EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000003577 (Gene tree)
Gene ID: 102687309
Gene Symbol: rexo4
Alias: im:7156740|si:ch73-209e20.4
Full Name: REX4 homolog%2C 3'-5' exonuclease
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7689 bases
Position: chrLG21:5177296-5184984
Accession: 102687309
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000004245	RNase_T	PF00929.24	9.4e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000004253	-	4803	XM_006640633	ENSLOCP00000004245	436 (aa)	XP_006640696	W5M787

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	54.472	ENSG00000148300	REXO4	82	55.432	Homo_sapiens
ENSLOCG00000003577	rexo4	82	56.131	ENSAPOG00000019264	rexo4	89	54.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000003577	rexo4	84	52.231	ENSAMEG00000011649	REXO4	94	50.739	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLOCG00000003577	rexo4	85	56.614	ENSAOCG00000004087	rexo4	87	56.117	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000003577	rexo4	85	56.085	ENSAPEG00000009106	rexo4	87	55.585	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000003577	rexo4	85	56.331	ENSATEG00000017662	rexo4	98	52.257	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000003577	rexo4	77	61.159	ENSAPLG00000005865	REXO4	99	60.000	Anas_platyrhynchos
ENSLOCG00000003577	rexo4	83	51.206	ENSANAG00000028404	REXO4	84	52.473	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	57.337	ENSACLG00000006007	rexo4	83	55.586	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000003577	rexo4	80	56.098	ENSAMXG00000013291	rexo4	82	56.461	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000003577	rexo4	80	49.716	ENSBTAG00000019721	REXO4	96	46.914	Bos_taurus
ENSLOCG00000003577	rexo4	83	51.762	ENSCJAG00000009774	REXO4	83	53.591	Callithrix_jacchus
ENSLOCG00000003577	rexo4	89	46.572	ENSCAFG00000019767	REXO4	87	48.312	Canis_familiaris
ENSLOCG00000003577	rexo4	89	48.039	ENSCAFG00020000983	-	91	47.689	Canis_lupus_dingo
ENSLOCG00000003577	rexo4	82	49.727	ENSCHIG00000009517	REXO4	96	47.044	Capra_hircus
ENSLOCG00000003577	rexo4	83	53.908	ENSTSYG00000027492	REXO4	89	52.865	Carlito_syrichta
ENSLOCG00000003577	rexo4	51	67.117	ENSCAPG00000014583	REXO4	69	64.583	Cavia_aperea
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	49.869	ENSCPOG00000001386	REXO4	83	49.198	Cavia_porcellus
ENSLOCG00000003577	rexo4	83	44.920	ENSCCAG00000027049	REXO4	83	46.301	Cebus_capucinus
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	55.135	ENSCATG00000028646	REXO4	82	55.833	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000003577	rexo4	50	68.519	ENSCLAG00000006919	REXO4	69	65.812	Chinchilla_lanigera
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	54.865	ENSCSAG00000015280	REXO4	82	55.556	Chlorocebus_sabaeus
ENSLOCG00000003577	rexo4	91	55.283	ENSCPBG00000021152	REXO4	99	53.125	Chrysemys_picta_bellii
ENSLOCG00000003577	rexo4	51	58.482	ENSCING00000010751	-	80	58.482	Ciona_intestinalis
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	53.930	ENSCANG00000029855	REXO4	82	54.318	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLOCG00000003577	rexo4	79	51.821	ENSCGRG00001013126	Rexo4	50	68.519	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000003577	rexo4	79	51.821	ENSCGRG00000009819	Rexo4	51	68.519	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLOCG00000003577	rexo4	85	53.562	ENSCSEG00000019343	rexo4	94	50.121	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000003577	rexo4	52	73.009	ENSCVAG00000014963	rexo4	61	73.009	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000003577	rexo4	86	51.862	ENSDARG00000088619	rexo4	89	68.595	Danio_rerio
ENSLOCG00000003577	rexo4	82	45.498	ENSDNOG00000002429	REXO4	59	54.355	Dasypus_novemcinctus
ENSLOCG00000003577	rexo4	51	67.421	ENSDORG00000006190	Rexo4	63	67.421	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	57.258	ENSELUG00000003539	rexo4	83	56.216	Esox_lucius
ENSLOCG00000003577	rexo4	87	48.571	ENSFCAG00000011652	REXO4	87	47.949	Felis_catus
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	55.586	ENSFALG00000001520	REXO4	87	54.821	Ficedula_albicollis
ENSLOCG00000003577	rexo4	80	53.151	ENSFDAG00000016050	REXO4	84	52.473	Fukomys_damarensis
