EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLBEG00000006853 (Gene tree)
Gene ID: 109990025
Gene Symbol: rpp38
Alias: fc10d08|wu:fc10d08|zgc:92924
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Labrus_bergylta
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 828 bases
Position: chrFKLU01000175.1:989179-990006
Accession: 109990025
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLBEP00000008857	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	1.4e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLBET00000009333	-	828	XM_020641970	ENSLBEP00000008857	275 (aa)	XP_020497626	UPI0009B33599

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	44.322	ENSG00000152464	RPP38	93	49.057	Homo_sapiens
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	65.693	ENSAPOG00000001240	rpp38	98	65.724	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	44.815	ENSAMEG00000018832	RPP38	92	44.444	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	76.030	ENSACIG00000011592	rpp38	99	76.812	Amphilophus_citrinellus
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	64.336	ENSAOCG00000017293	rpp38	98	64.407	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	68.750	ENSAPEG00000002315	rpp38	98	68.683	Amphiprion_percula
ENSLBEG00000006853	rpp38	97	71.269	ENSATEG00000000731	rpp38	97	71.269	Anabas_testudineus
ENSLBEG00000006853	rpp38	89	39.300	ENSAPLG00000002054	RPP38	90	40.310	Anas_platyrhynchos
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	71.321	ENSACLG00000016962	rpp38	99	70.438	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	71.321	ENSACLG00000016958	rpp38	99	70.438	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000006853	rpp38	97	46.269	ENSAMXG00000025023	rpp38	96	46.350	Astyanax_mexicanus
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	42.803	ENSBTAG00000007702	RPP38	92	42.264	Bos_taurus
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	45.556	ENSCAFG00000024373	RPP38	92	45.489	Canis_familiaris
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	45.556	ENSCAFG00020008008	RPP38	92	45.489	Canis_lupus_dingo
ENSLBEG00000006853	rpp38	92	42.412	ENSCHIG00000012484	RPP38	90	41.860	Capra_hircus
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	46.209	ENSCPOG00000003981	RPP38	92	45.487	Cavia_porcellus
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	43.590	ENSCLAG00000010194	RPP38	92	43.223	Chinchilla_lanigera
ENSLBEG00000006853	rpp38	91	44.528	ENSCSAG00000019055	RPP38	92	44.689	Chlorocebus_sabaeus
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	43.956	ENSCHOG00000004335	RPP38	92	42.491	Choloepus_hoffmanni
ENSLBEG00000006853	rpp38	98	44.840	ENSCGRG00001001395	Rpp38	96	44.840	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLBEG00000006853	rpp38	98	44.840	ENSCGRG00000017441	Rpp38	96	44.840	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	60.755	ENSCSEG00000001721	rpp38	99	60.949	Cynoglossus_semilaevis
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	63.538	ENSCVAG00000001676	rpp38	98	64.336	Cyprinodon_variegatus
ENSLBEG00000006853	rpp38	92	51.172	ENSDARG00000040350	rpp38	98	51.264	Danio_rerio
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	42.857	ENSDNOG00000040314	RPP38	92	41.758	Dasypus_novemcinctus
ENSLBEG00000006853	rpp38	92	46.693	ENSDORG00000009783	Rpp38	89	46.693	Dipodomys_ordii
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	42.701	ENSETEG00000002839	RPP38	92	42.537	Echinops_telfairi
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	43.284	ENSEASG00005019783	RPP38	91	42.593	Equus_asinus_asinus
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	41.392	ENSEEUG00000014677	RPP38	92	41.544	Erinaceus_europaeus
ENSLBEG00000006853	rpp38	97	53.608	ENSELUG00000010160	rpp38	99	53.947	Esox_lucius
