EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000004035 (Gene tree)
Gene ID: 102694972
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: S-adenosyl-L-methionine-dependent tRNA 4-demethylwyosine synthase-like
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 68528 bases
Position: chrLG22:5423944-5492471
Accession: 102694972
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000004828	Wyosine_form	PF08608.12	1e-27	1	1
ENSLOCP00000004849	Wyosine_form	PF08608.12	1e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000004836	-	5197	XM_006641020	ENSLOCP00000004828	756 (aa)	XP_006641083	W5M8W9
ENSLOCT00000004857	-	4470	-	ENSLOCP00000004849	755 (aa)	-	W5M8Z0

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	61.528	ENSG00000277149	TYW1B	99	61.528	Homo_sapiens
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.891	ENSG00000198874	TYW1	99	69.891	Homo_sapiens
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	72.022	ENSAPOG00000014391	tyw1	96	73.895	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	70.458	ENSACIG00000007325	tyw1	99	70.458	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	72.199	ENSAOCG00000016792	tyw1	96	73.481	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	72.752	ENSAPEG00000015939	tyw1	97	74.548	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000004035	tyw1	86	72.256	ENSATEG00000006856	tyw1	90	72.256	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	68.392	ENSANAG00000037051	-	99	68.392	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000004035	tyw1	99	71.466	ENSACLG00000018688	tyw1	99	71.466	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	74.278	ENSAMXG00000004157	tyw1	99	74.278	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.536	ENSBTAG00000008446	TYW1	99	69.536	Bos_taurus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	68.399	ENSCJAG00000004295	-	99	68.399	Callithrix_jacchus
ENSLOCG00000004035	tyw1	97	68.293	ENSCAFG00000010867	-	99	69.106	Canis_familiaris
ENSLOCG00000004035	tyw1	97	60.300	ENSCAFG00020005367	-	99	64.132	Canis_lupus_dingo
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.377	ENSCHIG00000019510	-	99	69.377	Capra_hircus
ENSLOCG00000004035	tyw1	86	68.654	ENSTSYG00000008236	-	98	68.654	Carlito_syrichta
ENSLOCG00000004035	tyw1	84	66.509	ENSCAPG00000013569	-	99	67.190	Cavia_aperea
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	67.586	ENSCPOG00000011182	-	99	67.209	Cavia_porcellus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.346	ENSCCAG00000026643	-	99	69.346	Cebus_capucinus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.482	ENSCATG00000043677	-	99	69.482	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	68.681	ENSCLAG00000006321	-	99	68.956	Chinchilla_lanigera
ENSLOCG00000004035	tyw1	97	61.111	ENSCSAG00000018274	-	99	61.111	Chlorocebus_sabaeus
ENSLOCG00000004035	tyw1	73	86.325	ENSCHOG00000003801	-	84	86.325	Choloepus_hoffmanni
ENSLOCG00000004035	tyw1	99	71.070	ENSCPBG00000014896	-	100	70.789	Chrysemys_picta_bellii
ENSLOCG00000004035	tyw1	87	55.848	ENSCSAVG00000005712	-	100	56.575	Ciona_savignyi
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.755	ENSCANG00000033209	-	99	69.755	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLOCG00000004035	tyw1	68	78.161	ENSCGRG00001003679	Tyw1	90	77.009	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000004035	tyw1	99	69.814	ENSCSEG00000005810	tyw1	98	71.144	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000004035	tyw1	85	72.685	ENSCVAG00000001054	tyw1	91	72.840	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000004035	tyw1	99	72.053	ENSDARG00000062987	tyw1	99	72.053	Danio_rerio
ENSLOCG00000004035	tyw1	100	66.843	ENSDNOG00000024165	-	99	68.999	Dasypus_novemcinctus
ENSLOCG00000004035	tyw1	83	64.274	ENSDORG00000014772	Tyw1	91	64.960	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000004035	tyw1	58	70.833	ENSEBUG00000004494	tyw1	92	70.833	Eptatretus_burgeri
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.178	ENSEASG00005008818	-	99	69.178	Equus_asinus_asinus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	64.247	ENSECAG00000023164	-	99	64.247	Equus_caballus
ENSLOCG00000004035	tyw1	59	82.292	ENSEEUG00000005950	-	61	82.292	Erinaceus_europaeus
ENSLOCG00000004035	tyw1	100	67.979	ENSELUG00000008449	tyw1	99	69.565	Esox_lucius
