EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000004792 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: celf4
Alias: zgc:92761
Full Name: CUGBP%2C Elav-like family member 4
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 41379 bases
Position: chrLG2:12582319-12623697
Accession: ZDB-GENE-040718-300
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000005754	RRM_1	PF00076.22	5.2e-37	1	2
ENSLOCP00000005754	RRM_1	PF00076.22	5.2e-37	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000005762	-	1277	-	ENSLOCP00000005754	411 (aa)	-	W5MBJ5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLOCG00000004792	celf4	98	42.651	ENSLOCG00000005966	celf1	90	40.421
ENSLOCG00000004792	celf4	98	59.233	ENSLOCG00000006518	celf3b	97	59.472
ENSLOCG00000004792	celf4	98	40.724	ENSLOCG00000015690	celf2	88	42.923
ENSLOCG00000004792	celf4	98	61.446	ENSLOCG00000005481	celf5a	98	61.557
ENSLOCG00000004792	celf4	98	66.425	ENSLOCG00000015141	si:dkey-205h23.2	98	67.229

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.880	ENSG00000101489	CELF4	96	95.122	Homo_sapiens
ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.638	ENSAPOG00000002964	celf4	93	81.638	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000004792	celf4	85	68.436	ENSAMEG00000017059	CELF4	90	69.553	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLOCG00000004792	celf4	99	60.050	ENSACIG00000018097	celf4	92	59.305	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000004792	celf4	71	53.535	ENSAOCG00000019919	-	75	53.287	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.638	ENSAOCG00000020590	celf4	93	81.638	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000004792	celf4	98	63.704	ENSAPEG00000002940	celf4	90	63.704	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000004792	celf4	98	63.704	ENSATEG00000023731	celf4	92	63.704	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000004792	celf4	95	64.384	ENSAPLG00000007830	-	100	64.384	Anas_platyrhynchos
ENSLOCG00000004792	celf4	67	80.866	ENSACAG00000012428	CELF4	96	80.866	Anolis_carolinensis
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.305	ENSANAG00000029499	CELF4	93	70.264	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.390	ENSACLG00000011828	celf4	93	81.390	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000004792	celf4	98	83.127	ENSAMXG00000007935	celf4	96	83.127	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000004792	celf4	82	95.122	ENSBTAG00000004940	CELF4	91	95.122	Bos_taurus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.231	ENSCJAG00000021135	CELF4	93	70.192	Callithrix_jacchus
ENSLOCG00000004792	celf4	82	95.122	ENSCHIG00000007169	CELF4	91	95.122	Capra_hircus
ENSLOCG00000004792	celf4	98	69.305	ENSTSYG00000000816	CELF4	84	70.264	Carlito_syrichta
ENSLOCG00000004792	celf4	98	74.458	ENSCPOG00000035956	CELF4	78	74.217	Cavia_porcellus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.305	ENSCCAG00000028373	CELF4	93	70.264	Cebus_capucinus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.231	ENSCATG00000045293	CELF4	93	70.192	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000004792	celf4	99	74.458	ENSCLAG00000008344	CELF4	93	74.217	Chinchilla_lanigera
ENSLOCG00000004792	celf4	96	77.078	ENSCSAG00000017933	CELF4	100	77.582	Chlorocebus_sabaeus
ENSLOCG00000004792	celf4	96	71.608	ENSCPBG00000005237	CELF4	93	71.357	Chrysemys_picta_bellii
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.305	ENSCANG00000036735	CELF4	93	70.264	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLOCG00000004792	celf4	86	73.950	ENSCGRG00001018085	Celf4	75	73.669	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000004792	celf4	98	81.886	ENSCSEG00000007074	celf4	87	97.619	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000004792	celf4	99	63.210	ENSCVAG00000017617	celf4	91	63.704	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000004792	celf4	98	81.886	ENSDARG00000070045	celf4	98	81.141	Danio_rerio
