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Description

Ensembl ID: ENSMALG00000001696 (Gene tree)
Gene ID: 109955939
Gene Symbol: celf4
Alias: zgc:92761
Full Name: CUGBP Elav-like family member 4
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 79901 bases
Position: chrKV884706.1:4525730-4605630
Accession: 109955939
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000002327	RRM_1	PF00076.22	3e-53	1	3
ENSMALP00000002327	RRM_1	PF00076.22	3e-53	2	3
ENSMALP00000002327	RRM_1	PF00076.22	3e-53	3	3
ENSMALP00000002315	RRM_1	PF00076.22	3.5e-53	1	3
ENSMALP00000002315	RRM_1	PF00076.22	3.5e-53	2	3
ENSMALP00000002315	RRM_1	PF00076.22	3.5e-53	3	3
ENSMALP00000002301	RRM_1	PF00076.22	4.1e-53	1	3
ENSMALP00000002301	RRM_1	PF00076.22	4.1e-53	2	3
ENSMALP00000002301	RRM_1	PF00076.22	4.1e-53	3	3
ENSMALP00000002342	RRM_1	PF00076.22	1.8e-30	1	3
ENSMALP00000002342	RRM_1	PF00076.22	1.8e-30	2	3
ENSMALP00000002342	RRM_1	PF00076.22	1.8e-30	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000002406	-	1284	-	ENSMALP00000002342	427 (aa)	-	-
ENSMALT00000002379	-	1581	-	ENSMALP00000002315	504 (aa)	-	-
ENSMALT00000002365	-	1644	XM_020592597	ENSMALP00000002301	525 (aa)	XP_020448253	UPI0009B4A5DA
ENSMALT00000002391	-	1533	-	ENSMALP00000002327	488 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000001696	celf4	91	37.500	ENSMALG00000010070	elavl1a	80	45.679
ENSMALG00000001696	celf4	67	36.250	ENSMALG00000019536	RBMS3	54	36.250
ENSMALG00000001696	celf4	92	73.485	ENSMALG00000011641	celf3a	100	72.243
ENSMALG00000001696	celf4	96	32.673	ENSMALG00000016659	elavl3	82	41.860
ENSMALG00000001696	celf4	51	32.222	ENSMALG00000017478	tia1l	65	34.568
ENSMALG00000001696	celf4	97	47.648	ENSMALG00000000961	-	100	46.322
ENSMALG00000001696	celf4	91	75.055	ENSMALG00000017703	celf5a	94	73.894
ENSMALG00000001696	celf4	95	35.802	ENSMALG00000016432	elavl4	76	40.741
ENSMALG00000001696	celf4	68	31.818	ENSMALG00000016924	-	81	34.177
ENSMALG00000001696	celf4	96	37.037	ENSMALG00000003411	elavl2	89	37.037
ENSMALG00000001696	celf4	91	46.285	ENSMALG00000011132	-	98	46.681
ENSMALG00000001696	celf4	77	37.349	ENSMALG00000006066	pabpc1b	72	37.349
ENSMALG00000001696	celf4	65	34.568	ENSMALG00000014520	rbms2b	51	34.568
ENSMALG00000001696	celf4	67	32.099	ENSMALG00000016900	rbms2a	52	32.099
ENSMALG00000001696	celf4	91	38.636	ENSMALG00000021265	-	97	45.679
ENSMALG00000001696	celf4	91	68.172	ENSMALG00000007438	celf3b	100	67.216
ENSMALG00000001696	celf4	56	37.349	ENSMALG00000013020	-	50	37.349
ENSMALG00000001696	celf4	100	78.905	ENSMALG00000012778	-	100	78.702

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000001696	celf4	100	80.990	ENSG00000101489	CELF4	100	94.030	Homo_sapiens
ENSMALG00000001696	celf4	100	99.619	ENSAPOG00000002964	celf4	100	99.619	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000001696	celf4	88	81.473	ENSAMEG00000017059	CELF4	99	82.143	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000001696	celf4	100	86.066	ENSACIG00000018097	celf4	100	86.066	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000001696	celf4	52	69.962	ENSAOCG00000019919	-	78	69.922	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000001696	celf4	100	99.619	ENSAOCG00000020590	celf4	100	99.619	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000001696	celf4	100	88.776	ENSAPEG00000002940	celf4	99	88.776	Amphiprion_percula
ENSMALG00000001696	celf4	100	88.776	ENSATEG00000023731	celf4	100	88.776	Anabas_testudineus
ENSMALG00000001696	celf4	88	75.726	ENSAPLG00000007830	-	100	75.726	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000001696	celf4	50	84.615	ENSACAG00000012428	CELF4	92	87.500	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000001696	celf4	100	80.671	ENSANAG00000029499	CELF4	99	81.262	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000001696	celf4	100	99.429	ENSACLG00000011828	celf4	100	99.429	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000001696	celf4	100	94.095	ENSAMXG00000007935	celf4	100	94.095	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000001696	celf4	100	82.056	ENSBTAG00000004940	CELF4	98	92.683	Bos_taurus
