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Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000005725 (Gene tree)
Gene ID: 102686444
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30395 bases
Position: chrLG20:7635899-7666293
Accession: 102686444
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000006915	ResIII	PF04851.15	5.8e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000006923	-	6334	XM_006640380	ENSLOCP00000006915	1428 (aa)	XP_006640443	W5MEV6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLOCG00000005725	sbno1	78	60.811	ENSLOCG00000004643	si:ch73-63e15.2	69	66.440

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.805	ENSG00000139697	SBNO1	99	81.663	Homo_sapiens
ENSLOCG00000005725	sbno1	81	86.926	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	86.926	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.560	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	81.290	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	78.683	ENSACIG00000008088	sbno1	99	79.178	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.381	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	80.875	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.381	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	80.875	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	82.055	ENSATEG00000006667	sbno1	100	82.336	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	82.575	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	82.361	Anas_platyrhynchos
ENSLOCG00000005725	sbno1	98	80.536	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	79.831	Anolis_carolinensis
ENSLOCG00000005725	sbno1	92	88.748	ENSANAG00000029958	-	99	88.288	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	78.152	ENSACLG00000024913	sbno1	100	78.255	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	86.467	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	86.467	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000005725	sbno1	98	81.960	ENSBTAG00000020505	SBNO1	100	82.115	Bos_taurus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.734	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	81.592	Callithrix_jacchus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.831	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	89.881	Canis_familiaris
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	86.871	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	86.871	Canis_lupus_dingo
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	88.689	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	88.689	Capra_hircus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.805	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	82.491	Carlito_syrichta
ENSLOCG00000005725	sbno1	89	88.669	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	88.669	Cavia_aperea
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	88.669	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	88.669	Cavia_porcellus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	77.415	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	77.344	Cebus_capucinus
ENSLOCG00000005725	sbno1	90	88.849	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	88.849	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	89.029	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	89.029	Chinchilla_lanigera
ENSLOCG00000005725	sbno1	81	85.886	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	85.714	Chlorocebus_sabaeus
ENSLOCG00000005725	sbno1	93	77.894	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	77.704	Choloepus_hoffmanni
ENSLOCG00000005725	sbno1	98	82.705	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	82.278	Chrysemys_picta_bellii
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	77.841	ENSCANG00000042688	-	99	77.699	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLOCG00000005725	sbno1	93	87.612	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	87.612	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000005725	sbno1	93	87.612	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	87.612	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.239	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	80.872	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.577	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	80.929	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	85.520	ENSDARG00000099080	sbno1	99	85.591	Danio_rerio
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	83.429	ENSDNOG00000017147	SBNO1	96	83.429	Dasypus_novemcinctus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	76.245	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	73.752	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000005725	sbno1	91	78.616	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	78.616	Echinops_telfairi
ENSLOCG00000005725	sbno1	75	61.241	ENSEBUG00000013823	sbno1	95	60.960	Eptatretus_burgeri
ENSLOCG00000005725	sbno1	50	78.822	ENSEASG00005012595	-	92	79.132	Equus_asinus_asinus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	82.018	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	82.405	Equus_caballus
ENSLOCG00000005725	sbno1	81	85.246	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	85.246	Erinaceus_europaeus
ENSLOCG00000005725	sbno1	98	83.955	ENSELUG00000002886	sbno1	100	84.096	Esox_lucius
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.805	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	81.605	Felis_catus
ENSLOCG00000005725	sbno1	96	82.332	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	82.374	Ficedula_albicollis
ENSLOCG00000005725	sbno1	98	80.127	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	84.946	Fukomys_damarensis
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.946	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	80.875	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000005725	sbno1	91	83.728	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.410	Gadus_morhua
ENSLOCG00000005725	sbno1	86	83.199	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	82.476	Gallus_gallus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.986	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	81.127	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000005725	sbno1	91	83.841	ENSGACG00000015633	sbno1	99	83.905	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	82.123	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	88.889	Gopherus_agassizii
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	88.669	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	88.669	Gorilla_gorilla
