EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000005222 (Gene tree)
Gene ID: 102686237
Gene Symbol: polrmt
Alias: si:dkey-21e2.1|si:dkeyp-74c5.5|wu:fb73g10
Full Name: RNA polymerase mitochondrial
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 48310 bases
Position: chrLG19:7633158-7681467
Accession: 102686237
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000006293	RNA_pol	PF00940.19	1.1e-133	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000006301	-	4041	XM_006640041	ENSLOCP00000006293	1255 (aa)	XP_006640104	W5MD34

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.726	ENSG00000099821	POLRMT	67	74.118	Homo_sapiens
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.675	ENSAPOG00000003942	polrmt	100	57.750	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000005222	polrmt	77	47.716	ENSAMEG00000002745	POLRMT	82	47.716	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLOCG00000005222	polrmt	89	60.663	ENSACIG00000016078	polrmt	99	60.663	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.844	ENSAOCG00000020208	polrmt	100	57.844	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.770	ENSAPEG00000007949	polrmt	100	57.770	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	56.983	ENSATEG00000024025	polrmt	100	57.560	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000005222	polrmt	77	52.390	ENSAPLG00000003051	POLRMT	99	52.182	Anas_platyrhynchos
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.144	ENSANAG00000032916	POLRMT	97	41.144	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.291	ENSACLG00000003766	polrmt	100	58.197	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000005222	polrmt	98	64.852	ENSAMXG00000018258	polrmt	100	64.852	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	42.879	ENSBTAG00000015051	POLRMT	98	42.958	Bos_taurus
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.003	ENSCJAG00000012913	POLRMT	97	41.003	Callithrix_jacchus
ENSLOCG00000005222	polrmt	97	43.169	ENSCAFG00000019711	POLRMT	98	43.169	Canis_familiaris
ENSLOCG00000005222	polrmt	97	43.169	ENSCAFG00020016843	POLRMT	99	43.175	Canis_lupus_dingo
ENSLOCG00000005222	polrmt	81	46.922	ENSCHIG00000013267	POLRMT	87	47.015	Capra_hircus
ENSLOCG00000005222	polrmt	72	49.388	ENSCAPG00000016900	POLRMT	89	49.390	Cavia_aperea
ENSLOCG00000005222	polrmt	95	40.352	ENSCPOG00000023061	POLRMT	96	40.352	Cavia_porcellus
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.699	ENSCCAG00000025014	POLRMT	97	41.699	Cebus_capucinus
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.527	ENSCATG00000040393	POLRMT	97	41.527	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000005222	polrmt	86	42.182	ENSCLAG00000007473	POLRMT	80	42.450	Chinchilla_lanigera
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.673	ENSCSAG00000012942	POLRMT	97	41.673	Chlorocebus_sabaeus
ENSLOCG00000005222	polrmt	95	52.157	ENSCPBG00000009869	POLRMT	99	56.474	Chrysemys_picta_bellii
ENSLOCG00000005222	polrmt	60	39.632	ENSCSAVG00000000440	-	99	39.632	Ciona_savignyi
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.899	ENSCANG00000038011	POLRMT	97	41.979	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLOCG00000005222	polrmt	74	51.189	ENSCGRG00001021311	Polrmt	83	51.189	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000005222	polrmt	77	45.544	ENSCGRG00000011134	Polrmt	84	45.544	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	50.452	ENSCSEG00000002734	polrmt	100	50.452	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	58.197	ENSCVAG00000005949	polrmt	100	58.197	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	58.138	ENSDARG00000101220	polrmt	100	58.138	Danio_rerio
ENSLOCG00000005222	polrmt	75	52.350	ENSDORG00000014125	Polrmt	86	52.350	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000005222	polrmt	77	39.662	FBgn0261938	mtRNApol	77	39.511	Drosophila_melanogaster
ENSLOCG00000005222	polrmt	90	53.814	ENSETEG00000003476	POLRMT	90	53.945	Echinops_telfairi
ENSLOCG00000005222	polrmt	70	46.344	ENSEBUG00000013453	-	99	46.344	Eptatretus_burgeri
