EuRBPDB

  • Home
  • Cancer
  • Family
  • Species
  • RBPredictor
  • Search
  • Download
  • Submit
  • Help
  • Contact

  • Description
  • RBDs
  • Transcripts
  • Gene Model
  • Pathways
  • PPI
  • Orthologs
Description
Ensembl ID
ENSMALG00000007257 (Gene tree)
Gene ID
109970179
Gene Symbol
prpf3
Alias
HPRP3|wu:fa11f05
Full Name
pre-mRNA processing factor 3
Gene Type
protein_coding
Species
Monopterus_albus
Status
putative
Strand
Plus strand
Length
6212 bases
Position
chrKV884880.1:31669-37880
Accession
109970179
RBP type
canonical RBP
Summary
-
RNA binding domains(RBDs)
Protein IDDomain Pfam IDE-value Domain number Total number
ENSMALP00000010211PRP3PF08572.101.2e-7511
ENSMALP00000010211PWIPF01480.171.5e-1111
Transcripts
Transcript IDNameLengthRefSeq ID Protein IDLengthRefSeq IDUniportKB ID
ENSMALT00000010432-2070XM_020617574ENSMALP00000010211689 (aa)XP_020473230-
Gene Model
Click here to download ENSMALG00000007257's gene model file
Pathways
Pathway IDPathway NameSource
malb03040SpliceosomeKEGG
Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMALG00000007257's network
Orthologs
Ensembl IDGene SymbolCoverageIdentiy OrthologGene SymbolCoverageIdentiy Species
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSG00000117360PRPF310070.429Homo_sapiens
ENSMALG00000007257prpf310085.552ENSAPOG00000015584prpf310086.305Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSAMEG00000001630PRPF310070.429Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000007257prpf310086.060ENSACIG00000007876prpf310085.917Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000007257prpf310085.007ENSAOCG00000011449prpf310086.143Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000007257prpf310088.143ENSATEG00000023583prpf310087.714Anabas_testudineus
ENSMALG00000007257prpf39972.286ENSAPLG00000002440PRPF310071.429Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000007257prpf39970.839ENSACAG00000003176PRPF310070.839Anolis_carolinensis
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSANAG00000026138PRPF310070.429Aotus_nancymaae
ENSMALG00000007257prpf310086.957ENSACLG00000020127prpf310086.127Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000007257prpf310078.442ENSAMXG00000007306prpf310078.442Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSBTAG00000013946PRPF310070.429Bos_taurus
ENSMALG00000007257prpf38138.664WBGene00010844prp-39635.303Caenorhabditis_elegans
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSCJAG00000009926PRPF310070.429Callithrix_jacchus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSCAFG00000011820PRPF310070.429Canis_familiaris
ENSMALG00000007257prpf38170.567ENSCAFG00020019653PRPF310070.390Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSCHIG00000015434PRPF310070.429Capra_hircus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSTSYG00000001383PRPF310070.429Carlito_syrichta
ENSMALG00000007257prpf39361.240ENSCAPG00000017812PRPF38573.061Cavia_aperea
ENSMALG00000007257prpf39970.286ENSCPOG00000008068PRPF310070.286Cavia_porcellus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSCCAG00000026380PRPF310070.429Cebus_capucinus
ENSMALG00000007257prpf39957.730ENSCATG00000041778PRPF310057.730Cercocebus_atys
ENSMALG00000007257prpf39970.571ENSCLAG00000015009PRPF310070.571Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000007257prpf37679.562ENSCHOG00000011645PRPF37680.292Choloepus_hoffmanni
ENSMALG00000007257prpf39971.041ENSCPBG00000008216PRPF310071.184Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000007257prpf35961.017ENSCING00000003312-9961.017Ciona_intestinalis
ENSMALG00000007257prpf37954.480ENSCSAVG00000008720-9454.122Ciona_savignyi
ENSMALG00000007257prpf39969.857ENSCANG00000036769PRPF310069.857Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSCGRG00001019100Prpf310070.429Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSCGRG00000007322Prpf310070.429Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000007257prpf310083.994ENSCSEG00000002532prpf310083.711Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000007257prpf310083.761ENSCVAG00000009318prpf310083.665Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000007257prpf310077.669ENSDARG00000086425prpf310078.472Danio_rerio
ENSMALG00000007257prpf39965.616ENSDNOG00000005904PRPF310065.186Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000007257prpf39370.570ENSDORG00000008664Prpf39970.262Dipodomys_ordii
ENSMALG00000007257prpf38051.408FBgn0036915Prp39951.167Drosophila_melanogaster
ENSMALG00000007257prpf39970.286ENSETEG00000019124PRPF310070.429Echinops_telfairi
ENSMALG00000007257prpf310060.481ENSEBUG00000011680prpf310059.893Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000007257prpf39970.286ENSEASG00005001566PRPF310070.286Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSECAG00000019840PRPF310070.429Equus_caballus
ENSMALG00000007257prpf38471.136ENSEEUG00000007338PRPF38571.591Erinaceus_europaeus
