EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLBEG00000012756 (Gene tree)
Gene ID: 109995968
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC109995968
Gene Type: protein_coding
Species: Labrus_bergylta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 18494 bases
Position: chrFKLU01000348.1:254766-273259
Accession: 109995968
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLBEP00000016514	MMR_HSR1	PF01926.23	4.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLBET00000017457	-	6281	XM_020649882	ENSLBEP00000016514	448 (aa)	XP_020505538	UPI0009B474FB

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Amphilophus_citrinellus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	57.871	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	57.650	Amphilophus_citrinellus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Amphiprion_percula
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Amphiprion_percula
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Anabas_testudineus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	89.509	Anabas_testudineus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	99	57.589	ENSACAG00000028632	-	99	58.000	Anolis_carolinensis
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	59.071	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.071	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	79.510	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.510	Astyanax_mexicanus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	60.307	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.307	Astyanax_mexicanus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	79	61.517	ENSCING00000020807	-	94	61.517	Ciona_intestinalis
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	98	55.455	ENSCSAVG00000009987	-	98	55.682	Ciona_savignyi
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	87.500	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	84.906	Cynoglossus_semilaevis
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	59.111	Cynoglossus_semilaevis
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	88.170	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	88.170	Cyprinodon_variegatus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	59.556	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Cyprinodon_variegatus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	98	82.500	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.500	Danio_rerio
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	73.469	Danio_rerio
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	83	53.639	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	98	53.639	Eptatretus_burgeri
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	99	80.942	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	80.942	Esox_lucius
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Fundulus_heteroclitus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	88.616	Fundulus_heteroclitus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	89	55.087	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.087	Gadus_morhua
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	88.616	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	88.616	Gambusia_affinis
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	59.778	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.778	Gambusia_affinis
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	85	63.351	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.347	Gasterosteus_aculeatus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	58	94.186	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.186	Gasterosteus_aculeatus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.518	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.518	Haplochromis_burtoni
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	59.292	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Haplochromis_burtoni
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	99	85.586	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	85.586	Hippocampus_comes
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	58.667	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Hippocampus_comes
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	84	57.713	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	57.713	Ictalurus_punctatus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	75.947	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	75.947	Ictalurus_punctatus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	96	59.815	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	58.661	Ictalurus_punctatus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	89.732	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	89.732	Kryptolebias_marmoratus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	58.444	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	58.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	99	62.022	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.247	Latimeria_chalumnae
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	99	68.243	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.243	Latimeria_chalumnae
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	61.470	ENSLACG00000004899	-	99	61.470	Latimeria_chalumnae
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	99	74.497	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.497	Lepisosteus_oculatus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	89.509	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	89.509	Mastacembelus_armatus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	96	60.508	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.508	Mastacembelus_armatus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	58.850	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	58.850	Maylandia_zebra
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.295	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	91.295	Maylandia_zebra
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	58.093	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	58.093	Mola_mola
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Monopterus_albus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	98	88.155	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	87.927	Monopterus_albus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	96	59.633	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	59.862	Neolamprologus_brichardi
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.071	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	91.071	Neolamprologus_brichardi
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	59.071	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.071	Oreochromis_niloticus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Oreochromis_niloticus
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Oryzias_latipes
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	85.491	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	85.491	Oryzias_latipes
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Oryzias_latipes_hni
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ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Oryzias_latipes_hsok
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	88.393	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	88.393	Oryzias_latipes_hsok
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Oryzias_melastigma
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	89.955	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	89.955	Oryzias_melastigma
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	75.056	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	75.056	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	57.684	ENSPKIG00000023918	-	98	57.684	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	58.388	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	85.714	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	85.714	Periophthalmus_magnuspinnatus
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