ENSLOCG00000003577	rexo4	80	55.432	ENSFHEG00000002413	rexo4	86	54.420	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000003577	rexo4	50	60.092	ENSGMOG00000012876	rexo4	66	60.092	Gadus_morhua
ENSLOCG00000003577	rexo4	63	51.042	ENSGAFG00000015404	-	83	49.123	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000003577	rexo4	85	56.334	ENSGACG00000008065	rexo4	86	55.256	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000003577	rexo4	84	56.216	ENSGAGG00000010260	REXO4	95	55.584	Gopherus_agassizii
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	54.472	ENSGGOG00000014508	REXO4	82	55.432	Gorilla_gorilla
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	56.676	ENSHBUG00000000542	rexo4	83	55.041	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	50.404	ENSHGLG00000016901	REXO4	84	51.117	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	50.404	ENSHGLG00100017444	REXO4	84	51.117	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000003577	rexo4	55	62.762	ENSHCOG00000018196	rexo4	61	62.762	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000003577	rexo4	93	49.268	ENSIPUG00000021084	rexo4	92	46.934	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000003577	rexo4	78	53.824	ENSSTOG00000003754	REXO4	82	53.672	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLOCG00000003577	rexo4	79	51.549	ENSJJAG00000013002	Rexo4	86	47.132	Jaculus_jaculus
ENSLOCG00000003577	rexo4	83	55.270	ENSKMAG00000015039	rexo4	97	51.551	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000003577	rexo4	86	54.881	ENSLBEG00000025570	rexo4	87	54.331	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000003577	rexo4	82	54.768	ENSLACG00000012399	REXO4	85	54.496	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000003577	rexo4	84	47.150	ENSLAFG00000011274	REXO4	88	47.059	Loxodonta_africana
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	54.865	ENSMFAG00000042425	REXO4	82	54.190	Macaca_fascicularis
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	54.865	ENSMMUG00000000935	REXO4	82	54.190	Macaca_mulatta
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	54.865	ENSMNEG00000031604	REXO4	82	53.911	Macaca_nemestrina
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	55.285	ENSMLEG00000037716	REXO4	82	56.338	Mandrillus_leucophaeus
ENSLOCG00000003577	rexo4	85	55.499	ENSMAMG00000011251	rexo4	89	56.771	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	55.769	ENSMZEG00005012336	rexo4	69	68.852	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	56.630	ENSMGAG00000006521	REXO4	99	56.630	Meleagris_gallopavo
ENSLOCG00000003577	rexo4	79	50.862	ENSMAUG00000015137	Rexo4	50	68.056	Mesocricetus_auratus
ENSLOCG00000003577	rexo4	83	50.938	ENSMICG00000008422	REXO4	90	50.254	Microcebus_murinus
ENSLOCG00000003577	rexo4	79	53.073	ENSMOCG00000020607	Rexo4	88	50.253	Microtus_ochrogaster
ENSLOCG00000003577	rexo4	85	52.764	ENSMODG00000012817	REXO4	53	68.936	Monodelphis_domestica
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	55.398	ENSMALG00000019705	rexo4	82	53.889	Monopterus_albus
ENSLOCG00000003577	rexo4	79	51.445	MGP_CAROLIEiJ_G0023332	-	52	70.370	Mus_caroli
ENSLOCG00000003577	rexo4	80	51.613	ENSMUSG00000052406	Rexo4	83	52.762	Mus_musculus
ENSLOCG00000003577	rexo4	82	50.678	MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	83	51.705	Mus_pahari
ENSLOCG00000003577	rexo4	83	50.781	MGP_SPRETEiJ_G0024249	-	88	51.187	Mus_spretus
ENSLOCG00000003577	rexo4	90	49.118	ENSNGAG00000010700	Rexo4	54	69.444	Nannospalax_galili
ENSLOCG00000003577	rexo4	89	51.961	ENSNBRG00000011712	rexo4	84	54.722	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000003577	rexo4	77	53.779	ENSNLEG00000007556	-	69	58.657	Nomascus_leucogenys
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	53.930	ENSNLEG00000013130	-	91	52.778	Nomascus_leucogenys
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	42.935	ENSMEUG00000006513	-	96	40.547	Notamacropus_eugenii
ENSLOCG00000003577	rexo4	50	67.281	ENSODEG00000015721	REXO4	61	67.281	Octodon_degus
