EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000002728 (Gene tree)
Gene ID: 102691340
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7525 bases
Position: chrLG6:3798738-3806262
Accession: 102691340
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000003211	SYF2	PF08231.12	7.2e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000003218	-	1752	XM_006631364	ENSLOCP00000003211	251 (aa)	XP_006631427	W5M4A3

Gene Model

Click here to download ENSLOCG00000002728's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLOCG00000002728's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.851	ENSG00000117614	SYF2	97	80.851	Homo_sapiens
ENSLOCG00000002728	syf2	95	85.294	ENSAPOG00000001174	syf2	100	85.294	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000002728	syf2	78	84.103	ENSAMEG00000010134	-	100	84.103	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLOCG00000002728	syf2	87	84.862	ENSAMEG00000010115	-	90	84.862	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLOCG00000002728	syf2	93	83.333	ENSACIG00000023688	syf2	94	83.333	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	85.714	ENSAOCG00000022046	syf2	98	86.580	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000002728	syf2	88	84.615	ENSAOCG00000010912	syf2	69	84.615	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000002728	syf2	95	85.714	ENSAPEG00000018858	syf2	92	85.714	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000002728	syf2	95	85.294	ENSATEG00000007745	syf2	100	85.294	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000002728	syf2	80	85.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	85.500	Anas_platyrhynchos
ENSLOCG00000002728	syf2	66	71.257	ENSACAG00000026777	-	100	71.257	Anolis_carolinensis
ENSLOCG00000002728	syf2	81	83.333	ENSACAG00000013653	-	100	83.333	Anolis_carolinensis
ENSLOCG00000002728	syf2	92	81.277	ENSANAG00000032473	SYF2	97	81.277	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.193	ENSACLG00000019916	syf2	100	83.193	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000002728	syf2	95	82.773	ENSAMXG00000004051	syf2	100	82.773	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000002728	syf2	89	83.408	ENSBTAG00000001651	SYF2	94	83.408	Bos_taurus
ENSLOCG00000002728	syf2	83	52.607	WBGene00019402	syf-2	96	50.442	Caenorhabditis_elegans
ENSLOCG00000002728	syf2	92	81.277	ENSCJAG00000046570	SYF2	97	81.277	Callithrix_jacchus
ENSLOCG00000002728	syf2	86	84.722	ENSCAFG00000012895	-	100	77.642	Canis_familiaris
ENSLOCG00000002728	syf2	92	74.138	ENSCAFG00000030331	-	99	74.138	Canis_familiaris
ENSLOCG00000002728	syf2	63	80.503	ENSCAFG00020021094	-	95	74.176	Canis_lupus_dingo
ENSLOCG00000002728	syf2	86	84.722	ENSCAFG00020021091	-	100	77.642	Canis_lupus_dingo
ENSLOCG00000002728	syf2	89	83.857	ENSCHIG00000020874	SYF2	93	83.857	Capra_hircus
ENSLOCG00000002728	syf2	98	77.551	ENSTSYG00000005114	SYF2	99	77.551	Carlito_syrichta
ENSLOCG00000002728	syf2	79	84.848	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	84.848	Cavia_aperea
ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.098	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	79.098	Cavia_porcellus
ENSLOCG00000002728	syf2	92	81.277	ENSCCAG00000022459	SYF2	97	81.277	Cebus_capucinus
ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.000	ENSCATG00000026917	SYF2	97	80.000	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000002728	syf2	93	81.933	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	81.148	Chinchilla_lanigera
ENSLOCG00000002728	syf2	94	78.750	ENSCSAG00000000948	SYF2	99	78.750	Chlorocebus_sabaeus
ENSLOCG00000002728	syf2	71	63.536	ENSCHOG00000005273	-	100	63.536	Choloepus_hoffmanni
ENSLOCG00000002728	syf2	89	84.753	ENSCPBG00000025073	SYF2	95	81.780	Chrysemys_picta_bellii
ENSLOCG00000002728	syf2	88	53.812	ENSCING00000003017	-	93	54.260	Ciona_intestinalis
ENSLOCG00000002728	syf2	84	50.935	ENSCSAVG00000006627	-	98	50.935	Ciona_savignyi
ENSLOCG00000002728	syf2	92	70.213	ENSCANG00000037322	SYF2	99	69.710	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.752	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	79.752	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000002728	syf2	78	85.714	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	85.859	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLOCG00000002728	syf2	87	83.486	ENSCSEG00000000117	syf2	99	79.325	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000002728	syf2	88	87.387	ENSCVAG00000019543	syf2	100	84.519	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.193	ENSDARG00000004706	syf2	100	83.193	Danio_rerio