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	43.489	ENSEASG00005021493	POLRMT	97	43.725	Equus_asinus_asinus
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	43.072	ENSECAG00000032711	POLRMT	97	43.162	Equus_caballus
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	56.301	ENSELUG00000019319	polrmt	100	56.783	Esox_lucius
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	44.206	ENSFCAG00000018808	POLRMT	97	44.241	Felis_catus
ENSLOCG00000005222	polrmt	83	47.810	ENSFALG00000013910	POLRMT	99	47.568	Ficedula_albicollis
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	40.108	ENSFDAG00000020312	POLRMT	97	40.308	Fukomys_damarensis
ENSLOCG00000005222	polrmt	99	56.674	ENSFHEG00000021239	polrmt	99	59.029	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000005222	polrmt	94	55.186	ENSGMOG00000011829	polrmt	100	55.186	Gadus_morhua
ENSLOCG00000005222	polrmt	97	49.292	ENSGALG00000001377	POLRMT	99	49.334	Gallus_gallus
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.515	ENSGAFG00000003953	polrmt	100	57.515	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000005222	polrmt	94	57.536	ENSGACG00000012957	polrmt	100	57.780	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000005222	polrmt	94	54.752	ENSGAGG00000005522	POLRMT	100	54.805	Gopherus_agassizii
ENSLOCG00000005222	polrmt	76	43.093	ENSGGOG00000023264	-	82	64.127	Gorilla_gorilla
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	56.921	ENSHBUG00000010005	polrmt	100	57.824	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	40.704	ENSHGLG00000019286	POLRMT	97	40.933	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	40.504	ENSHGLG00100005762	POLRMT	97	40.299	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	54.927	ENSHCOG00000001565	polrmt	100	54.927	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	61.334	ENSIPUG00000000789	polrmt	100	61.334	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000005222	polrmt	88	54.160	ENSSTOG00000003431	POLRMT	94	54.054	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLOCG00000005222	polrmt	92	51.645	ENSJJAG00000012916	Polrmt	96	51.895	Jaculus_jaculus
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.132	ENSKMAG00000004426	polrmt	100	57.132	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.650	ENSLBEG00000016529	polrmt	100	58.389	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	60.032	ENSLACG00000011518	POLRMT	99	60.032	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.335	ENSLAFG00000001860	POLRMT	97	41.779	Loxodonta_africana
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.673	ENSMFAG00000031466	POLRMT	97	41.673	Macaca_fascicularis
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.594	ENSMNEG00000039129	POLRMT	97	41.594	Macaca_nemestrina
ENSLOCG00000005222	polrmt	89	60.267	ENSMLEG00000037404	POLRMT	96	60.267	Mandrillus_leucophaeus
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.544	ENSMAMG00000019284	polrmt	100	58.395	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.291	ENSMZEG00005009932	polrmt	100	58.197	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000005222	polrmt	77	54.917	ENSMGAG00000003243	POLRMT	99	49.191	Meleagris_gallopavo
ENSLOCG00000005222	polrmt	92	52.857	ENSMAUG00000019392	Polrmt	97	52.857	Mesocricetus_auratus
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	42.038	ENSMICG00000016701	POLRMT	97	41.992	Microcebus_murinus
ENSLOCG00000005222	polrmt	95	39.904	ENSMOCG00000008868	Polrmt	97	39.857	Microtus_ochrogaster
ENSLOCG00000005222	polrmt	95	53.160	ENSMMOG00000000705	polrmt	99	53.239	Mola_mola
ENSLOCG00000005222	polrmt	97	44.514	ENSMODG00000006478	POLRMT	98	44.592	Monodelphis_domestica
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	56.003	ENSMALG00000021224	polrmt	100	56.003	Monopterus_albus
ENSLOCG00000005222	polrmt	93	52.532	MGP_CAROLIEiJ_G0015538	Polrmt	97	52.532	Mus_caroli
ENSLOCG00000005222	polrmt	91	52.690	ENSMUSG00000020329	Polrmt	99	52.690	Mus_musculus
ENSLOCG00000005222	polrmt	94	41.821	MGP_PahariEiJ_G0030951	Polrmt	97	41.574	Mus_pahari
ENSLOCG00000005222	polrmt	91	52.456	MGP_SPRETEiJ_G0016356	Polrmt	99	52.456	Mus_spretus