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	55.827	ENSONIG00000020052	rexo4	84	55.125	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000003577	rexo4	84	51.697	ENSOANG00000002453	REXO4	95	52.033	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLOCG00000003577	rexo4	85	56.873	ENSORLG00000006904	rexo4	62	68.182	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000003577	rexo4	85	56.300	ENSORLG00020013768	rexo4	87	56.300	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000003577	rexo4	93	52.812	ENSORLG00015012070	rexo4	87	55.764	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000003577	rexo4	86	55.928	ENSOMEG00000018327	rexo4	84	56.873	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000003577	rexo4	87	49.367	ENSOGAG00000014040	REXO4	86	50.000	Otolemur_garnettii
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	54.472	ENSPPAG00000027911	REXO4	82	55.153	Pan_paniscus
ENSLOCG00000003577	rexo4	82	51.087	ENSPPRG00000002894	REXO4	87	51.233	Panthera_pardus
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	54.472	ENSPTRG00000023363	REXO4	82	55.153	Pan_troglodytes
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	55.676	ENSPANG00000026040	REXO4	82	56.389	Papio_anubis
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	58.708	ENSPKIG00000024761	rexo4	90	56.545	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000003577	rexo4	83	57.333	ENSPSIG00000016908	REXO4	86	57.260	Pelodiscus_sinensis
ENSLOCG00000003577	rexo4	82	55.348	ENSPMGG00000005312	rexo4	83	54.133	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLOCG00000003577	rexo4	79	53.429	ENSPEMG00000017982	Rexo4	83	53.714	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLOCG00000003577	rexo4	83	53.333	ENSPCIG00000017379	REXO4	54	68.644	Phascolarctos_cinereus
ENSLOCG00000003577	rexo4	80	56.780	ENSPFOG00000017751	rexo4	87	55.342	Poecilia_formosa
ENSLOCG00000003577	rexo4	80	56.742	ENSPLAG00000010487	rexo4	86	55.313	Poecilia_latipinna
ENSLOCG00000003577	rexo4	80	56.980	ENSPMEG00000020767	rexo4	87	55.858	Poecilia_mexicana
ENSLOCG00000003577	rexo4	80	57.102	ENSPREG00000021841	rexo4	86	55.313	Poecilia_reticulata
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	54.348	ENSPPYG00000019735	REXO4	82	54.875	Pongo_abelii
ENSLOCG00000003577	rexo4	85	47.165	ENSPCAG00000010581	REXO4	84	48.876	Procavia_capensis
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	51.791	ENSPCOG00000025466	REXO4	89	50.521	Propithecus_coquereli
ENSLOCG00000003577	rexo4	82	44.837	ENSPVAG00000001429	REXO4	85	44.180	Pteropus_vampyrus
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	56.793	ENSPNYG00000013712	rexo4	83	55.041	Pundamilia_nyererei
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	52.575	ENSPNAG00000019227	rexo4	81	50.964	Pygocentrus_nattereri
ENSLOCG00000003577	rexo4	79	52.394	ENSRNOG00000027867	Rexo4	83	52.137	Rattus_norvegicus
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	54.743	ENSRBIG00000037515	REXO4	82	54.875	Rhinopithecus_bieti
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	54.472	ENSRROG00000028864	REXO4	82	54.596	Rhinopithecus_roxellana
ENSLOCG00000003577	rexo4	83	41.935	ENSSBOG00000032587	REXO4	82	42.005	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLOCG00000003577	rexo4	80	55.679	ENSSHAG00000005827	REXO4	90	54.098	Sarcophilus_harrisii
ENSLOCG00000003577	rexo4	55	70.954	ENSSFOG00015017394	rexo4	79	74.561	Scleropages_formosus
ENSLOCG00000003577	rexo4	87	53.351	ENSSMAG00000015441	rexo4	88	52.742	Scophthalmus_maximus
ENSLOCG00000003577	rexo4	84	55.526	ENSSDUG00000023346	rexo4	97	52.809	Seriola_dumerili
ENSLOCG00000003577	rexo4	84	57.027	ENSSLDG00000011085	rexo4	100	53.968	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLOCG00000003577	rexo4	81	57.703	ENSSPUG00000015868	REXO4	96	54.523	Sphenodon_punctatus
ENSLOCG00000003577	rexo4	85	55.556	ENSSPAG00000007221	rexo4	87	55.467	Stegastes_partitus
ENSLOCG00000003577	rexo4	82	46.194	ENSSSCG00000023173	REXO4	85	46.900	Sus_scrofa
ENSLOCG00000003577	rexo4	80	56.510	ENSTGUG00000005537	REXO4	91	55.858	Taeniopygia_guttata
ENSLOCG00000003577	rexo4	80	58.127	ENSTRUG00000013225	rexo4	86	58.592	Takifugu_rubripes
ENSLOCG00000003577	rexo4	80	57.746	ENSTNIG00000005873	rexo4	96	56.497	Tetraodon_nigroviridis
ENSLOCG00000003577	rexo4	84	50.660	ENSUAMG00000018676	REXO4	85	51.047	Ursus_americanus
ENSLOCG00000003577	rexo4	52	60.965	ENSUMAG00000023164	REXO4	59	60.965	Ursus_maritimus
ENSLOCG00000003577	rexo4	89	47.585	ENSVVUG00000027337	REXO4	91	46.445	Vulpes_vulpes
ENSLOCG00000003577	rexo4	69	54.276	ENSXETG00000023096	rexo4	84	53.333	Xenopus_tropicalis
ENSLOCG00000003577	rexo4	80	57.143	ENSXMAG00000013686	rexo4	90	54.891	Xiphophorus_maculatus