EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLBEG00000014425 (Gene tree)
Gene ID: 109992412
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Labrus_bergylta
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8386 bases
Position: chrFKLU01000231.1:809940-818325
Accession: 109992412
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLBEP00000018738	SYF2	PF08231.12	1.7e-52	1	1
ENSLBEP00000018754	SYF2	PF08231.12	1.7e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLBET00000019782	-	717	-	ENSLBEP00000018754	238 (aa)	-	-
ENSLBET00000019766	-	1944	XM_020644996	ENSLBEP00000018738	238 (aa)	XP_020500652	UPI0009B303FD

Gene Model

Click here to download ENSLBEG00000014425's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLBEG00000014425's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLBEG00000014425	syf2	91	83.796	ENSG00000117614	SYF2	90	83.105	Homo_sapiens
ENSLBEG00000014425	syf2	100	93.697	ENSAPOG00000001174	syf2	100	93.697	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000014425	syf2	92	82.192	ENSAMEG00000010115	-	90	82.192	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLBEG00000014425	syf2	82	83.077	ENSAMEG00000010134	-	100	83.077	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLBEG00000014425	syf2	99	89.362	ENSACIG00000023688	syf2	88	92.694	Amphilophus_citrinellus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	92.857	ENSAOCG00000022046	syf2	93	94.064	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000014425	syf2	93	92.308	ENSAOCG00000010912	syf2	69	92.308	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000014425	syf2	100	92.857	ENSAPEG00000018858	syf2	92	92.857	Amphiprion_percula
ENSLBEG00000014425	syf2	100	94.538	ENSATEG00000007745	syf2	100	94.538	Anabas_testudineus
ENSLBEG00000014425	syf2	84	85.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.500	Anas_platyrhynchos
ENSLBEG00000014425	syf2	70	70.659	ENSACAG00000026777	-	100	70.659	Anolis_carolinensis
ENSLBEG00000014425	syf2	86	83.333	ENSACAG00000013653	-	100	83.333	Anolis_carolinensis
ENSLBEG00000014425	syf2	91	84.259	ENSANAG00000032473	SYF2	90	83.562	Aotus_nancymaae
ENSLBEG00000014425	syf2	100	91.176	ENSACLG00000019916	syf2	100	91.176	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000014425	syf2	100	84.874	ENSAMXG00000004051	syf2	91	89.401	Astyanax_mexicanus
ENSLBEG00000014425	syf2	93	82.883	ENSBTAG00000001651	SYF2	93	83.562	Bos_taurus
ENSLBEG00000014425	syf2	87	52.133	WBGene00019402	syf-2	90	51.415	Caenorhabditis_elegans
ENSLBEG00000014425	syf2	91	84.259	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	83.562	Callithrix_jacchus
ENSLBEG00000014425	syf2	91	82.870	ENSCAFG00000012895	-	89	82.192	Canis_familiaris
ENSLBEG00000014425	syf2	91	77.778	ENSCAFG00000030331	-	92	77.778	Canis_familiaris
ENSLBEG00000014425	syf2	76	74.176	ENSCAFG00020021094	-	95	74.176	Canis_lupus_dingo
ENSLBEG00000014425	syf2	91	82.870	ENSCAFG00020021091	-	89	82.192	Canis_lupus_dingo
ENSLBEG00000014425	syf2	100	77.366	ENSCHIG00000020874	SYF2	91	83.105	Capra_hircus
ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.333	ENSTSYG00000005114	SYF2	90	82.192	Carlito_syrichta
ENSLBEG00000014425	syf2	83	83.333	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.333	Cavia_aperea
