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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSLBEG00000022399 (Gene tree)
Gene ID: 109988102
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Labrus_bergylta
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5296 bases
Position: chrFKLU01000006.1:422008-427303
Accession: 109988102
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLBEP00000029586	eRF1_2	PF03464.15	4e-31	1	1
ENSLBEP00000029611	eRF1_2	PF03464.15	4e-31	1	1
ENSLBEP00000029586	eRF1_3	PF03465.15	8.1e-26	1	1
ENSLBEP00000029611	eRF1_3	PF03465.15	8.5e-26	1	1
ENSLBEP00000029586	eRF1_1	PF03463.15	4.3e-52	1	1
ENSLBEP00000029611	eRF1_1	PF03463.15	7.6e-47	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLBET00000031011	-	1595	-	ENSLBEP00000029611	387 (aa)	-	-
ENSLBET00000030986	-	1586	XM_020639475	ENSLBEP00000029586	384 (aa)	XP_020495131	UPI0009B43442

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.779	ENSG00000152684	PELO	100	80.779	Homo_sapiens
ENSLBEG00000022399	pelo	64	93.522	ENSAPOG00000000616	pelo	90	93.522	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000022399	pelo	64	93.522	ENSAPOG00000023700	-	90	93.522	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	92.708	ENSAPOG00000023072	pelo	99	92.708	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	79.948	ENSAMEG00000007734	PELO	99	79.948	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLBEG00000022399	pelo	97	87.936	ENSACIG00000014386	pelo	97	93.195	Amphilophus_citrinellus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	92.969	ENSAOCG00000023717	pelo	99	92.969	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000022399	pelo	100	92.969	ENSAPEG00000011235	pelo	99	92.969	Amphiprion_percula
ENSLBEG00000022399	pelo	100	94.805	ENSATEG00000019550	pelo	100	94.805	Anabas_testudineus
ENSLBEG00000022399	pelo	77	71.044	ENSAPLG00000013265	PELO	99	71.044	Anas_platyrhynchos
ENSLBEG00000022399	pelo	98	80.533	ENSACAG00000004352	PELO	99	79.688	Anolis_carolinensis
ENSLBEG00000022399	pelo	100	79.948	ENSANAG00000014096	PELO	99	79.948	Aotus_nancymaae
ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.909	ENSACLG00000010305	pelo	100	90.909	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000022399	pelo	97	91.957	ENSAMXG00000020299	pelo	100	91.192	Astyanax_mexicanus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.779	ENSBTAG00000003268	PELO	99	80.779	Bos_taurus
ENSLBEG00000022399	pelo	99	59.843	WBGene00011280	pelo-1	100	59.843	Caenorhabditis_elegans
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSCJAG00000035190	PELO	99	80.208	Callithrix_jacchus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSCAFG00020023234	PELO	99	80.208	Canis_lupus_dingo
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.519	ENSCHIG00000016410	PELO	99	80.519	Capra_hircus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.729	ENSTSYG00000005203	PELO	99	80.729	Carlito_syrichta
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.729	ENSCPOG00000027406	PELO	99	80.729	Cavia_porcellus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSCCAG00000035600	PELO	99	80.208	Cebus_capucinus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSCATG00000011829	PELO	99	80.208	Cercocebus_atys
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSCLAG00000005043	PELO	99	80.208	Chinchilla_lanigera
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSCSAG00000016692	PELO	99	80.208	Chlorocebus_sabaeus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.469	ENSCHOG00000000523	PELO	99	80.469	Choloepus_hoffmanni
ENSLBEG00000022399	pelo	98	80.800	ENSCPBG00000007544	PELO	99	79.948	Chrysemys_picta_bellii
ENSLBEG00000022399	pelo	97	64.611	ENSCING00000001979	-	100	64.844	Ciona_intestinalis
ENSLBEG00000022399	pelo	100	65.885	ENSCSAVG00000006158	-	100	65.885	Ciona_savignyi
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSCANG00000023382	PELO	99	80.208	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLBEG00000022399	pelo	97	81.769	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	81.558	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLBEG00000022399	pelo	97	82.574	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.338	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLBEG00000022399	pelo	100	91.429	ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.429	Cynoglossus_semilaevis
ENSLBEG00000022399	pelo	100	91.169	ENSCVAG00000016082	pelo	100	91.169	Cyprinodon_variegatus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	89.610	ENSDARG00000055477	pelo	100	89.610	Danio_rerio
ENSLBEG00000022399	pelo	100	77.143	ENSDNOG00000036721	PELO	99	77.143	Dasypus_novemcinctus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.990	ENSDORG00000016689	Pelo	99	80.990	Dipodomys_ordii
ENSLBEG00000022399	pelo	96	67.297	FBgn0011207	pelo	96	66.406	Drosophila_melanogaster
ENSLBEG00000022399	pelo	71	77.778	ENSEBUG00000004955	pelo	99	77.778	Eptatretus_burgeri
ENSLBEG00000022399	pelo	100	79.948	ENSEASG00005013348	PELO	99	79.948	Equus_asinus_asinus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	91.406	ENSELUG00000023229	pelo	99	91.406	Esox_lucius
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSFCAG00000032341	PELO	99	80.208	Felis_catus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.469	ENSFALG00000004559	PELO	99	80.469	Ficedula_albicollis
ENSLBEG00000022399	pelo	74	82.042	ENSFDAG00000002076	PELO	88	82.042	Fukomys_damarensis
ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.909	ENSFHEG00000009769	pelo	100	90.909	Fundulus_heteroclitus
