EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000003304 (Gene tree)
Gene ID: 102688059
Gene Symbol: xpo6
Alias: Ranbp20|fi24f12|wu:fi24f12
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 25778 bases
Position: chrLG13:5250497-5276274
Accession: 102688059
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000003912	Xpo1	PF08389.12	2.7e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000003920	-	6079	XM_006637082	ENSLOCP00000003912	1071 (aa)	-	W5M6A4

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.699	ENSG00000169180	XPO6	100	78.417	Homo_sapiens
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.581	ENSAPOG00000012873	xpo6	94	82.581	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.419	ENSAMEG00000011014	XPO6	94	81.419	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.937	ENSACIG00000008055	xpo6	94	82.369	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	83.134	ENSAOCG00000001326	xpo6	94	83.134	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	83.041	ENSAPEG00000016304	xpo6	94	83.041	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.945	ENSATEG00000002273	xpo6	94	83.396	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	83.193	ENSAPLG00000007480	XPO6	94	83.193	Anas_platyrhynchos
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	71.193	ENSACAG00000016883	XPO6	94	71.193	Anolis_carolinensis
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.326	ENSANAG00000031761	XPO6	94	81.326	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.836	ENSACLG00000007048	xpo6	94	82.836	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	76.809	ENSAMXG00000032539	xpo6	94	76.809	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.672	ENSBTAG00000010309	XPO6	94	80.672	Bos_taurus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.419	ENSCJAG00000006014	XPO6	94	81.419	Callithrix_jacchus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.606	ENSCAFG00000017356	XPO6	94	81.606	Canis_familiaris
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.606	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	81.690	Canis_lupus_dingo
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.952	ENSCHIG00000022341	XPO6	94	80.952	Capra_hircus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	77.726	ENSTSYG00000012249	XPO6	94	77.726	Carlito_syrichta
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.232	ENSCPOG00000012824	XPO6	94	81.232	Cavia_porcellus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.326	ENSCCAG00000036360	XPO6	94	81.326	Cebus_capucinus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.793	ENSCATG00000034030	XPO6	94	81.793	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.232	ENSCLAG00000012270	XPO6	94	81.232	Chinchilla_lanigera
ENSLOCG00000003304	xpo6	91	79.151	ENSCHOG00000004369	XPO6	86	79.151	Choloepus_hoffmanni
ENSLOCG00000003304	xpo6	87	91.176	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	91.176	Chrysemys_picta_bellii
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	46.422	ENSCING00000006884	-	94	46.422	Ciona_intestinalis
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	44.628	ENSCSAVG00000000850	-	94	44.628	Ciona_savignyi
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.793	ENSCANG00000041578	XPO6	94	81.793	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.419	ENSCGRG00001013173	Xpo6	94	81.419	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.198	ENSCSEG00000013622	xpo6	94	81.198	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.499	ENSCVAG00000017399	xpo6	95	81.343	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	75.668	ENSDARG00000041217	xpo6	97	75.668	Danio_rerio
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.326	ENSDNOG00000012449	XPO6	94	81.326	Dasypus_novemcinctus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.326	ENSDORG00000000919	Xpo6	94	81.326	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000003304	xpo6	82	84.556	ENSETEG00000018768	XPO6	79	84.556	Echinops_telfairi
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	59.201	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	57.700	Eptatretus_burgeri
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.419	ENSEASG00005017296	XPO6	94	81.419	Equus_asinus_asinus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.326	ENSECAG00000008601	XPO6	94	81.326	Equus_caballus
ENSLOCG00000003304	xpo6	97	74.566	ENSEEUG00000014587	XPO6	94	74.566	Erinaceus_europaeus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	85.343	ENSELUG00000009159	xpo6	94	85.343	Esox_lucius
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.606	ENSFCAG00000010309	XPO6	94	81.606	Felis_catus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	83.100	ENSFALG00000004441	XPO6	92	83.380	Ficedula_albicollis
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.326	ENSFDAG00000012689	XPO6	94	81.326	Fukomys_damarensis
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.966	ENSFHEG00000021190	xpo6	94	80.966	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	83.100	ENSGALG00000035360	XPO6	94	83.100	Gallus_gallus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.851	ENSGAFG00000004044	xpo6	94	80.851	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.743	ENSGAGG00000022738	XPO6	99	82.743	Gopherus_agassizii
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.606	ENSGGOG00000005609	XPO6	94	81.606	Gorilla_gorilla
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.765	ENSHBUG00000019504	xpo6	94	82.765	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.513	ENSHGLG00000009679	-	94	81.513	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000003304	xpo6	93	67.035	ENSHGLG00000003865	-	94	67.035	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.513	ENSHGLG00100003673	-	94	81.513	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000003304	xpo6	93	69.401	ENSHGLG00100001081	-	94	69.401	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.996	ENSHCOG00000004987	xpo6	94	81.423	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	76.107	ENSIPUG00000006516	xpo6	94	76.107	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.046	ENSSTOG00000012161	XPO6	94	81.046	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.859	ENSJJAG00000019392	Xpo6	94	80.859	Jaculus_jaculus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.423	ENSKMAG00000010403	xpo6	94	81.423	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.369	ENSLBEG00000023039	xpo6	95	82.369	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.606	ENSLACG00000017930	XPO6	94	81.606	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.672	ENSLAFG00000011960	XPO6	94	80.672	Loxodonta_africana
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.793	ENSMFAG00000045067	XPO6	94	81.793	Macaca_fascicularis
