EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000002210 (Gene tree)
Gene ID: 102693982
Gene Symbol: pusl1
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 53124 bases
Position: chrLG25:4069996-4123119
Accession: 102693982
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000002596	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1e-35	1	2
ENSLOCP00000002596	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1e-35	2	2
ENSLOCP00000002577	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.1e-35	1	2
ENSLOCP00000002577	PseudoU_synth_1	PF01416.20	1.1e-35	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000002583	-	1442	-	ENSLOCP00000002577	302 (aa)	-	W5M2G9
ENSLOCT00000002602	-	1809	XM_006641912	ENSLOCP00000002596	295 (aa)	XP_015192303	W5M2I8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	46.758	ENSG00000169972	PUSL1	98	46.400	Homo_sapiens
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	55.674	ENSAPOG00000016290	pusl1	95	55.282	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	48.084	ENSAMEG00000013752	PUSL1	94	48.084	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLOCG00000002210	pusl1	93	55.636	ENSACIG00000015240	pusl1	100	55.636	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000002210	pusl1	93	56.000	ENSAOCG00000019419	pusl1	82	56.000	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	54.639	ENSAPEG00000005452	pusl1	94	55.319	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000002210	pusl1	98	54.362	ENSATEG00000024154	pusl1	99	54.362	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	57.092	ENSAPLG00000004946	PUSL1	98	55.973	Anas_platyrhynchos
ENSLOCG00000002210	pusl1	88	54.406	ENSACAG00000014111	PUSL1	99	54.406	Anolis_carolinensis
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	48.464	ENSANAG00000037456	PUSL1	96	48.464	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000002210	pusl1	99	55.333	ENSACLG00000008675	pusl1	99	55.333	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000002210	pusl1	98	58.763	ENSAMXG00000044007	pusl1	100	57.664	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000002210	pusl1	94	50.179	ENSBTAG00000007619	PUSL1	95	50.179	Bos_taurus
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	48.464	ENSCJAG00000010972	PUSL1	96	48.464	Callithrix_jacchus
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	46.099	ENSCAFG00000019291	PUSL1	94	45.704	Canis_familiaris
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	46.809	ENSCAFG00020011568	PUSL1	93	46.392	Canis_lupus_dingo
ENSLOCG00000002210	pusl1	94	50.538	ENSCHIG00000012615	PUSL1	97	50.538	Capra_hircus
ENSLOCG00000002210	pusl1	94	49.819	ENSCPOG00000005149	PUSL1	95	48.639	Cavia_porcellus
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	48.464	ENSCCAG00000027475	PUSL1	96	48.464	Cebus_capucinus
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	47.440	ENSCATG00000018260	PUSL1	96	47.440	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000002210	pusl1	94	50.542	ENSCLAG00000005232	PUSL1	95	49.488	Chinchilla_lanigera
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	47.782	ENSCSAG00000000680	PUSL1	96	47.782	Chlorocebus_sabaeus
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	62.676	ENSCPBG00000022621	PUSL1	97	62.676	Chrysemys_picta_bellii
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	48.929	ENSCANG00000034373	PUSL1	94	48.601	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	48.214	ENSCGRG00001012429	Pusl1	96	48.214	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	47.857	ENSCGRG00000006466	Pusl1	96	47.857	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	58.246	ENSCSEG00000005159	pusl1	95	58.246	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000002210	pusl1	81	42.083	ENSCVAG00000012923	pusl1	91	42.083	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	62.105	ENSDARG00000074565	pusl1	99	62.411	Danio_rerio
ENSLOCG00000002210	pusl1	94	34.098	FBgn0083976	CG34140	99	34.323	Drosophila_melanogaster
ENSLOCG00000002210	pusl1	94	47.842	ENSECAG00000006248	PUSL1	91	47.842	Equus_caballus
ENSLOCG00000002210	pusl1	98	45.051	ENSEEUG00000000837	PUSL1	98	45.051	Erinaceus_europaeus
ENSLOCG00000002210	pusl1	98	58.966	ENSELUG00000015945	pusl1	99	58.966	Esox_lucius
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	48.571	ENSFCAG00000007617	PUSL1	94	48.252	Felis_catus
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	52.817	ENSFHEG00000006370	pusl1	95	52.817	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	58.657	ENSGMOG00000019388	pusl1	100	58.657	Gadus_morhua
