EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000006529 (Gene tree)
Gene ID: 109954499
Gene Symbol: urb2
Alias: fc13e02|si:dkey-162b3.2|wu:fc13e02
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18037 bases
Position: chrKV884698.1:460064-478100
Accession: 109954499
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000009164	Urb2	PF10441.9	1.1e-18	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000009355	-	5604	XM_020589856	ENSMALP00000009164	1672 (aa)	XP_020445512	UPI0009B31C4C

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.702	ENSG00000135763	URB2	99	61.628	Homo_sapiens
ENSMALG00000006529	urb2	91	70.637	ENSAPOG00000000608	urb2	100	70.637	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000006529	urb2	100	35.559	ENSAMEG00000009206	URB2	100	35.794	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000006529	urb2	100	72.765	ENSAOCG00000019961	urb2	100	72.765	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000006529	urb2	100	72.765	ENSAPEG00000005263	urb2	100	72.765	Amphiprion_percula
ENSMALG00000006529	urb2	100	76.596	ENSATEG00000020930	urb2	100	76.773	Anabas_testudineus
ENSMALG00000006529	urb2	97	36.369	ENSAPLG00000002998	URB2	99	36.271	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000006529	urb2	99	37.089	ENSACAG00000001285	URB2	99	37.089	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.869	ENSANAG00000033963	URB2	99	35.869	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000006529	urb2	91	67.636	ENSACLG00000009254	urb2	100	67.636	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000006529	urb2	99	41.839	ENSAMXG00000003474	urb2	99	41.839	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000006529	urb2	100	35.211	ENSBTAG00000010180	URB2	100	35.211	Bos_taurus
ENSMALG00000006529	urb2	95	60.839	ENSCJAG00000010968	URB2	99	60.839	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.149	ENSCAFG00000012118	URB2	99	35.501	Canis_familiaris
ENSMALG00000006529	urb2	93	33.836	ENSCAFG00020027217	URB2	98	34.212	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000006529	urb2	100	34.627	ENSCHIG00000014513	URB2	100	34.627	Capra_hircus
ENSMALG00000006529	urb2	100	35.431	ENSTSYG00000006924	URB2	100	35.422	Carlito_syrichta
ENSMALG00000006529	urb2	58	41.379	ENSCPOG00000020777	-	98	41.379	Cavia_porcellus
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.752	ENSCCAG00000023932	URB2	99	35.752	Cebus_capucinus
ENSMALG00000006529	urb2	99	36.126	ENSCATG00000043366	URB2	99	36.390	Cercocebus_atys
ENSMALG00000006529	urb2	99	36.412	ENSCLAG00000006268	URB2	99	36.240	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.893	ENSCSAG00000010599	URB2	99	36.158	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000006529	urb2	65	54.955	ENSCHOG00000010163	URB2	64	54.955	Choloepus_hoffmanni
ENSMALG00000006529	urb2	99	37.616	ENSCPBG00000006191	URB2	99	37.347	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.411	ENSCANG00000023711	URB2	99	35.476	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.322	ENSCGRG00001009591	Urb2	99	35.229	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.322	ENSCGRG00000011259	Urb2	99	35.229	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000006529	urb2	100	57.685	ENSCSEG00000000299	urb2	100	57.685	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000006529	urb2	100	61.639	ENSCVAG00000011011	urb2	100	61.758	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000006529	urb2	100	43.129	ENSDARG00000003217	urb2	98	70.213	Danio_rerio
ENSMALG00000006529	urb2	68	31.086	ENSDNOG00000043064	URB2	99	32.828	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000006529	urb2	99	34.550	ENSDORG00000014975	Urb2	99	34.647	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000006529	urb2	95	38.732	ENSETEG00000002869	URB2	95	38.732	Echinops_telfairi
ENSMALG00000006529	urb2	100	35.510	ENSEASG00005012060	URB2	100	35.518	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000006529	urb2	94	60.690	ENSECAG00000012338	URB2	100	60.690	Equus_caballus
ENSMALG00000006529	urb2	92	55.944	ENSEEUG00000002669	URB2	92	55.944	Erinaceus_europaeus
ENSMALG00000006529	urb2	100	48.768	ENSELUG00000014647	urb2	100	48.826	Esox_lucius
ENSMALG00000006529	urb2	99	34.874	ENSFCAG00000007662	URB2	99	35.191	Felis_catus