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.210	ENSFCAG00000014262	-	99	69.210	Felis_catus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	64.256	ENSFALG00000013810	-	99	64.666	Ficedula_albicollis
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	67.034	ENSFDAG00000013270	-	98	67.813	Fukomys_damarensis
ENSLOCG00000004035	tyw1	81	72.375	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	72.771	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	67.619	ENSGALG00000001110	-	99	68.571	Gallus_gallus
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	70.014	ENSGACG00000012692	tyw1	98	70.151	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	71.798	ENSGAGG00000022393	-	99	72.503	Gopherus_agassizii
ENSLOCG00000004035	tyw1	87	61.504	ENSGGOG00000001473	TYW1	99	61.504	Gorilla_gorilla
ENSLOCG00000004035	tyw1	99	71.202	ENSHBUG00000002640	tyw1	99	71.202	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000004035	tyw1	85	69.315	ENSHGLG00000012093	-	100	69.315	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	68.326	ENSHGLG00100011743	TYW1	98	68.741	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	65.235	ENSHCOG00000019949	tyw1	96	65.235	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000004035	tyw1	99	71.561	ENSIPUG00000016330	tyw1	100	71.825	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	68.050	ENSSTOG00000004067	-	90	68.138	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	66.992	ENSJJAG00000022959	Tyw1	98	68.182	Jaculus_jaculus
ENSLOCG00000004035	tyw1	100	70.249	ENSKMAG00000018599	tyw1	100	70.249	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000004035	tyw1	99	68.289	ENSLACG00000018917	tyw1	100	68.283	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.619	ENSMFAG00000035457	-	99	69.619	Macaca_fascicularis
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.619	ENSMMUG00000030374	-	99	69.619	Macaca_mulatta
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.619	ENSMNEG00000041992	-	99	69.619	Macaca_nemestrina
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.619	ENSMLEG00000039741	-	99	69.619	Mandrillus_leucophaeus
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	72.928	ENSMAMG00000016089	tyw1	94	72.928	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000004035	tyw1	91	74.282	ENSMZEG00005024386	tyw1	99	74.282	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000004035	tyw1	97	67.615	ENSMGAG00000002176	-	99	67.615	Meleagris_gallopavo
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	68.182	ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	68.320	Mesocricetus_auratus
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	69.890	ENSMICG00000014374	-	99	69.890	Microcebus_murinus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	65.934	ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	67.082	Microtus_ochrogaster
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	66.944	ENSMMOG00000005064	tyw1	97	67.545	Mola_mola
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	67.655	ENSMODG00000025697	-	99	68.151	Monodelphis_domestica
ENSLOCG00000004035	tyw1	99	70.806	ENSMALG00000010238	tyw1	99	70.933	Monopterus_albus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	66.896	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	99	67.260	Mus_caroli
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	67.406	ENSMUSG00000056310	Tyw1	99	67.773	Mus_musculus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	66.986	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	99	67.720	Mus_pahari
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	66.990	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	99	67.358	Mus_spretus
ENSLOCG00000004035	tyw1	92	70.115	ENSMPUG00000016191	-	100	70.115	Mustela_putorius_furo
ENSLOCG00000004035	tyw1	97	65.811	ENSMLUG00000013582	-	99	66.035	Myotis_lucifugus
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	68.377	ENSNGAG00000002742	Tyw1	99	68.377	Nannospalax_galili
ENSLOCG00000004035	tyw1	92	72.246	ENSNBRG00000016996	tyw1	99	72.246	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000004035	tyw1	99	67.733	ENSNLEG00000013210	-	98	68.801	Nomascus_leucogenys
ENSLOCG00000004035	tyw1	88	55.988	ENSOPRG00000008734	-	88	56.418	Ochotona_princeps
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	61.026	ENSODEG00000014729	-	98	61.304	Octodon_degus
