EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000004279 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3891 bases
Position: chrKV884877.1:361125-365015
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000005985	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-30	1	5
ENSMALP00000005985	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-30	2	5
ENSMALP00000005985	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-30	3	5
ENSMALP00000005985	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-30	4	5
ENSMALP00000005985	zf-C2H2	PF00096.26	6.5e-30	5	5
ENSMALP00000005985	zf-met	PF12874.7	3.5e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000006117	-	792	-	ENSMALP00000005985	263 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSMALG00000004279's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMALG00000004279's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000004279	-	87	44.379	ENSMALG00000005562	-	63	44.379
ENSMALG00000004279	-	75	44.144	ENSMALG00000012129	-	75	42.604
ENSMALG00000004279	-	73	43.836	ENSMALG00000003294	-	100	42.328
ENSMALG00000004279	-	74	39.130	ENSMALG00000004265	-	84	39.130
ENSMALG00000004279	-	82	50.877	ENSMALG00000010959	-	95	42.574
ENSMALG00000004279	-	79	42.683	ENSMALG00000010700	-	95	42.683
ENSMALG00000004279	-	78	36.634	ENSMALG00000013656	scrt2	50	39.474
ENSMALG00000004279	-	85	47.778	ENSMALG00000000494	-	66	42.381
ENSMALG00000004279	-	87	42.347	ENSMALG00000011756	-	61	42.347
ENSMALG00000004279	-	73	44.974	ENSMALG00000001487	-	88	44.974
ENSMALG00000004279	-	84	33.951	ENSMALG00000019558	si:dkey-89b17.4	58	34.568
ENSMALG00000004279	-	76	41.711	ENSMALG00000012116	-	95	41.711
ENSMALG00000004279	-	75	32.624	ENSMALG00000013521	-	64	32.624
ENSMALG00000004279	-	73	44.667	ENSMALG00000014911	-	67	44.667
ENSMALG00000004279	-	78	44.974	ENSMALG00000007051	-	97	47.024
ENSMALG00000004279	-	72	41.799	ENSMALG00000018062	-	56	41.799
ENSMALG00000004279	-	76	45.783	ENSMALG00000008930	-	82	36.036
ENSMALG00000004279	-	76	40.000	ENSMALG00000012757	-	66	40.000
ENSMALG00000004279	-	81	38.843	ENSMALG00000014761	-	62	38.843
ENSMALG00000004279	-	81	44.503	ENSMALG00000012721	-	74	44.503
ENSMALG00000004279	-	88	51.852	ENSMALG00000011493	-	91	51.852
ENSMALG00000004279	-	78	45.802	ENSMALG00000019139	-	79	42.105
ENSMALG00000004279	-	74	45.882	ENSMALG00000011720	-	82	45.882
ENSMALG00000004279	-	81	33.708	ENSMALG00000004996	-	67	35.570
ENSMALG00000004279	-	83	42.069	ENSMALG00000022544	znf526	57	42.069
ENSMALG00000004279	-	86	37.037	ENSMALG00000008638	-	61	37.037
ENSMALG00000004279	-	85	42.328	ENSMALG00000008786	-	87	42.328
ENSMALG00000004279	-	80	39.524	ENSMALG00000011992	-	80	44.560
ENSMALG00000004279	-	80	45.455	ENSMALG00000005554	-	88	45.455
ENSMALG00000004279	-	80	45.946	ENSMALG00000005239	-	89	45.946
ENSMALG00000004279	-	74	39.241	ENSMALG00000010693	-	61	39.241
ENSMALG00000004279	-	71	35.135	ENSMALG00000001010	-	58	35.135
ENSMALG00000004279	-	74	44.578	ENSMALG00000008496	-	76	44.578
ENSMALG00000004279	-	75	40.000	ENSMALG00000013934	prdm5	75	40.000
ENSMALG00000004279	-	74	44.944	ENSMALG00000005203	-	94	44.944
ENSMALG00000004279	-	84	42.188	ENSMALG00000003975	-	92	44.697
ENSMALG00000004279	-	80	45.833	ENSMALG00000007812	-	92	45.550
ENSMALG00000004279	-	78	44.503	ENSMALG00000012008	-	82	44.503
ENSMALG00000004279	-	81	40.719	ENSMALG00000005901	znf319b	73	40.719
ENSMALG00000004279	-	76	47.788	ENSMALG00000013592	-	67	48.101
ENSMALG00000004279	-	78	36.905	ENSMALG00000012704	scrt1b	51	36.552
ENSMALG00000004279	-	72	45.205	ENSMALG00000002956	-	95	45.205
ENSMALG00000004279	-	78	39.130	ENSMALG00000021318	snai2	55	39.130
ENSMALG00000004279	-	91	42.945	ENSMALG00000015655	-	100	45.455
ENSMALG00000004279	-	73	46.073	ENSMALG00000006887	-	91	46.073
