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Description

Ensembl ID: ENSMALG00000002081 (Gene tree)
Gene ID: 109955557
Gene Symbol: smarca5
Alias: SWI/SNF related|matrix associated|actin dependent regulator of chromatin A5|chunp6878|fb26d12|fb49g04|im:7146484|wu:fb26d12|wu:fb49g04|zgc:158434
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 5
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 12224 bases
Position: chrKV884703.1:1408954-1421177
Accession: 109955557
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000002853	ResIII	PF04851.15	5.8e-11	1	1
ENSMALP00000002878	ResIII	PF04851.15	5.9e-11	1	1
ENSMALP00000002878	DEAD	PF00270.29	3.8e-06	1	1
ENSMALP00000002853	DEAD	PF00270.29	4e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000002957	-	3012	-	ENSMALP00000002878	1003 (aa)	-	-
ENSMALT00000002932	-	6972	XM_020591835	ENSMALP00000002853	1033 (aa)	XP_020447491	UPI0009B43F05

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000002081	smarca5	55	40.072	ENSMALG00000014675	chd1l	54	41.472
ENSMALG00000002081	smarca5	52	40.201	ENSMALG00000010244	hells	72	40.778

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.922	ENSG00000102038	SMARCA1	92	83.333	Homo_sapiens
ENSMALG00000002081	smarca5	100	97.782	ENSAPOG00000016035	smarca5	100	97.782	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.911	ENSAMEG00000015218	SMARCA1	92	82.323	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000002081	smarca5	87	98.002	ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.002	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000002081	smarca5	100	97.782	ENSAOCG00000015578	smarca5	100	97.782	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000002081	smarca5	100	97.782	ENSAPEG00000011117	smarca5	99	99.173	Amphiprion_percula
ENSMALG00000002081	smarca5	100	97.300	ENSATEG00000012894	smarca5	100	97.300	Anabas_testudineus
ENSMALG00000002081	smarca5	96	84.511	ENSAPLG00000013149	SMARCA1	99	84.151	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000002081	smarca5	97	84.314	ENSACAG00000011376	SMARCA1	93	84.560	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000002081	smarca5	97	78.086	ENSANAG00000023098	SMARCA1	92	78.528	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000002081	smarca5	100	97.300	ENSACLG00000025356	smarca5	100	97.300	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000002081	smarca5	99	92.254	ENSAMXG00000005709	smarca5	94	95.385	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000002081	smarca5	92	84.056	ENSAMXG00000011227	smarca1	99	85.283	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.869	ENSBTAG00000002292	SMARCA1	92	82.256	Bos_taurus
ENSMALG00000002081	smarca5	99	62.463	WBGene00002169	isw-1	95	63.880	Caenorhabditis_elegans
ENSMALG00000002081	smarca5	96	83.506	ENSCJAG00000002868	SMARCA1	92	83.333	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	73.610	ENSCAFG00000018673	SMARCA1	99	75.410	Canis_familiaris
ENSMALG00000002081	smarca5	97	83.025	ENSCAFG00020001751	SMARCA1	92	83.436	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.766	ENSCHIG00000009837	SMARCA1	92	83.027	Capra_hircus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	83.025	ENSTSYG00000004240	SMARCA1	96	83.179	Carlito_syrichta
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.697	ENSCPOG00000013601	SMARCA1	93	82.114	Cavia_porcellus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	80.247	ENSCCAG00000030817	SMARCA1	92	80.675	Cebus_capucinus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.497	ENSCATG00000015921	SMARCA1	92	83.420	Cercocebus_atys
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.202	ENSCLAG00000002171	SMARCA1	92	82.618	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.922	ENSCSAG00000008460	SMARCA1	92	83.333	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	84.314	ENSCPBG00000001146	SMARCA1	92	84.356	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000002081	smarca5	98	74.187	ENSCING00000004110	swi/snf	97	75.204	Ciona_intestinalis
ENSMALG00000002081	smarca5	98	73.562	ENSCSAVG00000004620	-	99	75.951	Ciona_savignyi
ENSMALG00000002081	smarca5	97	83.025	ENSCANG00000007183	SMARCA1	92	83.436	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.893	ENSCGRG00001010776	Smarca1	92	82.311	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000002081	smarca5	97	80.957	ENSCGRG00000015301	Smarca1	96	81.753	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.422	ENSCSEG00000000328	smarca5	100	96.422	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.239	ENSCVAG00000008668	smarca5	99	97.403	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000002081	smarca5	100	91.040	ENSDARG00000052348	smarca5	100	90.944	Danio_rerio
ENSMALG00000002081	smarca5	96	82.454	ENSDARG00000012776	smarca1	96	82.347	Danio_rerio
ENSMALG00000002081	smarca5	98	81.809	ENSDNOG00000004315	SMARCA1	91	84.239	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.497	ENSDORG00000009270	Smarca1	92	83.316	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000002081	smarca5	99	73.594	FBgn0011604	Iswi	97	74.500	Drosophila_melanogaster
ENSMALG00000002081	smarca5	81	81.818	ENSETEG00000017426	SMARCA1	86	81.818	Echinops_telfairi
