EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000000200 (Gene tree)
Gene ID: 109965937
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: poly(U)-binding-splicing factor PUF60-like
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16116 bases
Position: chrKV884793.1:685653-701768
Accession: 109965937
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000000187	RRM_1	PF00076.22	1.8e-43	1	2
ENSMALP00000000187	RRM_1	PF00076.22	1.8e-43	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000000211	-	5496	XM_020610366	ENSMALP00000000187	521 (aa)	XP_020466022	UPI0009B3DD9B

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
malb03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000000200	-	56	36.000	ENSMALG00000009985	u2af2a	67	37.255
ENSMALG00000000200	-	100	75.856	ENSMALG00000006797	puf60b	100	75.665

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000000200	-	99	79.057	ENSG00000179950	PUF60	100	81.190	Homo_sapiens
ENSMALG00000000200	-	100	81.973	ENSAPOG00000001713	puf60b	100	81.973	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000000200	-	99	78.639	ENSAMEG00000006406	PUF60	93	79.848	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000000200	-	98	82.296	ENSACIG00000021705	puf60b	100	82.296	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000000200	-	98	86.497	ENSACIG00000003263	-	100	86.381	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000000200	-	100	91.396	ENSAOCG00000015558	-	100	91.778	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000000200	-	100	81.973	ENSAOCG00000005395	puf60b	100	82.879	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000000200	-	99	78.077	ENSAPEG00000011923	puf60b	99	78.035	Amphiprion_percula
ENSMALG00000000200	-	98	79.070	ENSAPEG00000001836	-	100	80.271	Amphiprion_percula
ENSMALG00000000200	-	100	81.784	ENSATEG00000001730	puf60b	100	81.784	Anabas_testudineus
ENSMALG00000000200	-	100	94.444	ENSATEG00000006303	-	100	94.636	Anabas_testudineus
ENSMALG00000000200	-	99	79.623	ENSAPLG00000010150	PUF60	100	80.835	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000000200	-	98	79.924	ENSACAG00000001645	PUF60	96	80.762	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000000200	-	99	79.245	ENSANAG00000018626	PUF60	100	81.382	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000000200	-	98	82.296	ENSACLG00000004462	puf60b	100	82.296	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000000200	-	98	74.953	ENSAMXG00000041030	puf60b	100	75.285	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000000200	-	98	83.491	ENSAMXG00000036570	puf60a	100	80.961	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000000200	-	99	79.096	ENSBTAG00000037493	PUF60	99	80.492	Bos_taurus
ENSMALG00000000200	-	78	49.827	WBGene00004389	rnp-6	83	49.013	Caenorhabditis_elegans
ENSMALG00000000200	-	99	79.057	ENSCJAG00000021485	PUF60	99	79.887	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000000200	-	99	78.868	ENSCAFG00000001400	PUF60	93	80.266	Canis_familiaris
ENSMALG00000000200	-	99	79.245	ENSCAFG00020018754	PUF60	99	80.075	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000000200	-	99	79.057	ENSCHIG00000001618	PUF60	87	80.455	Capra_hircus
ENSMALG00000000200	-	99	79.245	ENSTSYG00000011912	PUF60	100	81.382	Carlito_syrichta
ENSMALG00000000200	-	99	74.719	ENSCPOG00000014613	PUF60	94	76.083	Cavia_porcellus
ENSMALG00000000200	-	99	79.661	ENSCCAG00000007744	PUF60	99	79.699	Cebus_capucinus
ENSMALG00000000200	-	99	79.057	ENSCATG00000035405	PUF60	99	79.887	Cercocebus_atys
ENSMALG00000000200	-	99	79.245	ENSCLAG00000009154	PUF60	93	80.645	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000000200	-	98	79.771	ENSCSAG00000008878	PUF60	100	81.190	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000000200	-	98	80.153	ENSCPBG00000005595	PUF60	99	80.377	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000000200	-	96	49.119	ENSCING00000008436	-	95	49.318	Ciona_intestinalis
ENSMALG00000000200	-	61	55.655	ENSCING00000002156	-	87	56.716	Ciona_intestinalis