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	58.803	ENSGALG00000001714	PUSL1	98	58.803	Gallus_gallus
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	52.281	ENSGAFG00000007546	pusl1	97	52.281	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000002210	pusl1	100	50.495	ENSGACG00000007848	pusl1	100	50.495	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	60.915	ENSGAGG00000004730	PUSL1	97	60.915	Gopherus_agassizii
ENSLOCG00000002210	pusl1	84	46.875	ENSGGOG00000005364	PUSL1	98	46.875	Gorilla_gorilla
ENSLOCG00000002210	pusl1	99	55.333	ENSHBUG00000001264	pusl1	99	55.333	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000002210	pusl1	94	48.201	ENSHGLG00000017570	PUSL1	90	48.201	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000002210	pusl1	89	48.485	ENSHGLG00100007641	PUSL1	91	47.292	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	54.770	ENSHCOG00000010077	pusl1	100	56.318	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	62.324	ENSIPUG00000023921	pusl1	97	62.411	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000002210	pusl1	98	48.311	ENSSTOG00000001783	PUSL1	92	48.311	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	50.709	ENSJJAG00000020471	Pusl1	95	50.709	Jaculus_jaculus
ENSLOCG00000002210	pusl1	85	53.571	ENSKMAG00000005154	pusl1	85	53.571	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	55.137	ENSLBEG00000013469	pusl1	100	55.137	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000002210	pusl1	65	61.140	ENSLACG00000018795	PUSL1	95	61.140	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000002210	pusl1	88	49.042	ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	49.042	Loxodonta_africana
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	47.782	ENSMFAG00000046288	PUSL1	96	47.782	Macaca_fascicularis
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	42.321	ENSMMUG00000016279	PUSL1	96	42.321	Macaca_mulatta
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	48.929	ENSMNEG00000037989	PUSL1	92	48.929	Macaca_nemestrina
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	55.290	ENSMAMG00000016538	pusl1	96	55.290	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000002210	pusl1	99	55.333	ENSMZEG00005026990	pusl1	99	55.333	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	58.451	ENSMGAG00000003037	PUSL1	97	58.451	Meleagris_gallopavo
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	47.500	ENSMAUG00000019924	Pusl1	96	47.500	Mesocricetus_auratus
ENSLOCG00000002210	pusl1	94	49.104	ENSMICG00000014171	PUSL1	94	49.104	Microcebus_murinus
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	48.929	ENSMOCG00000005602	Pusl1	96	48.929	Microtus_ochrogaster
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	52.941	ENSMMOG00000003269	pusl1	99	55.000	Mola_mola
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	55.789	ENSMALG00000021686	pusl1	97	54.730	Monopterus_albus
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	47.857	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	96	47.857	Mus_caroli
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	47.500	ENSMUSG00000051557	Pusl1	96	47.500	Mus_musculus
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	47.857	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	96	47.857	Mus_pahari
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	47.857	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	96	47.857	Mus_spretus
ENSLOCG00000002210	pusl1	94	49.640	ENSMPUG00000014313	PUSL1	91	49.640	Mustela_putorius_furo
ENSLOCG00000002210	pusl1	94	50.179	ENSNGAG00000004647	Pusl1	83	50.179	Nannospalax_galili
ENSLOCG00000002210	pusl1	83	54.878	ENSNBRG00000014762	pusl1	89	54.878	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000002210	pusl1	87	48.289	ENSNLEG00000000051	PUSL1	95	48.289	Nomascus_leucogenys
ENSLOCG00000002210	pusl1	93	42.125	ENSMEUG00000005176	-	98	42.125	Notamacropus_eugenii
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	50.534	ENSMEUG00000011649	-	98	50.538	Notamacropus_eugenii
ENSLOCG00000002210	pusl1	94	48.736	ENSODEG00000008247	PUSL1	89	48.736	Octodon_degus
ENSLOCG00000002210	pusl1	100	56.106	ENSONIG00000019361	pusl1	100	56.106	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	55.634	ENSORLG00000016228	pusl1	96	55.634	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	55.282	ENSORLG00020013710	pusl1	96	55.282	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	55.124	ENSORLG00015008715	pusl1	99	55.319	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	57.343	ENSOMEG00000018897	pusl1	98	57.343	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	48.214	ENSOGAG00000031692	PUSL1	97	48.214	Otolemur_garnettii
