EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000003824 (Gene tree)
Gene ID: 102692168
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC102692168
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16180 bases
Position: chrLG20:5517186-5533365
Accession: 102692168
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000004569	MMR_HSR1	PF01926.23	1.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000004577	-	1353	XM_006640323	ENSLOCP00000004569	451 (aa)	XP_006640386	W5M861

Gene Model

Click here to download ENSLOCG00000003824's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLOCG00000003824's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	60.177	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	60.177	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.944	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	99	74.944	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.839	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	99	75.839	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	57.301	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	57.301	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.391	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	99	75.391	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.956	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.956	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.956	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.956	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.839	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	99	75.839	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.424	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	57.684	ENSACAG00000028632	-	98	57.906	Anolis_carolinensis
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.071	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.071	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.121	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.121	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.931	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	99	72.931	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	79	60.674	ENSCING00000020807	-	93	60.674	Ciona_intestinalis
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	98	55.756	ENSCSAVG00000009987	-	98	55.530	Ciona_savignyi
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	58.850	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	58.850	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.049	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	95	74.146	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.645	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	59.645	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	73.154	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	99	73.154	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.867	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	99	75.127	Danio_rerio
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	97	73.973	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	99	73.973	Danio_rerio
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	80	56.630	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	96	56.630	Eptatretus_burgeri
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	73.378	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	73.378	Esox_lucius
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	100	59.424	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.944	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	99	74.944	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	89	54.478	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	54.478	Gadus_morhua
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.867	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.867	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	73.154	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	73.154	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	57	87.549	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	98	87.549	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	85	64.062	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	62.035	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.292	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	58.758	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	58.758	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.160	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	98	72.160	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	96	58.986	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	58.986	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	70.246	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	70.246	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	85	57.031	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	85	57.031	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	58.537	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	58.537	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.273	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	99	74.273	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.497	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	99	74.497	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	61.161	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	61.607	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	67.114	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	67.114	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	62.222	ENSLACG00000004899	-	99	62.222	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	96	59.770	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	59.770	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.273	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	99	74.273	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.071	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.071	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	57.237	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.237	Mola_mola
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.424	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Monopterus_albus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	97	71.918	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	99	72.831	Monopterus_albus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	96	58.986	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	58.986	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	58.850	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	58.850	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	76.063	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	99	76.063	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	69.799	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	99	69.799	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.424	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.424	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.483	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	99	72.483	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.645	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	59.645	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.931	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	99	72.931	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	73.378	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	73.378	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.645	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	59.645	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.931	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	99	72.931	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.556	ENSPKIG00000023918	-	98	59.556	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.436	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.754	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	73.154	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	99	73.154	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.645	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	59.645	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.645	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	99	59.735	Poecilia_formosa
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.222	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	99	72.222	Poecilia_formosa
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.424	ENSPLAG00000019794	si:ch211-11k18.4	99	59.424	Poecilia_latipinna
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.483	ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	99	72.483	Poecilia_latipinna
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.645	ENSPMEG00000024198	si:ch211-11k18.4	99	59.770	Poecilia_mexicana
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.707	ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	93	72.707	Poecilia_mexicana
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	97	71.918	ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	99	71.918	Poecilia_reticulata
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	94	58.333	ENSPREG00000015319	si:ch211-11k18.4	98	58.333	Poecilia_reticulata
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.292	ENSPNYG00000017099	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Pundamilia_nyererei
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSPNYG00000017266	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Pundamilia_nyererei
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.121	ENSPNAG00000022138	si:ch211-11k18.4	99	59.121	Pygocentrus_nattereri
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.049	ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	99	74.049	Pygocentrus_nattereri
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	60.444	ENSSFOG00015000985	si:ch211-11k18.4	94	60.444	Scleropages_formosus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	69.575	ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	99	69.575	Scleropages_formosus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Scophthalmus_maximus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	57.871	ENSSMAG00000009651	si:ch211-11k18.4	99	57.871	Scophthalmus_maximus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.168	ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	75.168	Seriola_dumerili
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	58.758	ENSSDUG00000016411	si:ch211-11k18.4	99	58.758	Seriola_dumerili
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	58.980	ENSSLDG00000019145	si:ch211-11k18.4	99	58.980	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.391	ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	75.391	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	87	58.481	ENSSPUG00000010096	-	99	59.241	Sphenodon_punctatus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.513	ENSSPAG00000010697	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Stegastes_partitus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.391	ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	99	75.391	Stegastes_partitus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.071	ENSTRUG00000020291	si:ch211-11k18.4	99	59.071	Takifugu_rubripes
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	74.944	ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	99	74.944	Takifugu_rubripes
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	58.590	ENSXETG00000031783	-	99	58.590	Xenopus_tropicalis
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	73.602	ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	99	73.602	Xiphophorus_couchianus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	58.720	ENSXCOG00000018094	si:ch211-11k18.4	99	58.720	Xiphophorus_couchianus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	59.735	ENSXMAG00000021235	si:ch211-11k18.4	99	59.735	Xiphophorus_maculatus
ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	73.154	ENSXMAG00000007688	si:dkey-98f17.5	94	73.154	Xiphophorus_maculatus