EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000001149 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ipo4
Alias: si:ch211-196f5.1
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 24148 bases
Position: chrJH591418.1:433051-457198
Accession: 102692990
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000001308	IBN_N	PF03810.19	1.8e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000001313	-	2891	XM_006642984	ENSLOCP00000001308	954 (aa)	-	W5LYV1

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.354	ENSG00000196497	IPO4	90	36.559	Homo_sapiens
ENSLOCG00000001149	ipo4	83	69.898	ENSAPOG00000019018	ipo4	77	70.918	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000001149	ipo4	84	47.423	ENSAMEG00000016271	IPO4	65	47.423	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	68.031	ENSACIG00000004246	ipo4	76	67.775	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	69.643	ENSAOCG00000004773	ipo4	79	70.663	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	69.643	ENSAPEG00000002112	ipo4	79	70.663	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000001149	ipo4	80	71.726	ENSATEG00000017082	ipo4	80	73.214	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000001149	ipo4	54	54.545	ENSACAG00000003973	-	67	54.545	Anolis_carolinensis
ENSLOCG00000001149	ipo4	77	50.148	ENSANAG00000037973	IPO4	90	34.409	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	69.054	ENSACLG00000019742	ipo4	78	70.077	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000001149	ipo4	100	51.194	ENSAMXG00000037878	ipo4	77	68.638	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	47.680	ENSBTAG00000002707	IPO4	76	47.680	Bos_taurus
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.090	ENSCJAG00000006937	IPO4	90	35.484	Callithrix_jacchus
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	48.413	ENSCAFG00000012049	IPO4	75	48.196	Canis_familiaris
ENSLOCG00000001149	ipo4	80	48.518	ENSCAFG00020002873	IPO4	73	48.518	Canis_lupus_dingo
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.619	ENSCHIG00000009413	IPO4	73	47.680	Capra_hircus
ENSLOCG00000001149	ipo4	83	45.980	ENSTSYG00000002643	IPO4	90	37.634	Carlito_syrichta
ENSLOCG00000001149	ipo4	83	46.907	ENSCPOG00000014783	IPO4	76	46.907	Cavia_porcellus
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	49.300	ENSCCAG00000037929	IPO4	79	45.833	Cebus_capucinus
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	48.148	ENSCATG00000040395	IPO4	90	36.559	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	48.196	ENSCLAG00000012817	IPO4	75	48.196	Chinchilla_lanigera
ENSLOCG00000001149	ipo4	78	50.129	ENSCPBG00000025757	IPO4	74	50.129	Chrysemys_picta_bellii
ENSLOCG00000001149	ipo4	83	33.097	ENSCING00000008639	-	81	33.176	Ciona_intestinalis
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	34.048	ENSCSAVG00000011482	-	79	34.232	Ciona_savignyi
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.090	ENSCANG00000029513	IPO4	90	35.484	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLOCG00000001149	ipo4	84	44.010	ENSCGRG00001001217	Ipo4	77	44.743	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000001149	ipo4	84	44.010	ENSCGRG00000014404	Ipo4	77	44.743	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	60.814	ENSCSEG00000009606	ipo4	79	60.814	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000001149	ipo4	83	64.000	ENSCVAG00000002281	ipo4	79	64.010	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000001149	ipo4	100	51.981	ENSDARG00000041493	ipo4	79	73.214	Danio_rerio
ENSLOCG00000001149	ipo4	84	47.794	ENSDNOG00000000366	IPO4	77	47.794	Dasypus_novemcinctus
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	48.148	ENSDORG00000009274	Ipo4	75	48.196	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000001149	ipo4	84	45.833	ENSETEG00000018381	IPO4	76	45.833	Echinops_telfairi
ENSLOCG00000001149	ipo4	78	48.196	ENSEASG00005011954	IPO4	77	48.196	Equus_asinus_asinus
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	47.938	ENSECAG00000009909	IPO4	75	47.938	Equus_caballus
ENSLOCG00000001149	ipo4	77	72.449	ENSELUG00000020628	ipo4	78	72.449	Esox_lucius
ENSLOCG00000001149	ipo4	84	47.549	ENSFCAG00000005587	IPO4	90	41.935	Felis_catus
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	43.734	ENSFDAG00000000725	IPO4	75	43.734	Fukomys_damarensis
