EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000002665 (Gene tree)
Gene ID: 109958404
Gene Symbol: polr1e
Alias: zgc:112501
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4212 bases
Position: chrKV884720.1:2473017-2477228
Accession: 109958404
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000003646	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	9.8e-115	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000003740	-	1631	XM_020597003	ENSMALP00000003646	420 (aa)	XP_020452659	UPI0009B448C7

Gene Model

Click here to download ENSMALG00000002665's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
malb03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMALG00000002665's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000002665	polr1e	99	43.810	ENSG00000137054	POLR1E	99	43.810	Homo_sapiens
ENSMALG00000002665	polr1e	99	72.115	ENSAPOG00000012452	polr1e	100	72.115	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	40.471	ENSAMEG00000010193	POLR1E	97	40.471	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000002665	polr1e	99	69.378	ENSACIG00000009884	polr1e	99	72.774	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	77.404	ENSAOCG00000005665	polr1e	100	77.404	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000002665	polr1e	99	77.885	ENSAPEG00000020581	polr1e	100	77.885	Amphiprion_percula
ENSMALG00000002665	polr1e	99	83.173	ENSATEG00000020609	polr1e	100	83.173	Anabas_testudineus
ENSMALG00000002665	polr1e	80	39.433	ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	38.677	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.366	ENSANAG00000038046	POLR1E	99	44.366	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000002665	polr1e	100	76.667	ENSACLG00000013685	polr1e	100	76.667	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000002665	polr1e	99	58.554	ENSAMXG00000018181	polr1e	99	58.554	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	45.131	ENSBTAG00000012243	POLR1E	99	45.131	Bos_taurus
ENSMALG00000002665	polr1e	90	46.702	ENSCJAG00000010512	POLR1E	94	46.702	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	43.468	ENSCAFG00000002377	POLR1E	99	43.468	Canis_familiaris
ENSMALG00000002665	polr1e	99	43.705	ENSCAFG00020017851	POLR1E	99	43.705	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000002665	polr1e	97	46.944	ENSCHIG00000019479	POLR1E	97	46.944	Capra_hircus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.000	ENSTSYG00000002075	POLR1E	99	44.000	Carlito_syrichta
ENSMALG00000002665	polr1e	69	42.034	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	42.034	Cavia_aperea
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.836	ENSCPOG00000009965	POLR1E	100	44.836	Cavia_porcellus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	40.141	ENSCCAG00000029460	POLR1E	99	40.141	Cebus_capucinus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.048	ENSCATG00000031732	POLR1E	99	45.113	Cercocebus_atys
ENSMALG00000002665	polr1e	87	47.268	ENSCLAG00000012701	POLR1E	96	47.268	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.048	ENSCSAG00000010782	POLR1E	99	44.048	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000002665	polr1e	94	38.945	ENSCHOG00000013024	POLR1E	82	38.945	Choloepus_hoffmanni
ENSMALG00000002665	polr1e	99	45.433	ENSCPBG00000006923	POLR1E	99	45.803	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.524	ENSCANG00000036112	POLR1E	99	45.865	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000002665	polr1e	100	42.488	ENSCGRG00001006197	Polr1e	97	42.488	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000002665	polr1e	100	42.019	ENSCGRG00000006430	Polr1e	97	42.019	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000002665	polr1e	99	70.361	ENSCSEG00000005121	polr1e	99	70.361	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000002665	polr1e	99	76.442	ENSCVAG00000019759	polr1e	100	76.442	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000002665	polr1e	96	58.911	ENSDARG00000006434	polr1e	100	58.654	Danio_rerio
ENSMALG00000002665	polr1e	99	37.736	ENSDNOG00000010257	POLR1E	99	37.736	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000002665	polr1e	76	45.652	ENSETEG00000018204	POLR1E	90	45.963	Echinops_telfairi
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.601	ENSEASG00005000675	POLR1E	99	44.601	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.601	ENSECAG00000014669	POLR1E	99	44.601	Equus_caballus
ENSMALG00000002665	polr1e	94	38.889	ENSEEUG00000011928	POLR1E	83	38.889	Erinaceus_europaeus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	66.983	ENSELUG00000008150	polr1e	99	66.587	Esox_lucius
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.836	ENSFCAG00000013081	POLR1E	99	44.836	Felis_catus
ENSMALG00000002665	polr1e	94	45.274	ENSFALG00000012950	POLR1E	99	45.274	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000002665	polr1e	99	45.327	ENSFDAG00000016917	POLR1E	100	45.327	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000002665	polr1e	99	75.481	ENSFHEG00000009801	polr1e	100	75.481	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000002665	polr1e	98	53.571	ENSGMOG00000003336	POLR1E	99	53.571	Gadus_morhua