ENSMALG00000007257prpf310073.542ENSELUG00000013624prpf310073.267Esox_lucius
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSFCAG00000013940PRPF310070.429Felis_catus
ENSMALG00000007257prpf39970.857ENSFDAG00000010365PRPF310070.857Fukomys_damarensis
ENSMALG00000007257prpf310082.739ENSFHEG00000021746prpf310082.646Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000007257prpf310080.851ENSGMOG00000008535prpf310080.426Gadus_morhua
ENSMALG00000007257prpf39972.429ENSGALG00000028205PRPF310071.571Gallus_gallus
ENSMALG00000007257prpf310082.235ENSGAFG00000012671prpf310082.092Gambusia_affinis
ENSMALG00000007257prpf310083.498ENSGACG00000011792prpf310083.498Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000007257prpf39971.041ENSGAGG00000013765PRPF310074.194Gopherus_agassizii
ENSMALG00000007257prpf38575.148ENSGGOG00000013174PRPF310075.740Gorilla_gorilla
ENSMALG00000007257prpf310086.351ENSHBUG00000003493prpf310085.530Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000007257prpf39970.571ENSHGLG00000016569PRPF310070.571Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000007257prpf39953.602ENSHGLG00000016033-10053.026Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000007257prpf39970.571ENSHGLG00100007590PRPF310070.571Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000007257prpf39953.525ENSHGLG00100008951-10052.594Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000007257prpf310077.857ENSHCOG00000014058prpf310078.205Hippocampus_comes
ENSMALG00000007257prpf310079.603ENSIPUG00000000902PRPF310079.603Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSSTOG00000001889PRPF310070.429Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000007257prpf310084.241ENSKMAG00000001390prpf310084.143Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000007257prpf310085.755ENSLBEG00000026310prpf310085.795Labrus_bergylta
ENSMALG00000007257prpf39069.010ENSLACG00000010541PRPF310067.178Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSLAFG00000004713PRPF310070.429Loxodonta_africana
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSMFAG00000039791PRPF310070.429Macaca_fascicularis
ENSMALG00000007257prpf39171.181ENSMMUG00000016301PRPF39970.866Macaca_mulatta
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSMNEG00000038161PRPF310070.429Macaca_nemestrina
ENSMALG00000007257prpf39848.911ENSMLEG00000041065-9748.476Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000007257prpf38575.148ENSMLEG00000040609PRPF310075.740Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000007257prpf310088.068ENSMAMG00000014968prpf310088.068Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000007257prpf39296.739ENSMZEG00005015970prpf310096.739Maylandia_zebra
ENSMALG00000007257prpf39972.429ENSMGAG00000000707PRPF310071.571Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSMAUG00000017112Prpf310070.429Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000007257prpf39970.143ENSMICG00000015386PRPF310073.968Microcebus_murinus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSMOCG00000000242Prpf310070.429Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000007257prpf310080.650ENSMMOG00000016131prpf310080.000Mola_mola
ENSMALG00000007257prpf39970.513ENSMODG00000018774PRPF310070.513Monodelphis_domestica
ENSMALG00000007257prpf39970.286MGP_CAROLIEiJ_G0025354Prpf310070.286Mus_caroli
ENSMALG00000007257prpf39970.286ENSMUSG00000015748Prpf310070.286Mus_musculus
ENSMALG00000007257prpf39970.286MGP_PahariEiJ_G0026798Prpf310070.286Mus_pahari
ENSMALG00000007257prpf39970.286MGP_SPRETEiJ_G0026298Prpf310070.286Mus_spretus
ENSMALG00000007257prpf39969.000ENSMPUG00000005080PRPF310068.902Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000007257prpf39970.756ENSMLUG00000004646-10070.756Myotis_lucifugus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSNGAG00000000910Prpf310070.429Nannospalax_galili
ENSMALG00000007257prpf310085.091ENSNBRG00000003462prpf310084.993Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000007257prpf39071.270ENSNLEG00000009841PRPF39970.952Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000007257prpf38361.728ENSMEUG00000008733PRPF38961.765Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000007257prpf39970.672ENSOPRG00000010139PRPF310070.672Ochotona_princeps
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSODEG00000011363-10070.429Octodon_degus
ENSMALG00000007257prpf39952.975ENSODEG00000014412-10051.532Octodon_degus
ENSMALG00000007257prpf310084.789ENSONIG00000006394prpf310084.551Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000007257prpf39955.050ENSOANG00000015441PRPF310054.379Ornithorhynchus_anatinus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSOCUG00000011760PRPF310070.429Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000007257prpf310083.571ENSORLG00000010330prpf310083.571Oryzias_latipes
