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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSLOCG00000006262 (Gene tree)
Gene ID: 102695541
Gene Symbol: prpf38a
Alias: fa04h11|fc83e08|wu:fa04h11|wu:fc83e08|zgc:92059
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Lepisosteus_oculatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5495 bases
Position: chrLG10:9279711-9285205
Accession: 102695541
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLOCP00000007567	PRP38	PF03371.15	4.7e-63	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLOCT00000007575	-	1849	XM_006634839	ENSLOCP00000007567	309 (aa)	XP_006634902	W5MGQ8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSG00000134748	PRPF38A	100	80.192	Homo_sapiens
ENSLOCG00000006262	prpf38a	95	92.542	ENSAPOG00000011652	prpf38a	100	92.258	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	100	80.192	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	78.317	ENSACIG00000012292	prpf38a	100	85.761	Amphilophus_citrinellus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	95	92.542	ENSAOCG00000018004	prpf38a	100	92.258	Amphiprion_ocellaris
ENSLOCG00000006262	prpf38a	95	92.542	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	92.258	Amphiprion_percula
ENSLOCG00000006262	prpf38a	72	88.288	ENSATEG00000004608	prpf38a	100	90.968	Anabas_testudineus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	79	76.613	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	75.403	Anas_platyrhynchos
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	79.872	ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	80.511	Anolis_carolinensis
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSANAG00000027839	PRPF38A	100	80.192	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	60.317	ENSANAG00000029204	-	100	56.869	Aotus_nancymaae
ENSLOCG00000006262	prpf38a	72	88.739	ENSACLG00000021595	prpf38a	100	90.968	Astatotilapia_calliptera
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	83.121	ENSAMXG00000029274	prpf38a	100	84.713	Astyanax_mexicanus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	100	80.192	Bos_taurus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	63	63.077	WBGene00008380	prp-38	59	64.894	Caenorhabditis_elegans
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	100	80.192	Callithrix_jacchus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	100	80.192	Canis_familiaris
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	100	80.192	Canis_lupus_dingo
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	100	80.192	Capra_hircus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSTSYG00000009868	-	100	80.192	Carlito_syrichta
ENSLOCG00000006262	prpf38a	86	77.778	ENSTSYG00000031994	-	95	76.296	Carlito_syrichta
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	83.280	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	100	84.244	Cavia_porcellus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	79.167	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	100	79.233	Cebus_capucinus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	55.305	ENSCATG00000044190	-	57	56.085	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSCATG00000032296	PRPF38A	100	80.192	Cercocebus_atys
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	100	80.192	Chinchilla_lanigera
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.789	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	100	80.511	Chrysemys_picta_bellii
ENSLOCG00000006262	prpf38a	75	66.810	ENSCSAVG00000009580	-	63	76.190	Ciona_savignyi
ENSLOCG00000006262	prpf38a	75	87.069	ENSCANG00000032608	PRPF38A	74	87.838	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSCGRG00001018502	-	100	80.192	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000006262	prpf38a	85	72.137	ENSCGRG00001002557	-	74	75.676	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	100	80.192	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLOCG00000006262	prpf38a	72	88.739	ENSCSEG00000001269	prpf38a	76	88.288	Cynoglossus_semilaevis
ENSLOCG00000006262	prpf38a	72	90.090	ENSCVAG00000012305	prpf38a	100	91.613	Cyprinodon_variegatus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	83.121	ENSDARG00000039213	prpf38a	100	84.076	Danio_rerio
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	100	80.192	Dasypus_novemcinctus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	85	75.758	ENSDORG00000025371	-	67	88.360	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000006262	prpf38a	85	75.758	ENSDORG00000023691	-	67	88.360	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	69.649	ENSDORG00000023857	-	100	68.371	Dipodomys_ordii
ENSLOCG00000006262	prpf38a	68	69.668	FBgn0050342	Prp38	57	75.132	Drosophila_melanogaster
ENSLOCG00000006262	prpf38a	77	81.172	ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	77.876	Eptatretus_burgeri
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSEASG00005014427	PRPF38A	100	80.192	Equus_asinus_asinus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSECAG00000022628	PRPF38A	100	80.192	Equus_caballus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	72	91.892	ENSELUG00000021094	prpf38a	100	92.903	Esox_lucius
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	100	80.192	Felis_catus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	99	76.129	ENSFALG00000003612	-	63	88.360	Ficedula_albicollis
ENSLOCG00000006262	prpf38a	87	78.676	ENSFALG00000005598	-	100	77.206	Ficedula_albicollis
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	82.958	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	100	80.323	Fukomys_damarensis
ENSLOCG00000006262	prpf38a	91	79.286	ENSFHEG00000014317	prpf38a	75	89.640	Fundulus_heteroclitus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	54	95.181	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	95.181	Gadus_morhua
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	80.192	Gallus_gallus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	72	90.991	ENSGAFG00000012422	prpf38a	100	91.935	Gambusia_affinis
ENSLOCG00000006262	prpf38a	72	87.500	ENSGACG00000005423	prpf38a	100	90.385	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	50	85.256	ENSGACG00000000182	-	100	85.965	Gasterosteus_aculeatus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.789	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	100	80.511	Gopherus_agassizii
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ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSHGLG00000000475	PRPF38A	100	80.192	Heterocephalus_glaber_female
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSHGLG00100008935	PRPF38A	100	80.192	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	74.598	ENSHGLG00100003928	-	100	72.168	Heterocephalus_glaber_male
ENSLOCG00000006262	prpf38a	84	72.862	ENSHCOG00000020781	prpf38a	60	92.063	Hippocampus_comes
ENSLOCG00000006262	prpf38a	91	79.167	ENSIPUG00000005757	prpf38a	71	94.595	Ictalurus_punctatus
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	100	80.192	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSLOCG00000006262	prpf38a	95	92.203	ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	91.290	Labrus_bergylta
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ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	81.470	ENSMFAG00000039449	PRPF38A	100	80.192	Macaca_fascicularis
ENSLOCG00000006262	prpf38a	87	78.676	ENSMMUG00000014333	PRPF38A	98	76.923	Macaca_mulatta
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ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	55.305	ENSMNEG00000040242	-	57	56.614	Macaca_nemestrina
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ENSLOCG00000006262	prpf38a	75	87.069	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	74	87.838	Meleagris_gallopavo
ENSLOCG00000006262	prpf38a	85	83.396	ENSMAUG00000018029	-	84	83.784	Mesocricetus_auratus
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ENSLOCG00000006262	prpf38a	72	90.090	ENSMALG00000019363	prpf38a	97	92.581	Monopterus_albus
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ENSLOCG00000006262	prpf38a	73	87.665	ENSNBRG00000004013	prpf38a	98	84.790	Neolamprologus_brichardi
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ENSLOCG00000006262	prpf38a	97	63.366	ENSNLEG00000012592	-	68	57.399	Nomascus_leucogenys
ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	78.594	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	100	76.997	Notamacropus_eugenii
ENSLOCG00000006262	prpf38a	74	87.336	ENSOPRG00000008985	PRPF38A	92	87.838	Ochotona_princeps
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