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.104	ENSGALG00000005395	POLR1E	99	44.104	Gallus_gallus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	74.760	ENSGAFG00000004850	polr1e	100	74.760	Gambusia_affinis
ENSMALG00000002665	polr1e	99	69.928	ENSGACG00000016087	polr1e	100	69.928	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000002665	polr1e	96	41.626	ENSGAGG00000001659	POLR1E	98	42.462	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.048	ENSGGOG00000001882	POLR1E	99	45.865	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000002665	polr1e	100	76.667	ENSHBUG00000002559	polr1e	100	76.667	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000002665	polr1e	99	46.118	ENSHGLG00000002036	POLR1E	100	46.118	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000002665	polr1e	99	46.353	ENSHGLG00100012784	POLR1E	100	46.353	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000002665	polr1e	99	73.317	ENSHCOG00000002774	polr1e	100	73.317	Hippocampus_comes
ENSMALG00000002665	polr1e	99	56.250	ENSIPUG00000003019	polr1e	99	56.250	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	45.346	ENSSTOG00000009810	POLR1E	99	45.346	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000002665	polr1e	97	45.146	ENSJJAG00000020731	Polr1e	93	45.146	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	76.202	ENSKMAG00000000046	polr1e	100	76.202	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	78.043	ENSLBEG00000003104	polr1e	99	78.043	Labrus_bergylta
ENSMALG00000002665	polr1e	85	51.240	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.240	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000002665	polr1e	99	53.428	ENSLOCG00000012859	polr1e	99	53.428	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.235	ENSLAFG00000012831	POLR1E	99	44.235	Loxodonta_africana
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.048	ENSMFAG00000045465	POLR1E	99	45.113	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.048	ENSMMUG00000017892	POLR1E	99	45.113	Macaca_mulatta
ENSMALG00000002665	polr1e	99	40.509	ENSMNEG00000040283	POLR1E	99	40.509	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.048	ENSMLEG00000031135	POLR1E	99	45.113	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	78.998	ENSMAMG00000001260	polr1e	99	78.998	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000002665	polr1e	100	76.905	ENSMZEG00005021536	polr1e	100	76.905	Maylandia_zebra
ENSMALG00000002665	polr1e	99	43.059	ENSMAUG00000021044	Polr1e	96	43.059	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	45.305	ENSMICG00000003673	POLR1E	99	45.305	Microcebus_murinus
ENSMALG00000002665	polr1e	100	42.254	ENSMOCG00000012920	Polr1e	97	42.254	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000002665	polr1e	99	78.417	ENSMMOG00000007391	polr1e	100	78.417	Mola_mola
ENSMALG00000002665	polr1e	95	45.274	ENSMODG00000002884	POLR1E	98	45.274	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000002665	polr1e	98	42.823	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	97	43.182	Mus_caroli
ENSMALG00000002665	polr1e	98	42.959	ENSMUSG00000028318	Polr1e	97	43.325	Mus_musculus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.286	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	97	44.836	Mus_pahari
ENSMALG00000002665	polr1e	98	43.373	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	97	43.577	Mus_spretus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	39.368	ENSMPUG00000006040	POLR1E	99	37.895	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.418	ENSMLUG00000012688	POLR1E	96	44.418	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000002665	polr1e	97	45.631	ENSNGAG00000002520	Polr1e	93	45.631	Nannospalax_galili
ENSMALG00000002665	polr1e	100	76.905	ENSNBRG00000016822	polr1e	100	76.905	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000002665	polr1e	99	43.810	ENSNLEG00000003616	POLR1E	99	45.113	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000002665	polr1e	73	49.333	ENSMEUG00000015372	-	59	49.333	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000002665	polr1e	85	38.187	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	38.187	Ochotona_princeps
ENSMALG00000002665	polr1e	97	46.455	ENSODEG00000014565	POLR1E	94	46.455	Octodon_degus
ENSMALG00000002665	polr1e	100	77.381	ENSONIG00000008921	polr1e	100	77.381	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000002665	polr1e	90	46.597	ENSOCUG00000024773	POLR1E	91	46.597	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	71.875	ENSORLG00000005143	polr1e	100	71.875	Oryzias_latipes
ENSMALG00000002665	polr1e	92	69.171	ENSORLG00020007271	polr1e	99	69.171	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000002665	polr1e	99	72.115	ENSORLG00015000137	polr1e	100	72.115	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000002665	polr1e	99	69.212	ENSOMEG00000013264	polr1e	99	69.212	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.131	ENSOGAG00000012981	POLR1E	97	44.131	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000002665	polr1e	97	46.699	ENSOARG00000011465	POLR1E	93	46.699	Ovis_aries
