EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000002057 (Gene tree)
Gene ID: 102687281
Gene Symbol: trit1
Alias: si:ch211-194e15.1
Full Name: tRNA isopentenyltransferase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 36087 bases
Position: chrLG6:2600653-2636739
Accession: 102687281
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000002391	IPPT	PF01715.17	1.3e-60	1	1
ENSLOCP00000002391	zf-C2H2_jaz	PF12171.8	2.9e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000002396	-	4330	XM_006631344	ENSLOCP00000002391	476 (aa)	XP_006631407	W5M1Y3

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000002057	trit1	95	59.111	ENSG00000043514	TRIT1	99	60.227	Homo_sapiens
ENSLOCG00000002057	trit1	91	69.213	ENSAPOG00000020918	trit1	95	67.713	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000002057	trit1	90	60.373	ENSAMEG00000004342	TRIT1	90	60.373	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLOCG00000002057	trit1	85	69.802	ENSACIG00000017409	trit1	91	68.736	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000002057	trit1	91	68.981	ENSAOCG00000009850	trit1	88	68.981	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000002057	trit1	91	68.750	ENSAPEG00000001481	trit1	88	68.750	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000002057	trit1	95	64.967	ENSATEG00000005426	trit1	93	64.967	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000002057	trit1	71	54.412	ENSAPLG00000011421	TRIT1	96	54.412	Anas_platyrhynchos
ENSLOCG00000002057	trit1	92	60.502	ENSACAG00000002280	TRIT1	85	60.502	Anolis_carolinensis
ENSLOCG00000002057	trit1	92	59.773	ENSANAG00000030732	TRIT1	94	57.951	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000002057	trit1	95	69.690	ENSACLG00000004920	trit1	93	69.690	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000002057	trit1	93	71.655	ENSAMXG00000010959	trit1	95	71.818	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000002057	trit1	93	60.998	ENSBTAG00000013832	TRIT1	93	60.222	Bos_taurus
ENSLOCG00000002057	trit1	84	34.223	WBGene00001740	gro-1	94	35.059	Caenorhabditis_elegans
ENSLOCG00000002057	trit1	92	59.545	ENSCJAG00000002620	TRIT1	92	62.500	Callithrix_jacchus
ENSLOCG00000002057	trit1	88	61.151	ENSCAFG00000003048	TRIT1	92	59.545	Canis_familiaris
ENSLOCG00000002057	trit1	88	60.094	ENSCAFG00020003875	TRIT1	97	59.887	Canis_lupus_dingo
ENSLOCG00000002057	trit1	92	61.136	ENSCHIG00000013259	TRIT1	93	60.222	Capra_hircus
ENSLOCG00000002057	trit1	90	60.930	ENSTSYG00000004363	TRIT1	95	59.161	Carlito_syrichta
ENSLOCG00000002057	trit1	71	58.457	ENSCAPG00000017001	TRIT1	86	58.457	Cavia_aperea
ENSLOCG00000002057	trit1	90	60.698	ENSCPOG00000012820	TRIT1	90	60.698	Cavia_porcellus
ENSLOCG00000002057	trit1	92	59.453	ENSCCAG00000031271	TRIT1	91	61.562	Cebus_capucinus
ENSLOCG00000002057	trit1	92	56.818	ENSCATG00000034344	TRIT1	92	62.575	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000002057	trit1	90	60.047	ENSCLAG00000009828	TRIT1	90	60.047	Chinchilla_lanigera
ENSLOCG00000002057	trit1	83	59.091	ENSCSAG00000001137	TRIT1	94	59.091	Chlorocebus_sabaeus
ENSLOCG00000002057	trit1	90	60.373	ENSCHOG00000000435	TRIT1	90	60.373	Choloepus_hoffmanni
ENSLOCG00000002057	trit1	92	44.866	ENSCSAVG00000002050	-	95	44.866	Ciona_savignyi
