	91.909	Equus_caballus
ENSLBEG00000005875	eftud2	91	89.831	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	87	98.630	Erinaceus_europaeus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	95.765	ENSELUG00000017169	eftud2	95	94.168	Esox_lucius
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	95	91.802	Felis_catus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	ENSFALG00000007551	EFTUD2	95	91.586	Ficedula_albicollis
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.824	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	95	91.694	Fukomys_damarensis
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.412	ENSFHEG00000013479	eftud2	95	97.732	Fundulus_heteroclitus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	95.765	ENSGMOG00000014277	eftud2	95	95.248	Gadus_morhua
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSGALG00000000988	EFTUD2	94	93.257	Gallus_gallus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	ENSGAFG00000002263	eftud2	95	97.516	Gambusia_affinis
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	96.588	ENSGACG00000009163	eftud2	95	97.300	Gasterosteus_aculeatus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	95	91.802	Gorilla_gorilla
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	ENSHBUG00000023546	eftud2	97	98.056	Haplochromis_burtoni
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	95	91.478	Heterocephalus_glaber_female
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	95	91.478	Heterocephalus_glaber_male
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	96.353	ENSHCOG00000017689	eftud2	95	96.872	Hippocampus_comes
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	95.529	ENSIPUG00000023182	Eftud2	95	94.060	Ictalurus_punctatus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	93	92.706	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSJJAG00000018268	Eftud2	93	93.371	Jaculus_jaculus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	96.588	ENSKMAG00000021027	eftud2	95	97.516	Kryptolebias_marmoratus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	93.647	ENSLACG00000012918	EFTUD2	95	92.765	Latimeria_chalumnae
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	94.941	ENSLOCG00000011460	eftud2	95	93.413	Lepisosteus_oculatus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	95	91.262	Loxodonta_africana
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	95	91.802	Macaca_fascicularis
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	90	100.000	Macaca_mulatta
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	95	91.802	Macaca_nemestrina
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	95	91.802	Mandrillus_leucophaeus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.412	ENSMAMG00000022190	eftud2	96	97.948	Mastacembelus_armatus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	ENSMZEG00005022885	eftud2	95	98.164	Maylandia_zebra
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.371	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	95	91.389	Meleagris_gallopavo
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSMAUG00000021178	Eftud2	95	91.478	Mesocricetus_auratus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSMICG00000016592	EFTUD2	95	91.802	Microcebus_murinus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSMOCG00000009039	-	95	91.478	Microtus_ochrogaster
ENSLBEG00000005875	eftud2	95	75.169	ENSMOCG00000017653	-	90	75.281	Microtus_ochrogaster
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	97.294	Mola_mola
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.824	ENSMODG00000011347	EFTUD2	95	91.802	Monodelphis_domestica
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	95.412	ENSMALG00000014501	eftud2	100	95.412	Monopterus_albus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	95	91.154	Mus_caroli
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	ENSMUSG00000020929	Eftud2	95	91.253	Mus_musculus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	95	91.154	Mus_pahari
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	95	91.154	Mus_spretus
ENSLBEG00000005875	eftud2	99	91.370	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	89	91.802	Mustela_putorius_furo
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	95	91.909	Myotis_lucifugus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSNGAG00000017834	Eftud2	95	91.586	Nannospalax_galili
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.176	ENSNBRG00000020081	eftud2	95	98.056	Neolamprologus_brichardi
ENSLBEG00000005875	eftud2	99	89.752	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	95	89.968	Nomascus_leucogenys
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	89.882	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	93	91.602	Notamacropus_eugenii
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	83.647	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	95	83.495	Ochotona_princeps
ENSLBEG00000005875	eftud2	92	75.460	ENSODEG00000003385	-	94	75.576	Octodon_degus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSODEG00000018041	-	95	90.939	Octodon_degus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	ENSONIG00000000912	eftud2	95	98.164	Oreochromis_niloticus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	95	91.694	Oryctolagus_cuniculus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	ENSORLG00000003109	eftud2	95	97.300	Oryzias_latipes
