EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLBEG00000024952 (Gene tree)
Gene ID: 109989770
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Labrus_bergylta
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 15544 bases
Position: chrFKLU01000169.1:96928-112471
Accession: 109989770
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLBEP00000033174	IBN_N	PF03810.19	3.4e-16	1	1
ENSLBEP00000033126	IBN_N	PF03810.19	3.4e-16	1	1
ENSLBEP00000033229	IBN_N	PF03810.19	3.2e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLBET00000034639	-	4626	XM_020641636	ENSLBEP00000033174	1087 (aa)	XP_020497292	UPI0009B3ADBB
ENSLBET00000034694	-	3234	-	ENSLBEP00000033229	1077 (aa)	-	-
ENSLBET00000034590	-	4279	-	ENSLBEP00000033126	1088 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.981	ENSG00000196497	IPO4	99	45.120	Homo_sapiens
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	81.325	ENSAPOG00000019018	ipo4	100	81.417	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.911	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	43.646	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	80.992	ENSACIG00000004246	ipo4	100	80.992	Amphilophus_citrinellus
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	85.229	ENSAOCG00000004773	ipo4	100	85.229	Amphiprion_ocellaris
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	85.413	ENSAPEG00000002112	ipo4	100	85.413	Amphiprion_percula
ENSLBEG00000024952	ipo4	92	87.090	ENSATEG00000017082	ipo4	99	87.090	Anabas_testudineus
ENSLBEG00000024952	ipo4	85	45.887	ENSACAG00000003973	-	97	46.645	Anolis_carolinensis
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.517	ENSANAG00000037973	IPO4	100	44.556	Aotus_nancymaae
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	80.865	ENSACLG00000019742	ipo4	100	80.865	Astatotilapia_calliptera
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	70.653	ENSAMXG00000037878	ipo4	100	70.653	Astyanax_mexicanus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.819	ENSBTAG00000002707	IPO4	99	43.370	Bos_taurus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.167	ENSCJAG00000006937	IPO4	100	45.105	Callithrix_jacchus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.251	ENSCAFG00000012049	IPO4	99	45.120	Canis_familiaris
ENSLBEG00000024952	ipo4	98	44.940	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	44.022	Canis_lupus_dingo
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.227	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	43.871	Capra_hircus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.507	ENSTSYG00000002643	IPO4	99	44.475	Carlito_syrichta
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.465	ENSCPOG00000014783	IPO4	99	44.373	Cavia_porcellus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.074	ENSCCAG00000037929	IPO4	100	45.014	Cebus_capucinus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.074	ENSCATG00000040395	IPO4	100	44.922	Cercocebus_atys
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.742	ENSCLAG00000012817	IPO4	99	44.659	Chinchilla_lanigera
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.163	ENSCPBG00000025757	IPO4	99	43.070	Chrysemys_picta_bellii
ENSLBEG00000024952	ipo4	93	36.735	ENSCING00000008639	-	99	37.379	Ciona_intestinalis
ENSLBEG00000024952	ipo4	94	37.118	ENSCSAVG00000011482	-	99	37.476	Ciona_savignyi
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.888	ENSCANG00000029513	IPO4	100	44.739	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.410	ENSCGRG00001001217	Ipo4	99	43.514	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.410	ENSCGRG00000014404	Ipo4	99	43.514	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	76.951	ENSCSEG00000009606	ipo4	100	77.227	Cynoglossus_semilaevis
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	75.346	ENSCVAG00000002281	ipo4	100	75.296	Cyprinodon_variegatus
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	73.829	ENSDARG00000041493	ipo4	100	74.013	Danio_rerio
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.018	ENSDNOG00000000366	IPO4	99	44.618	Dasypus_novemcinctus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.972	ENSDORG00000009274	Ipo4	99	45.018	Dipodomys_ordii
ENSLBEG00000024952	ipo4	93	30.414	FBgn0042177	CG32164	93	30.518	Drosophila_melanogaster
ENSLBEG00000024952	ipo4	93	30.397	FBgn0042178	CG32165	93	30.116	Drosophila_melanogaster
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.026	ENSETEG00000018381	IPO4	99	43.538	Echinops_telfairi
ENSLBEG00000024952	ipo4	91	45.233	ENSEASG00005011954	IPO4	96	46.053	Equus_asinus_asinus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.742	ENSECAG00000009909	IPO4	99	44.843	Equus_caballus
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	74.771	ENSELUG00000020628	ipo4	100	74.862	Esox_lucius
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.111	ENSFCAG00000005587	IPO4	99	44.751	Felis_catus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	40.951	ENSFDAG00000000725	IPO4	99	40.876	Fukomys_damarensis
ENSLBEG00000024952	ipo4	89	80.759	ENSFHEG00000009351	ipo4	98	81.030	Fundulus_heteroclitus
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	77.859	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	77.768	Gadus_morhua
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	79.377	ENSGAFG00000005601	ipo4	100	79.377	Gambusia_affinis
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	82.061	ENSGACG00000002276	ipo4	99	82.061	Gasterosteus_aculeatus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.074	ENSGGOG00000016062	IPO4	100	44.922	Gorilla_gorilla
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	81.601	ENSHBUG00000023269	ipo4	100	81.618	Haplochromis_burtoni
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.280	ENSHGLG00000002923	IPO4	99	44.383	Heterocephalus_glaber_female
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.096	ENSHGLG00100003725	IPO4	99	44.199	Heterocephalus_glaber_male
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	77.516	ENSHCOG00000016854	ipo4	99	77.516	Hippocampus_comes
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	73.781	ENSIPUG00000001185	ipo4	100	73.689	Ictalurus_punctatus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.480	ENSSTOG00000002288	IPO4	99	45.295	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.744	ENSJJAG00000019002	Ipo4	99	44.710	Jaculus_jaculus
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	79.982	ENSKMAG00000004627	ipo4	100	79.982	Kryptolebias_marmoratus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	49.819	ENSLACG00000001428	IPO4	99	49.910	Latimeria_chalumnae