ENSLOCG00000002057	trit1	92	59.091	ENSCANG00000043008	TRIT1	92	62.275	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLOCG00000002057	trit1	88	62.590	ENSCGRG00001001894	Trit1	91	60.731	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000002057	trit1	84	58.853	ENSCGRG00000007059	Trit1	83	61.257	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLOCG00000002057	trit1	88	66.508	ENSCSEG00000009574	trit1	91	66.667	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000002057	trit1	91	70.139	ENSDARG00000032876	trit1	99	71.006	Danio_rerio
ENSLOCG00000002057	trit1	93	52.716	ENSDNOG00000001994	TRIT1	94	50.395	Dasypus_novemcinctus
ENSLOCG00000002057	trit1	90	54.545	ENSDORG00000012449	Trit1	93	53.653	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000002057	trit1	85	40.092	FBgn0043799	CG31381	88	40.092	Drosophila_melanogaster
ENSLOCG00000002057	trit1	84	62.129	ENSETEG00000008733	TRIT1	94	62.129	Echinops_telfairi
ENSLOCG00000002057	trit1	87	55.635	ENSEBUG00000012845	trit1	91	55.635	Eptatretus_burgeri
ENSLOCG00000002057	trit1	92	58.691	ENSECAG00000010597	TRIT1	86	57.837	Equus_caballus
ENSLOCG00000002057	trit1	90	48.019	ENSEEUG00000009269	TRIT1	90	48.019	Erinaceus_europaeus
ENSLOCG00000002057	trit1	90	63.657	ENSELUG00000017278	trit1	88	63.657	Esox_lucius
ENSLOCG00000002057	trit1	92	58.864	ENSFCAG00000006029	TRIT1	93	58.000	Felis_catus
ENSLOCG00000002057	trit1	82	60.759	ENSFALG00000000532	TRIT1	96	60.759	Ficedula_albicollis
ENSLOCG00000002057	trit1	87	60.621	ENSFDAG00000003098	TRIT1	92	60.621	Fukomys_damarensis
ENSLOCG00000002057	trit1	71	63.717	ENSFHEG00000022274	trit1	99	63.717	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000002057	trit1	91	69.585	ENSGMOG00000006522	trit1	100	69.585	Gadus_morhua
ENSLOCG00000002057	trit1	88	61.962	ENSGALG00000003851	TRIT1	90	61.962	Gallus_gallus
ENSLOCG00000002057	trit1	75	66.573	ENSGAFG00000018636	trit1	96	63.388	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000002057	trit1	91	68.203	ENSGACG00000008493	trit1	99	68.203	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000002057	trit1	84	60.902	ENSGAGG00000000522	TRIT1	97	60.750	Gopherus_agassizii
ENSLOCG00000002057	trit1	95	59.111	ENSGGOG00000010070	TRIT1	94	61.404	Gorilla_gorilla
ENSLOCG00000002057	trit1	95	69.469	ENSHBUG00000018999	trit1	93	69.469	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000002057	trit1	91	54.273	ENSHGLG00000009564	-	95	52.747	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000002057	trit1	91	58.810	ENSHGLG00000010308	-	93	58.810	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000002057	trit1	82	44.359	ENSHGLG00100018159	-	98	44.359	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000002057	trit1	91	58.810	ENSHGLG00100015382	-	98	57.174	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000002057	trit1	86	66.828	ENSHCOG00000006755	trit1	83	66.667	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000002057	trit1	97	69.165	ENSIPUG00000021822	trit1	95	69.165	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000002057	trit1	93	59.502	ENSSTOG00000006446	TRIT1	91	58.758	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLOCG00000002057	trit1	90	55.116	ENSJJAG00000000300	-	93	53.659	Jaculus_jaculus
ENSLOCG00000002057	trit1	90	56.177	ENSJJAG00000000316	-	93	56.177	Jaculus_jaculus
