EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000001056 (Gene tree)
Gene ID: 109951196
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 17393 bases
Position: chrKV885057.1:199652-217044
Accession: 109951196
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000001542	ResIII	PF04851.15	9.4e-08	1	1
ENSMALP00000001483	ResIII	PF04851.15	1.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000001532	-	8139	XM_020585533	ENSMALP00000001483	1406 (aa)	XP_020441189	UPI0009B3E665
ENSMALT00000001592	-	4014	-	ENSMALP00000001542	1337 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSMALG00000001056's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMALG00000001056's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000001056	sbno1	59	62.349	ENSMALG00000021831	si:ch73-63e15.2	79	63.376

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.350	ENSG00000139697	SBNO1	99	75.140	Homo_sapiens
ENSMALG00000001056	sbno1	85	94.071	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	94.261	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.384	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	75.157	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000001056	sbno1	100	88.322	ENSACIG00000008088	sbno1	99	88.101	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	92.395	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	92.395	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000001056	sbno1	100	92.324	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	92.324	Amphiprion_percula
ENSMALG00000001056	sbno1	100	92.608	ENSATEG00000006667	sbno1	100	92.537	Anabas_testudineus
ENSMALG00000001056	sbno1	98	75.357	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.828	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000001056	sbno1	98	74.520	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.403	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.315	ENSANAG00000029958	-	99	82.374	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000001056	sbno1	100	87.426	ENSACLG00000024913	sbno1	100	87.426	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000001056	sbno1	100	81.104	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	81.316	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	75.542	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	75.542	Bos_taurus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.402	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	75.245	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.506	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	84.127	Canis_familiaris
ENSMALG00000001056	sbno1	95	80.072	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	80.072	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000001056	sbno1	100	75.577	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	83.333	Capra_hircus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.332	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.036	Carlito_syrichta
ENSMALG00000001056	sbno1	90	83.485	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	83.485	Cavia_aperea
ENSMALG00000001056	sbno1	95	83.485	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	83.485	Cavia_porcellus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	71.119	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	71.869	Cebus_capucinus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	74.684	ENSCATG00000008239	SBNO1	99	82.585	Cercocebus_atys
ENSMALG00000001056	sbno1	95	83.485	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	83.485	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000001056	sbno1	86	80.546	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	80.973	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000001056	sbno1	96	73.048	ENSCHOG00000008814	SBNO1	99	69.306	Choloepus_hoffmanni
ENSMALG00000001056	sbno1	98	75.036	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	75.088	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000001056	sbno1	99	71.888	ENSCANG00000042688	-	99	71.659	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000001056	sbno1	96	80.783	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	81.183	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000001056	sbno1	96	80.783	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	81.183	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000001056	sbno1	100	89.197	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	89.126	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000001056	sbno1	100	89.765	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	89.837	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	81.432	ENSDARG00000099080	sbno1	100	81.786	Danio_rerio
ENSMALG00000001056	sbno1	99	79.960	ENSDNOG00000017147	SBNO1	95	79.960	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	69.331	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	79.893	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000001056	sbno1	93	71.069	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.069	Echinops_telfairi
ENSMALG00000001056	sbno1	74	64.362	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	63.356	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000001056	sbno1	51	73.416	ENSEASG00005012595	-	92	74.633	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.611	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	76.046	Equus_caballus
ENSMALG00000001056	sbno1	84	75.956	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	75.956	Erinaceus_europaeus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	83.239	ENSELUG00000002886	sbno1	99	83.522	Esox_lucius
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.611	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	75.385	Felis_catus
ENSMALG00000001056	sbno1	98	75.214	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	75.758	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000001056	sbno1	95	80.435	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	79.892	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000001056	sbno1	100	89.694	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	89.908	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000001056	sbno1	97	84.158	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.243	Gadus_morhua
ENSMALG00000001056	sbno1	88	75.218	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.876	Gallus_gallus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	90.263	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	90.121	Gambusia_affinis
ENSMALG00000001056	sbno1	97	86.752	ENSGACG00000015633	sbno1	99	88.606	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000001056	sbno1	98	74.320	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	83.513	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.280	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	83.303	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000001056	sbno1	100	80.959	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	80.590	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000001056	sbno1	95	83.485	ENSHGLG00000014165	-	99	82.796	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000001056	sbno1	93	89.827	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	91.865	Hippocampus_comes
ENSMALG00000001056	sbno1	100	81.413	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	82.282	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000001056	sbno1	95	82.585	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	82.585	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.402	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	79.174	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	91.258	ENSKMAG00000009696	sbno1	100	91.258	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	89.645	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	89.716	Labrus_bergylta
ENSMALG00000001056	sbno1	100	71.047	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.206	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000001056	sbno1	100	80.253	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.464	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.262	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.332	Loxodonta_africana