ENSMALG00000000200	-	95	52.290	ENSCSAVG00000001385	-	99	52.863	Ciona_savignyi
ENSMALG00000000200	-	79	58.468	ENSCSAVG00000004765	-	97	49.299	Ciona_savignyi
ENSMALG00000000200	-	79	79.059	ENSCANG00000041843	PUF60	100	80.806	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000000200	-	99	79.434	ENSCGRG00001017442	Puf60	93	80.645	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000000200	-	99	79.434	ENSCGRG00000003717	Puf60	93	80.455	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000000200	-	99	82.115	ENSCSEG00000019887	puf60b	93	82.115	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000000200	-	99	80.732	ENSCSEG00000014845	-	91	82.274	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000000200	-	90	88.769	ENSCVAG00000001560	-	96	90.372	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000000200	-	98	81.323	ENSCVAG00000009386	puf60b	100	81.518	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000000200	-	98	81.382	ENSDARG00000032175	puf60a	100	88.983	Danio_rerio
ENSMALG00000000200	-	98	75.797	ENSDARG00000001241	puf60b	100	88.976	Danio_rerio
ENSMALG00000000200	-	96	65.243	ENSDNOG00000043278	PUF60	90	67.188	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000000200	-	99	79.245	ENSDORG00000004585	Puf60	95	80.645	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000000200	-	84	61.938	FBgn0028577	hfp	99	48.663	Drosophila_melanogaster
ENSMALG00000000200	-	95	67.864	ENSEBUG00000005470	-	92	66.095	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000000200	-	98	60.884	ENSEBUG00000014291	puf60b	84	61.224	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000000200	-	99	79.245	ENSEASG00005009695	PUF60	99	80.075	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000000200	-	99	79.245	ENSECAG00000024681	PUF60	98	80.075	Equus_caballus
ENSMALG00000000200	-	100	85.822	ENSELUG00000018443	-	100	85.633	Esox_lucius
ENSMALG00000000200	-	100	79.330	ENSELUG00000006507	puf60b	100	78.062	Esox_lucius
ENSMALG00000000200	-	99	79.245	ENSFCAG00000001045	PUF60	100	81.382	Felis_catus
ENSMALG00000000200	-	99	70.943	ENSFALG00000001136	PUF60	98	72.538	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000000200	-	99	79.434	ENSFDAG00000017177	PUF60	93	80.835	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000000200	-	93	89.549	ENSFHEG00000021687	PUF60	100	90.814	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000000200	-	100	81.214	ENSFHEG00000020046	puf60b	100	82.296	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000000200	-	99	68.381	ENSGMOG00000006392	puf60b	100	68.381	Gadus_morhua
ENSMALG00000000200	-	64	85.131	ENSGALG00000039901	PUF60	94	85.131	Gallus_gallus
ENSMALG00000000200	-	100	81.214	ENSGAFG00000021040	puf60b	100	82.296	Gambusia_affinis
ENSMALG00000000200	-	98	86.914	ENSGAFG00000004334	-	100	87.109	Gambusia_affinis
ENSMALG00000000200	-	99	69.333	ENSGACG00000004717	puf60b	99	70.095	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000000200	-	100	77.230	ENSGACG00000001484	-	100	78.389	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000000200	-	98	80.153	ENSGAGG00000013289	PUF60	92	80.377	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000000200	-	99	79.057	ENSGGOG00000004646	PUF60	99	79.887	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000000200	-	100	81.404	ENSHBUG00000015118	puf60b	100	82.296	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000000200	-	100	92.352	ENSHBUG00000009634	-	100	92.925	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000000200	-	99	79.434	ENSHGLG00000006111	PUF60	93	80.835	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000000200	-	99	79.434	ENSHGLG00100012362	PUF60	93	80.835	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000000200	-	98	78.879	ENSHCOG00000015541	puf60b	100	79.252	Hippocampus_comes
ENSMALG00000000200	-	96	75.100	ENSHCOG00000000378	-	99	73.614	Hippocampus_comes