ENSLOCG00000005222	polrmt	95	43.288	ENSMPUG00000009910	POLRMT	96	43.288	Mustela_putorius_furo
ENSLOCG00000005222	polrmt	95	42.880	ENSMLUG00000009223	POLRMT	96	42.880	Myotis_lucifugus
ENSLOCG00000005222	polrmt	93	53.724	ENSNGAG00000005498	Polrmt	97	53.724	Nannospalax_galili
ENSLOCG00000005222	polrmt	99	57.444	ENSNBRG00000023530	polrmt	100	57.820	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.673	ENSNLEG00000000718	POLRMT	97	41.673	Nomascus_leucogenys
ENSLOCG00000005222	polrmt	60	49.438	ENSOPRG00000013579	POLRMT	67	49.563	Ochotona_princeps
ENSLOCG00000005222	polrmt	90	55.491	ENSONIG00000002405	polrmt	100	59.413	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.982	ENSORLG00000004329	polrmt	97	57.982	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.756	ENSORLG00020003896	polrmt	100	57.756	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.687	ENSORLG00015022238	polrmt	97	57.687	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	56.048	ENSOMEG00000008292	polrmt	100	56.349	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	42.540	ENSOGAG00000007912	POLRMT	97	42.540	Otolemur_garnettii
ENSLOCG00000005222	polrmt	98	35.209	ENSOARG00000008898	POLRMT	90	54.202	Ovis_aries
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.959	ENSPPAG00000030853	POLRMT	97	41.959	Pan_paniscus
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	40.032	ENSPPAG00000043321	-	97	40.143	Pan_paniscus
ENSLOCG00000005222	polrmt	82	52.790	ENSPPRG00000001547	POLRMT	89	52.722	Panthera_pardus
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	40.301	ENSPTRG00000039638	-	97	40.301	Pan_troglodytes
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.013	ENSPTRG00000010157	POLRMT	93	41.013	Pan_troglodytes
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.148	ENSPANG00000006649	POLRMT	97	41.148	Papio_anubis
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	60.244	ENSPKIG00000024580	polrmt	100	60.396	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000005222	polrmt	88	57.912	ENSPMGG00000014627	polrmt	99	57.609	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLOCG00000005222	polrmt	92	52.449	ENSPEMG00000011671	Polrmt	97	52.449	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLOCG00000005222	polrmt	65	49.600	ENSPMAG00000005070	-	99	49.600	Petromyzon_marinus
ENSLOCG00000005222	polrmt	97	47.257	ENSPCIG00000006103	POLRMT	98	47.257	Phascolarctos_cinereus
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.637	ENSPFOG00000003911	polrmt	100	58.077	Poecilia_formosa
ENSLOCG00000005222	polrmt	89	55.489	ENSPLAG00000005743	polrmt	99	55.386	Poecilia_latipinna
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	58.968	ENSPMEG00000008947	polrmt	99	58.968	Poecilia_mexicana
ENSLOCG00000005222	polrmt	69	49.079	ENSPMEG00000011484	polrmt	95	49.079	Poecilia_mexicana
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.356	ENSPREG00000007650	polrmt	100	57.356	Poecilia_reticulata
ENSLOCG00000005222	polrmt	90	52.917	ENSPPYG00000009282	POLRMT	97	52.917	Pongo_abelii
ENSLOCG00000005222	polrmt	90	60.870	ENSPCAG00000010816	POLRMT	91	60.870	Procavia_capensis
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.228	ENSPCOG00000014539	POLRMT	97	41.228	Propithecus_coquereli
ENSLOCG00000005222	polrmt	95	42.135	ENSPVAG00000008403	POLRMT	96	42.215	Pteropus_vampyrus
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.143	ENSPNYG00000020790	polrmt	100	58.048	Pundamilia_nyererei
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	58.714	ENSPNAG00000019790	polrmt	99	59.559	Pygocentrus_nattereri
ENSLOCG00000005222	polrmt	97	41.089	ENSRNOG00000024879	Polrmt	99	41.089	Rattus_norvegicus
ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.853	ENSRBIG00000006728	POLRMT	97	41.853	Rhinopithecus_bieti
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ENSLOCG00000005222	polrmt	96	41.167	ENSSBOG00000025388	POLRMT	97	41.167	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSLOCG00000005222	polrmt	94	52.803	ENSXETG00000006545	polrmt	95	52.427	Xenopus_tropicalis
ENSLOCG00000005222	polrmt	100	57.804	ENSXMAG00000012464	polrmt	100	57.804	Xiphophorus_maculatus