ENSMALG00000001056	sbno1	95	79.574	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	79.574	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000001056	sbno1	95	79.574	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	79.574	Macaca_mulatta
ENSMALG00000001056	sbno1	95	82.406	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	82.406	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	91.827	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	92.040	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000001056	sbno1	98	75.608	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	75.935	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000001056	sbno1	50	73.249	ENSMAUG00000004834	-	99	74.888	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	73.986	ENSMICG00000006573	-	99	79.496	Microcebus_murinus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	72.912	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	82.790	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000001056	sbno1	100	84.729	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	84.878	Mola_mola
ENSMALG00000001056	sbno1	99	74.982	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	74.982	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.615	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	90.789	Mus_caroli
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.420	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	90.789	Mus_musculus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.792	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	90.789	Mus_pahari
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.792	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	90.789	Mus_spretus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.542	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	75.297	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000001056	sbno1	99	74.930	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	75.000	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000001056	sbno1	92	83.398	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	83.398	Nannospalax_galili
ENSMALG00000001056	sbno1	100	87.740	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	87.371	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000001056	sbno1	99	72.498	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	74.147	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000001056	sbno1	62	69.811	ENSMEUG00000008768	-	93	70.440	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000001056	sbno1	99	74.772	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.982	Ochotona_princeps
ENSMALG00000001056	sbno1	95	83.666	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	83.666	Octodon_degus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	91.619	ENSONIG00000015348	sbno1	100	91.264	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000001056	sbno1	98	74.538	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	74.982	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	89.362	ENSORLG00000001593	sbno1	100	89.007	Oryzias_latipes
ENSMALG00000001056	sbno1	100	89.212	ENSORLG00020015216	sbno1	100	88.857	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000001056	sbno1	100	89.567	ENSORLG00015002726	sbno1	100	89.212	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000001056	sbno1	99	89.537	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	89.751	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000001056	sbno1	50	72.308	ENSOGAG00000010781	-	99	73.881	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000001056	sbno1	100	75.402	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.402	Ovis_aries
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.245	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	83.303	Pan_paniscus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.611	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.385	Panthera_pardus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.770	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.543	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.245	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	83.303	Pan_troglodytes
ENSMALG00000001056	sbno1	95	82.406	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	82.406	Papio_anubis
ENSMALG00000001056	sbno1	100	79.196	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	79.704	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000001056	sbno1	92	71.873	ENSPSIG00000009256	-	99	72.024	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000001056	sbno1	98	74.889	ENSPSIG00000009572	-	99	74.491	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000001056	sbno1	95	82.609	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.609	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000001056	sbno1	99	74.650	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	74.860	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	90.334	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	90.334	Poecilia_formosa
ENSMALG00000001056	sbno1	100	90.405	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	90.405	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000001056	sbno1	100	90.341	ENSPMEG00000021212	sbno1	100	90.341	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000001056	sbno1	100	89.915	ENSPREG00000017746	sbno1	100	89.915	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.333	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	75.193	Pongo_abelii
ENSMALG00000001056	sbno1	89	70.464	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	70.213	Procavia_capensis
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.315	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	82.554	Propithecus_coquereli
ENSMALG00000001056	sbno1	87	83.499	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	83.499	Pteropus_vampyrus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	91.122	ENSPNYG00000004291	sbno1	100	91.051	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000001056	sbno1	100	81.343	ENSPNAG00000015622	sbno1	100	80.989	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000001056	sbno1	100	75.035	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	82.940	Rattus_norvegicus
ENSMALG00000001056	sbno1	95	82.406	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	82.406	Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000001056	sbno1	97	73.116	ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	72.609	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000001056	sbno1	100	79.930	ENSSFOG00015019025	sbno1	100	80.563	Scleropages_formosus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	92.040	ENSSMAG00000013640	sbno1	100	91.969	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	93.532	ENSSDUG00000023480	sbno1	100	93.674	Seriola_dumerili
ENSMALG00000001056	sbno1	100	93.390	ENSSLDG00000007928	sbno1	100	93.532	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000001056	sbno1	89	80.161	ENSSARG00000002594	SBNO1	89	80.161	Sorex_araneus
ENSMALG00000001056	sbno1	98	75.111	ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.383	Sphenodon_punctatus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	92.751	ENSSPAG00000016244	sbno1	100	92.964	Stegastes_partitus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.385	ENSSSCG00000009776	SBNO1	99	75.297	Sus_scrofa
ENSMALG00000001056	sbno1	98	75.071	ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	75.617	Taeniopygia_guttata
ENSMALG00000001056	sbno1	99	86.525	ENSTRUG00000018490	sbno1	99	87.163	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000001056	sbno1	57	84.845	ENSTNIG00000013506	sbno1	99	85.430	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.542	ENSUAMG00000019671	SBNO1	99	75.315	Ursus_americanus
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.542	ENSUMAG00000004002	SBNO1	99	75.315	Ursus_maritimus
ENSMALG00000001056	sbno1	95	73.333	ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	73.333	Vicugna_pacos
ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.611	ENSVVUG00000027807	SBNO1	99	75.385	Vulpes_vulpes
ENSMALG00000001056	sbno1	99	72.261	ENSXETG00000031930	SBNO1	99	72.414	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000001056	sbno1	88	88.421	ENSXCOG00000011607	sbno1	99	85.899	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000001056	sbno1	100	90.270	ENSXMAG00000002140	sbno1	100	90.270	Xiphophorus_maculatus