ENSLOCG00000002210	pusl1	88	51.527	ENSOARG00000004905	PUSL1	98	51.527	Ovis_aries
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	47.099	ENSPPAG00000029283	PUSL1	96	47.099	Pan_paniscus
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	47.782	ENSPPRG00000023329	PUSL1	97	47.782	Panthera_pardus
ENSLOCG00000002210	pusl1	88	48.473	ENSPTIG00000018532	PUSL1	96	48.846	Panthera_tigris_altaica
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	47.099	ENSPTRG00000000021	PUSL1	96	47.099	Pan_troglodytes
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	47.782	ENSPANG00000000591	PUSL1	96	47.782	Papio_anubis
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	60.714	ENSPKIG00000002447	pusl1	97	60.714	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000002210	pusl1	89	58.015	ENSPSIG00000002781	PUSL1	97	58.015	Pelodiscus_sinensis
ENSLOCG00000002210	pusl1	94	51.986	ENSPMGG00000011051	pusl1	99	51.986	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	48.571	ENSPEMG00000013541	Pusl1	96	48.571	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	49.826	ENSPCIG00000007816	-	65	49.826	Phascolarctos_cinereus
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	53.873	ENSPFOG00000015448	pusl1	96	52.577	Poecilia_formosa
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	53.684	ENSPLAG00000004348	pusl1	96	53.684	Poecilia_latipinna
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	53.684	ENSPMEG00000000931	pusl1	96	53.684	Poecilia_mexicana
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	54.035	ENSPREG00000002324	pusl1	96	54.035	Poecilia_reticulata
ENSLOCG00000002210	pusl1	86	45.769	ENSPPYG00000002014	PUSL1	92	45.769	Pongo_abelii
ENSLOCG00000002210	pusl1	64	49.206	ENSPCAG00000002272	PUSL1	77	49.206	Procavia_capensis
ENSLOCG00000002210	pusl1	73	50.000	ENSPVAG00000001016	PUSL1	69	50.000	Pteropus_vampyrus
ENSLOCG00000002210	pusl1	81	57.261	ENSPNYG00000006588	pusl1	100	57.261	Pundamilia_nyererei
ENSLOCG00000002210	pusl1	98	61.724	ENSPNAG00000024441	pusl1	100	61.724	Pygocentrus_nattereri
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	49.286	ENSRNOG00000022354	Pusl1	96	49.286	Rattus_norvegicus
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	47.440	ENSRBIG00000036842	PUSL1	96	47.440	Rhinopithecus_bieti
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	47.440	ENSRROG00000030704	PUSL1	96	47.440	Rhinopithecus_roxellana
ENSLOCG00000002210	pusl1	91	48.000	ENSSBOG00000032249	PUSL1	99	48.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLOCG00000002210	pusl1	52	51.634	ENSSHAG00000004840	-	84	49.383	Sarcophilus_harrisii
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	62.766	ENSSFOG00015008281	pusl1	93	62.857	Scleropages_formosus
ENSLOCG00000002210	pusl1	99	54.305	ENSSMAG00000007187	pusl1	99	54.305	Scophthalmus_maximus
ENSLOCG00000002210	pusl1	97	59.386	ENSSDUG00000000287	pusl1	94	55.872	Seriola_dumerili
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	61.053	ENSSLDG00000009605	pusl1	94	59.661	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLOCG00000002210	pusl1	61	50.838	ENSSARG00000005323	-	94	50.838	Sorex_araneus
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	48.973	ENSSPAG00000002528	pusl1	100	51.460	Stegastes_partitus
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	49.291	ENSSSCG00000003338	PUSL1	91	49.291	Sus_scrofa
ENSLOCG00000002210	pusl1	93	54.579	ENSTGUG00000003214	PUSL1	98	53.791	Taeniopygia_guttata
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	56.842	ENSTRUG00000010102	pusl1	96	56.842	Takifugu_rubripes
ENSLOCG00000002210	pusl1	59	52.023	ENSTNIG00000005789	pusl1	78	52.023	Tetraodon_nigroviridis
ENSLOCG00000002210	pusl1	58	46.857	ENSTBEG00000005001	PUSL1	73	46.857	Tupaia_belangeri
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	43.345	ENSTTRG00000017030	PUSL1	96	43.345	Tursiops_truncatus
ENSLOCG00000002210	pusl1	82	48.971	ENSUAMG00000012801	PUSL1	80	48.971	Ursus_americanus
ENSLOCG00000002210	pusl1	82	48.560	ENSUMAG00000002084	PUSL1	80	48.560	Ursus_maritimus
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	46.809	ENSVVUG00000004320	PUSL1	94	40.909	Vulpes_vulpes
ENSLOCG00000002210	pusl1	78	59.825	ENSXETG00000011145	pusl1	100	59.825	Xenopus_tropicalis
ENSLOCG00000002210	pusl1	95	50.534	ENSXCOG00000017748	pusl1	99	50.534	Xiphophorus_couchianus
ENSLOCG00000002210	pusl1	96	54.035	ENSXMAG00000018846	pusl1	96	54.035	Xiphophorus_maculatus