ENSLBEG00000014425	syf2	100	77.869	ENSCPOG00000005326	SYF2	90	83.562	Cavia_porcellus
ENSLBEG00000014425	syf2	91	84.259	ENSCCAG00000022459	SYF2	90	83.562	Cebus_capucinus
ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.814	ENSCATG00000026917	SYF2	90	82.192	Cercocebus_atys
ENSLBEG00000014425	syf2	98	81.545	ENSCLAG00000008474	SYF2	90	84.018	Chinchilla_lanigera
ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.814	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	82.192	Chlorocebus_sabaeus
ENSLBEG00000014425	syf2	71	64.881	ENSCHOG00000005273	-	89	64.198	Choloepus_hoffmanni
ENSLBEG00000014425	syf2	94	83.857	ENSCPBG00000025073	SYF2	88	84.932	Chrysemys_picta_bellii
ENSLBEG00000014425	syf2	89	54.206	ENSCING00000003017	-	89	54.673	Ciona_intestinalis
ENSLBEG00000014425	syf2	89	50.935	ENSCSAVG00000006627	-	98	50.935	Ciona_savignyi
ENSLBEG00000014425	syf2	99	69.068	ENSCANG00000037322	SYF2	98	63.750	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	78.512	ENSCGRG00001020733	Syf2	90	83.562	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLBEG00000014425	syf2	82	84.184	ENSCGRG00000005095	Syf2	97	83.500	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLBEG00000014425	syf2	91	89.862	ENSCSEG00000000117	syf2	91	89.862	Cynoglossus_semilaevis
ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.795	ENSCVAG00000019543	syf2	100	90.377	Cyprinodon_variegatus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	86.555	ENSDARG00000004706	syf2	100	86.555	Danio_rerio
ENSLBEG00000014425	syf2	100	77.143	ENSDNOG00000047605	SYF2	89	83.105	Dasypus_novemcinctus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	78.689	ENSDORG00000001274	Syf2	90	83.562	Dipodomys_ordii
ENSLBEG00000014425	syf2	94	54.425	FBgn0033556	CG12343	97	54.795	Drosophila_melanogaster
ENSLBEG00000014425	syf2	87	68.599	ENSETEG00000015729	SYF2	89	68.780	Echinops_telfairi
ENSLBEG00000014425	syf2	83	58.376	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.376	Eptatretus_burgeri
ENSLBEG00000014425	syf2	100	68.595	ENSEASG00005004232	-	90	73.516	Equus_asinus_asinus
ENSLBEG00000014425	syf2	92	83.562	ENSEASG00005004224	-	89	83.562	Equus_asinus_asinus
ENSLBEG00000014425	syf2	99	77.686	ENSECAG00000012023	-	89	83.562	Equus_caballus
ENSLBEG00000014425	syf2	92	83.562	ENSECAG00000010440	-	92	83.562	Equus_caballus
ENSLBEG00000014425	syf2	74	67.598	ENSEEUG00000015084	SYF2	86	72.785	Erinaceus_europaeus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	86.975	ENSELUG00000003465	syf2	91	92.166	Esox_lucius
ENSLBEG00000014425	syf2	94	82.063	ENSFCAG00000043095	-	89	83.105	Felis_catus
ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.838	ENSFCAG00000010324	-	76	83.562	Felis_catus
ENSLBEG00000014425	syf2	86	81.863	ENSFALG00000000460	SYF2	88	81.944	Ficedula_albicollis
ENSLBEG00000014425	syf2	100	76.955	ENSFDAG00000008310	SYF2	90	83.105	Fukomys_damarensis
ENSLBEG00000014425	syf2	95	78.761	ENSFHEG00000007238	syf2	97	78.182	Fundulus_heteroclitus
ENSLBEG00000014425	syf2	90	89.767	ENSGMOG00000019138	syf2	96	89.767	Gadus_morhua
ENSLBEG00000014425	syf2	94	83.408	ENSGALG00000013639	SYF2	86	85.253	Gallus_gallus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	89.916	ENSGAFG00000019435	syf2	100	89.916	Gambusia_affinis