ENSMALG00000006529	urb2	99	36.772	ENSFALG00000003385	URB2	99	36.624	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.318	ENSFDAG00000021079	URB2	99	35.153	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000006529	urb2	100	61.698	ENSFHEG00000010357	urb2	100	61.995	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000006529	urb2	99	53.160	ENSGMOG00000012459	urb2	100	52.983	Gadus_morhua
ENSMALG00000006529	urb2	99	37.515	ENSGALG00000011101	URB2	99	37.711	Gallus_gallus
ENSMALG00000006529	urb2	100	66.627	ENSGACG00000016179	urb2	100	66.627	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000006529	urb2	99	37.565	ENSGAGG00000021879	URB2	99	37.355	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.531	ENSGGOG00000025643	URB2	99	35.480	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000006529	urb2	100	68.142	ENSHBUG00000018469	urb2	100	68.142	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000006529	urb2	97	34.270	ENSHGLG00000016561	URB2	99	34.354	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000006529	urb2	94	36.905	ENSHGLG00100001838	URB2	99	34.115	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000006529	urb2	100	42.031	ENSIPUG00000020315	urb2	100	42.031	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.229	ENSSTOG00000025323	URB2	99	35.467	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.480	ENSJJAG00000011998	Urb2	99	35.519	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000006529	urb2	100	66.094	ENSKMAG00000020129	urb2	100	66.153	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000006529	urb2	99	38.246	ENSLACG00000002038	URB2	99	38.104	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000006529	urb2	99	43.809	ENSLOCG00000015462	urb2	99	43.809	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.170	ENSLAFG00000012484	URB2	100	34.994	Loxodonta_africana
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.856	ENSMFAG00000039905	URB2	99	36.063	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.972	ENSMMUG00000009509	URB2	99	36.179	Macaca_mulatta
ENSMALG00000006529	urb2	99	36.009	ENSMNEG00000038762	URB2	98	40.580	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000006529	urb2	99	36.184	ENSMLEG00000043252	URB2	99	36.390	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000006529	urb2	100	74.466	ENSMAMG00000020365	urb2	100	74.466	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000006529	urb2	100	68.142	ENSMZEG00005011027	urb2	100	68.142	Maylandia_zebra
ENSMALG00000006529	urb2	95	35.254	ENSMGAG00000012073	URB2	98	35.696	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000006529	urb2	95	58.741	ENSMAUG00000017980	Urb2	99	58.741	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000006529	urb2	100	35.091	ENSMICG00000033302	URB2	100	35.176	Microcebus_murinus
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.588	ENSMOCG00000020369	Urb2	99	35.769	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.518	ENSMUSG00000031976	Urb2	99	35.622	Mus_musculus
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.673	ENSMPUG00000012438	URB2	99	35.927	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.287	ENSNGAG00000016524	Urb2	99	35.559	Nannospalax_galili
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.569	ENSNLEG00000014450	URB2	99	35.539	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000006529	urb2	88	45.581	ENSMEUG00000016434	URB2	93	45.581	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000006529	urb2	89	80.952	ENSOPRG00000009906	URB2	87	80.952	Ochotona_princeps
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.819	ENSODEG00000005593	URB2	99	35.706	Octodon_degus
ENSMALG00000006529	urb2	100	64.765	ENSONIG00000017078	urb2	100	65.122	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000006529	urb2	100	33.570	ENSOANG00000013732	URB2	100	33.746	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMALG00000006529	urb2	100	35.129	ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.197	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000006529	urb2	100	61.529	ENSORLG00000010915	urb2	100	61.589	Oryzias_latipes