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	65.140	ENSFHEG00000009351	ipo4	77	66.158	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	72.010	ENSGMOG00000001801	ipo4	78	72.010	Gadus_morhua
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	64.031	ENSGAFG00000005601	ipo4	79	65.473	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	67.857	ENSGACG00000002276	ipo4	79	68.031	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.354	ENSGGOG00000016062	IPO4	90	36.559	Gorilla_gorilla
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	70.588	ENSHBUG00000023269	ipo4	77	70.588	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	46.649	ENSHGLG00000002923	IPO4	75	47.165	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	46.134	ENSHGLG00100003725	IPO4	75	46.649	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000001149	ipo4	78	68.031	ENSHCOG00000016854	ipo4	79	68.286	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	69.133	ENSIPUG00000001185	ipo4	78	70.408	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	46.649	ENSSTOG00000002288	IPO4	76	46.649	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLOCG00000001149	ipo4	83	47.030	ENSJJAG00000019002	Ipo4	55	47.059	Jaculus_jaculus
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	69.388	ENSKMAG00000004627	ipo4	79	69.388	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	67.519	ENSLBEG00000024952	ipo4	79	67.775	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000001149	ipo4	77	58.056	ENSLACG00000001428	IPO4	76	58.056	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000001149	ipo4	84	47.549	ENSLAFG00000015852	IPO4	77	47.549	Loxodonta_africana
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.884	ENSMFAG00000000743	IPO4	90	36.559	Macaca_fascicularis
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.884	ENSMMUG00000012481	IPO4	90	36.559	Macaca_mulatta
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.884	ENSMNEG00000043531	IPO4	90	36.559	Macaca_nemestrina
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.884	ENSMLEG00000042067	IPO4	90	36.559	Mandrillus_leucophaeus
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	66.582	ENSMAMG00000021976	ipo4	78	67.857	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	69.054	ENSMZEG00005017273	ipo4	77	70.077	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000001149	ipo4	84	44.988	ENSMAUG00000017565	Ipo4	77	44.988	Mesocricetus_auratus
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	46.825	ENSMICG00000001719	IPO4	90	36.559	Microcebus_murinus
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	44.709	ENSMOCG00000020462	Ipo4	77	45.758	Microtus_ochrogaster
ENSLOCG00000001149	ipo4	83	64.031	ENSMMOG00000005264	ipo4	78	64.031	Mola_mola
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	44.987	ENSMODG00000003337	IPO4	72	44.987	Monodelphis_domestica
ENSLOCG00000001149	ipo4	84	64.541	ENSMALG00000001587	ipo4	79	64.706	Monopterus_albus
ENSLOCG00000001149	ipo4	76	48.000	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	89	40.217	Mus_caroli
ENSLOCG00000001149	ipo4	76	48.000	ENSMUSG00000002319	Ipo4	90	41.379	Mus_musculus
ENSLOCG00000001149	ipo4	76	46.400	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	89	40.217	Mus_pahari
ENSLOCG00000001149	ipo4	76	47.200	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	89	40.217	Mus_spretus
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	48.454	ENSMPUG00000005916	IPO4	75	48.969	Mustela_putorius_furo
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	47.165	ENSMLUG00000025277	IPO4	65	47.680	Myotis_lucifugus
ENSLOCG00000001149	ipo4	84	45.588	ENSNGAG00000019340	Ipo4	77	45.588	Nannospalax_galili
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	69.821	ENSNBRG00000005870	ipo4	79	70.844	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	45.361	ENSOPRG00000016615	IPO4	75	46.134	Ochotona_princeps
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	46.907	ENSODEG00000002609	IPO4	75	46.907	Octodon_degus
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	70.077	ENSONIG00000014574	ipo4	79	70.077	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	45.220	ENSOCUG00000002881	IPO4	75	46.253	Oryctolagus_cuniculus
