EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000005937 (Gene tree)
Gene ID: 102697645
Gene Symbol: MTRF1
Alias: MGC47721|MTTRF1|RF1
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9940 bases
Position: chrLG17:15756999-15766938
Accession: 102697645
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000007169	RF-1	PF00472.20	1.3e-37	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000007177	MTRF1-201	5033	XM_006639075	ENSLOCP00000007169	445 (aa)	XP_006639138	W5MFL0

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLOCG00000005937	MTRF1	84	39.947	ENSLOCG00000015502	mtrf1l	97	39.947

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	58.505	ENSG00000120662	MTRF1	87	58.505	Homo_sapiens
ENSLOCG00000005937	MTRF1	77	62.139	ENSAPOG00000010181	mtrf1	85	62.139	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	58.122	ENSAMEG00000008696	MTRF1	89	58.122	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLOCG00000005937	MTRF1	53	72.152	ENSACIG00000001495	mtrf1	96	72.152	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	60.152	ENSAOCG00000002832	mtrf1	89	60.152	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	59.645	ENSAPEG00000014844	mtrf1	89	59.645	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000005937	MTRF1	77	62.571	ENSATEG00000017403	mtrf1	84	62.571	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	91	55.663	ENSAPLG00000009317	MTRF1	95	56.386	Anas_platyrhynchos
ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	57.364	ENSACAG00000000897	MTRF1	86	57.364	Anolis_carolinensis
ENSLOCG00000005937	MTRF1	78	57.880	ENSANAG00000025310	-	94	58.824	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000005937	MTRF1	98	49.775	ENSANAG00000023063	-	98	49.775	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000005937	MTRF1	89	61.307	ENSACLG00000023945	mtrf1	89	61.307	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000005937	MTRF1	54	69.456	ENSAMXG00000031859	mtrf1	99	69.456	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	58.312	ENSBTAG00000012260	MTRF1	87	58.312	Bos_taurus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	57.975	ENSCJAG00000017739	MTRF1	99	66.279	Callithrix_jacchus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	95	54.630	ENSCAFG00000004795	MTRF1	96	54.630	Canis_familiaris
ENSLOCG00000005937	MTRF1	95	54.630	ENSCAFG00020018178	MTRF1	96	54.630	Canis_lupus_dingo
ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	58.901	ENSCHIG00000011810	MTRF1	86	58.901	Capra_hircus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	98	53.846	ENSTSYG00000006976	MTRF1	99	53.846	Carlito_syrichta
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	57.545	ENSCAPG00000013163	MTRF1	91	57.545	Cavia_aperea
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	57.289	ENSCPOG00000005264	MTRF1	88	57.289	Cavia_porcellus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	98	54.157	ENSCCAG00000035116	MTRF1	98	54.157	Cebus_capucinus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	58.247	ENSCATG00000009909	MTRF1	87	58.247	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	57.468	ENSCLAG00000000582	MTRF1	89	57.468	Chinchilla_lanigera
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	58.505	ENSCSAG00000017835	MTRF1	87	58.505	Chlorocebus_sabaeus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	83	53.989	ENSCHOG00000011915	-	92	53.989	Choloepus_hoffmanni
ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	57.105	ENSCPBG00000007969	MTRF1	85	57.895	Chrysemys_picta_bellii
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	58.247	ENSCANG00000040353	MTRF1	87	58.247	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	57.975	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	89	57.975	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	57.975	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	89	57.975	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	61.518	ENSCSEG00000005667	mtrf1	86	61.518	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000005937	MTRF1	84	60.590	ENSCVAG00000021729	mtrf1	86	60.590	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	53	60.851	ENSDARG00000033579	mtrf1	100	60.851	Danio_rerio
ENSLOCG00000005937	MTRF1	98	53.708	ENSDNOG00000034196	MTRF1	96	67.003	Dasypus_novemcinctus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	59.173	ENSDORG00000016429	Mtrf1	87	59.173	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	56.545	ENSETEG00000014811	MTRF1	86	56.545	Echinops_telfairi
ENSLOCG00000005937	MTRF1	51	57.642	ENSEBUG00000000778	mtrf1	94	57.642	Eptatretus_burgeri
ENSLOCG00000005937	MTRF1	98	54.176	ENSEASG00005015715	MTRF1	98	54.176	Equus_asinus_asinus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	98	53.950	ENSECAG00000014389	MTRF1	95	53.950	Equus_caballus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	44.560	ENSEEUG00000004450	-	87	44.703	Erinaceus_europaeus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	97	58.257	ENSELUG00000006544	mtrf1	99	58.257	Esox_lucius
