EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLBEG00000007442 (Gene tree)
Gene ID: 109982525
Gene Symbol: ipo13
Alias: -
Full Name: importin-13-like
Gene Type: protein_coding
Species: Labrus_bergylta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17320 bases
Position: chrFKLU01000044.1:626067-643386
Accession: 109982525
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLBEP00000009709	Xpo1	PF08389.12	1.4e-22	1	1
ENSLBEP00000009709	IBN_N	PF03810.19	4.8e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLBET00000010233	-	2898	XM_020631786	ENSLBEP00000009709	965 (aa)	XP_020487442	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	66.909	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	100	66.909

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.696	ENSG00000117408	IPO13	99	80.314	Homo_sapiens
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	95.838	ENSAPOG00000003308	ipo13	100	95.838	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	69.255	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	99	69.151	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.802	ENSAMEG00000001123	IPO13	99	80.419	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLBEG00000007442	ipo13	95	90.889	ENSACIG00000008146	ipo13	100	90.870	Amphilophus_citrinellus
ENSLBEG00000007442	ipo13	97	69.020	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	69.060	Amphilophus_citrinellus
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	95.525	ENSAOCG00000004943	ipo13	100	95.525	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	68.012	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	99	67.909	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	95.421	ENSAPEG00000011282	ipo13	100	95.421	Amphiprion_percula
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	68.116	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	99	68.012	Amphiprion_percula
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	67.461	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	67.899	Anabas_testudineus
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	95.109	ENSATEG00000018367	ipo13	100	95.109	Anabas_testudineus
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	80.439	ENSAPLG00000001349	IPO13	99	80.439	Anas_platyrhynchos
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	81.540	ENSACAG00000014300	IPO13	99	81.540	Anolis_carolinensis
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.696	ENSANAG00000034183	IPO13	99	80.314	Aotus_nancymaae
ENSLBEG00000007442	ipo13	95	95.770	ENSACLG00000011458	ipo13	100	95.770	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	68.763	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	99	68.698	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	89.293	ENSAMXG00000005200	ipo13	100	89.293	Astyanax_mexicanus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	63.675	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	63.675	Astyanax_mexicanus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	79.958	ENSBTAG00000018887	IPO13	99	79.581	Bos_taurus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.802	ENSCJAG00000007453	IPO13	99	80.419	Callithrix_jacchus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.802	ENSCAFG00000004875	IPO13	99	80.419	Canis_familiaris
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.802	ENSCAFG00020017359	IPO13	99	80.419	Canis_lupus_dingo
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.063	ENSCHIG00000008341	IPO13	99	79.686	Capra_hircus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.696	ENSTSYG00000035980	IPO13	99	80.146	Carlito_syrichta
ENSLBEG00000007442	ipo13	86	79.555	ENSCAPG00000001972	IPO13	97	79.555	Cavia_aperea
ENSLBEG00000007442	ipo13	97	80.277	ENSCPOG00000012445	IPO13	98	79.894	Cavia_porcellus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.802	ENSCCAG00000022035	IPO13	99	80.419	Cebus_capucinus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.696	ENSCATG00000041276	IPO13	99	80.314	Cercocebus_atys
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.380	ENSCLAG00000002914	IPO13	99	80.000	Chinchilla_lanigera
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.696	ENSCSAG00000001190	IPO13	99	80.314	Chlorocebus_sabaeus
ENSLBEG00000007442	ipo13	95	81.243	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	81.243	Chrysemys_picta_bellii
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	38.438	ENSCING00000001863	-	100	38.254	Ciona_intestinalis
ENSLBEG00000007442	ipo13	97	36.478	ENSCSAVG00000001368	-	99	36.268	Ciona_savignyi
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.696	ENSCANG00000009091	IPO13	99	80.314	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	79.430	ENSCGRG00001021177	Ipo13	99	78.423	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	79.430	ENSCGRG00000012411	Ipo13	99	78.423	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	62.733	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	99	62.733	Cynoglossus_semilaevis
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	92.716	ENSCSEG00000007713	ipo13	100	92.716	Cynoglossus_semilaevis
ENSLBEG00000007442	ipo13	96	65.882	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	99	65.882	Cyprinodon_variegatus
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	95.525	ENSCVAG00000013039	ipo13	100	95.525	Cyprinodon_variegatus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	89.673	ENSDARG00000060618	ipo13	99	89.673	Danio_rerio
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	65.964	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	65.859	Danio_rerio
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.485	ENSDNOG00000016583	IPO13	99	80.105	Dasypus_novemcinctus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.591	ENSDORG00000005471	Ipo13	99	80.209	Dipodomys_ordii
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	67.427	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.523	Eptatretus_burgeri
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.802	ENSEASG00005001738	IPO13	99	80.419	Equus_asinus_asinus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.802	ENSECAG00000015508	IPO13	99	80.419	Equus_caballus
ENSLBEG00000007442	ipo13	67	84.921	ENSEEUG00000011681	IPO13	82	84.921	Erinaceus_europaeus
