EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000004349 (Gene tree)
Gene ID: 109952419
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: im:6912651
Full Name: uncharacterized LOC109952419
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7537 bases
Position: chrKV885147.1:9019-16555
Accession: 109952419
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000006095	Isy1	PF06246.12	8.4e-08	1	1
ENSMALP00000006075	Isy1	PF06246.12	1.4e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000006208	-	3687	XM_020587490	ENSMALP00000006075	340 (aa)	XP_020443146	UPI0009B35C23
ENSMALT00000006228	-	726	-	ENSMALP00000006095	241 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSMALG00000004349's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMALG00000004349's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	91	67.302	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	99	67.302	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	70.916	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	100	70.916	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	64.032	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	99	64.032	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	91	66.234	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	99	66.234	Amphiprion_percula
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	60.870	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	100	68.608	Anabas_testudineus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	96	60.432	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	100	63.548	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	53.612	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	99	53.612	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	52.265	ENSCSEG00000007482	-	99	53.355	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	54.754	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	99	57.994	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	56.202	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	99	56.202	Danio_rerio
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	50.676	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	99	52.244	Esox_lucius
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	52.787	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	99	59.609	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	83	58.824	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	80	62.705	Gambusia_affinis
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	96	60.432	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	63.548	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	53.282	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	99	53.282	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	54.934	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	99	62.102	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	96	54.887	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	98	55.147	Labrus_bergylta
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	98	40.780	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	99	40.780	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	49.071	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	99	49.071	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	91	66.456	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	66.456	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	96	60.432	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	100	63.548	Maylandia_zebra
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	68.379	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	100	68.379	Mola_mola
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	96	68.750	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	100	68.675	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	96	66.270	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	99	66.667	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	52.597	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	55.452	Oryzias_latipes
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	53.488	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	56.151	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	53.094	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	55.937	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	52.961	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	100	57.692	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	51.639	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	100	51.639	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	56.855	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	98	56.855	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	61.597	ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	61.597	Poecilia_formosa
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	53.289	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	58.387	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	53.947	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	58.065	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	64.898	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	100	64.898	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	96	60.072	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	63.226	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	56.061	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	99	56.061	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	47.143	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	100	47.143	Scleropages_formosus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	88	72.333	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	100	72.293	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	91	73.899	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	73.899	Seriola_dumerili
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	91	73.041	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	73.041	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	91	64.557	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	100	64.557	Stegastes_partitus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	60.507	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	100	60.507	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	64.463	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	100	64.463	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	100	52.961	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	100	57.413	Xiphophorus_maculatus