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	57.468	ENSFCAG00000031635	MTRF1	89	57.468	Felis_catus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	60.053	ENSFALG00000008036	MTRF1	94	60.053	Ficedula_albicollis
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	58.270	ENSFDAG00000017881	MTRF1	88	58.270	Fukomys_damarensis
ENSLOCG00000005937	MTRF1	84	60.322	ENSFHEG00000019043	mtrf1	86	60.322	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	83	60.322	ENSGMOG00000008608	mtrf1	97	60.322	Gadus_morhua
ENSLOCG00000005937	MTRF1	84	59.358	ENSGALG00000016951	MTRF1	82	60.160	Gallus_gallus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	61.155	ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	61.155	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000005937	MTRF1	83	64.151	ENSGACG00000013728	mtrf1	97	64.151	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	70	59.486	ENSGAGG00000025696	MTRF1	99	60.450	Gopherus_agassizii
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	58.505	ENSGGOG00000002529	MTRF1	87	58.505	Gorilla_gorilla
ENSLOCG00000005937	MTRF1	99	53.483	ENSHGLG00000003210	MTRF1	98	53.483	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	56.997	ENSHGLG00100011843	MTRF1	88	56.997	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000005937	MTRF1	84	60.800	ENSHCOG00000009449	mtrf1	85	60.800	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000005937	MTRF1	90	57.426	ENSSTOG00000021682	MTRF1	91	57.426	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	57.360	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	89	57.360	Jaculus_jaculus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	62.183	ENSKMAG00000003231	mtrf1	87	62.183	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	53	73.529	ENSLBEG00000023151	mtrf1	96	73.529	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000005937	MTRF1	53	73.529	ENSLBEG00000027169	-	96	73.529	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	64.398	ENSLACG00000010582	MTRF1	85	64.398	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	57.215	ENSLAFG00000022177	-	89	57.215	Loxodonta_africana
ENSLOCG00000005937	MTRF1	90	45.636	ENSLAFG00000030499	-	89	45.636	Loxodonta_africana
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	58.247	ENSMFAG00000037972	MTRF1	87	58.247	Macaca_fascicularis
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	58.247	ENSMNEG00000035487	MTRF1	87	58.247	Macaca_nemestrina
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	57.761	ENSMLEG00000033582	MTRF1	88	57.761	Mandrillus_leucophaeus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	84	64.096	ENSMAMG00000022048	mtrf1	84	64.096	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	89	61.307	ENSMZEG00005017922	mtrf1	89	61.307	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000005937	MTRF1	84	58.824	ENSMGAG00000014971	MTRF1	90	59.626	Meleagris_gallopavo
ENSLOCG00000005937	MTRF1	98	55.856	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	99	55.856	Mesocricetus_auratus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	98	54.299	ENSMICG00000033131	MTRF1	98	54.299	Microcebus_murinus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	61.818	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	86	61.818	Microtus_ochrogaster
ENSLOCG00000005937	MTRF1	53	65.254	ENSMMOG00000013394	mtrf1	97	65.254	Mola_mola
ENSLOCG00000005937	MTRF1	98	54.955	ENSMODG00000014772	MTRF1	98	54.955	Monodelphis_domestica
ENSLOCG00000005937	MTRF1	91	60.391	ENSMALG00000013274	mtrf1	93	60.391	Monopterus_albus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	60.950	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	84	60.950	Mus_caroli
ENSLOCG00000005937	MTRF1	97	55.889	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	97	55.889	Mus_musculus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	58.734	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	89	58.734	Mus_pahari
ENSLOCG00000005937	MTRF1	96	55.581	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	98	55.581	Mus_spretus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	57.801	ENSMPUG00000001874	MTRF1	88	57.801	Mustela_putorius_furo
ENSLOCG00000005937	MTRF1	91	55.718	ENSMLUG00000017237	MTRF1	92	55.718	Myotis_lucifugus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	58.481	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	89	58.481	Nannospalax_galili
ENSLOCG00000005937	MTRF1	53	73.617	ENSNBRG00000004634	mtrf1	99	73.617	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000005937	MTRF1	97	54.691	ENSNLEG00000001236	MTRF1	97	54.691	Nomascus_leucogenys
