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Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000000504 (Gene tree)
Gene ID: 102696380
Gene Symbol: AGO1
Alias: Ago1|eif2c1|si:ch211-119n15.3
Full Name: protein argonaute-1
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30240 bases
Position: chrLG6:23747-53986
Accession: 102696380
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000000559	PAZ	PF02170.22	7.2e-29	1	1
ENSLOCP00000000604	PAZ	PF02170.22	1.6e-28	1	1
ENSLOCP00000000604	Piwi	PF02171.17	9.2e-114	1	1
ENSLOCP00000000559	Piwi	PF02171.17	9.3e-114	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000000605	AGO1-202	2925	-	ENSLOCP00000000604	858 (aa)	-	W5LWU7
ENSLOCT00000000560	AGO1-201	2925	-	ENSLOCP00000000559	858 (aa)	XP_015204000	W5LWQ2

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	83.678	ENSLOCG00000000584	ago4	99	83.678
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	83.433	ENSLOCG00000007766	ago2	98	82.941

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSG00000092847	AGO1	100	94.501	Homo_sapiens
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	ENSAPOG00000024299	ago1	100	94.755	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSAMEG00000000504	AGO1	100	94.056	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLOCG00000000504	AGO1	82	88.889	ENSACIG00000005298	ago1	98	88.889	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	ENSAOCG00000017727	ago1	100	94.755	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	ENSAPEG00000004458	ago1	100	94.755	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	ENSATEG00000008523	ago1	100	94.755	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	87.471	ENSAPLG00000010440	AGO1	99	87.471	Anas_platyrhynchos
ENSLOCG00000000504	AGO1	91	94.373	ENSACAG00000029174	AGO1	100	94.373	Anolis_carolinensis
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	93.925	ENSANAG00000037711	AGO1	100	94.056	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.522	ENSACLG00000000890	ago1	100	94.522	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000000504	AGO1	80	94.898	ENSAMXG00000001917	ago1	98	94.898	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSBTAG00000012253	AGO1	100	94.056	Bos_taurus
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.340	ENSCJAG00000032023	AGO1	100	94.056	Callithrix_jacchus
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSCAFG00000003443	AGO1	100	94.056	Canis_familiaris
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	93.655	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	94.174	Canis_lupus_dingo
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	93.986	ENSCHIG00000011848	-	100	93.279	Capra_hircus
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	73.893	ENSTSYG00000032426	-	100	73.893	Carlito_syrichta
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.340	ENSTSYG00000009767	-	100	94.056	Carlito_syrichta
ENSLOCG00000000504	AGO1	89	87.785	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	86.875	Cavia_aperea
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSCPOG00000011568	AGO1	100	94.056	Cavia_porcellus
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSCCAG00000011823	AGO1	100	94.056	Cebus_capucinus
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	93.706	ENSCATG00000031521	AGO1	100	94.501	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.340	ENSCLAG00000011507	AGO1	100	94.056	Chinchilla_lanigera
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSCSAG00000001091	AGO1	100	94.056	Chlorocebus_sabaeus
ENSLOCG00000000504	AGO1	85	88.372	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	88.372	Choloepus_hoffmanni
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	93.939	ENSCPBG00000018594	AGO1	100	93.939	Chrysemys_picta_bellii
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSCANG00000039798	AGO1	100	94.056	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.118	ENSCGRG00001022708	Ago1	100	94.056	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.340	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	94.340	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	93.039	ENSCSEG00000001051	ago1	99	93.039	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.522	ENSCVAG00000018173	ago1	100	94.522	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.289	ENSDARG00000092644	ago1	100	94.289	Danio_rerio
ENSLOCG00000000504	AGO1	91	94.501	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	94.501	Dasypus_novemcinctus
ENSLOCG00000000504	AGO1	90	95.097	ENSDORG00000008494	Ago1	100	95.273	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000000504	AGO1	82	88.967	ENSETEG00000007626	AGO1	100	88.366	Echinops_telfairi
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.340	ENSEASG00005012086	AGO1	100	94.056	Equus_asinus_asinus
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSECAG00000024353	AGO1	100	94.056	Equus_caballus
ENSLOCG00000000504	AGO1	92	86.150	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	86.150	Erinaceus_europaeus
ENSLOCG00000000504	AGO1	91	94.757	ENSELUG00000016803	ago1	100	94.757	Esox_lucius
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSFCAG00000000746	AGO1	100	94.056	Felis_catus
ENSLOCG00000000504	AGO1	91	88.010	ENSFALG00000000790	AGO1	100	88.010	Ficedula_albicollis
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.172	ENSFDAG00000017210	AGO1	100	94.172	Fukomys_damarensis
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	90.909	ENSFHEG00000017927	ago1	99	90.909	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000000504	AGO1	87	82.377	ENSGMOG00000019413	ago1	100	82.377	Gadus_morhua
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.543	ENSGALG00000002249	AGO1	100	93.939	Gallus_gallus
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	ENSGAFG00000009775	ago1	100	94.755	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000000504	AGO1	87	94.541	ENSGACG00000012443	ago1	100	94.541	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000000504	AGO1	91	94.373	ENSGAGG00000012893	-	100	94.373	Gopherus_agassizii