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.793	ENSMMUG00000018623	XPO6	94	81.793	Macaca_mulatta
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.793	ENSMNEG00000028587	XPO6	94	81.793	Macaca_nemestrina
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.793	ENSMLEG00000029685	XPO6	94	81.793	Mandrillus_leucophaeus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.743	ENSMAMG00000001351	xpo6	95	82.743	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.929	ENSMZEG00005010620	xpo6	94	82.929	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.682	ENSMGAG00000009566	XPO6	97	82.682	Meleagris_gallopavo
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	71.229	ENSMAUG00000012539	Xpo6	94	70.950	Mesocricetus_auratus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.606	ENSMICG00000001923	XPO6	94	81.606	Microcebus_murinus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.326	ENSMOCG00000008015	Xpo6	94	81.326	Microtus_ochrogaster
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.716	ENSMMOG00000011992	xpo6	94	81.716	Mola_mola
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.260	ENSMODG00000015516	XPO6	94	82.260	Monodelphis_domestica
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	74.440	ENSMALG00000020612	xpo6	94	74.557	Monopterus_albus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.419	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	94	81.419	Mus_caroli
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.326	ENSMUSG00000000131	Xpo6	94	81.326	Mus_musculus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.232	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	94	81.232	Mus_pahari
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.139	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	94	81.139	Mus_spretus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.139	ENSMPUG00000012920	XPO6	92	81.139	Mustela_putorius_furo
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.952	ENSMLUG00000012970	XPO6	94	80.952	Myotis_lucifugus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.419	ENSNGAG00000012740	Xpo6	94	81.419	Nannospalax_galili
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.857	ENSNBRG00000007275	xpo6	94	82.857	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.699	ENSNLEG00000011518	XPO6	94	81.699	Nomascus_leucogenys
ENSLOCG00000003304	xpo6	86	79.042	ENSOPRG00000009278	XPO6	81	79.042	Ochotona_princeps
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.419	ENSODEG00000012917	XPO6	94	81.419	Octodon_degus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.673	ENSONIG00000019366	xpo6	94	82.673	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.232	ENSOCUG00000002727	XPO6	94	81.232	Oryctolagus_cuniculus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.794	ENSORLG00000011231	xpo6	95	80.240	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.063	ENSORLG00020000386	xpo6	94	81.063	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.979	ENSORLG00015003636	xpo6	94	80.979	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.979	ENSOMEG00000016505	xpo6	94	80.979	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.699	ENSOGAG00000012844	XPO6	94	81.699	Otolemur_garnettii
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.859	ENSOARG00000000960	XPO6	94	80.859	Ovis_aries
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.699	ENSPPAG00000033668	XPO6	94	81.699	Pan_paniscus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.606	ENSPPRG00000001454	XPO6	95	81.606	Panthera_pardus
ENSLOCG00000003304	xpo6	97	80.539	ENSPTIG00000016663	XPO6	94	80.539	Panthera_tigris_altaica
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.699	ENSPTRG00000007919	XPO6	94	81.699	Pan_troglodytes
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.793	ENSPANG00000017103	XPO6	94	81.793	Papio_anubis
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	86.555	ENSPKIG00000022550	xpo6	94	86.586	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.250	ENSPSIG00000018225	XPO6	95	81.250	Pelodiscus_sinensis
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.166	ENSPMGG00000014436	xpo6	95	82.166	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.232	ENSPEMG00000012100	Xpo6	94	81.232	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	70.083	ENSPMAG00000003127	xpo6	94	70.083	Petromyzon_marinus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.979	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	82.066	Phascolarctos_cinereus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.221	ENSPFOG00000008763	xpo6	94	81.221	Poecilia_formosa
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.221	ENSPLAG00000014054	xpo6	94	81.221	Poecilia_latipinna
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.129	ENSPMEG00000018994	xpo6	94	81.129	Poecilia_mexicana
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.129	ENSPREG00000016421	xpo6	93	81.129	Poecilia_reticulata
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.606	ENSPPYG00000007218	XPO6	94	81.606	Pongo_abelii
ENSLOCG00000003304	xpo6	89	84.884	ENSPCAG00000008918	XPO6	84	84.884	Procavia_capensis
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.699	ENSPCOG00000017886	XPO6	94	81.699	Propithecus_coquereli
ENSLOCG00000003304	xpo6	79	83.858	ENSPVAG00000012234	XPO6	74	83.858	Pteropus_vampyrus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	83.022	ENSPNYG00000008375	xpo6	94	83.022	Pundamilia_nyererei
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	76.888	ENSPNAG00000008284	xpo6	94	76.888	Pygocentrus_nattereri
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.859	ENSRNOG00000016722	Xpo6	94	80.859	Rattus_norvegicus
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ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.793	ENSRROG00000044864	XPO6	94	81.793	Rhinopithecus_roxellana
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.326	ENSSBOG00000027650	XPO6	94	81.326	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.260	ENSSHAG00000013864	XPO6	94	82.260	Sarcophilus_harrisii
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ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.183	ENSSMAG00000010566	xpo6	94	82.369	Scophthalmus_maximus
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	83.116	ENSSDUG00000017294	xpo6	95	83.209	Seriola_dumerili
ENSLOCG00000003304	xpo6	100	82.929	ENSSLDG00000006580	xpo6	95	83.022	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSLOCG00000003304	xpo6	100	80.882	ENSTNIG00000018949	xpo6	94	80.882	Tetraodon_nigroviridis
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ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.499	ENSXMAG00000011630	xpo6	94	81.499	Xiphophorus_maculatus