ENSMALG00000001696	celf4	100	80.632	ENSCJAG00000021135	CELF4	99	81.225	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000001696	celf4	100	82.056	ENSCHIG00000007169	CELF4	98	92.683	Capra_hircus
ENSMALG00000001696	celf4	94	81.250	ENSTSYG00000000816	CELF4	85	82.031	Carlito_syrichta
ENSMALG00000001696	celf4	100	79.208	ENSCPOG00000035956	CELF4	99	80.000	Cavia_porcellus
ENSMALG00000001696	celf4	100	80.671	ENSCCAG00000028373	CELF4	99	81.262	Cebus_capucinus
ENSMALG00000001696	celf4	100	80.632	ENSCATG00000045293	CELF4	99	81.225	Cercocebus_atys
ENSMALG00000001696	celf4	100	83.762	ENSCLAG00000008344	CELF4	99	84.554	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000001696	celf4	90	87.921	ENSCSAG00000017933	CELF4	100	89.888	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000001696	celf4	92	83.473	ENSCPBG00000005237	CELF4	96	84.034	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000001696	celf4	100	80.671	ENSCANG00000036735	CELF4	99	81.262	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000001696	celf4	76	77.573	ENSCGRG00001018085	Celf4	89	79.420	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000001696	celf4	100	99.238	ENSCSEG00000007074	celf4	99	100.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000001696	celf4	100	87.805	ENSCVAG00000017617	celf4	99	87.805	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000001696	celf4	100	94.667	ENSDARG00000070045	celf4	100	96.296	Danio_rerio
ENSMALG00000001696	celf4	90	84.511	ENSDNOG00000032492	CELF4	99	86.957	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000001696	celf4	100	83.762	ENSDORG00000007169	Celf4	99	84.554	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000001696	celf4	78	93.750	ENSETEG00000007432	-	74	77.931	Echinops_telfairi
ENSMALG00000001696	celf4	100	82.495	ENSEASG00005016534	CELF4	99	83.099	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000001696	celf4	100	80.632	ENSECAG00000008810	CELF4	99	81.225	Equus_caballus
ENSMALG00000001696	celf4	89	80.804	ENSEEUG00000003763	CELF4	86	81.696	Erinaceus_europaeus
ENSMALG00000001696	celf4	100	82.294	ENSFCAG00000045234	CELF4	99	82.897	Felis_catus
ENSMALG00000001696	celf4	90	89.045	ENSFALG00000009188	CELF4	98	90.169	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000001696	celf4	100	79.802	ENSFDAG00000010287	CELF4	99	80.000	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000001696	celf4	100	97.436	ENSFHEG00000003431	celf4	99	97.436	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000001696	celf4	79	92.683	ENSGMOG00000011747	-	74	92.683	Gadus_morhua
ENSMALG00000001696	celf4	100	92.391	ENSGMOG00000008703	celf4	91	92.391	Gadus_morhua
ENSMALG00000001696	celf4	100	98.667	ENSGAFG00000021515	celf4	99	98.126	Gambusia_affinis
ENSMALG00000001696	celf4	100	91.288	ENSGACG00000008752	celf4	100	91.271	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000001696	celf4	68	88.737	ENSGAGG00000023014	-	98	88.737	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000001696	celf4	71	85.185	ENSGAGG00000017672	-	86	90.217	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000001696	celf4	100	80.671	ENSGGOG00000013920	CELF4	99	81.262	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000001696	celf4	100	99.238	ENSHBUG00000021618	celf4	100	99.238	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000001696	celf4	100	80.990	ENSHGLG00000003130	CELF4	99	81.188	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000001696	celf4	100	83.168	ENSHGLG00100006394	CELF4	99	83.960	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000001696	celf4	100	86.122	ENSHCOG00000012195	celf4	99	85.510	Hippocampus_comes
ENSMALG00000001696	celf4	100	84.381	ENSIPUG00000010810	celf4	96	82.553	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000001696	celf4	100	82.970	ENSJJAG00000016892	Celf4	99	83.762	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000001696	celf4	100	98.667	ENSKMAG00000019602	celf4	100	98.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000001696	celf4	100	88.163	ENSLBEG00000000940	celf4	99	88.163	Labrus_bergylta