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	93.590	ENSGGOG00000003316	AGO1	100	94.056	Gorilla_gorilla
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.522	ENSHBUG00000010459	ago1	100	94.522	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.340	ENSHGLG00000011540	AGO1	100	94.056	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.340	ENSHGLG00100005568	AGO1	100	94.056	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.805	ENSHCOG00000005708	ago1	99	94.805	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.639	ENSIPUG00000023216	ago1	100	94.639	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	93.794	ENSSTOG00000010857	AGO1	100	94.056	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.056	ENSJJAG00000019449	Ago1	100	94.056	Jaculus_jaculus
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	ENSKMAG00000019464	ago1	100	94.755	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	ENSLBEG00000007694	ago1	100	94.755	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	88.575	ENSLACG00000017009	AGO1	99	88.575	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.118	ENSLAFG00000010835	AGO1	100	94.118	Loxodonta_africana
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSMFAG00000002846	AGO1	100	94.056	Macaca_fascicularis
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	89.777	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	90.273	Macaca_mulatta
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	90.559	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	94.501	Macaca_nemestrina
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSMLEG00000038388	AGO1	100	94.056	Mandrillus_leucophaeus
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	ENSMAMG00000008381	ago1	100	94.755	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.522	ENSMZEG00005007996	ago1	100	94.522	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	88.889	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	88.889	Meleagris_gallopavo
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSMAUG00000015189	Ago1	100	94.056	Mesocricetus_auratus
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	93.925	ENSMICG00000016147	AGO1	100	94.056	Microcebus_murinus
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.543	ENSMOCG00000000537	Ago1	100	93.939	Microtus_ochrogaster
ENSLOCG00000000504	AGO1	78	94.627	ENSMMOG00000018459	ago1	93	94.627	Mola_mola
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	93.823	ENSMODG00000023335	AGO1	100	93.823	Monodelphis_domestica
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.687	ENSMALG00000011057	ago1	99	94.687	Monopterus_albus
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	94.056	Mus_caroli
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	94.056	Mus_musculus
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	94.056	Mus_pahari
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	94.056	Mus_spretus
ENSLOCG00000000504	AGO1	84	94.290	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	94.290	Mustela_putorius_furo
ENSLOCG00000000504	AGO1	61	95.793	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	95.793	Myotis_lucifugus
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	93.939	ENSNGAG00000017448	Ago1	100	93.939	Nannospalax_galili
ENSLOCG00000000504	AGO1	91	94.757	ENSNBRG00000010867	ago1	100	94.757	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.056	ENSNLEG00000011181	AGO1	100	94.056	Nomascus_leucogenys
ENSLOCG00000000504	AGO1	84	88.571	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	88.571	Notamacropus_eugenii
ENSLOCG00000000504	AGO1	91	91.185	ENSOPRG00000012325	AGO1	93	91.185	Ochotona_princeps
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	92.841	ENSODEG00000005321	AGO1	100	94.056	Octodon_degus
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.471	ENSONIG00000016345	ago1	100	94.471	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	85.484	ENSOANG00000002080	AGO1	100	86.179	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.543	ENSOCUG00000023116	AGO1	100	93.939	Oryctolagus_cuniculus
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	ENSORLG00000014965	ago1	100	94.755	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	ENSORLG00020018253	ago1	100	94.755	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	ENSORLG00015003287	ago1	100	94.755	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	ENSOMEG00000020528	ago1	100	94.755	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	93.911	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	93.911	Otolemur_garnettii
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSOARG00000019591	AGO1	100	94.056	Ovis_aries
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	93.590	ENSPPAG00000034838	AGO1	100	94.056	Pan_paniscus
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSPPRG00000006475	AGO1	100	94.056	Panthera_pardus
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.425	ENSPTIG00000020991	AGO1	100	93.823	Panthera_tigris_altaica
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	93.590	ENSPTRG00000000528	AGO1	100	94.056	Pan_troglodytes
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSPANG00000009060	AGO1	100	94.056	Papio_anubis
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	93.705	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	93.705	Pelodiscus_sinensis
ENSLOCG00000000504	AGO1	80	94.331	ENSPMGG00000024099	ago1	98	94.331	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLOCG00000000504	AGO1	99	93.801	ENSPEMG00000023313	Ago1	100	94.056	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	93.823	ENSPCIG00000000172	AGO1	100	93.823	Phascolarctos_cinereus
ENSLOCG00000000504	AGO1	100	97.436	ENSPFOG00000005867	ago1	100	97.436	Poecilia_formosa
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ENSLOCG00000000504	AGO1	100	94.755	ENSPREG00000006534	ago1	100	94.755	Poecilia_reticulata
ENSLOCG00000000504	AGO1	98	94.662	ENSPPYG00000001551	AGO1	100	94.056	Pongo_abelii
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