ENSLBEG00000014425	syf2	94	91.518	ENSGACG00000007305	syf2	91	93.548	Gasterosteus_aculeatus
ENSLBEG00000014425	syf2	94	84.305	ENSGAGG00000010670	SYF2	88	85.388	Gopherus_agassizii
ENSLBEG00000014425	syf2	91	83.796	ENSGGOG00000012796	SYF2	90	83.105	Gorilla_gorilla
ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.756	ENSHBUG00000020477	syf2	100	90.756	Haplochromis_burtoni
ENSLBEG00000014425	syf2	94	82.511	ENSHGLG00000014393	SYF2	90	83.562	Heterocephalus_glaber_female
ENSLBEG00000014425	syf2	94	72.646	ENSHGLG00000004304	-	91	73.973	Heterocephalus_glaber_female
ENSLBEG00000014425	syf2	94	82.511	ENSHGLG00100014722	SYF2	90	83.562	Heterocephalus_glaber_male
ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.756	ENSHCOG00000012904	syf2	78	90.756	Hippocampus_comes
ENSLBEG00000014425	syf2	100	86.611	ENSIPUG00000019859	syf2	91	90.783	Ictalurus_punctatus
ENSLBEG00000014425	syf2	61	78.082	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.082	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLBEG00000014425	syf2	84	83.920	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.920	Jaculus_jaculus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.756	ENSKMAG00000013856	syf2	100	89.916	Kryptolebias_marmoratus
ENSLBEG00000014425	syf2	97	78.017	ENSLACG00000012064	SYF2	91	83.333	Latimeria_chalumnae
ENSLBEG00000014425	syf2	100	84.454	ENSLOCG00000002728	syf2	95	84.454	Lepisosteus_oculatus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	77.959	ENSLAFG00000023150	-	89	83.562	Loxodonta_africana
ENSLBEG00000014425	syf2	77	55.435	ENSLAFG00000030814	-	100	55.435	Loxodonta_africana
ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.814	ENSMFAG00000041831	SYF2	90	82.192	Macaca_fascicularis
ENSLBEG00000014425	syf2	91	82.870	ENSMMUG00000002968	SYF2	90	82.192	Macaca_mulatta
ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.814	ENSMNEG00000030180	SYF2	90	82.192	Macaca_nemestrina
ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.814	ENSMLEG00000030248	SYF2	90	82.192	Mandrillus_leucophaeus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	92.017	ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.017	Mastacembelus_armatus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	91.176	ENSMZEG00005006429	syf2	100	91.176	Maylandia_zebra
ENSLBEG00000014425	syf2	84	84.925	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.925	Meleagris_gallopavo
ENSLBEG00000014425	syf2	100	79.339	ENSMAUG00000018974	Syf2	90	84.932	Mesocricetus_auratus
ENSLBEG00000014425	syf2	84	83.920	ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.920	Microcebus_murinus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	78.926	ENSMOCG00000022938	Syf2	90	84.475	Microtus_ochrogaster
ENSLBEG00000014425	syf2	95	91.189	ENSMMOG00000002396	syf2	92	92.237	Mola_mola
ENSLBEG00000014425	syf2	94	79.111	ENSMODG00000013951	-	97	80.090	Monodelphis_domestica
ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.041	ENSMALG00000010706	syf2	100	89.212	Monopterus_albus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	79.339	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	90	84.932	Mus_caroli