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	ENSORLG00020009865	eftud2	95	97.192	Oryzias_latipes_hni
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	ENSORLG00015002611	eftud2	95	98.282	Oryzias_latipes_hsok
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	95	90.183	Otolemur_garnettii
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSOARG00000009078	EFTUD2	93	91.694	Ovis_aries
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	95	91.802	Pan_paniscus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	95	91.909	Panthera_pardus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	95	91.909	Panthera_tigris_altaica
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	95	91.802	Pan_troglodytes
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSPANG00000021284	EFTUD2	95	91.802	Papio_anubis
ENSLBEG00000005875	eftud2	97	89.857	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.298	Pelodiscus_sinensis
ENSLBEG00000005875	eftud2	99	88.877	ENSPMGG00000007281	eftud2	97	88.398	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSPEMG00000005129	Eftud2	95	91.370	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.824	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	95	91.802	Phascolarctos_cinereus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.412	ENSPFOG00000008515	eftud2	95	97.732	Poecilia_formosa
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.412	ENSPLAG00000010393	eftud2	95	97.732	Poecilia_latipinna
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.412	ENSPMEG00000005087	eftud2	95	97.732	Poecilia_mexicana
ENSLBEG00000005875	eftud2	99	92.747	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	95	90.399	Pongo_abelii
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	89.765	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	93	91.271	Procavia_capensis
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	95	91.802	Propithecus_coquereli
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	89.176	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	95	87.271	Pteropus_vampyrus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.176	ENSPNYG00000012448	eftud2	95	98.056	Pundamilia_nyererei
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	95.882	ENSPNAG00000012490	eftud2	95	94.816	Pygocentrus_nattereri
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.588	ENSRNOG00000002818	Eftud2	95	91.361	Rattus_norvegicus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	95	91.694	Rhinopithecus_bieti
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSRROG00000042925	EFTUD2	95	91.694	Rhinopithecus_roxellana
ENSLBEG00000005875	eftud2	99	33.333	YKL173W	SNU114	89	34.088	Saccharomyces_cerevisiae
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	95	91.802	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.824	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	93	93.371	Sarcophilus_harrisii
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	95.647	ENSSFOG00015023272	eftud2	95	93.952	Scleropages_formosus
ENSLBEG00000005875	eftud2	99	97.948	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	93.176	Scophthalmus_maximus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.647	ENSSDUG00000022675	eftud2	95	98.488	Seriola_dumerili
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.765	ENSSLDG00000001595	eftud2	95	98.596	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	83.647	ENSSARG00000008664	EFTUD2	95	83.387	Sorex_araneus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.118	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	95	91.370	Sphenodon_punctatus
ENSLBEG00000005875	eftud2	99	98.704	ENSSPAG00000016235	eftud2	94	98.704	Stegastes_partitus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	95	91.694	Sus_scrofa
ENSLBEG00000005875	eftud2	87	92.916	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	92.537	Taeniopygia_guttata
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	95.765	ENSTRUG00000016422	eftud2	95	96.436	Takifugu_rubripes
ENSLBEG00000005875	eftud2	99	91.505	ENSTNIG00000005346	eftud2	95	91.398	Tetraodon_nigroviridis
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	86.588	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	95	86.192	Tupaia_belangeri
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	88.941	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	87	88.941	Tursiops_truncatus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	91.765	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	95	90.723	Ursus_americanus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	95	91.909	Ursus_maritimus
ENSLBEG00000005875	eftud2	87	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	81	82.487	Vicugna_pacos
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	95	91.909	Vulpes_vulpes
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.353	ENSXETG00000003394	eftud2	93	92.792	Xenopus_tropicalis
ENSLBEG00000005875	eftud2	93	98.342	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	98.342	Xiphophorus_couchianus
ENSLBEG00000005875	eftud2	100	97.294	ENSXMAG00000008494	eftud2	95	97.516	Xiphophorus_maculatus