EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLBEG00000023218 (Gene tree)
Gene ID: 109993884
Gene Symbol: papolg
Alias: zgc:63762
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Labrus_bergylta
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 19166 bases
Position: chrFKLU01000270.1:202856-222021
Accession: 109993884
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLBEP00000030723	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.8e-29	1	2
ENSLBEP00000030723	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.8e-29	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLBET00000032137	-	4417	XM_020647005	ENSLBEP00000030723	867 (aa)	XP_020502661	UPI0009B35515

Gene Model

Click here to download ENSLBEG00000023218's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLBEG00000023218's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.374	ENSG00000115421	PAPOLG	100	86.752	Homo_sapiens
ENSLBEG00000023218	papolg	100	86.583	ENSAPOG00000004798	papolg	95	97.670	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000023218	papolg	97	68.597	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	69.241	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLBEG00000023218	papolg	89	80.387	ENSACIG00000010546	papolg	93	97.133	Amphilophus_citrinellus
ENSLBEG00000023218	papolg	100	86.353	ENSAOCG00000010254	papolg	100	86.468	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000023218	papolg	100	86.583	ENSAPEG00000006944	papolg	100	86.697	Amphiprion_percula
ENSLBEG00000023218	papolg	100	87.615	ENSATEG00000009007	papolg	100	87.615	Anabas_testudineus
ENSLBEG00000023218	papolg	88	64.820	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	72	79.221	Anas_platyrhynchos
ENSLBEG00000023218	papolg	73	57.053	ENSACAG00000015048	-	87	72.289	Anolis_carolinensis
ENSLBEG00000023218	papolg	98	67.990	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	67.990	Aotus_nancymaae
ENSLBEG00000023218	papolg	100	86.124	ENSACLG00000015592	papolg	100	85.436	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000023218	papolg	99	75.000	ENSAMXG00000004611	papolg	100	73.704	Astyanax_mexicanus
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.374	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	68.502	Bos_taurus
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.246	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	68.246	Callithrix_jacchus
ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.286	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	91	68.798	Canis_familiaris
ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.066	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	68.401	Canis_lupus_dingo
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.374	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	68.502	Capra_hircus
ENSLBEG00000023218	papolg	99	67.949	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	67.734	Carlito_syrichta
ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.502	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	68.286	Cavia_porcellus
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.246	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	68.374	Cebus_capucinus
ENSLBEG00000023218	papolg	90	80.952	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	80.952	Cercocebus_atys
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.582	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	68.582	Chinchilla_lanigera
ENSLBEG00000023218	papolg	98	67.990	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	67.990	Chlorocebus_sabaeus
ENSLBEG00000023218	papolg	89	66.619	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	66.334	Choloepus_hoffmanni
ENSLBEG00000023218	papolg	57	64.503	ENSCING00000024664	-	92	64.503	Ciona_intestinalis
ENSLBEG00000023218	papolg	56	65.155	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.155	Ciona_savignyi
ENSLBEG00000023218	papolg	98	67.990	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	67.990	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLBEG00000023218	papolg	88	67.839	ENSCGRG00001014951	Papolg	99	67.746	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLBEG00000023218	papolg	88	67.839	ENSCGRG00000005552	-	99	67.746	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLBEG00000023218	papolg	89	81.419	ENSCSEG00000000771	papolg	95	96.774	Cynoglossus_semilaevis
ENSLBEG00000023218	papolg	100	84.078	ENSCVAG00000016602	papolg	89	96.607	Cyprinodon_variegatus
ENSLBEG00000023218	papolg	99	77.001	ENSDARG00000012141	papolg	100	75.823	Danio_rerio
ENSLBEG00000023218	papolg	98	65.641	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	65.769	Dasypus_novemcinctus
ENSLBEG00000023218	papolg	89	56.705	ENSETEG00000011815	PAPOLG	100	56.433	Echinops_telfairi
ENSLBEG00000023218	papolg	51	72.396	ENSEBUG00000004020	papolg	96	69.100	Eptatretus_burgeri
ENSLBEG00000023218	papolg	53	58.952	ENSEBUG00000005042	-	78	58.952	Eptatretus_burgeri
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.072	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	67.980	Equus_asinus_asinus
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.072	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	68.159	Equus_caballus
ENSLBEG00000023218	papolg	89	60.591	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	60.179	Erinaceus_europaeus
ENSLBEG00000023218	papolg	97	67.939	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	67.939	Felis_catus