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	63.520	ENSORLG00000006457	ipo4	82	63.520	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	63.520	ENSORLG00020004286	ipo4	79	63.520	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	63.520	ENSORLG00015021856	ipo4	79	63.520	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000001149	ipo4	83	62.632	ENSOMEG00000016203	ipo4	79	62.755	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	44.974	ENSOGAG00000010642	IPO4	77	44.608	Otolemur_garnettii
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.721	ENSOARG00000019188	IPO4	74	47.721	Ovis_aries
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.884	ENSPPAG00000035476	IPO4	90	36.559	Pan_paniscus
ENSLOCG00000001149	ipo4	84	48.039	ENSPPRG00000023607	IPO4	90	43.011	Panthera_pardus
ENSLOCG00000001149	ipo4	84	48.039	ENSPTIG00000008720	IPO4	90	43.011	Panthera_tigris_altaica
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.884	ENSPTRG00000006200	IPO4	90	36.559	Pan_troglodytes
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.619	ENSPANG00000026278	IPO4	90	36.559	Papio_anubis
ENSLOCG00000001149	ipo4	80	67.347	ENSPKIG00000007830	ipo4	78	67.347	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	71.611	ENSPKIG00000007683	-	79	71.611	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000001149	ipo4	83	61.404	ENSPMGG00000020871	ipo4	80	62.155	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	44.987	ENSPEMG00000016160	Ipo4	75	46.015	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLOCG00000001149	ipo4	83	46.455	ENSPCIG00000010718	IPO4	79	46.455	Phascolarctos_cinereus
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	65.051	ENSPFOG00000009255	ipo4	79	65.217	Poecilia_formosa
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	65.051	ENSPLAG00000020556	ipo4	79	65.217	Poecilia_latipinna
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	65.051	ENSPMEG00000013102	ipo4	79	65.217	Poecilia_mexicana
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	64.706	ENSPREG00000017605	ipo4	79	64.706	Poecilia_reticulata
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.619	ENSPPYG00000005688	IPO4	75	47.423	Pongo_abelii
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.619	ENSPCAG00000015669	IPO4	75	47.680	Procavia_capensis
ENSLOCG00000001149	ipo4	83	46.734	ENSPCOG00000015319	IPO4	90	36.559	Propithecus_coquereli
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.354	ENSPVAG00000010755	IPO4	75	47.938	Pteropus_vampyrus
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	69.054	ENSPNYG00000021414	ipo4	79	70.077	Pundamilia_nyererei
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	69.643	ENSPNAG00000027964	ipo4	78	69.643	Pygocentrus_nattereri
ENSLOCG00000001149	ipo4	84	43.382	ENSRNOG00000019553	Ipo4	77	44.118	Rattus_norvegicus
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.619	ENSRBIG00000027704	IPO4	90	35.484	Rhinopithecus_bieti
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	47.884	ENSRROG00000011492	IPO4	90	35.484	Rhinopithecus_roxellana
ENSLOCG00000001149	ipo4	81	44.149	ENSSBOG00000020162	IPO4	90	34.409	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLOCG00000001149	ipo4	83	46.699	ENSSHAG00000002619	IPO4	74	47.188	Sarcophilus_harrisii
ENSLOCG00000001149	ipo4	86	67.008	ENSSFOG00015014437	IPO4	79	67.008	Scleropages_formosus
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	66.835	ENSSFOG00015012267	ipo4	78	67.342	Scleropages_formosus
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	68.112	ENSSMAG00000019912	ipo4	79	69.133	Scophthalmus_maximus
ENSLOCG00000001149	ipo4	87	61.250	ENSSDUG00000017513	ipo4	80	61.250	Seriola_dumerili
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ENSLOCG00000001149	ipo4	85	64.194	ENSTRUG00000012832	ipo4	79	64.194	Takifugu_rubripes
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	58.779	ENSTNIG00000005191	ipo4	78	58.779	Tetraodon_nigroviridis
ENSLOCG00000001149	ipo4	83	47.165	ENSTBEG00000009781	IPO4	74	47.165	Tupaia_belangeri
ENSLOCG00000001149	ipo4	98	36.058	ENSTTRG00000008626	IPO4	75	47.165	Tursiops_truncatus
ENSLOCG00000001149	ipo4	82	44.845	ENSUAMG00000024037	IPO4	75	44.845	Ursus_americanus
ENSLOCG00000001149	ipo4	76	49.533	ENSXETG00000014621	ipo4	77	45.897	Xenopus_tropicalis
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	62.660	ENSXCOG00000005208	ipo4	80	62.660	Xiphophorus_couchianus
ENSLOCG00000001149	ipo4	85	65.306	ENSXMAG00000006041	ipo4	79	65.473	Xiphophorus_maculatus