ENSMALG00000000200	-	98	77.273	ENSIPUG00000004660	puf60b	100	77.083	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000000200	-	98	81.574	ENSIPUG00000002453	puf60a	100	82.342	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000000200	-	99	79.245	ENSSTOG00000025037	PUF60	94	80.455	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000000200	-	99	79.434	ENSJJAG00000001076	Puf60	93	80.645	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000000200	-	98	82.101	ENSKMAG00000016745	puf60b	100	82.296	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000000200	-	98	85.413	ENSKMAG00000010106	-	100	85.824	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000000200	-	99	80.519	ENSLBEG00000012505	puf60b	100	80.519	Labrus_bergylta
ENSMALG00000000200	-	68	76.230	ENSLACG00000005456	PUF60	99	76.776	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000000200	-	100	85.255	ENSLOCG00000010106	puf60b	100	85.444	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000000200	-	99	78.302	ENSLAFG00000022929	PUF60	94	79.507	Loxodonta_africana
ENSMALG00000000200	-	99	79.057	ENSMFAG00000043373	PUF60	99	80.266	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000000200	-	99	79.057	ENSMMUG00000013558	PUF60	99	79.887	Macaca_mulatta
ENSMALG00000000200	-	99	79.057	ENSMNEG00000031099	PUF60	99	79.887	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000000200	-	98	79.771	ENSMLEG00000040009	PUF60	100	81.190	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000000200	-	99	81.574	ENSMAMG00000010394	puf60b	100	79.356	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000000200	-	100	95.411	ENSMAMG00000019476	-	100	95.602	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000000200	-	98	82.296	ENSMZEG00005018515	puf60b	100	82.296	Maylandia_zebra
ENSMALG00000000200	-	100	92.161	ENSMZEG00005019425	-	100	92.734	Maylandia_zebra
ENSMALG00000000200	-	99	79.362	ENSMGAG00000013070	PUF60	95	85.465	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000000200	-	93	64.822	ENSMAUG00000018549	-	95	66.398	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000000200	-	68	83.607	ENSMAUG00000014267	-	90	83.333	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000000200	-	99	79.245	ENSMICG00000012226	PUF60	99	80.377	Microcebus_murinus
ENSMALG00000000200	-	99	79.434	ENSMOCG00000018780	Puf60	93	80.835	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000000200	-	98	82.490	ENSMMOG00000004217	puf60b	100	82.490	Mola_mola
ENSMALG00000000200	-	99	78.641	ENSMMOG00000018059	-	99	85.615	Mola_mola
ENSMALG00000000200	-	99	78.679	ENSMODG00000009161	PUF60	94	80.076	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000000200	-	99	79.623	MGP_CAROLIEiJ_G0019910	Puf60	93	81.025	Mus_caroli
ENSMALG00000000200	-	99	79.623	ENSMUSG00000002524	Puf60	93	81.025	Mus_musculus
ENSMALG00000000200	-	99	79.623	MGP_PahariEiJ_G0019920	Puf60	93	81.025	Mus_pahari
ENSMALG00000000200	-	99	79.623	MGP_SPRETEiJ_G0020812	Puf60	93	81.025	Mus_spretus
ENSMALG00000000200	-	99	79.057	ENSMPUG00000008137	PUF60	92	80.266	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000000200	-	99	73.783	ENSMLUG00000013032	-	99	74.906	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000000200	-	99	78.679	ENSMLUG00000000238	-	93	79.886	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000000200	-	99	79.434	ENSNGAG00000000712	Puf60	100	81.574	Nannospalax_galili
ENSMALG00000000200	-	83	77.232	ENSNBRG00000013047	puf60b	97	80.622	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000000200	-	100	92.146	ENSNBRG00000017223	-	100	92.720	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000000200	-	99	79.057	ENSNLEG00000002156	PUF60	99	79.887	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000000200	-	71	91.336	ENSOPRG00000002147	PUF60	75	88.737	Ochotona_princeps
ENSMALG00000000200	-	95	60.913	ENSODEG00000015513	-	98	60.425	Octodon_degus
ENSMALG00000000200	-	71	87.500	ENSODEG00000014024	-	90	87.500	Octodon_degus
ENSMALG00000000200	-	99	82.115	ENSONIG00000006247	puf60b	98	82.115	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000000200	-	100	91.587	ENSONIG00000014030	-	99	92.161	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000000200	-	97	67.191	ENSOANG00000006962	PUF60	99	66.994	Ornithorhynchus_anatinus