ENSLOCG00000004792	celf4	97	75.931	ENSDNOG00000032492	CELF4	97	76.179	Dasypus_novemcinctus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	74.458	ENSDORG00000007169	Celf4	93	74.217	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000004792	celf4	99	71.253	ENSEASG00005016534	CELF4	93	72.236	Equus_asinus_asinus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.231	ENSECAG00000008810	CELF4	72	96.552	Equus_caballus
ENSLOCG00000004792	celf4	83	60.784	ENSEEUG00000003763	CELF4	70	61.972	Erinaceus_europaeus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	71.007	ENSFCAG00000045234	CELF4	93	71.990	Felis_catus
ENSLOCG00000004792	celf4	96	77.078	ENSFALG00000009188	CELF4	98	77.582	Ficedula_albicollis
ENSLOCG00000004792	celf4	98	74.458	ENSFDAG00000010287	CELF4	78	74.217	Fukomys_damarensis
ENSLOCG00000004792	celf4	99	56.954	ENSFHEG00000003431	celf4	91	57.395	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000004792	celf4	96	70.960	ENSGMOG00000008703	celf4	74	70.960	Gadus_morhua
ENSLOCG00000004792	celf4	81	92.683	ENSGMOG00000011747	-	74	92.683	Gadus_morhua
ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.141	ENSGAFG00000021515	celf4	85	80.149	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000004792	celf4	99	76.355	ENSGACG00000008752	celf4	93	76.355	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000004792	celf4	74	85.185	ENSGAGG00000017672	-	78	90.217	Gopherus_agassizii
ENSLOCG00000004792	celf4	86	69.209	ENSGAGG00000023014	-	98	69.774	Gopherus_agassizii
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.305	ENSGGOG00000013920	CELF4	93	70.264	Gorilla_gorilla
ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.141	ENSHBUG00000021618	celf4	93	80.149	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.639	ENSHGLG00000003130	CELF4	93	69.398	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000004792	celf4	99	73.735	ENSHGLG00100006394	CELF4	93	73.494	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000004792	celf4	99	62.963	ENSHCOG00000012195	celf4	93	62.222	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000004792	celf4	98	71.216	ENSIPUG00000010810	celf4	82	71.216	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	73.494	ENSJJAG00000016892	Celf4	93	73.253	Jaculus_jaculus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.638	ENSKMAG00000019602	celf4	94	81.638	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000004792	celf4	98	63.704	ENSLBEG00000000940	celf4	91	63.704	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000004792	celf4	80	95.495	ENSLAFG00000021352	CELF4	100	71.608	Loxodonta_africana
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.305	ENSMFAG00000042983	CELF4	93	70.264	Macaca_fascicularis
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.880	ENSMMUG00000006866	CELF4	93	70.361	Macaca_mulatta
ENSLOCG00000004792	celf4	99	71.007	ENSMNEG00000033449	CELF4	93	71.990	Macaca_nemestrina
ENSLOCG00000004792	celf4	88	74.247	ENSMLEG00000028543	CELF4	76	73.973	Mandrillus_leucophaeus
ENSLOCG00000004792	celf4	98	63.704	ENSMAMG00000018573	celf4	90	63.704	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	63.291	ENSMZEG00005026879	celf4	88	63.291	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000004792	celf4	86	55.056	ENSMGAG00000017029	CELF4	100	54.213	Meleagris_gallopavo
ENSLOCG00000004792	celf4	99	68.990	ENSMICG00000006984	CELF4	93	69.952	Microcebus_murinus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	73.976	ENSMOCG00000011985	Celf4	93	73.976	Microtus_ochrogaster
ENSLOCG00000004792	celf4	99	63.210	ENSMMOG00000012281	celf4	92	63.210	Mola_mola
ENSLOCG00000004792	celf4	81	72.836	ENSMODG00000000306	CELF4	78	72.836	Monodelphis_domestica
ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.638	ENSMALG00000001696	celf4	93	81.638	Monopterus_albus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	74.217	MGP_CAROLIEiJ_G0022058	Celf4	99	70.024	Mus_caroli