ENSLOCG00000002057	trit1	99	63.907	ENSKMAG00000021788	trit1	96	63.907	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000002057	trit1	95	66.813	ENSLBEG00000024262	trit1	93	66.813	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000002057	trit1	91	64.073	ENSLACG00000013861	TRIT1	87	64.073	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000002057	trit1	94	57.461	ENSLAFG00000016876	TRIT1	93	57.461	Loxodonta_africana
ENSLOCG00000002057	trit1	92	59.773	ENSMFAG00000001316	TRIT1	92	62.575	Macaca_fascicularis
ENSLOCG00000002057	trit1	92	59.773	ENSMMUG00000016220	TRIT1	92	62.575	Macaca_mulatta
ENSLOCG00000002057	trit1	92	59.773	ENSMNEG00000023137	TRIT1	92	62.575	Macaca_nemestrina
ENSLOCG00000002057	trit1	92	59.545	ENSMLEG00000035296	TRIT1	92	62.575	Mandrillus_leucophaeus
ENSLOCG00000002057	trit1	87	66.346	ENSMAMG00000005868	trit1	88	68.235	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000002057	trit1	95	69.469	ENSMZEG00005011506	trit1	93	69.469	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000002057	trit1	79	60.582	ENSMGAG00000005516	TRIT1	99	60.582	Meleagris_gallopavo
ENSLOCG00000002057	trit1	93	60.356	ENSMAUG00000000399	Trit1	93	60.444	Mesocricetus_auratus
ENSLOCG00000002057	trit1	90	59.441	ENSMICG00000016294	TRIT1	90	59.441	Microcebus_murinus
ENSLOCG00000002057	trit1	91	60.369	ENSMOCG00000008173	Trit1	90	60.369	Microtus_ochrogaster
ENSLOCG00000002057	trit1	85	63.325	ENSMMOG00000021140	trit1	93	63.325	Mola_mola
ENSLOCG00000002057	trit1	87	61.594	ENSMODG00000017650	TRIT1	95	59.954	Monodelphis_domestica
ENSLOCG00000002057	trit1	91	65.046	ENSMALG00000017843	trit1	97	62.232	Monopterus_albus
ENSLOCG00000002057	trit1	91	61.731	MGP_CAROLIEiJ_G0026428	Trit1	95	59.956	Mus_caroli
ENSLOCG00000002057	trit1	89	62.704	ENSMUSG00000028653	Trit1	95	60.841	Mus_musculus
ENSLOCG00000002057	trit1	95	59.868	MGP_PahariEiJ_G0028758	Trit1	98	58.246	Mus_pahari
ENSLOCG00000002057	trit1	91	61.731	MGP_SPRETEiJ_G0027408	Trit1	97	59.957	Mus_spretus
ENSLOCG00000002057	trit1	90	60.373	ENSMPUG00000014291	TRIT1	95	58.850	Mustela_putorius_furo
ENSLOCG00000002057	trit1	90	58.741	ENSMLUG00000000334	TRIT1	95	56.954	Myotis_lucifugus
ENSLOCG00000002057	trit1	95	58.889	ENSNLEG00000012038	TRIT1	94	61.516	Nomascus_leucogenys
ENSLOCG00000002057	trit1	93	53.741	ENSMEUG00000005217	TRIT1	93	53.483	Notamacropus_eugenii
ENSLOCG00000002057	trit1	63	51.538	ENSOPRG00000003205	-	63	51.538	Ochotona_princeps
ENSLOCG00000002057	trit1	91	57.763	ENSODEG00000006117	TRIT1	92	57.763	Octodon_degus
ENSLOCG00000002057	trit1	94	69.488	ENSONIG00000015407	trit1	94	69.488	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000002057	trit1	79	61.640	ENSOANG00000002779	TRIT1	94	61.640	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLOCG00000002057	trit1	90	61.072	ENSOCUG00000002054	TRIT1	93	59.333	Oryctolagus_cuniculus
ENSLOCG00000002057	trit1	95	63.797	ENSORLG00000005802	trit1	96	63.797	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000002057	trit1	95	64.018	ENSORLG00020005519	trit1	96	64.018	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000002057	trit1	95	64.238	ENSORLG00015018715	trit1	96	64.238	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000002057	trit1	94	63.920	ENSOMEG00000006569	trit1	96	62.222	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000002057	trit1	88	61.758	ENSOGAG00000009571	TRIT1	88	61.758	Otolemur_garnettii