ENSMALG00000002081	smarca5	99	80.704	ENSEBUG00000001239	smarca5	96	82.528	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000002081	smarca5	96	79.896	ENSEASG00005008218	SMARCA1	99	79.370	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.922	ENSECAG00000012106	SMARCA1	92	83.333	Equus_caballus
ENSMALG00000002081	smarca5	80	81.494	ENSEEUG00000014927	SMARCA1	80	83.775	Erinaceus_europaeus
ENSMALG00000002081	smarca5	96	83.992	ENSELUG00000010515	smarca1	95	84.706	Esox_lucius
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.922	ENSFCAG00000018496	SMARCA1	92	83.333	Felis_catus
ENSMALG00000002081	smarca5	92	84.348	ENSFALG00000000209	SMARCA1	98	85.120	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000002081	smarca5	99	80.139	ENSFDAG00000009818	SMARCA1	95	81.781	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000002081	smarca5	100	94.752	ENSFHEG00000007687	smarca5	100	94.359	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000002081	smarca5	99	81.207	ENSGALG00000008431	SMARCA1	95	85.057	Gallus_gallus
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.721	ENSGAFG00000017731	smarca5	100	96.721	Gambusia_affinis
ENSMALG00000002081	smarca5	95	84.906	ENSGAGG00000023575	SMARCA1	99	84.362	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000002081	smarca5	71	96.000	ENSGGOG00000012841	-	91	79.736	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.996	ENSHGLG00000003080	SMARCA1	92	82.413	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.493	ENSHGLG00100001102	SMARCA1	98	81.911	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.724	ENSHCOG00000005458	smarca5	100	96.724	Hippocampus_comes
ENSMALG00000002081	smarca5	100	90.803	ENSIPUG00000005229	SMARCA5	96	94.867	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000002081	smarca5	99	81.727	ENSIPUG00000016905	Smarca1	99	83.914	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.819	ENSSTOG00000014524	SMARCA1	95	82.907	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.576	ENSJJAG00000002593	Smarca1	93	81.892	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.528	ENSKMAG00000003777	smarca5	100	96.528	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000002081	smarca5	95	95.293	ENSLBEG00000013295	SMARCA1	100	97.975	Labrus_bergylta
ENSMALG00000002081	smarca5	100	95.745	ENSLBEG00000018112	smarca5	100	95.261	Labrus_bergylta
ENSMALG00000002081	smarca5	95	85.266	ENSLACG00000016697	SMARCA1	95	84.948	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000002081	smarca5	96	84.990	ENSLOCG00000014591	smarca1	95	85.363	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.800	ENSLAFG00000000896	SMARCA1	98	82.215	Loxodonta_africana
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.922	ENSMFAG00000002117	SMARCA1	95	83.247	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.497	ENSMMUG00000008818	SMARCA1	98	84.255	Macaca_mulatta
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.497	ENSMNEG00000041768	SMARCA1	95	83.247	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.922	ENSMLEG00000043198	SMARCA1	92	83.333	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000002081	smarca5	100	97.305	ENSMAMG00000014294	smarca5	100	97.305	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000002081	smarca5	100	97.300	ENSMZEG00005009369	smarca5	100	97.300	Maylandia_zebra
ENSMALG00000002081	smarca5	96	83.368	ENSMGAG00000007042	SMARCA1	97	83.030	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000002081	smarca5	97	80.855	ENSMAUG00000008133	Smarca1	92	81.649	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	83.230	ENSMICG00000015768	SMARCA1	92	83.640	Microcebus_murinus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.167	ENSMOCG00000009464	Smarca1	92	81.587	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000002081	smarca5	98	95.617	ENSMMOG00000005547	smarca5	100	96.784	Mola_mola
ENSMALG00000002081	smarca5	94	84.517	ENSMODG00000013187	-	94	83.897	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.372	MGP_CAROLIEiJ_G0033034	Smarca1	92	81.892	Mus_caroli
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.372	ENSMUSG00000031099	Smarca1	92	81.892	Mus_musculus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.576	MGP_PahariEiJ_G0031579	Smarca1	92	82.172	Mus_pahari
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.372	MGP_SPRETEiJ_G0034192	Smarca1	92	81.892	Mus_spretus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.012	ENSMPUG00000017423	SMARCA1	87	82.424	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000002081	smarca5	98	79.960	ENSMLUG00000029614	SMARCA1	93	80.847	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.365	ENSNGAG00000006492	Smarca1	92	82.165	Nannospalax_galili
ENSMALG00000002081	smarca5	98	96.945	ENSNBRG00000004463	smarca5	100	98.092	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.735	ENSNLEG00000015179	SMARCA1	96	82.541	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000002081	smarca5	92	75.294	ENSMEUG00000008819	SMARCA1	97	75.996	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000002081	smarca5	97	80.991	ENSODEG00000012163	SMARCA1	92	81.781	Octodon_degus