ENSLBEG00000014425	syf2	100	79.339	ENSMUSG00000028821	Syf2	90	84.932	Mus_musculus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	79.339	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	90	84.932	Mus_pahari
ENSLBEG00000014425	syf2	100	79.339	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	90	84.932	Mus_spretus
ENSLBEG00000014425	syf2	91	82.870	ENSMPUG00000015802	-	89	82.192	Mustela_putorius_furo
ENSLBEG00000014425	syf2	92	82.273	ENSMPUG00000015801	-	89	82.648	Mustela_putorius_furo
ENSLBEG00000014425	syf2	99	77.917	ENSMLUG00000001885	SYF2	90	82.648	Myotis_lucifugus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	76.423	ENSNGAG00000007912	Syf2	89	83.105	Nannospalax_galili
ENSLBEG00000014425	syf2	100	81.590	ENSNBRG00000010720	syf2	99	81.590	Neolamprologus_brichardi
ENSLBEG00000014425	syf2	91	83.796	ENSNLEG00000035185	SYF2	90	83.105	Nomascus_leucogenys
ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.814	ENSOPRG00000012870	SYF2	90	82.192	Ochotona_princeps
ENSLBEG00000014425	syf2	94	81.166	ENSODEG00000017664	-	92	82.192	Octodon_degus
ENSLBEG00000014425	syf2	98	70.815	ENSODEG00000014338	-	91	73.059	Octodon_degus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.756	ENSONIG00000008213	syf2	100	90.756	Oreochromis_niloticus
ENSLBEG00000014425	syf2	85	83.663	ENSOANG00000009552	SYF2	100	83.663	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLBEG00000014425	syf2	91	84.259	ENSOCUG00000013050	SYF2	90	83.562	Oryctolagus_cuniculus
ENSLBEG00000014425	syf2	98	90.987	ENSORLG00000028820	syf2	94	94.064	Oryzias_latipes
ENSLBEG00000014425	syf2	100	89.076	ENSORLG00020018333	syf2	100	89.076	Oryzias_latipes_hni
ENSLBEG00000014425	syf2	100	88.655	ENSORLG00015014665	syf2	91	94.470	Oryzias_latipes_hsok
ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.336	ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	Oryzias_melastigma
ENSLBEG00000014425	syf2	100	78.279	ENSOGAG00000009962	SYF2	90	84.018	Otolemur_garnettii
ENSLBEG00000014425	syf2	93	81.696	ENSOARG00000006348	-	89	82.353	Ovis_aries
ENSLBEG00000014425	syf2	82	57.436	ENSOARG00000006269	-	100	57.436	Ovis_aries
ENSLBEG00000014425	syf2	91	83.796	ENSPPAG00000036579	SYF2	90	83.105	Pan_paniscus
ENSLBEG00000014425	syf2	99	79.079	ENSPPRG00000001638	-	89	83.562	Panthera_pardus
ENSLBEG00000014425	syf2	94	82.063	ENSPPRG00000001651	-	89	83.105	Panthera_pardus
ENSLBEG00000014425	syf2	91	84.259	ENSPTIG00000005711	-	79	83.871	Panthera_tigris_altaica
ENSLBEG00000014425	syf2	94	82.063	ENSPTIG00000007036	-	89	83.105	Panthera_tigris_altaica
ENSLBEG00000014425	syf2	91	83.796	ENSPTRG00000000352	SYF2	90	83.105	Pan_troglodytes
ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.814	ENSPANG00000008139	SYF2	90	82.192	Papio_anubis
ENSLBEG00000014425	syf2	100	84.874	ENSPKIG00000008130	syf2	92	90.323	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLBEG00000014425	syf2	99	79.747	ENSPSIG00000011816	SYF2	84	84.332	Pelodiscus_sinensis
ENSLBEG00000014425	syf2	98	89.270	ENSPMGG00000008755	syf2	86	92.694	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	78.512	ENSPEMG00000008283	Syf2	90	84.018	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLBEG00000014425	syf2	94	83.408	ENSPCIG00000014235	SYF2	87	85.253	Phascolarctos_cinereus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	88.285	ENSPFOG00000004116	syf2	90	92.627	Poecilia_formosa