ENSLOCG00000004035	tyw1	99	71.391	ENSONIG00000005872	tyw1	99	71.391	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	68.655	ENSOCUG00000003173	-	99	68.120	Oryctolagus_cuniculus
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	70.474	ENSORLG00000001393	tyw1	98	69.359	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	70.056	ENSORLG00020019361	tyw1	98	69.499	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	70.278	ENSORLG00015008095	tyw1	94	70.874	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000004035	tyw1	89	72.230	ENSOGAG00000016555	-	99	67.297	Otolemur_garnettii
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.231	ENSOARG00000010673	-	99	69.231	Ovis_aries
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	68.999	ENSPPRG00000004945	-	99	68.999	Panthera_pardus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	68.999	ENSPTIG00000019545	-	99	68.999	Panthera_tigris_altaica
ENSLOCG00000004035	tyw1	99	64.058	ENSPTRG00000023076	TYW1B	99	64.058	Pan_troglodytes
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.619	ENSPANG00000019053	-	99	69.619	Papio_anubis
ENSLOCG00000004035	tyw1	99	71.561	ENSPKIG00000006545	tyw1	100	71.429	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000004035	tyw1	93	71.208	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	71.208	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	67.862	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	68.088	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	73.370	ENSPFOG00000015855	tyw1	97	73.370	Poecilia_formosa
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	72.016	ENSPLAG00000000838	tyw1	100	70.043	Poecilia_latipinna
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	72.215	ENSPMEG00000019437	tyw1	99	70.056	Poecilia_mexicana
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	68.942	ENSPREG00000018773	tyw1	96	69.861	Poecilia_reticulata
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	68.392	ENSPPYG00000017514	TYW1	99	69.482	Pongo_abelii
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	54.195	ENSPCOG00000015294	-	98	54.333	Propithecus_coquereli
ENSLOCG00000004035	tyw1	99	71.466	ENSPNYG00000022381	tyw1	99	72.059	Pundamilia_nyererei
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	75.962	ENSPNAG00000009001	tyw1	99	75.962	Pygocentrus_nattereri
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	67.030	ENSRNOG00000024352	Tyw1	99	68.407	Rattus_norvegicus
ENSLOCG00000004035	tyw1	98	68.491	ENSRBIG00000039619	-	99	69.619	Rhinopithecus_bieti
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.619	ENSRROG00000039780	-	99	69.619	Rhinopithecus_roxellana
ENSLOCG00000004035	tyw1	93	38.806	YPL207W	-	81	38.806	Saccharomyces_cerevisiae
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	67.978	ENSSBOG00000025873	-	99	67.978	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	67.984	ENSSHAG00000010346	-	99	69.103	Sarcophilus_harrisii
ENSLOCG00000004035	tyw1	99	70.899	ENSSFOG00015001054	tyw1	99	72.953	Scleropages_formosus
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	72.192	ENSSMAG00000020514	tyw1	96	72.192	Scophthalmus_maximus
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	73.764	ENSSDUG00000001552	tyw1	94	76.751	Seriola_dumerili
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	73.626	ENSSLDG00000003554	tyw1	96	73.626	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.210	ENSSPUG00000002715	-	99	69.619	Sphenodon_punctatus
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	69.041	ENSSSCG00000007733	-	99	69.041	Sus_scrofa
ENSLOCG00000004035	tyw1	88	66.867	ENSTGUG00000003428	-	99	67.319	Taeniopygia_guttata
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	71.961	ENSTRUG00000016107	tyw1	93	72.099	Takifugu_rubripes
ENSLOCG00000004035	tyw1	87	75.449	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	75.449	Tetraodon_nigroviridis
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	68.801	ENSUMAG00000015343	-	99	68.801	Ursus_maritimus
ENSLOCG00000004035	tyw1	97	67.751	ENSVVUG00000016457	-	99	68.564	Vulpes_vulpes
ENSLOCG00000004035	tyw1	96	70.245	ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.805	Xenopus_tropicalis
ENSLOCG00000004035	tyw1	95	72.284	ENSXMAG00000013125	tyw1	99	72.646	Xiphophorus_maculatus