EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLBEG00000020585 (Gene tree)
Gene ID: 110000743
Gene Symbol: prpf38a
Alias: fa04h11|fc83e08|wu:fa04h11|wu:fc83e08|zgc:92059
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Labrus_bergylta
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6532 bases
Position: chrFKLU01000712.1:61590-68121
Accession: 110000743
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLBEP00000027084	PRP38	PF03371.15	1e-62	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLBET00000028385	-	1412	XM_020656092	ENSLBEP00000027084	309 (aa)	XP_020511748	UPI0009B4BBB9

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSG00000134748	PRPF38A	96	79.195	Homo_sapiens
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	95.469	ENSAPOG00000011652	prpf38a	100	95.469	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	96	79.195	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLBEG00000020585	prpf38a	72	91.441	ENSACIG00000012292	prpf38a	96	85.714	Amphilophus_citrinellus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	95.469	ENSAOCG00000018004	prpf38a	100	95.469	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	95.469	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	95.469	Amphiprion_percula
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	92.880	ENSATEG00000004608	prpf38a	100	92.880	Anabas_testudineus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	79	75.000	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	94	72.103	Anas_platyrhynchos
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.872	ENSACAG00000008249	PRPF38A	96	79.530	Anolis_carolinensis
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	55.272	ENSANAG00000029204	-	95	53.356	Aotus_nancymaae
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSANAG00000027839	PRPF38A	96	79.195	Aotus_nancymaae
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	94.498	ENSACLG00000021595	prpf38a	100	94.498	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	83.387	ENSAMXG00000029274	prpf38a	100	85.304	Astyanax_mexicanus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	96	79.195	Bos_taurus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	63	63.077	WBGene00008380	prp-38	59	64.894	Caenorhabditis_elegans
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	96	79.195	Callithrix_jacchus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	96	79.195	Canis_familiaris
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	96	79.195	Canis_lupus_dingo
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	96	79.195	Capra_hircus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	86	75.556	ENSTSYG00000031994	-	90	72.941	Carlito_syrichta
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSTSYG00000009868	-	96	79.195	Carlito_syrichta
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	81.029	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	95	81.419	Cavia_porcellus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	81.672	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	95	78.859	Cebus_capucinus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	93	51.903	ENSCATG00000044190	-	57	55.556	Cercocebus_atys
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSCATG00000032296	PRPF38A	96	79.195	Cercocebus_atys
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	96	79.195	Chinchilla_lanigera
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.872	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	96	79.530	Chrysemys_picta_bellii
ENSLBEG00000020585	prpf38a	86	58.885	ENSCSAVG00000009580	-	95	59.247	Ciona_savignyi
ENSLBEG00000020585	prpf38a	75	85.714	ENSCANG00000032608	PRPF38A	99	79.195	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	84	69.732	ENSCGRG00001002557	-	74	72.851	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSCGRG00001018502	-	96	79.195	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	96	79.195	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLBEG00000020585	prpf38a	72	91.403	ENSCSEG00000001269	prpf38a	100	85.374	Cynoglossus_semilaevis
ENSLBEG00000020585	prpf38a	72	94.118	ENSCVAG00000012305	prpf38a	100	94.175	Cyprinodon_variegatus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	83.387	ENSDARG00000039213	prpf38a	100	85.304	Danio_rerio
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	97	79.195	Dasypus_novemcinctus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	84	74.525	ENSDORG00000025371	-	67	86.243	Dipodomys_ordii
ENSLBEG00000020585	prpf38a	84	74.525	ENSDORG00000023691	-	67	86.243	Dipodomys_ordii
ENSLBEG00000020585	prpf38a	85	94.792	ENSDORG00000023857	-	95	94.792	Dipodomys_ordii
ENSLBEG00000020585	prpf38a	66	69.268	FBgn0050342	Prp38	57	72.487	Drosophila_melanogaster
ENSLBEG00000020585	prpf38a	77	80.335	ENSEBUG00000012588	prpf38a	96	74.582	Eptatretus_burgeri
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSEASG00005014427	PRPF38A	96	79.195	Equus_asinus_asinus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSECAG00000022628	PRPF38A	96	79.195	Equus_caballus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	95.146	ENSELUG00000021094	prpf38a	100	95.146	Esox_lucius