ENSLOCG00000004792	celf4	99	75.676	ENSMUSG00000024268	Celf4	93	76.658	Mus_musculus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	74.217	MGP_PahariEiJ_G0018792	Celf4	99	70.024	Mus_pahari
ENSLOCG00000004792	celf4	99	74.217	MGP_SPRETEiJ_G0022969	Celf4	99	69.231	Mus_spretus
ENSLOCG00000004792	celf4	98	63.615	ENSMPUG00000001027	CELF4	98	66.359	Mustela_putorius_furo
ENSLOCG00000004792	celf4	98	74.384	ENSMLUG00000001755	CELF4	98	74.631	Myotis_lucifugus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	74.217	ENSNGAG00000000761	Celf4	93	74.699	Nannospalax_galili
ENSLOCG00000004792	celf4	99	63.291	ENSNBRG00000018194	celf4	88	63.291	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000004792	celf4	81	69.345	ENSMEUG00000007202	-	84	69.940	Notamacropus_eugenii
ENSLOCG00000004792	celf4	78	70.504	ENSOPRG00000014415	CELF4	82	76.259	Ochotona_princeps
ENSLOCG00000004792	celf4	99	74.458	ENSODEG00000018464	CELF4	93	74.217	Octodon_degus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.390	ENSONIG00000019463	celf4	93	80.397	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000004792	celf4	85	72.254	ENSOCUG00000024790	CELF4	75	73.199	Oryctolagus_cuniculus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.390	ENSORLG00000008913	celf4	93	80.397	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.390	ENSORLG00020008454	celf4	93	80.397	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.390	ENSORLG00015004115	celf4	93	80.397	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.638	ENSOMEG00000002391	celf4	93	81.638	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000004792	celf4	98	76.010	ENSOGAG00000010018	CELF4	98	76.485	Otolemur_garnettii
ENSLOCG00000004792	celf4	86	73.521	ENSOARG00000005276	CELF4	100	73.521	Ovis_aries
ENSLOCG00000004792	celf4	90	74.247	ENSPPAG00000020644	CELF4	90	73.973	Pan_paniscus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.305	ENSPPRG00000007683	CELF4	93	70.264	Panthera_pardus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.305	ENSPTRG00000009982	CELF4	93	70.264	Pan_troglodytes
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.305	ENSPANG00000006365	CELF4	93	70.264	Papio_anubis
ENSLOCG00000004792	celf4	98	76.049	ENSPKIG00000017421	celf4	90	76.296	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000004792	celf4	96	77.078	ENSPSIG00000015538	CELF4	98	77.582	Pelodiscus_sinensis
ENSLOCG00000004792	celf4	99	74.217	ENSPEMG00000019299	Celf4	93	73.976	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLOCG00000004792	celf4	56	71.795	ENSPLAG00000012151	celf4	79	72.650	Poecilia_latipinna
ENSLOCG00000004792	celf4	66	97.619	ENSPMEG00000015313	celf4	88	97.619	Poecilia_mexicana
ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.390	ENSPREG00000021231	celf4	93	81.390	Poecilia_reticulata
ENSLOCG00000004792	celf4	76	76.279	ENSPCAG00000000126	CELF4	75	77.209	Procavia_capensis
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.305	ENSPVAG00000009204	CELF4	93	70.264	Pteropus_vampyrus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	63.291	ENSPNYG00000004131	celf4	88	63.291	Pundamilia_nyererei
ENSLOCG00000004792	celf4	98	83.127	ENSPNAG00000006426	celf4	92	83.127	Pygocentrus_nattereri
ENSLOCG00000004792	celf4	94	69.054	ENSRNOG00000014503	Celf4	100	70.077	Rattus_norvegicus
ENSLOCG00000004792	celf4	99	71.007	ENSRBIG00000035924	CELF4	93	71.990	Rhinopithecus_bieti
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.305	ENSRROG00000014839	CELF4	93	70.264	Rhinopithecus_roxellana
ENSLOCG00000004792	celf4	99	69.305	ENSSBOG00000030001	CELF4	90	70.264	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLOCG00000004792	celf4	89	71.622	ENSSHAG00000009193	CELF4	97	71.892	Sarcophilus_harrisii
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ENSLOCG00000004792	celf4	99	79.952	ENSSMAG00000009331	celf4	91	97.619	Scophthalmus_maximus
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ENSLOCG00000004792	celf4	99	57.616	ENSSPAG00000018307	celf4	91	57.616	Stegastes_partitus
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