ENSMALG00000004279	-	88	36.364	ENSMALG00000011860	-	59	38.889
ENSMALG00000004279	-	72	47.239	ENSMALG00000004647	-	91	47.239
ENSMALG00000004279	-	81	42.932	ENSMALG00000004984	-	91	42.932
ENSMALG00000004279	-	77	47.273	ENSMALG00000021084	-	60	44.037
ENSMALG00000004279	-	85	40.517	ENSMALG00000012056	-	96	40.517
ENSMALG00000004279	-	80	43.023	ENSMALG00000010369	-	76	43.023
ENSMALG00000004279	-	83	32.524	ENSMALG00000002274	-	94	32.524
ENSMALG00000004279	-	78	42.328	ENSMALG00000012155	-	95	42.328
ENSMALG00000004279	-	80	40.476	ENSMALG00000006492	znf341	58	40.476
ENSMALG00000004279	-	79	45.238	ENSMALG00000004216	-	62	45.238
ENSMALG00000004279	-	84	46.429	ENSMALG00000004579	-	98	43.590
ENSMALG00000004279	-	72	37.719	ENSMALG00000012856	-	50	37.719
ENSMALG00000004279	-	80	41.818	ENSMALG00000003423	-	96	41.818
ENSMALG00000004279	-	73	36.269	ENSMALG00000006454	zbtb47b	86	38.095
ENSMALG00000004279	-	79	44.974	ENSMALG00000001085	-	91	44.974
ENSMALG00000004279	-	73	36.139	ENSMALG00000019991	-	95	36.139
ENSMALG00000004279	-	88	44.828	ENSMALG00000004034	gfi1b	63	44.828
ENSMALG00000004279	-	73	44.262	ENSMALG00000020889	-	97	40.517
ENSMALG00000004279	-	73	43.386	ENSMALG00000000252	-	84	43.386
ENSMALG00000004279	-	74	47.090	ENSMALG00000003906	-	85	47.090
ENSMALG00000004279	-	80	43.523	ENSMALG00000018074	-	59	43.523
ENSMALG00000004279	-	96	41.600	ENSMALG00000003588	znf236	55	41.600
ENSMALG00000004279	-	78	41.964	ENSMALG00000007403	-	80	41.964
ENSMALG00000004279	-	78	41.667	ENSMALG00000009834	-	73	40.678
ENSMALG00000004279	-	86	43.299	ENSMALG00000011969	-	76	43.299
ENSMALG00000004279	-	72	44.554	ENSMALG00000018277	-	95	44.554
ENSMALG00000004279	-	75	42.442	ENSMALG00000019842	ZNF319	94	42.442
ENSMALG00000004279	-	75	35.542	ENSMALG00000000710	-	51	31.959
ENSMALG00000004279	-	79	45.641	ENSMALG00000021985	-	77	46.114
ENSMALG00000004279	-	73	43.558	ENSMALG00000003448	-	96	43.558
ENSMALG00000004279	-	79	36.709	ENSMALG00000014847	-	54	36.709
ENSMALG00000004279	-	73	46.032	ENSMALG00000004413	-	93	46.032
ENSMALG00000004279	-	90	42.708	ENSMALG00000012043	-	96	44.974
ENSMALG00000004279	-	81	35.500	ENSMALG00000013321	-	68	35.500
ENSMALG00000004279	-	84	46.087	ENSMALG00000013323	-	82	47.458

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000004279	-	78	40.816	ENSAPOG00000019138	-	57	40.816	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000004279	-	84	40.141	ENSAPOG00000008319	-	65	40.141	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000004279	-	71	39.634	ENSACIG00000017892	-	75	39.634	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000004279	-	89	40.940	ENSACIG00000007464	-	64	40.940	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000004279	-	75	38.636	ENSACIG00000002944	-	89	39.416	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000004279	-	78	41.818	ENSAOCG00000016897	-	63	41.818	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000004279	-	75	38.889	ENSAOCG00000006744	-	71	38.889	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000004279	-	83	40.141	ENSAOCG00000015944	-	69	40.141	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000004279	-	77	40.141	ENSAOCG00000014769	-	71	40.141	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000004279	-	80	51.724	ENSAOCG00000001325	-	91	55.665	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000004279	-	73	41.818	ENSAPEG00000001556	-	63	41.818	Amphiprion_percula
ENSMALG00000004279	-	78	39.130	ENSAPEG00000010013	-	59	39.877	Amphiprion_percula
ENSMALG00000004279	-	90	69.863	ENSATEG00000018931	-	93	69.863	Anabas_testudineus
ENSMALG00000004279	-	65	40.800	ENSACLG00000011658	-	83	40.800	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000004279	-	91	30.634	ENSAMXG00000029518	-	73	30.634	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000004279	-	80	39.252	ENSCING00000002128	zf(c2h2)-35	63	39.252	Ciona_intestinalis
