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Description

Ensembl ID: ENSLBEG00000009521 (Gene tree)
Gene ID: 110001640
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin-1
Gene Type: protein_coding
Species: Labrus_bergylta
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 28066 bases
Position: chrFKLU01000826.1:99427-127492
Accession: 110001640
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLBEP00000012452	IBN_N	PF03810.19	2.9e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLBET00000013088	-	2514	XM_020657127	ENSLBEP00000012452	837 (aa)	XP_020512783	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	84.491	ENSLBEG00000005301	-	91	84.491
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	84.282	ENSLBEG00000026241	tnpo2	93	84.282

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSG00000083312	TNPO1	91	90.136	Homo_sapiens
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.821	ENSAPOG00000003453	tnpo1	91	94.821	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	87.912	ENSAMEG00000007147	TNPO1	90	89.255	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLBEG00000009521	tnpo1	93	97.169	ENSACIG00000003711	tnpo1	100	97.169	Amphilophus_citrinellus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.945	ENSAOCG00000008154	tnpo1	91	94.945	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.945	ENSAPEG00000001112	tnpo1	91	94.945	Amphiprion_percula
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.451	ENSATEG00000010408	tnpo1	91	94.451	Anabas_testudineus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	95	86.194	ENSAPLG00000009619	-	88	87.326	Anas_platyrhynchos
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.382	ENSACAG00000009599	TNPO1	91	90.382	Anolis_carolinensis
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.766	ENSANAG00000022453	-	90	89.766	Aotus_nancymaae
ENSLBEG00000009521	tnpo1	93	83.226	ENSANAG00000025351	-	86	83.226	Aotus_nancymaae
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	91.615	ENSACLG00000027223	tnpo1	91	92.109	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	92.118	ENSAMXG00000009842	tnpo1	91	92.118	Astyanax_mexicanus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.012	ENSBTAG00000007979	TNPO1	90	90.012	Bos_taurus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.766	ENSCJAG00000016409	TNPO1	90	89.766	Callithrix_jacchus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	89.460	ENSCAFG00000008081	TNPO1	90	89.974	Canis_familiaris
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	87.546	ENSCAFG00020017397	TNPO1	90	87.546	Canis_lupus_dingo
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.889	ENSCHIG00000023462	TNPO1	90	89.889	Capra_hircus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	85.980	ENSTSYG00000001871	TNPO1	88	88.789	Carlito_syrichta
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.642	ENSCCAG00000026472	TNPO1	91	89.642	Cebus_capucinus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSCATG00000043792	TNPO1	95	93.117	Cercocebus_atys
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.642	ENSCLAG00000016191	TNPO1	91	89.642	Chinchilla_lanigera
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSCSAG00000015616	TNPO1	90	90.136	Chlorocebus_sabaeus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	83.290	ENSCHOG00000001746	TNPO1	91	83.808	Choloepus_hoffmanni
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.506	ENSCPBG00000000260	TNPO1	86	90.999	Chrysemys_picta_bellii
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	73.276	ENSCSAVG00000010981	-	99	70.845	Ciona_savignyi
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSCANG00000004353	TNPO1	90	90.136	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	90	90.136	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	90.206	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	90	90.206	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.711	ENSCSEG00000012674	tnpo1	91	93.711	Cynoglossus_semilaevis
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.958	ENSCVAG00000001010	tnpo1	91	93.958	Cyprinodon_variegatus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	91.245	ENSDARG00000035390	tnpo1	91	91.245	Danio_rerio
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	83.415	ENSDNOG00000006647	TNPO1	90	83.907	Dasypus_novemcinctus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	89	90.000	ENSDORG00000006476	Tnpo1	90	90.000	Dipodomys_ordii
ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	58.581	FBgn0035693	CG8219	86	58.323	Drosophila_melanogaster
ENSLBEG00000009521	tnpo1	86	84.234	ENSETEG00000017805	TNPO1	83	84.234	Echinops_telfairi
ENSLBEG00000009521	tnpo1	90	82.129	ENSEBUG00000001895	tnpo1	90	82.129	Eptatretus_burgeri
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSEASG00005018055	TNPO1	91	90.136	Equus_asinus_asinus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSECAG00000024424	TNPO1	90	90.136	Equus_caballus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	85.084	ENSELUG00000002821	tnpo1	91	85.084	Esox_lucius
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSFCAG00000013181	TNPO1	91	90.136	Felis_catus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	91.122	ENSFALG00000010292	TNPO1	91	91.122	Ficedula_albicollis
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.766	ENSFDAG00000013345	TNPO1	90	89.766	Fukomys_damarensis
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.958	ENSFHEG00000019234	tnpo1	91	93.958	Fundulus_heteroclitus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.529	ENSGMOG00000000347	tnpo1	90	90.529	Gadus_morhua
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.012	ENSGALG00000015014	TNPO1	93	90.259	Gallus_gallus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.596	ENSGAFG00000000943	tnpo1	91	93.596	Gambusia_affinis
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.588	ENSGACG00000015841	tnpo1	90	93.588	Gasterosteus_aculeatus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.875	ENSGAGG00000013419	TNPO1	91	90.875	Gopherus_agassizii
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSGGOG00000026800	TNPO1	91	90.136	Gorilla_gorilla
ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	79.484	ENSGGOG00000022535	-	86	79.484	Gorilla_gorilla
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.205	ENSHBUG00000008068	tnpo1	92	93.040	Haplochromis_burtoni
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.396	ENSHGLG00000000970	-	90	89.396	Heterocephalus_glaber_female
ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	89.318	ENSHGLG00100017090	-	90	89.318	Heterocephalus_glaber_male
ENSLBEG00000009521	tnpo1	93	69.270	ENSHGLG00100000963	-	89	69.270	Heterocephalus_glaber_male
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.889	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	88	90.259	Jaculus_jaculus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.588	ENSKMAG00000018195	tnpo1	91	93.465	Kryptolebias_marmoratus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	89	91.129	ENSLACG00000012199	TNPO1	86	91.129	Latimeria_chalumnae
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	91.985	ENSLOCG00000011092	tnpo1	88	91.985	Lepisosteus_oculatus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	94	89.454	ENSLAFG00000011796	TNPO1	90	89.454	Loxodonta_africana
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSMFAG00000003636	TNPO1	90	90.136	Macaca_fascicularis
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.087	ENSMMUG00000020923	TNPO1	90	90.087	Macaca_mulatta
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSMNEG00000044581	TNPO1	90	90.136	Macaca_nemestrina
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSMLEG00000030740	TNPO1	90	90.136	Mandrillus_leucophaeus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.575	ENSMAMG00000001357	tnpo1	91	94.575	Mastacembelus_armatus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	92.972	ENSMZEG00005004913	tnpo1	92	92.430	Maylandia_zebra
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	93.258	Mesocricetus_auratus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	86.067	ENSMICG00000008468	TNPO1	90	86.067	Microcebus_murinus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	90	90.136	Microtus_ochrogaster
ENSLBEG00000009521	tnpo1	93	97.304	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	97.304	Mola_mola
ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	96.552	ENSMODG00000001721	TNPO1	69	96.552	Monodelphis_domestica
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.095	ENSMALG00000009782	tnpo1	91	93.095	Monopterus_albus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.889	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	93.258	Mus_caroli
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	93.258	Mus_musculus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.012	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	93.258	Mus_pahari
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.889	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	93.258	Mus_spretus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSMPUG00000014387	TNPO1	90	90.136	Mustela_putorius_furo
ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	89.615	ENSMLUG00000016317	TNPO1	90	89.615	Myotis_lucifugus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	90	90.136	Nannospalax_galili
ENSLBEG00000009521	tnpo1	93	97.297	ENSNBRG00000009998	tnpo1	100	97.297	Neolamprologus_brichardi
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSNLEG00000004572	TNPO1	91	90.136	Nomascus_leucogenys
ENSLBEG00000009521	tnpo1	86	86.901	ENSOPRG00000012390	TNPO1	79	86.901	Ochotona_princeps
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.396	ENSODEG00000001771	TNPO1	90	89.396	Octodon_degus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.620	ENSONIG00000011151	tnpo1	91	92.467	Oreochromis_niloticus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	91.108	ENSOANG00000015785	TNPO1	94	91.108	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	83.269	ENSOCUG00000013318	TNPO1	90	83.269	Oryctolagus_cuniculus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	93	96.516	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	96.516	Oryzias_latipes
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	92.574	ENSORLG00020011559	tnpo1	91	93.193	Oryzias_latipes_hni
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.193	ENSORLG00015019113	tnpo1	91	93.688	Oryzias_latipes_hsok
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	92.946	ENSOMEG00000014567	tnpo1	91	93.441	Oryzias_melastigma
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSOGAG00000000808	TNPO1	90	90.136	Otolemur_garnettii
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	89.642	ENSOARG00000005038	TNPO1	77	88.889	Ovis_aries
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSPPAG00000042518	TNPO1	90	90.136	Pan_paniscus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSPPRG00000022336	TNPO1	91	90.136	Panthera_pardus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSPTIG00000018839	TNPO1	91	90.136	Panthera_tigris_altaica
ENSLBEG00000009521	tnpo1	86	82.597	ENSPTRG00000047731	-	90	82.597	Pan_troglodytes
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSPTRG00000016972	TNPO1	90	90.136	Pan_troglodytes
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSPANG00000006074	TNPO1	90	90.136	Papio_anubis
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	87.423	ENSPKIG00000019795	tnpo1	90	88.039	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	91.245	ENSPSIG00000014366	TNPO1	90	91.245	Pelodiscus_sinensis
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.148	ENSPMGG00000017014	tnpo1	91	90.394	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	92	90.206	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	90	90.206	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	91.122	ENSPCIG00000026080	TNPO1	93	91.122	Phascolarctos_cinereus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.850	ENSPFOG00000011447	tnpo1	91	93.850	Poecilia_formosa
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.850	ENSPLAG00000018696	tnpo1	91	93.850	Poecilia_latipinna
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ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.966	ENSPREG00000020705	tnpo1	91	93.966	Poecilia_reticulata
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.012	ENSPPYG00000015545	TNPO1	90	90.012	Pongo_abelii
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	ENSPCOG00000004254	TNPO1	90	90.136	Propithecus_coquereli
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.259	ENSPVAG00000013051	TNPO1	90	90.259	Pteropus_vampyrus
ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	94.205	ENSPNYG00000001522	tnpo1	92	93.040	Pundamilia_nyererei
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ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.958	ENSXMAG00000005440	tnpo1	91	93.958	Xiphophorus_maculatus