ENSMALG00000006529	urb2	100	61.470	ENSORLG00020003361	urb2	100	61.529	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000006529	urb2	100	61.352	ENSORLG00015001534	urb2	100	61.352	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000006529	urb2	100	61.671	ENSOMEG00000010076	urb2	100	61.848	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000006529	urb2	100	34.732	ENSOGAG00000003021	URB2	100	34.732	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000006529	urb2	100	34.785	ENSOARG00000003102	URB2	100	34.762	Ovis_aries
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.648	ENSPPAG00000040629	URB2	99	35.597	Pan_paniscus
ENSMALG00000006529	urb2	99	34.941	ENSPPRG00000012767	URB2	99	35.259	Panthera_pardus
ENSMALG00000006529	urb2	97	56.923	ENSPTIG00000012577	URB2	99	72.727	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.706	ENSPTRG00000002092	URB2	99	35.656	Pan_troglodytes
ENSMALG00000006529	urb2	99	34.767	ENSPANG00000002245	URB2	98	40.870	Papio_anubis
ENSMALG00000006529	urb2	99	43.677	ENSPKIG00000005787	urb2	99	43.527	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000006529	urb2	99	37.558	ENSPSIG00000002690	URB2	99	37.544	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000006529	urb2	96	33.719	ENSPEMG00000019551	Urb2	100	33.903	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000006529	urb2	96	52.174	ENSPCIG00000030071	URB2	99	52.174	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000006529	urb2	100	61.131	ENSPFOG00000014330	urb2	100	61.190	Poecilia_formosa
ENSMALG00000006529	urb2	100	61.190	ENSPLAG00000014654	urb2	100	61.190	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000006529	urb2	100	61.667	ENSPMEG00000012356	urb2	100	61.726	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000006529	urb2	100	61.511	ENSPREG00000010268	urb2	100	61.570	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000006529	urb2	100	35.606	ENSPPYG00000000123	URB2	100	35.698	Pongo_abelii
ENSMALG00000006529	urb2	100	35.752	ENSPCOG00000023537	URB2	100	36.226	Propithecus_coquereli
ENSMALG00000006529	urb2	100	32.591	ENSPVAG00000002108	URB2	100	32.591	Pteropus_vampyrus
ENSMALG00000006529	urb2	91	67.571	ENSPNYG00000016840	urb2	100	67.571	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000006529	urb2	99	43.052	ENSPNAG00000013684	urb2	99	43.052	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.284	ENSRNOG00000026853	Urb2	97	35.660	Rattus_norvegicus
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.889	ENSRBIG00000037937	URB2	99	36.090	Rhinopithecus_bieti
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.830	ENSRROG00000039854	URB2	99	35.760	Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000006529	urb2	99	35.522	ENSSBOG00000023055	URB2	99	35.522	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000006529	urb2	96	52.795	ENSSHAG00000014735	URB2	99	52.795	Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000006529	urb2	98	42.391	ENSSFOG00015015432	urb2	98	42.495	Scleropages_formosus
ENSMALG00000006529	urb2	91	74.354	ENSSMAG00000004984	urb2	100	74.354	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000006529	urb2	100	77.850	ENSSDUG00000000902	urb2	100	78.085	Seriola_dumerili
ENSMALG00000006529	urb2	99	37.897	ENSSPUG00000018549	URB2	99	37.941	Sphenodon_punctatus
ENSMALG00000006529	urb2	100	72.588	ENSSPAG00000013632	urb2	100	72.588	Stegastes_partitus
ENSMALG00000006529	urb2	100	35.044	ENSSSCG00000010186	URB2	100	34.977	Sus_scrofa
ENSMALG00000006529	urb2	99	36.827	ENSTGUG00000009990	URB2	99	36.731	Taeniopygia_guttata
ENSMALG00000006529	urb2	100	60.836	ENSTRUG00000008173	urb2	100	60.836	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000006529	urb2	93	62.693	ENSTNIG00000017689	urb2	100	56.999	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000006529	urb2	95	76.190	ENSTTRG00000014864	URB2	95	76.190	Tursiops_truncatus
ENSMALG00000006529	urb2	100	35.170	ENSUAMG00000015022	URB2	100	35.404	Ursus_americanus
ENSMALG00000006529	urb2	96	51.553	ENSUMAG00000004728	URB2	99	51.553	Ursus_maritimus
ENSMALG00000006529	urb2	54	60.140	ENSVPAG00000001750	-	52	60.140	Vicugna_pacos
ENSMALG00000006529	urb2	99	34.859	ENSVVUG00000006747	URB2	99	35.387	Vulpes_vulpes
ENSMALG00000006529	urb2	99	33.547	ENSXETG00000023331	urb2	99	33.547	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000006529	urb2	100	61.392	ENSXMAG00000015059	urb2	100	61.452	Xiphophorus_maculatus