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	44.118	ENSFCAG00000022449	RPP38	92	44.485	Felis_catus
ENSLBEG00000006853	rpp38	89	43.511	ENSFALG00000014804	RPP38	88	43.657	Ficedula_albicollis
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	41.901	ENSFDAG00000018669	RPP38	92	41.197	Fukomys_damarensis
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	64.493	ENSFHEG00000013741	rpp38	98	64.211	Fundulus_heteroclitus
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	42.537	ENSGALG00000008794	RPP38	89	42.751	Gallus_gallus
ENSLBEG00000006853	rpp38	59	79.141	ENSGACG00000009258	rpp38	99	78.528	Gasterosteus_aculeatus
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	71.321	ENSHBUG00000010937	rpp38	99	70.803	Haplochromis_burtoni
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	44.043	ENSHGLG00000012144	RPP38	92	45.788	Heterocephalus_glaber_female
ENSLBEG00000006853	rpp38	97	45.185	ENSIPUG00000022879	rpp38	98	46.350	Ictalurus_punctatus
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	42.238	ENSSTOG00000025699	RPP38	90	44.649	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLBEG00000006853	rpp38	98	45.105	ENSJJAG00000007523	Rpp38	92	45.353	Jaculus_jaculus
ENSLBEG00000006853	rpp38	92	65.019	ENSKMAG00000003986	rpp38	92	67.286	Kryptolebias_marmoratus
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	44.056	ENSLACG00000006502	RPP38	98	43.051	Latimeria_chalumnae
ENSLBEG00000006853	rpp38	100	47.183	ENSLOCG00000018347	rpp38	97	48.239	Lepisosteus_oculatus
ENSLBEG00000006853	rpp38	98	44.599	ENSLAFG00000000509	RPP38	96	44.097	Loxodonta_africana
ENSLBEG00000006853	rpp38	91	44.906	ENSMMUG00000007679	RPP38	92	45.055	Macaca_mulatta
ENSLBEG00000006853	rpp38	99	71.956	ENSMAMG00000012774	rpp38	97	72.325	Mastacembelus_armatus
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	72.075	ENSMZEG00005003189	rpp38	99	71.533	Maylandia_zebra
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	71.321	ENSMZEG00005003200	rpp38	99	70.438	Maylandia_zebra
ENSLBEG00000006853	rpp38	90	43.774	ENSMGAG00000008217	RPP38	89	42.652	Meleagris_gallopavo
ENSLBEG00000006853	rpp38	98	42.958	ENSMAUG00000003644	Rpp38	96	42.857	Mesocricetus_auratus
ENSLBEG00000006853	rpp38	98	43.103	ENSMOCG00000007020	Rpp38	96	42.553	Microtus_ochrogaster
ENSLBEG00000006853	rpp38	99	68.727	ENSMMOG00000003446	rpp38	99	68.000	Mola_mola
ENSLBEG00000006853	rpp38	92	43.462	ENSMODG00000024091	RPP38	92	43.396	Monodelphis_domestica
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	66.909	ENSMALG00000002356	rpp38	96	66.909	Monopterus_albus
ENSLBEG00000006853	rpp38	98	45.230	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	96	45.583	Mus_caroli
ENSLBEG00000006853	rpp38	98	44.876	ENSMUSG00000049950	Rpp38	96	45.230	Mus_musculus
ENSLBEG00000006853	rpp38	98	45.230	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	96	45.936	Mus_pahari
ENSLBEG00000006853	rpp38	98	44.523	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	96	44.876	Mus_spretus
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	46.403	ENSMPUG00000018523	RPP38	93	45.985	Mustela_putorius_furo
ENSLBEG00000006853	rpp38	91	43.985	ENSMLUG00000002153	RPP38	92	44.322	Myotis_lucifugus
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	45.896	ENSNGAG00000011066	Rpp38	92	45.896	Nannospalax_galili
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	72.180	ENSNBRG00000006994	rpp38	99	72.727	Neolamprologus_brichardi
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	72.556	ENSONIG00000020467	rpp38	98	72.000	Oreochromis_niloticus
ENSLBEG00000006853	rpp38	93	42.966	ENSOCUG00000024367	-	92	44.195	Oryctolagus_cuniculus
ENSLBEG00000006853	rpp38	93	42.586	ENSOCUG00000022768	-	92	43.820	Oryctolagus_cuniculus
ENSLBEG00000006853	rpp38	97	69.030	ENSORLG00000009219	rpp38	97	69.343	Oryzias_latipes
ENSLBEG00000006853	rpp38	97	67.658	ENSORLG00020011503	rpp38	94	68.727	Oryzias_latipes_hni