ENSLBEG00000023218	papolg	88	58.648	ENSFALG00000011079	PAPOLG	82	72.575	Ficedula_albicollis
ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.367	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	68.495	Fukomys_damarensis
ENSLBEG00000023218	papolg	65	80.354	ENSFHEG00000019080	papolg	97	78.938	Fundulus_heteroclitus
ENSLBEG00000023218	papolg	75	93.548	ENSGMOG00000018772	papolg	94	93.548	Gadus_morhua
ENSLBEG00000023218	papolg	88	62.096	ENSGALG00000007853	PAPOLG	84	76.306	Gallus_gallus
ENSLBEG00000023218	papolg	100	82.454	ENSGAFG00000003263	papolg	100	81.766	Gambusia_affinis
ENSLBEG00000023218	papolg	89	87.018	ENSGACG00000002718	papolg	100	87.018	Gasterosteus_aculeatus
ENSLBEG00000023218	papolg	98	67.990	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	68.118	Gorilla_gorilla
ENSLBEG00000023218	papolg	100	86.124	ENSHBUG00000004882	papolg	100	85.321	Haplochromis_burtoni
ENSLBEG00000023218	papolg	97	68.509	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	68.159	Heterocephalus_glaber_female
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.327	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	67.980	Heterocephalus_glaber_male
ENSLBEG00000023218	papolg	100	83.793	ENSHCOG00000006782	papolg	100	83.793	Hippocampus_comes
ENSLBEG00000023218	papolg	99	75.412	ENSIPUG00000021642	papolg	97	88.632	Ictalurus_punctatus
ENSLBEG00000023218	papolg	98	67.734	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	68.072	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLBEG00000023218	papolg	100	83.753	ENSKMAG00000016439	papolg	90	94.296	Kryptolebias_marmoratus
ENSLBEG00000023218	papolg	96	63.427	ENSLACG00000009543	PAPOLG	99	62.692	Latimeria_chalumnae
ENSLBEG00000023218	papolg	97	76.620	ENSLOCG00000016130	papolg	100	76.403	Lepisosteus_oculatus
ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.750	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.082	Loxodonta_africana
ENSLBEG00000023218	papolg	98	67.734	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	68.118	Macaca_fascicularis
ENSLBEG00000023218	papolg	98	67.734	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	68.118	Macaca_mulatta
ENSLBEG00000023218	papolg	98	61.019	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	61.401	Macaca_nemestrina
ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.246	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	68.374	Mandrillus_leucophaeus
ENSLBEG00000023218	papolg	100	86.468	ENSMAMG00000010667	papolg	95	96.619	Mastacembelus_armatus
ENSLBEG00000023218	papolg	100	86.124	ENSMZEG00005018140	papolg	100	85.436	Maylandia_zebra
ENSLBEG00000023218	papolg	88	62.452	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	86	75.791	Meleagris_gallopavo
ENSLBEG00000023218	papolg	88	69.351	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	68.872	Mesocricetus_auratus
ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.199	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	68.072	Microcebus_murinus
ENSLBEG00000023218	papolg	89	68.462	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	68.025	Microtus_ochrogaster
ENSLBEG00000023218	papolg	99	85.550	ENSMMOG00000008020	papolg	89	94.737	Mola_mola
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.961	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	68.482	Monodelphis_domestica
ENSLBEG00000023218	papolg	100	86.468	ENSMALG00000007012	papolg	100	86.468	Monopterus_albus
ENSLBEG00000023218	papolg	89	68.798	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	86.150	Mus_caroli
ENSLBEG00000023218	papolg	89	67.949	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	86.150	Mus_musculus
ENSLBEG00000023218	papolg	89	68.286	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	67.944	Mus_pahari
ENSLBEG00000023218	papolg	89	68.077	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	86.150	Mus_spretus
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.286	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	68.798	Mustela_putorius_furo
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.620	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	68.140	Myotis_lucifugus
ENSLBEG00000023218	papolg	89	68.414	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	68.159	Nannospalax_galili
ENSLBEG00000023218	papolg	89	76.350	ENSNBRG00000011943	papolg	99	75.450	Neolamprologus_brichardi
ENSLBEG00000023218	papolg	53	69.108	ENSMEUG00000013605	-	67	69.108	Notamacropus_eugenii
ENSLBEG00000023218	papolg	99	67.519	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	67.176	Ochotona_princeps
ENSLBEG00000023218	papolg	89	78.489	ENSONIG00000002985	papolg	100	77.465	Oreochromis_niloticus
ENSLBEG00000023218	papolg	98	69.211	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	69.161	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLBEG00000023218	papolg	89	67.734	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	67.344	Oryctolagus_cuniculus
ENSLBEG00000023218	papolg	100	83.276	ENSORLG00000001577	papolg	100	83.047	Oryzias_latipes
ENSLBEG00000023218	papolg	100	83.047	ENSORLG00020002482	papolg	100	83.162	Oryzias_latipes_hni
ENSLBEG00000023218	papolg	100	83.276	ENSORLG00015008836	papolg	100	83.047	Oryzias_latipes_hsok
ENSLBEG00000023218	papolg	100	84.060	ENSOMEG00000001406	papolg	100	84.404	Oryzias_melastigma
ENSLBEG00000023218	papolg	62	56.356	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	55.462	Otolemur_garnettii