ENSMALG00000001696	celf4	93	81.638	ENSLOCG00000004792	celf4	99	81.638	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000001696	celf4	100	83.730	ENSLAFG00000021352	CELF4	99	84.524	Loxodonta_africana
ENSMALG00000001696	celf4	100	80.671	ENSMFAG00000042983	CELF4	99	81.262	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000001696	celf4	100	80.990	ENSMMUG00000006866	CELF4	99	81.386	Macaca_mulatta
ENSMALG00000001696	celf4	100	82.294	ENSMNEG00000033449	CELF4	99	82.897	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000001696	celf4	92	80.440	ENSMLEG00000028543	CELF4	99	80.659	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000001696	celf4	100	88.776	ENSMAMG00000018573	celf4	99	88.776	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000001696	celf4	100	86.475	ENSMZEG00005026879	celf4	99	86.475	Maylandia_zebra
ENSMALG00000001696	celf4	65	66.767	ENSMGAG00000017029	CELF4	100	67.937	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000001696	celf4	100	80.632	ENSMICG00000006984	CELF4	99	81.225	Microcebus_murinus
ENSMALG00000001696	celf4	100	83.366	ENSMOCG00000011985	Celf4	99	84.356	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000001696	celf4	100	87.755	ENSMMOG00000012281	celf4	100	87.755	Mola_mola
ENSMALG00000001696	celf4	78	70.757	ENSMODG00000000306	CELF4	91	78.613	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000001696	celf4	100	83.564	MGP_CAROLIEiJ_G0022058	Celf4	100	83.473	Mus_caroli
ENSMALG00000001696	celf4	100	83.702	ENSMUSG00000024268	Celf4	99	86.720	Mus_musculus
ENSMALG00000001696	celf4	100	83.564	MGP_PahariEiJ_G0018792	Celf4	100	83.473	Mus_pahari
ENSMALG00000001696	celf4	100	83.564	MGP_SPRETEiJ_G0022969	Celf4	100	83.438	Mus_spretus
ENSMALG00000001696	celf4	94	71.090	ENSMPUG00000001027	CELF4	100	72.834	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000001696	celf4	90	87.131	ENSMLUG00000001755	CELF4	100	87.131	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000001696	celf4	100	83.762	ENSNGAG00000000761	Celf4	99	84.554	Nannospalax_galili
ENSMALG00000001696	celf4	100	86.475	ENSNBRG00000018194	celf4	99	86.475	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000001696	celf4	77	77.937	ENSMEUG00000007202	-	92	92.593	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000001696	celf4	89	81.013	ENSOPRG00000014415	CELF4	89	86.555	Ochotona_princeps
ENSMALG00000001696	celf4	100	83.762	ENSODEG00000018464	CELF4	99	84.554	Octodon_degus
ENSMALG00000001696	celf4	100	99.429	ENSONIG00000019463	celf4	100	99.429	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000001696	celf4	88	85.092	ENSOCUG00000024790	CELF4	81	85.780	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000001696	celf4	100	99.619	ENSORLG00000008913	celf4	100	99.619	Oryzias_latipes
ENSMALG00000001696	celf4	100	99.619	ENSORLG00020008454	celf4	100	99.619	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000001696	celf4	100	99.619	ENSORLG00015004115	celf4	100	99.619	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000001696	celf4	100	99.810	ENSOMEG00000002391	celf4	100	99.810	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000001696	celf4	94	80.000	ENSOGAG00000010018	CELF4	100	81.647	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000001696	celf4	68	80.892	ENSOARG00000005276	CELF4	100	86.943	Ovis_aries
ENSMALG00000001696	celf4	92	83.956	ENSPPAG00000020644	CELF4	99	84.176	Pan_paniscus
ENSMALG00000001696	celf4	100	80.671	ENSPPRG00000007683	CELF4	99	81.262	Panthera_pardus
ENSMALG00000001696	celf4	100	80.671	ENSPTRG00000009982	CELF4	99	81.262	Pan_troglodytes
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ENSMALG00000001696	celf4	90	92.537	ENSXCOG00000017592	celf4	97	89.858	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000001696	celf4	100	98.476	ENSXMAG00000018178	celf4	100	98.476	Xiphophorus_maculatus