ENSLBEG00000022399	pelo	98	91.777	ENSGMOG00000005849	pelo	99	91.146	Gadus_morhua
ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.909	ENSGAFG00000019350	pelo	100	90.909	Gambusia_affinis
ENSLBEG00000022399	pelo	100	93.247	ENSGACG00000007245	pelo	97	97.802	Gasterosteus_aculeatus
ENSLBEG00000022399	pelo	98	80.800	ENSGAGG00000004018	PELO	99	79.948	Gopherus_agassizii
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSGGOG00000012635	PELO	99	80.208	Gorilla_gorilla
ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.909	ENSHBUG00000005866	pelo	100	90.909	Haplochromis_burtoni
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.729	ENSHGLG00000005932	PELO	99	80.729	Heterocephalus_glaber_female
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ENSLBEG00000022399	pelo	100	89.351	ENSIPUG00000020627	pelo	100	89.351	Ictalurus_punctatus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.729	ENSSTOG00000027378	PELO	99	80.729	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	78.646	ENSJJAG00000015032	Pelo	99	78.646	Jaculus_jaculus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	92.468	ENSKMAG00000021305	pelo	100	92.468	Kryptolebias_marmoratus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSLAFG00000020551	PELO	99	80.208	Loxodonta_africana
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ENSLBEG00000022399	pelo	97	94.370	ENSMAMG00000013260	pelo	100	93.766	Mastacembelus_armatus
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ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.469	ENSMICG00000044040	PELO	99	80.469	Microcebus_murinus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	81.250	ENSMOCG00000017554	Pelo	99	81.250	Microtus_ochrogaster
ENSLBEG00000022399	pelo	100	92.448	ENSMMOG00000001324	pelo	99	92.448	Mola_mola
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ENSLBEG00000022399	pelo	100	81.250	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	99	81.250	Mus_pahari
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.990	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	99	80.990	Mus_spretus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	81.510	ENSMLUG00000024132	PELO	100	81.510	Myotis_lucifugus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	81.558	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	81.558	Nannospalax_galili
ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.909	ENSNBRG00000011799	pelo	100	90.909	Neolamprologus_brichardi
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSNLEG00000035970	PELO	99	80.208	Nomascus_leucogenys
ENSLBEG00000022399	pelo	100	79.948	ENSMEUG00000005468	PELO	99	79.948	Notamacropus_eugenii
ENSLBEG00000022399	pelo	98	79.894	ENSOPRG00000018793	PELO	99	79.894	Ochotona_princeps
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.990	ENSODEG00000017579	PELO	99	80.990	Octodon_degus
ENSLBEG00000022399	pelo	97	91.375	ENSONIG00000011511	pelo	100	90.909	Oreochromis_niloticus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.729	ENSOCUG00000023902	PELO	99	80.729	Oryctolagus_cuniculus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.649	ENSORLG00000005827	pelo	100	90.649	Oryzias_latipes
ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.909	ENSORLG00020016456	pelo	100	90.909	Oryzias_latipes_hni
ENSLBEG00000022399	pelo	100	90.909	ENSORLG00015014447	pelo	100	90.909	Oryzias_latipes_hsok
ENSLBEG00000022399	pelo	100	91.429	ENSOMEG00000021567	pelo	100	91.429	Oryzias_melastigma
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.729	ENSOGAG00000027940	PELO	99	80.729	Otolemur_garnettii
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.779	ENSOARG00000008324	PELO	99	80.779	Ovis_aries
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSPPAG00000038951	PELO	99	80.208	Pan_paniscus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSPPRG00000018800	PELO	99	80.208	Panthera_pardus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSPTIG00000019988	PELO	99	80.208	Panthera_tigris_altaica
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.519	ENSPTRG00000034409	PELO	100	80.519	Pan_troglodytes
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSPANG00000010902	PELO	99	80.208	Papio_anubis
ENSLBEG00000022399	pelo	100	89.870	ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.870	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLBEG00000022399	pelo	98	81.067	ENSPSIG00000004971	PELO	99	80.208	Pelodiscus_sinensis
ENSLBEG00000022399	pelo	66	92.913	ENSPMGG00000014561	pelo	94	92.913	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	81.510	ENSPEMG00000015584	Pelo	99	81.510	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLBEG00000022399	pelo	99	81.201	ENSPCIG00000004880	PELO	99	81.201	Phascolarctos_cinereus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	91.169	ENSPFOG00000007277	pelo	100	91.169	Poecilia_formosa
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ENSLBEG00000022399	pelo	100	91.169	ENSPMEG00000016964	pelo	100	91.169	Poecilia_mexicana
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ENSLBEG00000022399	pelo	100	81.250	ENSRNOG00000061128	Pelo	99	81.250	Rattus_norvegicus
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSRBIG00000007299	PELO	99	80.208	Rhinopithecus_bieti
ENSLBEG00000022399	pelo	100	80.208	ENSRROG00000035507	PELO	99	80.208	Rhinopithecus_roxellana
ENSLBEG00000022399	pelo	97	33.158	YNL001W	-	97	33.158	Saccharomyces_cerevisiae
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