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.374	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	68.502	Ovis_aries
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.374	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	68.374	Pan_paniscus
ENSLBEG00000023218	papolg	97	67.939	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	67.939	Panthera_pardus
ENSLBEG00000023218	papolg	97	67.812	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	67.812	Panthera_tigris_altaica
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.374	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	68.374	Pan_troglodytes
ENSLBEG00000023218	papolg	98	64.496	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	64.879	Papio_anubis
ENSLBEG00000023218	papolg	95	74.621	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	73.793	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLBEG00000023218	papolg	99	73.004	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.959	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLBEG00000023218	papolg	96	66.364	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	93	81.006	Pelodiscus_sinensis
ENSLBEG00000023218	papolg	88	68.229	ENSPEMG00000008960	-	99	68.135	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLBEG00000023218	papolg	88	52.799	ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.490	Petromyzon_marinus
ENSLBEG00000023218	papolg	58	63.944	ENSPMAG00000004864	-	99	63.944	Petromyzon_marinus
ENSLBEG00000023218	papolg	99	69.093	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	68.274	Phascolarctos_cinereus
ENSLBEG00000023218	papolg	100	83.620	ENSPFOG00000012909	papolg	100	83.505	Poecilia_formosa
ENSLBEG00000023218	papolg	100	83.601	ENSPLAG00000018445	papolg	100	83.372	Poecilia_latipinna
ENSLBEG00000023218	papolg	100	82.683	ENSPMEG00000003961	papolg	100	83.505	Poecilia_mexicana
ENSLBEG00000023218	papolg	100	83.162	ENSPREG00000010358	papolg	100	83.162	Poecilia_reticulata
ENSLBEG00000023218	papolg	98	67.949	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	67.949	Pongo_abelii
ENSLBEG00000023218	papolg	88	61.818	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	99	61.429	Procavia_capensis
ENSLBEG00000023218	papolg	89	62.051	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	62.008	Propithecus_coquereli
ENSLBEG00000023218	papolg	75	80.859	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	80.859	Pteropus_vampyrus
ENSLBEG00000023218	papolg	100	86.124	ENSPNYG00000006729	papolg	95	96.953	Pundamilia_nyererei
ENSLBEG00000023218	papolg	99	75.349	ENSPNAG00000015521	papolg	100	74.177	Pygocentrus_nattereri
ENSLBEG00000023218	papolg	89	68.798	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	67.985	Rattus_norvegicus
ENSLBEG00000023218	papolg	98	63.636	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	63.415	Rhinopithecus_bieti
ENSLBEG00000023218	papolg	98	67.990	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	67.779	Rhinopithecus_roxellana
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.077	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	68.462	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLBEG00000023218	papolg	94	68.792	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	68.280	Sarcophilus_harrisii
ENSLBEG00000023218	papolg	89	64.691	ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.433	Scleropages_formosus
ENSLBEG00000023218	papolg	89	72.173	ENSSFOG00015002383	papolg	94	85.816	Scleropages_formosus
ENSLBEG00000023218	papolg	98	86.921	ENSSMAG00000015598	papolg	100	87.100	Scophthalmus_maximus
ENSLBEG00000023218	papolg	100	87.156	ENSSDUG00000000912	papolg	95	97.849	Seriola_dumerili
ENSLBEG00000023218	papolg	100	87.385	ENSSLDG00000001217	papolg	95	93.202	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLBEG00000023218	papolg	88	67.617	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	74	82.617	Sphenodon_punctatus
ENSLBEG00000023218	papolg	100	88.532	ENSSPAG00000009004	papolg	94	97.670	Stegastes_partitus
ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.670	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	68.414	Sus_scrofa
ENSLBEG00000023218	papolg	61	72.556	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	72.556	Taeniopygia_guttata
ENSLBEG00000023218	papolg	89	81.057	ENSTRUG00000006410	papolg	94	93.772	Takifugu_rubripes
ENSLBEG00000023218	papolg	89	77.313	ENSTNIG00000017106	papolg	100	77.001	Tetraodon_nigroviridis
ENSLBEG00000023218	papolg	96	62.596	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	62.339	Tupaia_belangeri
ENSLBEG00000023218	papolg	99	64.322	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	64.578	Tursiops_truncatus
ENSLBEG00000023218	papolg	98	68.031	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	99	69.481	Ursus_americanus
ENSLBEG00000023218	papolg	96	69.091	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	69.481	Ursus_maritimus
ENSLBEG00000023218	papolg	97	65.077	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	65.032	Vicugna_pacos
ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.286	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	68.798	Vulpes_vulpes
ENSLBEG00000023218	papolg	89	66.879	ENSXETG00000002208	papolg	99	66.115	Xenopus_tropicalis
ENSLBEG00000023218	papolg	58	96.600	ENSXCOG00000006611	papolg	73	96.600	Xiphophorus_couchianus
ENSLBEG00000023218	papolg	64	94.012	ENSXMAG00000007383	papolg	96	94.012	Xiphophorus_maculatus