ENSMALG00000002081	smarca5	100	97.396	ENSONIG00000009993	smarca5	100	97.396	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000002081	smarca5	95	85.115	ENSOANG00000002862	SMARCA1	99	84.671	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	83.385	ENSOCUG00000001047	SMARCA1	92	83.538	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.061	ENSORLG00000021998	smarca5	100	96.061	Oryzias_latipes
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.250	ENSORLG00020017679	smarca5	100	96.250	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.439	ENSORLG00015017210	smarca5	100	96.439	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.532	ENSOMEG00000000086	smarca5	100	96.532	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.947	ENSOGAG00000004399	SMARCA1	90	83.701	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000002081	smarca5	96	83.333	ENSOARG00000014638	SMARCA1	99	83.027	Ovis_aries
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.922	ENSPPAG00000034647	SMARCA1	92	83.333	Pan_paniscus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	83.025	ENSPPRG00000008929	SMARCA1	92	83.436	Panthera_pardus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.193	ENSPTIG00000000915	SMARCA1	96	81.608	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.922	ENSPTRG00000049876	SMARCA1	92	83.420	Pan_troglodytes
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.922	ENSPANG00000003871	SMARCA1	92	83.333	Papio_anubis
ENSMALG00000002081	smarca5	98	80.727	ENSPKIG00000013411	smarca1	96	83.386	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000002081	smarca5	97	83.282	ENSPSIG00000010101	SMARCA1	99	84.362	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.161	ENSPEMG00000017503	Smarca1	92	81.959	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000002081	smarca5	96	84.336	ENSPCIG00000015460	SMARCA1	96	84.324	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.818	ENSPFOG00000007649	smarca5	100	96.818	Poecilia_formosa
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.818	ENSPLAG00000003363	smarca5	100	96.818	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.914	ENSPMEG00000019849	smarca5	100	96.914	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.818	ENSPREG00000023250	smarca5	100	96.818	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000002081	smarca5	97	80.041	ENSPPYG00000020703	SMARCA1	92	80.470	Pongo_abelii
ENSMALG00000002081	smarca5	78	75.364	ENSPCOG00000020722	SMARCA1	93	79.970	Propithecus_coquereli
ENSMALG00000002081	smarca5	92	81.911	ENSPVAG00000003805	SMARCA1	84	83.180	Pteropus_vampyrus
ENSMALG00000002081	smarca5	59	98.688	ENSPNYG00000012299	smarca5	93	98.688	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000002081	smarca5	97	81.687	ENSRNOG00000003762	Smarca1	92	82.106	Rattus_norvegicus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	83.025	ENSRROG00000034167	SMARCA1	92	83.436	Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000002081	smarca5	96	83.646	ENSSBOG00000020641	SMARCA1	99	83.231	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000002081	smarca5	95	79.393	ENSSHAG00000013518	SMARCA1	99	79.218	Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000002081	smarca5	96	92.547	ENSSFOG00015016794	smarca5	100	93.608	Scleropages_formosus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	83.845	ENSSFOG00015009043	smarca1	96	84.631	Scleropages_formosus
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.054	ENSSMAG00000004801	smarca5	100	96.054	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000002081	smarca5	100	98.162	ENSSDUG00000020690	smarca5	100	98.162	Seriola_dumerili
ENSMALG00000002081	smarca5	100	98.162	ENSSLDG00000025190	smarca5	100	98.162	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000002081	smarca5	82	81.533	ENSSARG00000000842	SMARCA1	81	83.986	Sorex_araneus
ENSMALG00000002081	smarca5	98	83.282	ENSSPUG00000000590	SMARCA1	93	85.057	Sphenodon_punctatus
ENSMALG00000002081	smarca5	100	97.686	ENSSPAG00000002894	smarca5	100	97.686	Stegastes_partitus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.462	ENSSSCG00000012649	SMARCA1	95	82.907	Sus_scrofa
ENSMALG00000002081	smarca5	96	83.954	ENSTGUG00000003899	-	99	83.845	Taeniopygia_guttata
ENSMALG00000002081	smarca5	100	95.468	ENSTRUG00000014094	smarca5	100	95.169	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000002081	smarca5	99	93.781	ENSTNIG00000017717	smarca5	97	94.390	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000002081	smarca5	90	81.051	ENSTBEG00000014973	SMARCA1	91	81.051	Tupaia_belangeri
ENSMALG00000002081	smarca5	98	78.528	ENSTTRG00000006168	SMARCA1	98	79.222	Tursiops_truncatus
ENSMALG00000002081	smarca5	97	82.716	ENSUAMG00000020201	SMARCA1	92	83.129	Ursus_americanus
ENSMALG00000002081	smarca5	98	77.677	ENSUMAG00000004073	SMARCA1	97	84.019	Ursus_maritimus
ENSMALG00000002081	smarca5	77	85.761	ENSVPAG00000010492	-	79	85.761	Vicugna_pacos
ENSMALG00000002081	smarca5	97	83.025	ENSVVUG00000008878	SMARCA1	98	84.665	Vulpes_vulpes
ENSMALG00000002081	smarca5	96	83.814	ENSXETG00000001526	smarca1	98	84.189	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000002081	smarca5	99	95.884	ENSXCOG00000011170	smarca5	100	96.931	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000002081	smarca5	100	96.625	ENSXMAG00000009678	smarca5	100	96.625	Xiphophorus_maculatus