ENSLOCG00000002728	syf2	93	80.169	ENSDNOG00000047605	SYF2	97	80.169	Dasypus_novemcinctus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.508	ENSDORG00000001274	Syf2	100	79.508	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000002728	syf2	87	55.656	FBgn0033556	CG12343	98	55.656	Drosophila_melanogaster
ENSLOCG00000002728	syf2	83	69.856	ENSETEG00000015729	SYF2	100	66.812	Echinops_telfairi
ENSLOCG00000002728	syf2	78	58.883	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	Eptatretus_burgeri
ENSLOCG00000002728	syf2	98	69.388	ENSEASG00005004232	-	99	69.388	Equus_asinus_asinus
ENSLOCG00000002728	syf2	89	83.408	ENSEASG00005004224	-	91	83.408	Equus_asinus_asinus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.339	ENSECAG00000010440	-	100	79.339	Equus_caballus
ENSLOCG00000002728	syf2	89	84.305	ENSECAG00000012023	-	91	84.305	Equus_caballus
ENSLOCG00000002728	syf2	67	71.676	ENSEEUG00000015084	SYF2	95	71.676	Erinaceus_europaeus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	84.034	ENSELUG00000003465	syf2	99	84.034	Esox_lucius
ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.253	ENSFCAG00000043095	-	100	77.291	Felis_catus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.184	ENSFCAG00000010324	-	85	79.184	Felis_catus
ENSLOCG00000002728	syf2	81	82.843	ENSFALG00000000460	SYF2	91	80.000	Ficedula_albicollis
ENSLOCG00000002728	syf2	95	80.658	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	80.658	Fukomys_damarensis
ENSLOCG00000002728	syf2	90	72.124	ENSFHEG00000007238	syf2	100	72.124	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000002728	syf2	87	86.758	ENSGMOG00000019138	syf2	98	86.758	Gadus_morhua
ENSLOCG00000002728	syf2	89	84.305	ENSGALG00000013639	SYF2	98	76.892	Gallus_gallus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	82.773	ENSGAFG00000019435	syf2	100	82.773	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000002728	syf2	89	83.929	ENSGACG00000007305	syf2	100	81.590	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000002728	syf2	89	85.202	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	83.262	Gopherus_agassizii
ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.851	ENSGGOG00000012796	SYF2	97	80.851	Gorilla_gorilla
ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.193	ENSHBUG00000020477	syf2	99	84.348	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000002728	syf2	88	73.423	ENSHGLG00000004304	-	100	70.168	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000002728	syf2	95	80.738	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	80.738	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000002728	syf2	95	80.738	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	80.738	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000002728	syf2	99	80.800	ENSHCOG00000012904	syf2	81	80.800	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.092	ENSIPUG00000019859	syf2	100	81.092	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000002728	syf2	58	80.822	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	80.822	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLOCG00000002728	syf2	79	86.432	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	86.432	Jaculus_jaculus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	84.100	ENSKMAG00000013856	syf2	100	84.100	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	84.454	ENSLBEG00000014425	syf2	100	84.454	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000002728	syf2	92	81.034	ENSLACG00000012064	SYF2	97	81.034	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000002728	syf2	94	78.926	ENSLAFG00000023150	-	99	78.926	Loxodonta_africana
ENSLOCG00000002728	syf2	73	58.696	ENSLAFG00000030814	-	100	58.696	Loxodonta_africana
ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.000	ENSMFAG00000041831	SYF2	97	80.000	Macaca_fascicularis
ENSLOCG00000002728	syf2	86	84.259	ENSMMUG00000002968	SYF2	97	80.426	Macaca_mulatta
ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.000	ENSMNEG00000030180	SYF2	97	80.000	Macaca_nemestrina
ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.000	ENSMLEG00000030248	SYF2	97	80.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSLOCG00000002728	syf2	96	83.471	ENSMAMG00000010403	syf2	99	83.471	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.193	ENSMZEG00005006429	syf2	100	83.193	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000002728	syf2	79	85.427	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	85.427	Meleagris_gallopavo
ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.818	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	81.818	Mesocricetus_auratus
ENSLOCG00000002728	syf2	79	85.427	ENSMICG00000016191	SYF2	100	85.427	Microcebus_murinus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.818	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	81.818	Microtus_ochrogaster
ENSLOCG00000002728	syf2	92	84.348	ENSMMOG00000002396	syf2	96	84.348	Mola_mola
ENSLOCG00000002728	syf2	89	80.000	ENSMODG00000013951	-	98	80.000	Monodelphis_domestica
ENSLOCG00000002728	syf2	95	82.573	ENSMALG00000010706	syf2	100	82.988	Monopterus_albus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.405	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	81.405	Mus_caroli
ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.405	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	81.405	Mus_musculus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.405	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	81.405	Mus_pahari
ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.405	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	81.405	Mus_spretus
ENSLOCG00000002728	syf2	86	84.722	ENSMPUG00000015802	-	100	76.494	Mustela_putorius_furo
ENSLOCG00000002728	syf2	87	84.404	ENSMPUG00000015801	-	89	84.404	Mustela_putorius_furo
ENSLOCG00000002728	syf2	89	82.960	ENSMLUG00000001885	SYF2	91	82.960	Myotis_lucifugus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	78.455	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	78.455	Nannospalax_galili
ENSLOCG00000002728	syf2	95	73.967	ENSNBRG00000010720	syf2	99	73.967	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.851	ENSNLEG00000035185	SYF2	97	80.851	Nomascus_leucogenys
ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.835	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	79.835	Ochotona_princeps
ENSLOCG00000002728	syf2	94	70.954	ENSODEG00000014338	-	99	71.610	Octodon_degus
ENSLOCG00000002728	syf2	93	79.832	ENSODEG00000017664	-	100	79.832	Octodon_degus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.193	ENSONIG00000008213	syf2	100	83.193	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000002728	syf2	80	84.653	ENSOANG00000009552	SYF2	100	84.653	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.098	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	79.918	Oryctolagus_cuniculus
ENSLOCG00000002728	syf2	93	83.262	ENSORLG00000028820	syf2	100	83.262	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000002728	syf2	95	82.353	ENSORLG00020018333	syf2	100	82.353	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000002728	syf2	95	82.353	ENSORLG00015014665	syf2	100	82.353	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.193	ENSOMEG00000013911	syf2	100	83.193	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000002728	syf2	95	80.738	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	80.738	Otolemur_garnettii
ENSLOCG00000002728	syf2	78	57.436	ENSOARG00000006269	-	100	57.436	Ovis_aries
ENSLOCG00000002728	syf2	89	83.111	ENSOARG00000006348	-	91	83.111	Ovis_aries
ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.851	ENSPPAG00000036579	SYF2	97	80.851	Pan_paniscus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	78.689	ENSPPRG00000001638	-	99	78.689	Panthera_pardus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.253	ENSPPRG00000001651	-	100	77.291	Panthera_pardus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	79.253	ENSPTIG00000007036	-	98	79.253	Panthera_tigris_altaica
ENSLOCG00000002728	syf2	86	85.185	ENSPTIG00000005711	-	81	83.408	Panthera_tigris_altaica
ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.851	ENSPTRG00000000352	SYF2	97	80.851	Pan_troglodytes
ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.000	ENSPANG00000008139	SYF2	97	80.000	Papio_anubis
ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.613	ENSPKIG00000008130	syf2	100	83.613	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000002728	syf2	99	77.600	ENSPSIG00000011816	SYF2	94	77.600	Pelodiscus_sinensis
ENSLOCG00000002728	syf2	89	86.996	ENSPMGG00000008755	syf2	87	86.996	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.405	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	81.405	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLOCG00000002728	syf2	89	83.408	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	77.600	Phascolarctos_cinereus
ENSLOCG00000002728	syf2	92	84.783	ENSPFOG00000004116	syf2	95	84.783	Poecilia_formosa
ENSLOCG00000002728	syf2	92	85.217	ENSPLAG00000006691	syf2	99	85.217	Poecilia_latipinna
ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.092	ENSPMEG00000011684	syf2	100	81.092	Poecilia_mexicana
ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.613	ENSPREG00000003009	syf2	100	83.613	Poecilia_reticulata
ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.851	ENSPPYG00000001713	SYF2	97	80.851	Pongo_abelii
ENSLOCG00000002728	syf2	95	54.733	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	54.733	Propithecus_coquereli
ENSLOCG00000002728	syf2	92	70.763	ENSPVAG00000005841	SYF2	96	70.763	Pteropus_vampyrus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.193	ENSPNYG00000004979	syf2	100	83.193	Pundamilia_nyererei
ENSLOCG00000002728	syf2	95	84.874	ENSPNAG00000015570	syf2	100	84.874	Pygocentrus_nattereri
ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.405	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	81.405	Rattus_norvegicus
ENSLOCG00000002728	syf2	92	77.872	ENSRBIG00000042970	SYF2	97	77.872	Rhinopithecus_bieti
ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.000	ENSRROG00000001347	SYF2	97	80.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSLOCG00000002728	syf2	86	85.185	ENSSBOG00000020184	SYF2	95	80.952	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLOCG00000002728	syf2	82	83.981	ENSSHAG00000007152	-	100	83.981	Sarcophilus_harrisii
ENSLOCG00000002728	syf2	89	82.511	ENSSHAG00000015630	-	100	76.305	Sarcophilus_harrisii
ENSLOCG00000002728	syf2	95	82.353	ENSSFOG00015023647	syf2	100	82.353	Scleropages_formosus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	81.933	ENSSMAG00000009867	syf2	100	81.933	Scophthalmus_maximus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.613	ENSSDUG00000013072	syf2	100	83.613	Seriola_dumerili
ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.613	ENSSLDG00000012677	syf2	100	83.613	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLOCG00000002728	syf2	95	62.295	ENSSARG00000012889	SYF2	100	62.295	Sorex_araneus
ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.085	ENSSPUG00000005251	SYF2	93	80.085	Sphenodon_punctatus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	82.353	ENSSPAG00000009626	syf2	100	82.353	Stegastes_partitus
ENSLOCG00000002728	syf2	89	83.857	ENSSSCG00000037481	SYF2	91	83.857	Sus_scrofa
ENSLOCG00000002728	syf2	59	56.291	ENSTGUG00000001126	SYF2	99	52.000	Taeniopygia_guttata
ENSLOCG00000002728	syf2	100	77.470	ENSTRUG00000001499	syf2	95	79.747	Takifugu_rubripes
ENSLOCG00000002728	syf2	89	83.857	ENSTNIG00000016912	syf2	100	83.857	Tetraodon_nigroviridis
ENSLOCG00000002728	syf2	95	61.728	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	61.728	Tupaia_belangeri
ENSLOCG00000002728	syf2	86	84.259	ENSTTRG00000003550	SYF2	99	78.838	Tursiops_truncatus
ENSLOCG00000002728	syf2	95	77.236	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	77.236	Ursus_americanus
ENSLOCG00000002728	syf2	86	84.259	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	76.096	Ursus_maritimus
ENSLOCG00000002728	syf2	88	83.784	ENSVPAG00000005705	SYF2	91	83.784	Vicugna_pacos
ENSLOCG00000002728	syf2	82	82.927	ENSVVUG00000027181	-	88	83.028	Vulpes_vulpes
ENSLOCG00000002728	syf2	86	84.722	ENSVVUG00000027175	-	100	77.642	Vulpes_vulpes
ENSLOCG00000002728	syf2	99	74.699	ENSXETG00000022797	syf2	98	74.699	Xenopus_tropicalis
ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.613	ENSXMAG00000022698	syf2	100	83.613	Xiphophorus_maculatus