EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLBEG00000018277 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Labrus_bergylta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 39254 bases
Position: chrFKLU01000190.1:694853-734106
Accession: 109990791
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLBEP00000023844	MIF4G	PF02854.19	3.4e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLBET00000025086	-	1707	XM_020643014	ENSLBEP00000023844	568 (aa)	XP_020498670	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.011	ENSG00000134030	CTIF	100	61.151	Homo_sapiens
ENSLBEG00000018277	ctif	99	77.909	ENSAPOG00000020192	ctif	99	78.475	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000018277	ctif	86	60.938	ENSAMEG00000006759	CTIF	78	60.352	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLBEG00000018277	ctif	62	93.706	ENSAOCG00000014275	ctif	57	93.640	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000018277	ctif	99	84.743	ENSAPEG00000016975	ctif	93	81.944	Amphiprion_percula
ENSLBEG00000018277	ctif	97	88.000	ENSACAG00000018006	CTIF	87	88.000	Anolis_carolinensis
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.375	ENSANAG00000024925	CTIF	99	60.820	Aotus_nancymaae
ENSLBEG00000018277	ctif	99	91.525	ENSACLG00000005956	ctif	90	91.525	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000018277	ctif	71	91.667	ENSAMXG00000015964	ctif	83	62.363	Astyanax_mexicanus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	63.158	ENSBTAG00000018901	CTIF	99	62.818	Bos_taurus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.175	ENSCJAG00000004729	CTIF	99	60.621	Callithrix_jacchus
ENSLBEG00000018277	ctif	96	60.267	ENSCAFG00000019076	CTIF	99	60.390	Canis_familiaris
ENSLBEG00000018277	ctif	96	60.399	ENSCAFG00020026482	CTIF	99	60.390	Canis_lupus_dingo
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.084	ENSCHIG00000014455	CTIF	99	60.526	Capra_hircus
ENSLBEG00000018277	ctif	89	61.290	ENSTSYG00000030461	CTIF	95	60.038	Carlito_syrichta
ENSLBEG00000018277	ctif	99	56.905	ENSCAPG00000011865	CTIF	99	56.645	Cavia_aperea
ENSLBEG00000018277	ctif	99	59.871	ENSCPOG00000001049	CTIF	99	59.481	Cavia_porcellus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	60.848	ENSCCAG00000022758	CTIF	99	60.294	Cebus_capucinus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.538	ENSCATG00000038134	CTIF	99	60.984	Cercocebus_atys
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.653	ENSCLAG00000008174	CTIF	99	61.258	Chinchilla_lanigera
ENSLBEG00000018277	ctif	99	59.968	ENSCSAG00000018021	CTIF	99	59.425	Chlorocebus_sabaeus
ENSLBEG00000018277	ctif	97	88.000	ENSCPBG00000025654	CTIF	90	88.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.175	ENSCANG00000030916	CTIF	99	61.702	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	62.175	ENSCGRG00001020158	Ctif	99	61.275	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLBEG00000018277	ctif	99	57.911	ENSCGRG00000000052	Ctif	99	57.211	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLBEG00000018277	ctif	95	93.220	ENSCSEG00000019857	ctif	80	93.220	Cynoglossus_semilaevis
ENSLBEG00000018277	ctif	75	79.630	ENSDARG00000090617	ctif	84	70.752	Danio_rerio
ENSLBEG00000018277	ctif	74	62.415	ENSDNOG00000037310	CTIF	83	65.583	Dasypus_novemcinctus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.111	ENSDORG00000003221	Ctif	99	60.720	Dipodomys_ordii
ENSLBEG00000018277	ctif	99	60.976	ENSEASG00005016094	CTIF	99	60.423	Equus_asinus_asinus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.338	ENSECAG00000020473	CTIF	99	60.784	Equus_caballus
ENSLBEG00000018277	ctif	84	62.275	ENSEEUG00000012451	CTIF	90	61.600	Erinaceus_europaeus
ENSLBEG00000018277	ctif	98	88.679	ENSELUG00000008733	ctif	90	88.679	Esox_lucius
ENSLBEG00000018277	ctif	99	62.944	ENSFCAG00000000664	CTIF	99	62.842	Felis_catus
ENSLBEG00000018277	ctif	96	60.374	ENSFALG00000008943	CTIF	97	59.658	Ficedula_albicollis
ENSLBEG00000018277	ctif	99	59.873	ENSFDAG00000017379	CTIF	99	59.490	Fukomys_damarensis
ENSLBEG00000018277	ctif	99	76.125	ENSFHEG00000004334	ctif	99	77.217	Fundulus_heteroclitus