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	96	79.195	Felis_catus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	87	76.838	ENSFALG00000005598	-	95	74.319	Ficedula_albicollis
ENSLBEG00000020585	prpf38a	99	74.516	ENSFALG00000003612	-	73	81.651	Ficedula_albicollis
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	80.707	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	96	78.859	Fukomys_damarensis
ENSLBEG00000020585	prpf38a	90	81.004	ENSFHEG00000014317	prpf38a	99	92.857	Fundulus_heteroclitus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	54	95.783	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	95.783	Gadus_morhua
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.872	ENSGALG00000010627	PRPF38A	96	79.530	Gallus_gallus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	72	93.213	ENSGAFG00000012422	prpf38a	100	93.204	Gambusia_affinis
ENSLBEG00000020585	prpf38a	72	93.722	ENSGACG00000005423	prpf38a	100	93.891	Gasterosteus_aculeatus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.872	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	96	79.530	Gopherus_agassizii
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSGGOG00000003940	PRPF38A	96	79.195	Gorilla_gorilla
ENSLBEG00000020585	prpf38a	61	94.709	ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	94.709	Haplochromis_burtoni
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSHGLG00000000475	PRPF38A	96	79.195	Heterocephalus_glaber_female
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ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	72.026	ENSHGLG00100003928	-	95	68.707	Heterocephalus_glaber_male
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSHGLG00100008935	PRPF38A	96	79.195	Heterocephalus_glaber_male
ENSLBEG00000020585	prpf38a	59	93.407	ENSHCOG00000020781	prpf38a	60	93.651	Hippocampus_comes
ENSLBEG00000020585	prpf38a	90	78.246	ENSIPUG00000005757	prpf38a	96	84.281	Ictalurus_punctatus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	96	79.195	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	78.914	ENSJJAG00000015811	Prpf38a	96	78.523	Jaculus_jaculus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	72	94.118	ENSKMAG00000006588	prpf38a	100	94.175	Kryptolebias_marmoratus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	80.511	ENSLACG00000011495	PRPF38A	96	80.201	Latimeria_chalumnae
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	91.290	ENSLOCG00000006262	prpf38a	95	92.203	Lepisosteus_oculatus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSLAFG00000025862	PRPF38A	96	79.195	Loxodonta_africana
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSMFAG00000039449	PRPF38A	96	79.195	Macaca_fascicularis
ENSLBEG00000020585	prpf38a	87	76.471	ENSMMUG00000014333	PRPF38A	93	73.643	Macaca_mulatta
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ENSLBEG00000020585	prpf38a	93	51.903	ENSMNEG00000040242	-	57	56.085	Macaca_nemestrina
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSMLEG00000041105	PRPF38A	96	79.195	Mandrillus_leucophaeus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	95.469	ENSMAMG00000015431	prpf38a	100	95.469	Mastacembelus_armatus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	94.498	ENSMZEG00005017838	prpf38a	100	94.498	Maylandia_zebra
ENSLBEG00000020585	prpf38a	75	86.147	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	99	79.530	Meleagris_gallopavo
ENSLBEG00000020585	prpf38a	85	81.061	ENSMAUG00000018029	-	84	81.900	Mesocricetus_auratus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSMICG00000014193	PRPF38A	96	79.195	Microcebus_murinus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSMOCG00000013080	Prpf38a	96	79.195	Microtus_ochrogaster
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	88.746	ENSMMOG00000016972	prpf38a	95	88.514	Mola_mola
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ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.233	MGP_CAROLIEiJ_G0026269	Prpf38a	96	78.859	Mus_caroli
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ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	78.914	MGP_SPRETEiJ_G0027238	Prpf38a	93	89.947	Mus_spretus
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	79.553	ENSMPUG00000006896	PRPF38A	96	79.195	Mustela_putorius_furo
ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	81.350	ENSNGAG00000011884	Prpf38a	96	79.195	Nannospalax_galili
ENSLBEG00000020585	prpf38a	72	91.892	ENSNBRG00000004013	prpf38a	94	86.395	Neolamprologus_brichardi
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ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	76.997	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	96	76.510	Notamacropus_eugenii
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ENSLBEG00000020585	prpf38a	75	44.635	ENSOANG00000009541	-	96	45.667	Ornithorhynchus_anatinus
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ENSLBEG00000020585	prpf38a	99	93.831	ENSORLG00015021393	prpf38a	99	93.831	Oryzias_latipes_hsok
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