ENSLBEG00000006853	rpp38	97	67.286	ENSORLG00015017702	rpp38	94	69.091	Oryzias_latipes_hsok
ENSLBEG00000006853	rpp38	91	68.235	ENSOMEG00000005414	rpp38	94	69.030	Oryzias_melastigma
ENSLBEG00000006853	rpp38	98	42.955	ENSOGAG00000008059	RPP38	92	43.728	Otolemur_garnettii
ENSLBEG00000006853	rpp38	92	41.538	ENSOARG00000004534	RPP38	90	42.248	Ovis_aries
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	45.055	ENSPPAG00000041577	RPP38	84	44.322	Pan_paniscus
ENSLBEG00000006853	rpp38	95	44.485	ENSPPRG00000015329	RPP38	92	44.485	Panthera_pardus
ENSLBEG00000006853	rpp38	95	44.000	ENSPTIG00000007188	RPP38	92	44.485	Panthera_tigris_altaica
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	45.055	ENSPTRG00000002318	RPP38	84	44.322	Pan_troglodytes
ENSLBEG00000006853	rpp38	93	49.811	ENSPKIG00000025652	rpp38	95	49.462	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLBEG00000006853	rpp38	97	42.029	ENSPSIG00000001527	RPP38	95	42.029	Pelodiscus_sinensis
ENSLBEG00000006853	rpp38	98	44.840	ENSPEMG00000008375	Rpp38	96	45.390	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLBEG00000006853	rpp38	93	46.792	ENSPCIG00000009096	RPP38	86	46.792	Phascolarctos_cinereus
ENSLBEG00000006853	rpp38	76	59.330	ENSPFOG00000016823	rpp38	92	61.538	Poecilia_formosa
ENSLBEG00000006853	rpp38	99	59.431	ENSPLAG00000007626	rpp38	99	59.075	Poecilia_latipinna
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	54.380	ENSPMEG00000020392	rpp38	97	54.676	Poecilia_mexicana
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	61.567	ENSPREG00000017744	rpp38	95	61.194	Poecilia_reticulata
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	44.689	ENSPPYG00000002113	RPP38	92	43.956	Pongo_abelii
ENSLBEG00000006853	rpp38	91	42.751	ENSPVAG00000007155	RPP38	92	43.956	Pteropus_vampyrus
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	71.698	ENSPNYG00000004293	rpp38	99	71.168	Pundamilia_nyererei
ENSLBEG00000006853	rpp38	91	45.276	ENSPNAG00000010633	rpp38	98	45.487	Pygocentrus_nattereri
ENSLBEG00000006853	rpp38	98	45.965	ENSRNOG00000038025	Rpp38	97	46.071	Rattus_norvegicus
ENSLBEG00000006853	rpp38	93	43.561	ENSSHAG00000015529	RPP38	92	45.113	Sarcophilus_harrisii
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	69.811	ENSSMAG00000018276	rpp38	95	69.057	Scophthalmus_maximus
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	70.566	ENSSDUG00000001651	rpp38	100	70.652	Seriola_dumerili
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	71.321	ENSSLDG00000014355	rpp38	100	70.909	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLBEG00000006853	rpp38	92	38.492	ENSSARG00000012099	RPP38	87	37.698	Sorex_araneus
ENSLBEG00000006853	rpp38	93	43.284	ENSSPUG00000005237	-	90	42.751	Sphenodon_punctatus
ENSLBEG00000006853	rpp38	93	39.194	ENSSPUG00000008560	-	92	38.828	Sphenodon_punctatus
ENSLBEG00000006853	rpp38	93	43.911	ENSSPUG00000018363	-	91	42.435	Sphenodon_punctatus
ENSLBEG00000006853	rpp38	96	66.418	ENSSPAG00000020387	rpp38	98	66.426	Stegastes_partitus
ENSLBEG00000006853	rpp38	92	42.857	ENSSSCG00000027110	RPP38	90	41.887	Sus_scrofa
ENSLBEG00000006853	rpp38	89	43.233	ENSTGUG00000001366	RPP38	90	42.279	Taeniopygia_guttata
ENSLBEG00000006853	rpp38	99	64.000	ENSTNIG00000001334	rpp38	99	63.636	Tetraodon_nigroviridis
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	43.273	ENSTTRG00000004420	RPP38	92	44.238	Tursiops_truncatus
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	44.815	ENSUAMG00000002618	RPP38	92	44.074	Ursus_americanus
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	45.660	ENSUMAG00000012382	RPP38	92	45.660	Ursus_maritimus
ENSLBEG00000006853	rpp38	94	46.125	ENSVVUG00000005272	RPP38	92	45.387	Vulpes_vulpes
ENSLBEG00000006853	rpp38	92	42.586	ENSXETG00000003419	rpp38	94	43.173	Xenopus_tropicalis