ENSLBEG00000018277	ctif	97	88.000	ENSGALG00000035912	-	88	88.000	Gallus_gallus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	88.136	ENSGAFG00000011896	ctif	99	73.413	Gambusia_affinis
ENSLBEG00000018277	ctif	70	58.191	ENSGAGG00000020663	CTIF	85	61.773	Gopherus_agassizii
ENSLBEG00000018277	ctif	99	60.813	ENSGGOG00000015204	CTIF	99	59.967	Gorilla_gorilla
ENSLBEG00000018277	ctif	99	80.403	ENSHBUG00000018092	ctif	92	79.167	Haplochromis_burtoni
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.028	ENSHGLG00000005663	CTIF	99	60.631	Heterocephalus_glaber_female
ENSLBEG00000018277	ctif	99	60.862	ENSHGLG00100006976	CTIF	99	60.631	Heterocephalus_glaber_male
ENSLBEG00000018277	ctif	99	67.003	ENSHCOG00000011784	ctif	98	66.835	Hippocampus_comes
ENSLBEG00000018277	ctif	97	97.561	ENSIPUG00000014050	ctif	86	81.667	Ictalurus_punctatus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.601	ENSSTOG00000001967	CTIF	99	61.211	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.450	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	60.726	Jaculus_jaculus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	75.956	ENSKMAG00000014651	ctif	99	69.115	Kryptolebias_marmoratus
ENSLBEG00000018277	ctif	97	91.667	ENSLOCG00000011697	ctif	99	57.538	Lepisosteus_oculatus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	53.727	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	79.468	Loxodonta_africana
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.538	ENSMFAG00000037903	CTIF	99	60.984	Macaca_fascicularis
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.538	ENSMMUG00000020898	CTIF	99	60.984	Macaca_mulatta
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.538	ENSMNEG00000039395	CTIF	99	60.984	Macaca_nemestrina
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.338	ENSMLEG00000041132	CTIF	99	60.784	Mandrillus_leucophaeus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	80.839	ENSMAMG00000014741	ctif	93	80.556	Mastacembelus_armatus
ENSLBEG00000018277	ctif	89	91.525	ENSMZEG00005019767	ctif	82	91.525	Maylandia_zebra
ENSLBEG00000018277	ctif	87	44.404	ENSMGAG00000001378	CTIF	80	53.200	Meleagris_gallopavo
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.588	ENSMAUG00000000656	Ctif	99	60.877	Mesocricetus_auratus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	60.032	ENSMICG00000010167	CTIF	99	60.256	Microcebus_murinus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.789	ENSMOCG00000020507	Ctif	99	61.075	Microtus_ochrogaster
ENSLBEG00000018277	ctif	99	56.529	ENSMODG00000003464	CTIF	99	55.960	Monodelphis_domestica
ENSLBEG00000018277	ctif	87	79.800	ENSMALG00000020553	ctif	99	78.672	Monopterus_albus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	60.220	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	99	59.528	Mus_caroli
ENSLBEG00000018277	ctif	99	60.697	ENSMUSG00000052928	Ctif	99	59.777	Mus_musculus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	62.541	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	99	61.827	Mus_pahari
ENSLBEG00000018277	ctif	99	60.283	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	91	79.085	Mus_spretus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.513	ENSMPUG00000000844	CTIF	99	60.458	Mustela_putorius_furo
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.375	ENSMLUG00000003025	CTIF	99	60.984	Myotis_lucifugus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.712	ENSNGAG00000011452	Ctif	99	61.003	Nannospalax_galili
ENSLBEG00000018277	ctif	99	80.220	ENSNBRG00000008679	ctif	92	79.167	Neolamprologus_brichardi
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.338	ENSNLEG00000011503	CTIF	99	60.784	Nomascus_leucogenys
ENSLBEG00000018277	ctif	99	55.776	ENSMEUG00000000218	CTIF	99	52.606	Notamacropus_eugenii
ENSLBEG00000018277	ctif	99	58.293	ENSOPRG00000003558	CTIF	99	57.674	Ochotona_princeps
ENSLBEG00000018277	ctif	99	60.000	ENSODEG00000018390	CTIF	99	59.618	Octodon_degus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	82.000	ENSONIG00000007750	ctif	99	80.435	Oreochromis_niloticus
