EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000006178 (Gene tree)
Gene ID: 102696320
Gene Symbol: tnpo2
Alias: fb01c02|fe01f03|ik:tdsubc_2a7|tdsubc_2a7|wu:fb01c02|wu:fe01f03|wu:fe16e12|xx:tdsubc_2a7|zgc:101009
Full Name: transportin 2
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9297 bases
Position: chrLG6:12738854-12748150
Accession: 102696320
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000007473	IBN_N	PF03810.19	1.1e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000007481	-	2685	XM_006631472	ENSLOCP00000007473	894 (aa)	XP_006631536	W5MGG4

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	86.374	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	86.374

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSG00000105576	TNPO2	100	94.151	Homo_sapiens
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.288	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	96.288	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	81	95.034	ENSAPOG00000013185	-	96	95.034	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	91.546	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	91.546	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLOCG00000006178	tnpo2	86	97.017	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	97.017	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	86	95.984	ENSACIG00000009586	-	100	95.984	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.288	ENSAOCG00000010152	-	100	96.288	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.513	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	96.513	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.288	ENSAPEG00000013268	-	100	96.288	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.513	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	96.513	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.063	ENSATEG00000019171	-	100	96.063	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.063	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	96.063	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	94.151	Anolis_carolinensis
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.038	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	94.038	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.625	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	96.625	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	90.101	ENSACLG00000020672	-	100	90.101	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.568	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	94.568	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.038	ENSBTAG00000011811	TNPO2	100	94.038	Bos_taurus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.103	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	93.103	Callithrix_jacchus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.263	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	94.263	Canis_familiaris
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.263	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	94.263	Canis_lupus_dingo
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	89.433	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	89.321	Capra_hircus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	94.151	Carlito_syrichta
ENSLOCG00000006178	tnpo2	93	91.677	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	91.677	Cavia_aperea
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	94.151	Cavia_porcellus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	94.151	Cebus_capucinus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.103	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	93.103	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	94.151	Chinchilla_lanigera
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	94.151	Chlorocebus_sabaeus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.376	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	94.376	Chrysemys_picta_bellii
ENSLOCG00000006178	tnpo2	96	94.282	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	94.282	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.215	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	93.215	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.263	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	94.263	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	91.789	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	91.789	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000006178	tnpo2	87	93.798	ENSCSEG00000011477	-	100	93.798	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.708	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	93.708	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.175	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	96.175	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	92.576	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	92.576	Danio_rerio
ENSLOCG00000006178	tnpo2	87	84.271	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	84.271	Dasypus_novemcinctus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	87.556	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	92.701	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	73.154	FBgn0024921	Tnpo	100	73.154	Drosophila_melanogaster
ENSLOCG00000006178	tnpo2	91	86.181	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	86.181	Echinops_telfairi
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	94.151	Equus_asinus_asinus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	94.151	Equus_caballus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	87	84.576	ENSELUG00000016542	-	99	84.763	Esox_lucius
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.115	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	96.115	Esox_lucius
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.103	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	93.103	Felis_catus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	94.151	Fukomys_damarensis
ENSLOCG00000006178	tnpo2	96	95.814	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	95.814	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.045	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	94.045	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	87.919	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	87.919	Gadus_morhua
ENSLOCG00000006178	tnpo2	80	94.444	ENSGMOG00000014237	-	90	94.444	Gadus_morhua
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.951	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	95.951	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.719	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	94.719	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.376	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	94.376	Gopherus_agassizii
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.175	ENSHBUG00000018317	-	100	96.175	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.625	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	96.625	Haplochromis_burtoni
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.038	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	94.038	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	92.436	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	92.436	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.376	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	94.376	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.726	ENSHCOG00000020440	-	100	95.726	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.838	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	95.838	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	100	95.190	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	95.190	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	94.151	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.103	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	93.103	Jaculus_jaculus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	92.238	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	92.238	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.063	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	96.063	Kryptolebias_marmoratus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.625	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	96.625	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.288	ENSLBEG00000005301	-	100	96.288	Labrus_bergylta
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	91.901	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	91.798	Latimeria_chalumnae
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.215	ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	93.215	Loxodonta_africana
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.103	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	93.103	Macaca_fascicularis
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	94.151	Macaca_mulatta
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	94.151	Macaca_nemestrina