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	56.777	ENSMEUG00000001846	MTRF1	88	56.777	Notamacropus_eugenii
ENSLOCG00000005937	MTRF1	66	32.886	ENSOPRG00000006450	-	91	32.886	Ochotona_princeps
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	56.853	ENSODEG00000005782	MTRF1	89	56.853	Octodon_degus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	62.113	ENSONIG00000012476	mtrf1	100	62.113	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	68	61.039	ENSOANG00000003383	-	98	61.039	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	89	57.644	ENSOCUG00000025207	MTRF1	89	57.644	Oryctolagus_cuniculus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	98	55.782	ENSORLG00000003225	mtrf1	97	55.782	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000005937	MTRF1	97	56.036	ENSORLG00020021048	mtrf1	96	56.036	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000005937	MTRF1	84	61.214	ENSORLG00015020957	mtrf1	86	61.214	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000005937	MTRF1	94	57.683	ENSOMEG00000002022	mtrf1	93	57.683	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000005937	MTRF1	73	52.000	ENSOGAG00000026411	-	99	52.000	Otolemur_garnettii
ENSLOCG00000005937	MTRF1	98	52.928	ENSOGAG00000009719	-	98	52.928	Otolemur_garnettii
ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	58.639	ENSOARG00000006994	MTRF1	86	58.639	Ovis_aries
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	58.505	ENSPPAG00000000050	MTRF1	87	58.505	Pan_paniscus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	57.722	ENSPPRG00000009511	MTRF1	89	57.722	Panthera_pardus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	57.722	ENSPTIG00000006673	MTRF1	89	57.722	Panthera_tigris_altaica
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	58.505	ENSPTRG00000005815	MTRF1	87	58.505	Pan_troglodytes
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	58.247	ENSPANG00000010809	MTRF1	87	58.247	Papio_anubis
ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	64.935	ENSPKIG00000015711	mtrf1	90	64.935	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	57.105	ENSPSIG00000004773	MTRF1	85	57.895	Pelodiscus_sinensis
ENSLOCG00000005937	MTRF1	53	70.085	ENSPMGG00000006724	mtrf1	95	70.085	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	60.779	ENSPEMG00000020982	Mtrf1	86	60.779	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLOCG00000005937	MTRF1	78	53.672	ENSPMAG00000009849	mtrf1	100	53.955	Petromyzon_marinus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	58.182	ENSPCIG00000012940	MTRF1	87	58.961	Phascolarctos_cinereus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	61.111	ENSPFOG00000000254	mtrf1	86	61.111	Poecilia_formosa
ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	61.376	ENSPLAG00000014280	mtrf1	86	61.376	Poecilia_latipinna
ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	61.111	ENSPMEG00000023245	mtrf1	86	61.111	Poecilia_mexicana
ENSLOCG00000005937	MTRF1	52	66.953	ENSPREG00000018619	mtrf1	96	66.953	Poecilia_reticulata
ENSLOCG00000005937	MTRF1	97	53.776	ENSPPYG00000005313	MTRF1	97	53.776	Pongo_abelii
ENSLOCG00000005937	MTRF1	98	53.846	ENSPCOG00000018133	MTRF1	99	53.846	Propithecus_coquereli
ENSLOCG00000005937	MTRF1	89	57.071	ENSPVAG00000008573	MTRF1	89	57.071	Pteropus_vampyrus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	54	73.859	ENSPNYG00000004357	mtrf1	98	73.859	Pundamilia_nyererei
ENSLOCG00000005937	MTRF1	90	62.808	ENSPNAG00000010682	mtrf1	93	62.808	Pygocentrus_nattereri
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	59.231	ENSRNOG00000047106	Mtrf1	93	69.027	Rattus_norvegicus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	57.732	ENSRBIG00000007069	MTRF1	87	57.732	Rhinopithecus_bieti
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	57.732	ENSRROG00000035345	MTRF1	87	57.732	Rhinopithecus_roxellana
ENSLOCG00000005937	MTRF1	84	58.933	ENSSBOG00000004572	MTRF1	99	58.933	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSLOCG00000005937	MTRF1	88	55.330	ENSSARG00000002306	MTRF1	89	55.330	Sorex_araneus
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ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	60.411	ENSTRUG00000000396	mtrf1	87	60.411	Takifugu_rubripes
ENSLOCG00000005937	MTRF1	87	62.791	ENSTNIG00000017149	-	100	62.791	Tetraodon_nigroviridis
ENSLOCG00000005937	MTRF1	54	61.506	ENSTBEG00000004696	-	100	61.506	Tupaia_belangeri
ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	58.701	ENSTTRG00000010370	MTRF1	86	58.701	Tursiops_truncatus
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ENSLOCG00000005937	MTRF1	86	56.883	ENSXETG00000018904	mtrf1	99	56.883	Xenopus_tropicalis
ENSLOCG00000005937	MTRF1	53	66.809	ENSXCOG00000020386	mtrf1	97	66.809	Xiphophorus_couchianus
ENSLOCG00000005937	MTRF1	85	61.680	ENSXMAG00000009853	mtrf1	86	61.680	Xiphophorus_maculatus