ENSMALG00000002665	polr1e	99	43.810	ENSPPAG00000034566	POLR1E	99	45.113	Pan_paniscus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.601	ENSPPRG00000005649	POLR1E	99	44.601	Panthera_pardus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.601	ENSPTIG00000009774	POLR1E	99	44.601	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000002665	polr1e	99	43.810	ENSPTRG00000020944	POLR1E	99	45.113	Pan_troglodytes
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.048	ENSPANG00000025563	POLR1E	99	45.113	Papio_anubis
ENSMALG00000002665	polr1e	99	57.857	ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.857	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000002665	polr1e	97	43.032	ENSPSIG00000003274	POLR1E	95	43.521	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000002665	polr1e	94	66.080	ENSPMGG00000024169	polr1e	96	66.080	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	42.824	ENSPEMG00000019151	-	96	42.824	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000002665	polr1e	99	35.934	ENSPEMG00000022300	-	96	35.934	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000002665	polr1e	98	44.928	ENSPCIG00000014798	POLR1E	99	44.928	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	71.847	ENSPFOG00000019627	polr1e	99	71.847	Poecilia_formosa
ENSMALG00000002665	polr1e	99	76.202	ENSPLAG00000022679	polr1e	100	76.202	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000002665	polr1e	86	77.222	ENSPMEG00000022123	polr1e	93	77.222	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000002665	polr1e	99	74.760	ENSPREG00000009470	polr1e	100	74.760	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.286	ENSPPYG00000019061	POLR1E	99	44.286	Pongo_abelii
ENSMALG00000002665	polr1e	50	39.906	ENSPCAG00000004891	POLR1E	69	39.906	Procavia_capensis
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.893	ENSPCOG00000027448	POLR1E	99	44.893	Propithecus_coquereli
ENSMALG00000002665	polr1e	95	44.888	ENSPVAG00000007940	POLR1E	84	45.137	Pteropus_vampyrus
ENSMALG00000002665	polr1e	100	76.905	ENSPNYG00000001032	polr1e	100	76.905	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000002665	polr1e	99	56.250	ENSPNAG00000006987	polr1e	99	56.250	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000002665	polr1e	99	42.721	ENSRNOG00000012664	Polr1e	96	42.721	Rattus_norvegicus
ENSMALG00000002665	polr1e	94	44.975	ENSRBIG00000034214	POLR1E	99	45.812	Rhinopithecus_bieti
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.048	ENSRROG00000031986	POLR1E	99	45.113	Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000002665	polr1e	96	45.146	ENSSBOG00000021415	POLR1E	96	45.146	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000002665	polr1e	82	44.348	ENSSHAG00000016084	POLR1E	95	44.348	Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000002665	polr1e	99	59.286	ENSSFOG00015002293	polr1e	99	59.233	Scleropages_formosus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	78.998	ENSSMAG00000011672	polr1e	94	78.998	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000002665	polr1e	100	81.429	ENSSDUG00000022279	polr1e	100	81.429	Seriola_dumerili
ENSMALG00000002665	polr1e	100	80.476	ENSSLDG00000024918	polr1e	100	80.476	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000002665	polr1e	55	40.948	ENSSARG00000009810	-	58	40.948	Sorex_araneus
ENSMALG00000002665	polr1e	94	45.226	ENSSPUG00000009499	POLR1E	95	45.226	Sphenodon_punctatus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	81.010	ENSSPAG00000021240	polr1e	100	81.010	Stegastes_partitus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	43.705	ENSSSCG00000005347	POLR1E	99	43.705	Sus_scrofa
ENSMALG00000002665	polr1e	94	39.468	ENSTGUG00000007169	POLR1E	100	39.468	Taeniopygia_guttata
ENSMALG00000002665	polr1e	99	71.531	ENSTRUG00000020779	polr1e	99	71.531	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000002665	polr1e	99	74.279	ENSTNIG00000017812	polr1e	99	74.279	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000002665	polr1e	95	46.269	ENSTBEG00000013786	POLR1E	85	46.269	Tupaia_belangeri
ENSMALG00000002665	polr1e	94	45.000	ENSTTRG00000008294	POLR1E	84	45.000	Tursiops_truncatus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.893	ENSUAMG00000012474	POLR1E	100	47.283	Ursus_americanus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	44.893	ENSUMAG00000011496	POLR1E	99	44.893	Ursus_maritimus
ENSMALG00000002665	polr1e	86	40.822	ENSVPAG00000009048	POLR1E	84	40.822	Vicugna_pacos
ENSMALG00000002665	polr1e	99	43.468	ENSVVUG00000019954	POLR1E	99	43.468	Vulpes_vulpes
ENSMALG00000002665	polr1e	99	39.810	ENSXETG00000006533	polr1e	99	39.810	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000002665	polr1e	99	72.596	ENSXCOG00000013706	polr1e	100	72.596	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000002665	polr1e	99	77.163	ENSXMAG00000012484	polr1e	100	77.163	Xiphophorus_maculatus