ENSMALG00000004279	-	75	54.348	ENSCSEG00000010453	-	54	54.348	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000004279	-	73	34.127	ENSCSEG00000010264	-	86	34.127	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000004279	-	72	50.909	ENSCSEG00000015593	-	75	50.909	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000004279	-	74	41.818	ENSCVAG00000015616	-	75	41.818	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000004279	-	83	51.316	ENSCVAG00000006653	-	64	51.316	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000004279	-	72	43.750	ENSCVAG00000012682	-	67	43.750	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000004279	-	72	41.463	ENSCVAG00000020141	-	59	41.463	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000004279	-	81	62.264	ENSCVAG00000003250	-	67	62.264	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000004279	-	75	42.754	ENSEBUG00000007931	-	61	42.754	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000004279	-	83	44.203	ENSELUG00000001909	-	88	36.242	Esox_lucius
ENSMALG00000004279	-	77	48.649	ENSELUG00000024007	-	66	48.649	Esox_lucius
ENSMALG00000004279	-	72	44.118	ENSGAFG00000001879	-	57	44.118	Gambusia_affinis
ENSMALG00000004279	-	80	65.455	ENSGAFG00000007528	-	55	65.455	Gambusia_affinis
ENSMALG00000004279	-	79	45.205	ENSGAFG00000008204	-	62	45.205	Gambusia_affinis
ENSMALG00000004279	-	81	39.877	ENSHBUG00000006656	-	59	39.877	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000004279	-	78	45.763	ENSHCOG00000013489	-	89	44.910	Hippocampus_comes
ENSMALG00000004279	-	63	48.148	ENSHCOG00000020670	-	72	48.148	Hippocampus_comes
ENSMALG00000004279	-	87	33.553	ENSHCOG00000008227	-	57	32.917	Hippocampus_comes
ENSMALG00000004279	-	77	48.876	ENSHCOG00000015497	-	74	48.876	Hippocampus_comes
ENSMALG00000004279	-	76	44.724	ENSHCOG00000008550	-	58	44.724	Hippocampus_comes
ENSMALG00000004279	-	76	44.724	ENSHCOG00000001873	-	58	44.724	Hippocampus_comes
ENSMALG00000004279	-	63	31.214	ENSIPUG00000024004	-	76	33.158	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000004279	-	88	38.393	ENSKMAG00000014184	-	60	38.983	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000004279	-	81	37.714	ENSKMAG00000007699	-	64	37.714	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000004279	-	77	46.316	ENSLBEG00000006161	-	82	46.316	Labrus_bergylta
ENSMALG00000004279	-	85	43.590	ENSLBEG00000007106	-	67	43.590	Labrus_bergylta
ENSMALG00000004279	-	70	43.258	ENSLBEG00000011210	-	53	43.258	Labrus_bergylta
ENSMALG00000004279	-	73	34.574	ENSLBEG00000017424	-	96	34.574	Labrus_bergylta
ENSMALG00000004279	-	88	57.083	ENSLBEG00000001132	-	81	57.083	Labrus_bergylta
ENSMALG00000004279	-	81	41.398	ENSLOCG00000004208	-	99	41.463	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000004279	-	88	73.023	ENSMAMG00000017939	-	95	73.023	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000004279	-	76	33.143	ENSMZEG00005013907	-	63	33.803	Maylandia_zebra
ENSMALG00000004279	-	74	50.980	ENSMMOG00000013330	-	65	50.980	Mola_mola
ENSMALG00000004279	-	93	40.845	ENSONIG00000007967	-	57	40.845	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000004279	-	73	42.593	ENSONIG00000005050	-	87	42.593	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000004279	-	90	38.095	ENSORLG00000002268	-	93	38.095	Oryzias_latipes
ENSMALG00000004279	-	76	48.571	ENSORLG00000021885	-	74	41.477	Oryzias_latipes
ENSMALG00000004279	-	66	41.667	ENSORLG00000028711	-	91	41.667	Oryzias_latipes