ENSMALG00000007257prpf310083.714ENSORLG00020009054prpf310083.714Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000007257prpf310083.571ENSORLG00015015016prpf310083.571Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000007257prpf310084.165ENSOMEG00000000940prpf310084.165Oryzias_melastigma
ENSMALG00000007257prpf39967.094ENSOGAG00000005352PRPF310067.094Otolemur_garnettii
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSOARG00000020798PRPF310070.429Ovis_aries
ENSMALG00000007257prpf39970.286ENSPPAG00000030983PRPF310070.286Pan_paniscus
ENSMALG00000007257prpf39854.215ENSPPAG00000043769-9954.070Pan_paniscus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSPPRG00000000731PRPF310070.429Panthera_pardus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSPTIG00000005516PRPF310070.429Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000007257prpf39853.343ENSPTRG00000047819-9953.198Pan_troglodytes
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSPTRG00000001254PRPF310070.429Pan_troglodytes
ENSMALG00000007257prpf39970.286ENSPANG00000000499PRPF310070.286Papio_anubis
ENSMALG00000007257prpf310080.198ENSPKIG00000010501prpf310080.198Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000007257prpf39971.571ENSPSIG00000014877PRPF310071.286Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000007257prpf310073.768ENSPMGG00000007776prpf310072.754Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSPEMG00000011672Prpf310070.429Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000007257prpf36171.461ENSPMAG00000005588prpf39970.199Petromyzon_marinus
ENSMALG00000007257prpf39970.513ENSPCIG00000008795PRPF310070.513Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000007257prpf310082.955ENSPFOG00000013638prpf310083.003Poecilia_formosa
ENSMALG00000007257prpf310083.095ENSPLAG00000018103prpf310083.000Poecilia_latipinna
ENSMALG00000007257prpf310083.190ENSPMEG00000023546prpf310083.095Poecilia_mexicana
ENSMALG00000007257prpf310082.951ENSPREG00000017216prpf310082.857Poecilia_reticulata
ENSMALG00000007257prpf39071.270ENSPPYG00000000900PRPF39670.952Pongo_abelii
ENSMALG00000007257prpf37662.382ENSPPYG00000018646-9962.193Pongo_abelii
ENSMALG00000007257prpf38771.546ENSPCAG00000014908PRPF38771.546Procavia_capensis
ENSMALG00000007257prpf39970.286ENSPCOG00000013828PRPF310070.286Propithecus_coquereli
ENSMALG00000007257prpf39970.529ENSPVAG00000013472PRPF310070.529Pteropus_vampyrus
ENSMALG00000007257prpf310086.207ENSPNYG00000004279prpf310085.387Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000007257prpf310079.972ENSPNAG00000001799prpf310079.775Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSRNOG00000025629Prpf310070.429Rattus_norvegicus
ENSMALG00000007257prpf38367.376ENSRBIG00000028854PRPF39868.794Rhinopithecus_bieti
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSRROG00000027464PRPF310070.429Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000007257prpf39964.143ENSSBOG00000033104PRPF310064.143Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000007257prpf39970.128ENSSHAG00000009548PRPF310070.128Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000007257prpf310080.532ENSSFOG00015022014prpf310079.916Scleropages_formosus
ENSMALG00000007257prpf310085.211ENSSMAG00000015739prpf310084.972Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000007257prpf310084.615ENSSDUG00000006840prpf310084.058Seriola_dumerili
ENSMALG00000007257prpf310087.482ENSSLDG00000015423prpf310087.377Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000007257prpf39970.571ENSSARG00000011064PRPF310070.571Sorex_araneus
ENSMALG00000007257prpf39970.563ENSSPUG00000000809PRPF310070.704Sphenodon_punctatus
ENSMALG00000007257prpf310085.734ENSSPAG00000018721prpf310085.915Stegastes_partitus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSSSCG00000030119PRPF310074.327Sus_scrofa
ENSMALG00000007257prpf39962.375ENSTGUG00000004552PRPF310062.040Taeniopygia_guttata
ENSMALG00000007257prpf310080.725ENSTRUG00000014923prpf310080.580Takifugu_rubripes
ENSMALG00000007257prpf39981.702ENSTNIG00000008058prpf310081.702Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000007257prpf38070.227ENSTBEG00000014072PRPF38872.045Tupaia_belangeri
ENSMALG00000007257prpf39965.429ENSTTRG00000010616PRPF310065.429Tursiops_truncatus
ENSMALG00000007257prpf37973.968ENSUAMG00000009345PRPF310074.327Ursus_americanus
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSUMAG00000003720PRPF310070.429Ursus_maritimus
ENSMALG00000007257prpf38875.455ENSVPAG00000005425PRPF38975.909Vicugna_pacos
ENSMALG00000007257prpf39970.429ENSVVUG00000007933PRPF310070.429Vulpes_vulpes
ENSMALG00000007257prpf39969.658ENSXETG00000018654prpf310069.658Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000007257prpf310083.381ENSXMAG00000016347prpf310083.286Xiphophorus_maculatus

Copyright © , Bioinformatics Center, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen University, China. All Rights Reserved.

Any comment and suggestion, please contact us