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	72.480	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	72.520	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000005725	sbno1	92	89.292	ENSHGLG00000014165	-	99	88.689	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000005725	sbno1	89	86.047	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	86.047	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	85.755	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	86.396	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	89.029	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	89.029	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	84.532	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	84.532	Jaculus_jaculus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.848	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	81.131	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.320	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	81.544	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000005725	sbno1	98	78.738	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	80.949	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.166	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	81.321	Loxodonta_africana
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	85.231	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	85.231	Macaca_fascicularis
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	85.231	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	85.231	Macaca_mulatta
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	88.849	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	88.849	Mandrillus_leucophaeus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.845	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	80.634	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	82.918	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	82.705	Meleagris_gallopavo
ENSLOCG00000005725	sbno1	92	86.207	ENSMICG00000006573	-	99	85.766	Microcebus_murinus
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	87.792	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	87.792	Microtus_ochrogaster
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	76.491	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	76.612	Mola_mola
ENSLOCG00000005725	sbno1	98	82.199	ENSMODG00000012470	SBNO1	99	82.057	Monodelphis_domestica
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.464	ENSMALG00000001056	sbno1	100	80.253	Monopterus_albus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.779	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	92.544	Mus_caroli
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.993	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	92.544	Mus_musculus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	82.090	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	92.544	Mus_pahari
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.851	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	92.544	Mus_spretus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.805	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	81.605	Mustela_putorius_furo
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.734	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	81.889	Myotis_lucifugus
ENSLOCG00000005725	sbno1	92	89.824	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	89.824	Nannospalax_galili
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	78.351	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	78.669	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	78.977	ENSNLEG00000001502	SBNO1	98	84.405	Nomascus_leucogenys
ENSLOCG00000005725	sbno1	61	77.160	ENSMEUG00000008768	-	93	76.543	Notamacropus_eugenii
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.554	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	80.128	Ochotona_princeps
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	89.029	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	89.029	Octodon_degus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.098	ENSONIG00000015348	sbno1	100	80.450	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000005725	sbno1	96	80.750	ENSOCUG00000002441	SBNO1	93	81.791	Oryctolagus_cuniculus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.155	ENSORLG00000001593	sbno1	100	80.577	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.845	ENSORLG00020015216	sbno1	100	80.704	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.845	ENSORLG00015002726	sbno1	100	80.704	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.905	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	81.117	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000005725	sbno1	98	81.844	ENSOARG00000004404	SBNO1	100	81.999	Ovis_aries
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	88.849	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	88.849	Pan_paniscus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.805	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	81.605	Panthera_pardus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.909	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	81.708	Panthera_tigris_altaica
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	88.669	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	88.669	Pan_troglodytes
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	88.849	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	88.849	Papio_anubis
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	89.000	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	88.762	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	82.482	ENSPSIG00000009572	-	99	82.128	Pelodiscus_sinensis
ENSLOCG00000005725	sbno1	90	78.522	ENSPSIG00000009256	-	100	78.214	Pelodiscus_sinensis
ENSLOCG00000005725	sbno1	96	87.612	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	87.612	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	82.173	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	81.960	Phascolarctos_cinereus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.479	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	81.901	Poecilia_formosa
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.479	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	81.901	Poecilia_latipinna
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.422	ENSPMEG00000021212	sbno1	100	81.844	Poecilia_mexicana
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.929	ENSPREG00000017746	sbno1	100	81.351	Poecilia_reticulata
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.579	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	81.437	Pongo_abelii
ENSLOCG00000005725	sbno1	82	82.805	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	75.479	Procavia_capensis
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	87.321	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	87.321	Propithecus_coquereli
ENSLOCG00000005725	sbno1	85	89.662	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	89.662	Pteropus_vampyrus
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.141	ENSPNYG00000004291	sbno1	100	80.282	Pundamilia_nyererei
ENSLOCG00000005725	sbno1	97	85.704	ENSPNAG00000015622	sbno1	100	85.846	Pygocentrus_nattereri
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	88.151	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	88.309	Rattus_norvegicus
ENSLOCG00000005725	sbno1	95	88.849	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	88.849	Rhinopithecus_roxellana
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