ENSMALG00000004279	-	87	39.037	ENSORLG00020018921	-	77	39.037	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000004279	-	77	43.119	ENSORLG00020019227	-	56	43.478	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000004279	-	76	43.478	ENSORLG00015018099	-	74	43.478	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000004279	-	87	43.925	ENSOMEG00000005578	-	75	43.925	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000004279	-	86	42.408	ENSPMGG00000009571	-	80	42.408	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000004279	-	75	41.975	ENSPMGG00000007051	-	60	33.511	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000004279	-	76	38.095	ENSPMGG00000019750	-	91	34.524	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000004279	-	82	37.021	ENSPMGG00000006928	-	57	37.021	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000004279	-	82	47.436	ENSPMGG00000002661	-	75	47.436	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000004279	-	75	45.299	ENSPMGG00000002659	-	87	45.299	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000004279	-	78	38.843	ENSPMGG00000002455	-	95	36.022	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000004279	-	73	33.333	ENSPMAG00000002022	-	100	33.333	Petromyzon_marinus
ENSMALG00000004279	-	72	36.634	ENSPMAG00000004189	-	95	37.799	Petromyzon_marinus
ENSMALG00000004279	-	73	43.564	ENSPMAG00000000839	-	94	43.564	Petromyzon_marinus
ENSMALG00000004279	-	84	67.692	ENSPFOG00000018860	-	99	67.692	Poecilia_formosa
ENSMALG00000004279	-	74	45.000	ENSPFOG00000009491	-	53	45.000	Poecilia_formosa
ENSMALG00000004279	-	88	41.379	ENSPLAG00000010067	-	71	41.379	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000004279	-	83	61.039	ENSPLAG00000008941	-	92	61.039	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000004279	-	89	54.268	ENSPLAG00000014832	-	91	46.320	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000004279	-	73	34.000	ENSPMEG00000002953	-	57	34.000	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000004279	-	89	54.268	ENSPMEG00000005210	-	91	46.320	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000004279	-	77	48.780	ENSPMEG00000024117	-	53	45.000	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000004279	-	84	41.071	ENSPREG00000009488	-	90	41.071	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000004279	-	77	41.905	ENSPREG00000002603	-	66	41.905	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000004279	-	79	40.157	ENSPNYG00000017888	-	64	40.157	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000004279	-	82	37.162	ENSPNAG00000005946	-	93	34.975	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000004279	-	73	42.991	ENSSFOG00015011531	-	88	38.710	Scleropages_formosus
ENSMALG00000004279	-	88	42.135	ENSSMAG00000013291	-	97	42.623	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000004279	-	84	40.141	ENSSMAG00000008308	-	59	40.141	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000004279	-	84	43.564	ENSSDUG00000020774	-	53	43.564	Seriola_dumerili
ENSMALG00000004279	-	76	40.141	ENSSLDG00000011849	-	53	40.141	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000004279	-	81	33.702	ENSSLDG00000014436	-	70	33.702	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000004279	-	76	40.141	ENSSPAG00000011533	-	79	40.141	Stegastes_partitus
ENSMALG00000004279	-	73	40.385	ENSSPAG00000011544	-	52	40.385	Stegastes_partitus
ENSMALG00000004279	-	86	44.231	ENSXETG00000012506	znf91	100	44.231	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000004279	-	78	39.583	ENSXCOG00000000254	-	88	39.583	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000004279	-	87	37.209	ENSXCOG00000003441	-	57	36.970	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000004279	-	79	61.333	ENSXCOG00000020768	-	71	61.333	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000004279	-	86	54.268	ENSXMAG00000012936	-	78	48.780	Xiphophorus_maculatus