ENSLOCG00000006178	tnpo2	96	93.195	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	93.195	Mandrillus_leucophaeus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.340	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	94.340	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.288	ENSMAMG00000011862	-	100	96.288	Mastacembelus_armatus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	92.584	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	92.584	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.625	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	96.625	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.175	ENSMZEG00005007408	-	100	96.175	Maylandia_zebra
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	94.151	Microcebus_murinus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.263	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	94.263	Microtus_ochrogaster
ENSLOCG00000006178	tnpo2	86	90.956	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	90.956	Mola_mola
ENSLOCG00000006178	tnpo2	87	95.262	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	95.990	Mola_mola
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.105	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	94.105	Monodelphis_domestica
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.713	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	94.713	Monopterus_albus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.288	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	96.288	Monopterus_albus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.263	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	94.263	Mus_caroli
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.263	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	94.263	Mus_musculus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.263	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	94.263	Mus_pahari
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.263	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	94.263	Mus_spretus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.263	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	94.263	Mustela_putorius_furo
ENSLOCG00000006178	tnpo2	96	94.516	ENSMLUG00000012669	TNPO2	100	94.516	Myotis_lucifugus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.263	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	94.263	Nannospalax_galili
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	91.451	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	91.451	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.175	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	96.175	Neolamprologus_brichardi
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	84.111	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	84.111	Nomascus_leucogenys
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	88.209	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	88.209	Notamacropus_eugenii
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	94.151	Octodon_degus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.513	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	96.513	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.212	ENSONIG00000017706	-	100	95.212	Oreochromis_niloticus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.263	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	94.263	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	90	93.721	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	94.035	Oryctolagus_cuniculus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.726	ENSORLG00000010363	tnpo2	100	95.726	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000006178	tnpo2	56	95.600	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	95.600	Oryzias_latipes
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.726	ENSORLG00020015785	tnpo2	100	95.726	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000006178	tnpo2	56	95.400	ENSORLG00020001020	TNPO2	99	95.400	Oryzias_latipes_hni
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.388	ENSORLG00015005489	tnpo2	100	95.388	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000006178	tnpo2	56	95.600	ENSORLG00015003941	TNPO2	99	95.600	Oryzias_latipes_hsok
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.613	ENSOMEG00000014877	TNPO2	100	95.613	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.838	ENSOMEG00000013440	TNPO2	100	95.838	Oryzias_melastigma
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.251	ENSOARG00000011717	TNPO2	92	93.655	Ovis_aries
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.103	ENSPPAG00000019494	TNPO2	100	93.103	Pan_paniscus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.326	ENSPPRG00000003075	TNPO2	100	93.326	Panthera_pardus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	84	87.533	ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	87.533	Panthera_tigris_altaica
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.103	ENSPTRG00000010535	TNPO2	100	93.103	Pan_troglodytes
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.103	ENSPANG00000016857	TNPO2	100	93.103	Papio_anubis
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.613	ENSPKIG00000004824	tnpo2	100	95.613	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000006178	tnpo2	97	93.103	ENSPKIG00000002899	-	99	93.983	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	90.476	ENSPSIG00000010215	TNPO2	100	90.476	Pelodiscus_sinensis
ENSLOCG00000006178	tnpo2	56	95.000	ENSPMGG00000022850	tnpo2	99	94.400	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	86	95.460	ENSPMGG00000016459	TNPO2	98	95.460	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	89.480	ENSPVAG00000013411	TNPO2	100	89.480	Pteropus_vampyrus
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ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.513	ENSPNYG00000013748	tnpo2	100	96.513	Pundamilia_nyererei
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ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.151	ENSRNOG00000003970	Tnpo2	97	94.151	Rattus_norvegicus
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ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.738	ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	96.738	Scleropages_formosus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.726	ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	95.726	Scleropages_formosus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.838	ENSSMAG00000004050	-	100	95.838	Scophthalmus_maximus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.738	ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	96.738	Scophthalmus_maximus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.625	ENSSDUG00000001767	tnpo2	100	96.625	Seriola_dumerili
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.288	ENSSDUG00000002607	TNPO2	100	96.288	Seriola_dumerili
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.175	ENSSLDG00000013107	-	100	96.175	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.625	ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	96.625	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLOCG00000006178	tnpo2	82	95.250	ENSSARG00000003825	TNPO2	86	95.250	Sorex_araneus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.624	ENSSPUG00000000736	TNPO2	100	93.624	Sphenodon_punctatus
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ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.045	ENSSPAG00000008511	-	100	94.045	Stegastes_partitus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.263	ENSSSCG00000013726	TNPO2	100	94.263	Sus_scrofa
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ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	95.501	ENSTRUG00000009453	TNPO2	100	95.501	Takifugu_rubripes
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	86.052	ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	95.259	Tetraodon_nigroviridis
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.026	ENSTNIG00000014071	TNPO2	100	93.026	Tetraodon_nigroviridis
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.215	ENSTTRG00000005443	TNPO2	100	93.215	Tursiops_truncatus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.103	ENSUAMG00000019621	TNPO2	100	93.103	Ursus_americanus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	90.535	ENSUMAG00000006504	TNPO2	99	90.535	Ursus_maritimus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	86.727	ENSVVUG00000023860	TNPO2	100	86.727	Vulpes_vulpes
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	91.451	ENSXETG00000004771	tnpo2	99	91.226	Xenopus_tropicalis
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	92.713	ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	92.713	Xiphophorus_couchianus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	96.063	ENSXMAG00000012793	TNPO2	100	96.063	Xiphophorus_maculatus
ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	94.607	ENSXMAG00000014217	TNPO2	100	94.607	Xiphophorus_maculatus