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ENSMALG00000000200	-	98	87.573	ENSORLG00000028655	-	99	88.566	Oryzias_latipes
ENSMALG00000000200	-	100	81.404	ENSORLG00020007333	puf60	100	82.101	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000000200	-	99	88.145	ENSORLG00020018144	-	99	89.122	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000000200	-	100	81.474	ENSORLG00015007718	puf60b	100	82.752	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000000200	-	99	87.954	ENSORLG00015016833	-	99	88.931	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000000200	-	100	78.253	ENSOMEG00000001643	puf60b	99	80.328	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000000200	-	99	89.101	ENSOMEG00000022185	-	99	90.076	Oryzias_melastigma
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ENSMALG00000000200	-	99	79.245	ENSPPRG00000003257	PUF60	100	81.382	Panthera_pardus
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ENSMALG00000000200	-	99	79.057	ENSPANG00000021936	PUF60	99	79.887	Papio_anubis
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ENSMALG00000000200	-	99	78.868	ENSPSIG00000004679	PUF60	99	80.076	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000000200	-	98	80.732	ENSPMGG00000013444	puf60b	100	80.732	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000000200	-	99	79.434	ENSPEMG00000008820	Puf60	93	80.835	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSMALG00000000200	-	100	89.695	ENSPMEG00000009767	-	92	89.885	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000000200	-	100	78.373	ENSPREG00000005440	puf60b	100	78.928	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000000200	-	79	77.594	ENSPPYG00000018951	-	95	79.572	Pongo_abelii
ENSMALG00000000200	-	79	79.059	ENSPCAG00000014837	PUF60	100	80.806	Procavia_capensis
ENSMALG00000000200	-	99	79.057	ENSPCOG00000027981	PUF60	99	79.962	Propithecus_coquereli
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ENSMALG00000000200	-	98	82.296	ENSPNYG00000002556	puf60b	100	82.296	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000000200	-	99	73.321	ENSPNAG00000019415	puf60b	91	73.896	Pygocentrus_nattereri
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ENSMALG00000000200	-	99	79.623	ENSRNOG00000009960	Puf60	93	81.025	Rattus_norvegicus
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ENSMALG00000000200	-	88	79.325	ENSSHAG00000006668	PUF60	89	80.892	Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000000200	-	100	80.470	ENSSFOG00015019371	puf60a	98	85.336	Scleropages_formosus
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ENSMALG00000000200	-	74	88.621	ENSSMAG00000016381	puf60b	78	86.869	Scophthalmus_maximus
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ENSMALG00000000200	-	98	94.314	ENSSPAG00000020285	-	100	94.510	Stegastes_partitus
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ENSMALG00000000200	-	99	79.057	ENSSSCG00000038800	PUF60	99	77.401	Sus_scrofa
ENSMALG00000000200	-	99	77.213	ENSTGUG00000012797	-	100	79.087	Taeniopygia_guttata
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ENSMALG00000000200	-	99	82.500	ENSTRUG00000005420	puf60b	100	80.114	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000000200	-	99	84.272	ENSTNIG00000003069	-	99	87.184	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000000200	-	99	82.500	ENSTNIG00000013675	puf60b	99	82.308	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000000200	-	81	63.068	ENSTBEG00000001899	-	100	65.429	Tupaia_belangeri
ENSMALG00000000200	-	60	82.131	ENSTBEG00000002751	-	97	82.474	Tupaia_belangeri
ENSMALG00000000200	-	98	80.115	ENSTTRG00000017088	PUF60	100	81.346	Tursiops_truncatus
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ENSMALG00000000200	-	98	79.008	ENSXETG00000012469	puf60	97	80.614	Xenopus_tropicalis
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ENSMALG00000000200	-	99	85.356	ENSXMAG00000010507	-	99	85.549	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000000200	-	100	81.214	ENSXMAG00000001862	puf60b	100	82.296	Xiphophorus_maculatus