ENSLBEG00000024952	ipo4	79	67.775	ENSLOCG00000001149	ipo4	85	67.519	Lepisosteus_oculatus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.761	ENSLAFG00000015852	IPO4	99	44.536	Loxodonta_africana
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.074	ENSMFAG00000000743	IPO4	100	44.922	Macaca_fascicularis
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.074	ENSMMUG00000012481	IPO4	100	44.922	Macaca_mulatta
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.981	ENSMNEG00000043531	IPO4	100	44.831	Macaca_nemestrina
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.074	ENSMLEG00000042067	IPO4	100	44.922	Mandrillus_leucophaeus
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	82.521	ENSMAMG00000021976	ipo4	100	82.613	Mastacembelus_armatus
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	81.693	ENSMZEG00005017273	ipo4	100	81.710	Maylandia_zebra
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.373	ENSMAUG00000017565	Ipo4	99	43.934	Mesocricetus_auratus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.438	ENSMICG00000001719	IPO4	99	44.977	Microcebus_murinus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.331	ENSMOCG00000020462	Ipo4	99	44.444	Microtus_ochrogaster
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	82.768	ENSMMOG00000005264	ipo4	99	83.104	Mola_mola
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.911	ENSMODG00000003337	IPO4	96	43.727	Monodelphis_domestica
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	81.651	ENSMALG00000001587	ipo4	100	81.743	Monopterus_albus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.026	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	46.144	Mus_caroli
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.566	ENSMUSG00000002319	Ipo4	99	45.700	Mus_musculus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.727	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	98	45.916	Mus_pahari
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.871	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	99	45.946	Mus_spretus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.664	ENSMPUG00000005916	IPO4	99	45.387	Mustela_putorius_furo
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.066	ENSMLUG00000025277	IPO4	86	44.526	Myotis_lucifugus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.742	ENSNGAG00000019340	Ipo4	99	44.742	Nannospalax_galili
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	84.637	ENSNBRG00000005870	ipo4	100	84.637	Neolamprologus_brichardi
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.120	ENSOPRG00000016615	IPO4	99	45.212	Ochotona_princeps
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.465	ENSODEG00000002609	IPO4	99	44.199	Octodon_degus
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	84.821	ENSONIG00000014574	ipo4	100	84.821	Oreochromis_niloticus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.526	ENSOCUG00000002881	IPO4	99	44.618	Oryctolagus_cuniculus
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	76.525	ENSORLG00000006457	ipo4	99	79.139	Oryzias_latipes
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	78.401	ENSORLG00020004286	ipo4	100	78.217	Oryzias_latipes_hni
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	78.676	ENSORLG00015021856	ipo4	100	78.493	Oryzias_latipes_hsok
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	77.509	ENSOMEG00000016203	ipo4	100	77.206	Oryzias_melastigma
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.669	ENSOGAG00000010642	IPO4	100	43.824	Otolemur_garnettii
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.361	ENSOARG00000019188	IPO4	99	43.097	Ovis_aries
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.610	ENSPPAG00000035476	IPO4	100	44.465	Pan_paniscus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.295	ENSPPRG00000023607	IPO4	99	44.936	Panthera_pardus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.203	ENSPTIG00000008720	IPO4	99	44.843	Panthera_tigris_altaica
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.888	ENSPTRG00000006200	IPO4	100	44.739	Pan_troglodytes
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.981	ENSPANG00000026278	IPO4	100	44.831	Papio_anubis
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	66.514	ENSPKIG00000007830	ipo4	100	67.155	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	68.018	ENSPKIG00000007683	-	99	67.709	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	72.569	ENSPMGG00000020871	ipo4	100	71.650	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	42.949	ENSPEMG00000016160	Ipo4	99	43.199	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLBEG00000024952	ipo4	96	46.087	ENSPCIG00000010718	IPO4	98	46.339	Phascolarctos_cinereus
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	79.358	ENSPFOG00000009255	ipo4	100	79.633	Poecilia_formosa
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	79.450	ENSPLAG00000020556	ipo4	100	79.725	Poecilia_latipinna
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	79.358	ENSPMEG00000013102	ipo4	100	79.633	Poecilia_mexicana
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	79.266	ENSPREG00000017605	ipo4	100	79.541	Poecilia_reticulata
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.981	ENSPPYG00000005688	IPO4	100	44.922	Pongo_abelii
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	45.531	ENSPCAG00000015669	IPO4	99	45.496	Procavia_capensis
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.600	ENSPCOG00000015319	IPO4	99	44.147	Propithecus_coquereli
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.507	ENSPVAG00000010755	IPO4	99	45.028	Pteropus_vampyrus
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	83.073	ENSPNYG00000021414	ipo4	100	83.073	Pundamilia_nyererei
ENSLBEG00000024952	ipo4	100	74.793	ENSPNAG00000027964	ipo4	100	74.977	Pygocentrus_nattereri
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	43.911	ENSRNOG00000019553	Ipo4	99	44.199	Rattus_norvegicus
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.796	ENSRBIG00000027704	IPO4	100	44.648	Rhinopithecus_bieti
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.888	ENSRROG00000011492	IPO4	100	44.739	Rhinopithecus_roxellana
ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.145	ENSSBOG00000020162	IPO4	100	44.099	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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