ENSLOCG00000002057	trit1	92	61.818	ENSOARG00000020140	TRIT1	93	60.889	Ovis_aries
ENSLOCG00000002057	trit1	95	59.111	ENSPPAG00000023930	TRIT1	94	61.516	Pan_paniscus
ENSLOCG00000002057	trit1	92	58.864	ENSPPRG00000009680	TRIT1	93	58.000	Panthera_pardus
ENSLOCG00000002057	trit1	92	58.864	ENSPTIG00000021134	TRIT1	93	58.000	Panthera_tigris_altaica
ENSLOCG00000002057	trit1	95	59.111	ENSPTRG00000000579	TRIT1	94	61.516	Pan_troglodytes
ENSLOCG00000002057	trit1	92	59.545	ENSPANG00000018125	TRIT1	92	62.275	Papio_anubis
ENSLOCG00000002057	trit1	80	65.172	ENSPKIG00000024527	trit1	95	65.699	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000002057	trit1	77	44.959	ENSPSIG00000017073	TRIT1	99	44.959	Pelodiscus_sinensis
ENSLOCG00000002057	trit1	82	66.327	ENSPMGG00000018445	trit1	94	66.327	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLOCG00000002057	trit1	92	61.765	ENSPEMG00000022418	Trit1	93	60.976	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLOCG00000002057	trit1	83	55.446	ENSPMAG00000008892	trit1	100	55.446	Petromyzon_marinus
ENSLOCG00000002057	trit1	87	61.429	ENSPCIG00000020666	TRIT1	97	61.605	Phascolarctos_cinereus
ENSLOCG00000002057	trit1	93	66.295	ENSPFOG00000014626	trit1	93	66.295	Poecilia_formosa
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ENSLOCG00000002057	trit1	72	50.440	ENSPCAG00000014680	TRIT1	93	50.440	Procavia_capensis
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ENSLOCG00000002057	trit1	91	52.995	ENSPVAG00000003344	TRIT1	96	51.641	Pteropus_vampyrus
ENSLOCG00000002057	trit1	66	71.019	ENSPNYG00000001003	trit1	100	71.019	Pundamilia_nyererei
ENSLOCG00000002057	trit1	93	69.615	ENSPNAG00000009466	trit1	94	72.487	Pygocentrus_nattereri
ENSLOCG00000002057	trit1	90	60.959	ENSRNOG00000014274	Trit1	95	59.436	Rattus_norvegicus
ENSLOCG00000002057	trit1	92	59.773	ENSRBIG00000043179	TRIT1	92	62.874	Rhinopithecus_bieti
ENSLOCG00000002057	trit1	92	59.773	ENSRROG00000042670	TRIT1	92	62.874	Rhinopithecus_roxellana
ENSLOCG00000002057	trit1	87	31.787	YOR274W	-	93	31.787	Saccharomyces_cerevisiae
ENSLOCG00000002057	trit1	92	59.773	ENSSBOG00000024417	TRIT1	91	62.763	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLOCG00000002057	trit1	85	58.128	ENSSHAG00000018363	TRIT1	95	58.128	Sarcophilus_harrisii
ENSLOCG00000002057	trit1	91	66.820	ENSSFOG00015007284	trit1	84	66.820	Scleropages_formosus
ENSLOCG00000002057	trit1	98	65.032	ENSSMAG00000020730	trit1	97	65.032	Scophthalmus_maximus
ENSLOCG00000002057	trit1	95	67.035	ENSSDUG00000001683	trit1	89	69.213	Seriola_dumerili
ENSLOCG00000002057	trit1	88	69.378	ENSSLDG00000008379	trit1	92	66.814	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLOCG00000002057	trit1	90	60.369	ENSSARG00000004540	TRIT1	95	59.333	Sorex_araneus
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ENSLOCG00000002057	trit1	95	65.188	ENSTNIG00000009240	trit1	96	66.287	Tetraodon_nigroviridis
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ENSLOCG00000002057	trit1	87	61.098	ENSXETG00000010952	trit1	90	61.098	Xenopus_tropicalis
ENSLOCG00000002057	trit1	72	68.895	ENSXMAG00000016302	trit1	93	68.895	Xiphophorus_maculatus