ENSLBEG00000018277	ctif	87	49.303	ENSOANG00000001337	CTIF	99	48.691	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	60.820	ENSOCUG00000024842	CTIF	99	60.263	Oryctolagus_cuniculus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	93.220	ENSORLG00000005786	ctif	99	73.544	Oryzias_latipes
ENSLBEG00000018277	ctif	99	91.525	ENSORLG00020005385	ctif	99	72.937	Oryzias_latipes_hni
ENSLBEG00000018277	ctif	99	93.220	ENSORLG00015011872	ctif	91	93.220	Oryzias_latipes_hsok
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.375	ENSOGAG00000013927	CTIF	99	60.820	Otolemur_garnettii
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.412	ENSOARG00000003754	CTIF	99	60.526	Ovis_aries
ENSLBEG00000018277	ctif	99	60.813	ENSPPAG00000023554	CTIF	99	59.967	Pan_paniscus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.412	ENSPPRG00000002265	CTIF	99	60.855	Panthera_pardus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.301	ENSPTIG00000013761	CTIF	99	60.749	Panthera_tigris_altaica
ENSLBEG00000018277	ctif	99	60.680	ENSPTRG00000010009	CTIF	99	60.130	Pan_troglodytes
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.338	ENSPANG00000017087	CTIF	99	60.784	Papio_anubis
ENSLBEG00000018277	ctif	87	61.010	ENSPKIG00000011234	ctif	99	60.852	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLBEG00000018277	ctif	99	63.194	ENSPSIG00000006508	CTIF	99	62.609	Pelodiscus_sinensis
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.201	ENSPEMG00000022746	Ctif	99	60.488	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLBEG00000018277	ctif	77	59.695	ENSPCIG00000026247	CTIF	97	63.333	Phascolarctos_cinereus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	86.441	ENSPFOG00000009243	ctif	99	75.083	Poecilia_formosa
ENSLBEG00000018277	ctif	99	86.441	ENSPLAG00000019171	ctif	99	71.757	Poecilia_latipinna
ENSLBEG00000018277	ctif	87	63.127	ENSPPYG00000009147	CTIF	99	62.476	Pongo_abelii
ENSLBEG00000018277	ctif	99	59.512	ENSPCOG00000013391	CTIF	99	58.958	Propithecus_coquereli
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.301	ENSPVAG00000001965	CTIF	99	60.749	Pteropus_vampyrus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	81.218	ENSPNYG00000007879	ctif	99	80.272	Pundamilia_nyererei
ENSLBEG00000018277	ctif	97	86.538	ENSPNAG00000029174	ctif	85	67.688	Pygocentrus_nattereri
ENSLBEG00000018277	ctif	99	62.975	ENSRNOG00000018342	Ctif	98	65.000	Rattus_norvegicus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.338	ENSRBIG00000043937	CTIF	99	60.784	Rhinopithecus_bieti
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.175	ENSRROG00000006039	CTIF	99	60.621	Rhinopithecus_roxellana
ENSLBEG00000018277	ctif	99	63.032	ENSSBOG00000028468	CTIF	99	62.457	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLBEG00000018277	ctif	99	56.694	ENSSHAG00000016321	CTIF	99	56.291	Sarcophilus_harrisii
ENSLBEG00000018277	ctif	99	75.891	ENSSMAG00000005707	ctif	99	75.427	Scophthalmus_maximus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	93.220	ENSSDUG00000016033	ctif	87	93.220	Seriola_dumerili
ENSLBEG00000018277	ctif	99	62.081	ENSSPUG00000014734	CTIF	99	61.513	Sphenodon_punctatus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	81.525	ENSSPAG00000003721	ctif	99	81.431	Stegastes_partitus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.322	ENSSSCG00000004506	CTIF	99	60.762	Sus_scrofa
ENSLBEG00000018277	ctif	96	57.938	ENSTGUG00000000030	CTIF	99	58.427	Taeniopygia_guttata
ENSLBEG00000018277	ctif	60	75.723	ENSTRUG00000002320	ctif	99	75.439	Takifugu_rubripes
ENSLBEG00000018277	ctif	99	72.305	ENSTNIG00000018763	ctif	99	72.315	Tetraodon_nigroviridis
ENSLBEG00000018277	ctif	86	86.000	ENSTBEG00000002613	CTIF	68	86.000	Tupaia_belangeri
ENSLBEG00000018277	ctif	99	58.649	ENSTTRG00000004347	CTIF	99	58.086	Tursiops_truncatus
ENSLBEG00000018277	ctif	84	57.774	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	57.089	Ursus_americanus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	63.265	ENSUMAG00000002735	CTIF	99	62.692	Ursus_maritimus
ENSLBEG00000018277	ctif	96	62.392	ENSVVUG00000014347	CTIF	99	62.331	Vulpes_vulpes
ENSLBEG00000018277	ctif	68	75.703	ENSXCOG00000002477	ctif	84	74.346	Xiphophorus_couchianus
ENSLBEG00000018277	ctif	99	72.323	ENSXMAG00000004236	ctif	99	71.358	Xiphophorus_maculatus