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	92.924	ENSELUG00000001498	ipo13	100	92.924	Esox_lucius
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	65.310	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	99	65.310	Esox_lucius
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.696	ENSFCAG00000006488	IPO13	99	80.314	Felis_catus
ENSLBEG00000007442	ipo13	95	81.352	ENSFALG00000005368	IPO13	100	81.352	Ficedula_albicollis
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.274	ENSFDAG00000015599	IPO13	99	79.605	Fukomys_damarensis
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	95.278	ENSFHEG00000023271	ipo13	100	95.005	Fundulus_heteroclitus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	67.570	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	99	67.464	Fundulus_heteroclitus
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	59.217	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	99	59.482	Gadus_morhua
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	93.880	ENSGMOG00000015856	ipo13	99	93.880	Gadus_morhua
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	81.598	ENSGALG00000010087	IPO13	99	81.598	Gallus_gallus
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	66.667	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	99	66.667	Gambusia_affinis
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	95.734	ENSGAFG00000006361	ipo13	100	95.734	Gambusia_affinis
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	68.399	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	99	68.399	Gasterosteus_aculeatus
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	93.478	ENSGACG00000014562	ipo13	100	93.478	Gasterosteus_aculeatus
ENSLBEG00000007442	ipo13	97	81.383	ENSGAGG00000008331	IPO13	98	81.383	Gopherus_agassizii
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.696	ENSGGOG00000016375	IPO13	99	80.314	Gorilla_gorilla
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	95.421	ENSHBUG00000018605	ipo13	100	95.421	Haplochromis_burtoni
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	67.835	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	99	67.769	Haplochromis_burtoni
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.274	ENSHGLG00000001822	IPO13	99	79.253	Heterocephalus_glaber_female
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.274	ENSHGLG00100015830	IPO13	99	79.253	Heterocephalus_glaber_male
ENSLBEG00000007442	ipo13	96	63.259	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	99	63.259	Hippocampus_comes
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	90.635	ENSHCOG00000018408	ipo13	98	92.865	Hippocampus_comes
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	88.321	ENSIPUG00000011283	IPO13	99	88.321	Ictalurus_punctatus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	59.368	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	99	59.368	Ictalurus_punctatus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.485	ENSSTOG00000003611	IPO13	99	80.105	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.485	ENSJJAG00000018591	Ipo13	99	79.461	Jaculus_jaculus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	95.173	ENSKMAG00000007869	ipo13	99	95.173	Kryptolebias_marmoratus
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	67.975	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	99	68.041	Kryptolebias_marmoratus
ENSLBEG00000007442	ipo13	74	31.868	ENSLACG00000002351	TNPO3	81	32.031	Latimeria_chalumnae
ENSLBEG00000007442	ipo13	97	76.266	ENSLACG00000016657	IPO13	99	74.923	Latimeria_chalumnae
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	84.287	ENSLOCG00000010620	ipo13	99	84.287	Lepisosteus_oculatus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	78.864	ENSLAFG00000017144	IPO13	99	78.497	Loxodonta_africana
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.696	ENSMFAG00000032846	IPO13	99	80.314	Macaca_fascicularis
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.696	ENSMMUG00000015142	IPO13	99	80.314	Macaca_mulatta
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.696	ENSMNEG00000041971	IPO13	99	80.314	Macaca_nemestrina
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.696	ENSMLEG00000044330	IPO13	99	80.314	Mandrillus_leucophaeus
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	95.317	ENSMAMG00000017290	ipo13	100	95.317	Mastacembelus_armatus
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	69.295	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	99	69.151	Mastacembelus_armatus
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	95.317	ENSMZEG00005019335	ipo13	100	95.317	Maylandia_zebra
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	68.660	ENSMZEG00005009283	si:ch73-182a11.2	99	68.595	Maylandia_zebra
ENSLBEG00000007442	ipo13	97	80.085	ENSMGAG00000009898	IPO13	100	80.085	Meleagris_gallopavo
ENSLBEG00000007442	ipo13	81	81.505	ENSMAUG00000013018	Ipo13	99	80.250	Mesocricetus_auratus
ENSLBEG00000007442	ipo13	92	84.706	ENSMICG00000011003	IPO13	99	82.486	Microcebus_murinus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	79.747	ENSMOCG00000008881	Ipo13	99	78.734	Microtus_ochrogaster
ENSLBEG00000007442	ipo13	97	92.537	ENSMMOG00000001954	ipo13	99	92.537	Mola_mola
ENSLBEG00000007442	ipo13	99	66.046	ENSMMOG00000018046	si:ch73-182a11.2	100	65.735	Mola_mola
ENSLBEG00000007442	ipo13	95	79.716	ENSMODG00000003017	IPO13	100	79.716	Monodelphis_domestica
ENSLBEG00000007442	ipo13	95	93.377	ENSMALG00000010805	ipo13	100	93.377	Monopterus_albus
ENSLBEG00000007442	ipo13	81	67.378	ENSMALG00000006451	si:ch73-182a11.2	99	67.378	Monopterus_albus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.274	MGP_CAROLIEiJ_G0026367	Ipo13	99	79.253	Mus_caroli
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ENSLBEG00000007442	ipo13	98	82.395	MGP_PahariEiJ_G0028698	Ipo13	99	82.395	Mus_pahari
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ENSLBEG00000007442	ipo13	98	75.099	ENSMPUG00000013635	IPO13	99	74.535	Mustela_putorius_furo
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.485	ENSMLUG00000006360	IPO13	99	80.105	Myotis_lucifugus
ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.506	ENSNGAG00000013019	Ipo13	99	79.461	Nannospalax_galili
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