ENSLBEG00000014425	syf2	98	89.700	ENSPLAG00000006691	syf2	93	92.166	Poecilia_latipinna
ENSLBEG00000014425	syf2	100	86.975	ENSPMEG00000011684	syf2	100	86.975	Poecilia_mexicana
ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.336	ENSPREG00000003009	syf2	100	90.336	Poecilia_reticulata
ENSLBEG00000014425	syf2	99	79.237	ENSPPYG00000001713	SYF2	90	83.105	Pongo_abelii
ENSLBEG00000014425	syf2	99	55.085	ENSPCOG00000027011	SYF2	75	67.925	Propithecus_coquereli
ENSLBEG00000014425	syf2	94	72.646	ENSPVAG00000005841	SYF2	89	73.516	Pteropus_vampyrus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.756	ENSPNYG00000004979	syf2	100	90.756	Pundamilia_nyererei
ENSLBEG00000014425	syf2	100	85.714	ENSPNAG00000015570	syf2	91	90.323	Pygocentrus_nattereri
ENSLBEG00000014425	syf2	100	79.339	ENSRNOG00000060597	Syf2	90	84.932	Rattus_norvegicus
ENSLBEG00000014425	syf2	99	76.695	ENSRBIG00000042970	SYF2	90	79.909	Rhinopithecus_bieti
ENSLBEG00000014425	syf2	99	78.814	ENSRROG00000001347	SYF2	90	82.192	Rhinopithecus_roxellana
ENSLBEG00000014425	syf2	91	83.796	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	83.105	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLBEG00000014425	syf2	94	82.511	ENSSHAG00000015630	-	88	83.562	Sarcophilus_harrisii
ENSLBEG00000014425	syf2	86	83.981	ENSSHAG00000007152	-	100	83.981	Sarcophilus_harrisii
ENSLBEG00000014425	syf2	100	84.874	ENSSFOG00015023647	syf2	92	90.323	Scleropages_formosus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	89.916	ENSSMAG00000009867	syf2	100	89.916	Scophthalmus_maximus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	92.857	ENSSDUG00000013072	syf2	91	94.931	Seriola_dumerili
ENSLBEG00000014425	syf2	100	92.857	ENSSLDG00000012677	syf2	91	94.931	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLBEG00000014425	syf2	99	60.996	ENSSARG00000012889	SYF2	90	63.927	Sorex_araneus
ENSLBEG00000014425	syf2	99	80.165	ENSSPUG00000005251	SYF2	87	84.932	Sphenodon_punctatus
ENSLBEG00000014425	syf2	100	92.017	ENSSPAG00000009626	syf2	100	92.017	Stegastes_partitus
ENSLBEG00000014425	syf2	93	82.805	ENSSSCG00000037481	SYF2	89	83.105	Sus_scrofa
ENSLBEG00000014425	syf2	63	53.642	ENSTGUG00000001126	SYF2	80	55.828	Taeniopygia_guttata
ENSLBEG00000014425	syf2	100	85.833	ENSTRUG00000001499	syf2	87	89.862	Takifugu_rubripes
ENSLBEG00000014425	syf2	94	88.341	ENSTNIG00000016912	syf2	97	89.862	Tetraodon_nigroviridis
ENSLBEG00000014425	syf2	100	57.202	ENSTBEG00000017370	SYF2	88	61.187	Tupaia_belangeri
ENSLBEG00000014425	syf2	99	77.178	ENSTTRG00000003550	SYF2	90	82.648	Tursiops_truncatus
ENSLBEG00000014425	syf2	92	82.192	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	82.192	Ursus_americanus
ENSLBEG00000014425	syf2	91	82.407	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.735	Ursus_maritimus
ENSLBEG00000014425	syf2	99	77.178	ENSVPAG00000005705	SYF2	90	82.648	Vicugna_pacos
ENSLBEG00000014425	syf2	86	82.439	ENSVVUG00000027181	-	88	81.735	Vulpes_vulpes
ENSLBEG00000014425	syf2	91	82.870	ENSVVUG00000027175	-	89	82.192	Vulpes_vulpes
ENSLBEG00000014425	syf2	100	74.793	ENSXETG00000022797	syf2	88	80.365	Xenopus_tropicalis
ENSLBEG00000014425	syf2	100	89.496	ENSXMAG00000022698	syf2	100	89.496	Xiphophorus_maculatus