EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000009611 (Gene tree)
Gene ID: 109951417
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: wu:fa56c07|wu:fi27f11|zgc:66238
Full Name: probable global transcription activator SNF2L2
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 44937 bases
Position: chrKV885073.1:237783-282719
Accession: 109951417
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000013629	BRK	PF07533.16	9.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000013941	SMARCA2-202	699	-	ENSMALP00000013648	232 (aa)	-	-
ENSMALT00000013922	SMARCA2-201	4602	XM_020585915	ENSMALP00000013629	1533 (aa)	XP_020441571	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000009611	SMARCA2	85	72.152	ENSMALG00000021534	-	99	71.238
ENSMALG00000009611	SMARCA2	93	71.598	ENSMALG00000003388	smarca4a	99	69.736

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.772	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	90.874	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	92.998	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	88	76.602	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	98	84.861	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	91.597	ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	91.597	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	91.321	ENSAOCG00000009647	-	99	91.478	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	91.002	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	99	92.241	Amphiprion_percula
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	92.492	ENSATEG00000006916	SMARCA2	99	92.366	Anabas_testudineus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	86	78.020	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.919	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	80.517	ENSACAG00000002423	SMARCA2	99	80.116	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.865	ENSANAG00000026498	SMARCA2	99	81.158	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	92.303	ENSACLG00000004248	SMARCA2	99	92.433	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	85.658	ENSAMXG00000012404	smarca2	98	84.990	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	81.362	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	99	81.647	Bos_taurus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.744	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	81.135	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	81.374	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	99	81.647	Canis_familiaris
ENSMALG00000009611	SMARCA2	74	87.784	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	87.696	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	81.362	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	99	81.647	Capra_hircus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.013	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.534	Carlito_syrichta
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.034	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	79.221	Cavia_aperea
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.366	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	99	80.784	Cavia_porcellus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	81.009	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	99	81.298	Cebus_capucinus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.610	ENSCATG00000031470	SMARCA2	99	81.017	Cercocebus_atys
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.974	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	99	80.653	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000009611	SMARCA2	91	82.148	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	81.818	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	84	81.946	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	81.946	Choloepus_hoffmanni
ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	80.369	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	99	79.974	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	81.168	ENSCANG00000039597	SMARCA2	99	81.520	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	75.393	ENSCGRG00001002323	Smarca2	99	74.130	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	88.975	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	99	88.509	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000009611	SMARCA2	84	90.731	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	90.813	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	83.164	ENSDARG00000008904	smarca2	99	82.697	Danio_rerio
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.739	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	99	80.371	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.641	ENSDORG00000014832	Smarca2	99	81.053	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000009611	SMARCA2	78	62.838	FBgn0000212	brm	72	62.321	Drosophila_melanogaster
ENSMALG00000009611	SMARCA2	89	58.922	ENSEBUG00000002449	-	95	61.898	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000009611	SMARCA2	94	69.966	ENSEBUG00000011442	-	97	68.675	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	81.308	ENSEASG00005010312	SMARCA2	99	81.594	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	61	91.176	ENSEEUG00000015540	-	68	79.452	Erinaceus_europaeus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	95	83.299	ENSELUG00000010318	smarca2	96	83.662	Esox_lucius
ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	81.250	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	99	81.453	Felis_catus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	80.040	ENSFALG00000010416	SMARCA2	98	81.774	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.248	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	99	79.570	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	92.308	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	98	92.631	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	82.676	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	82.224	Gadus_morhua
ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	78.385	ENSGALG00000010164	SMARCA2	99	80.295	Gallus_gallus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	95	85.493	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	95	85.695	Gambusia_affinis
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	87.683	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	87.238	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	78.985	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	99	80.039	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000009611	SMARCA2	77	85.408	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	83	84.380	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	91.871	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	98	92.000	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.689	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	99	79.823	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	81.217	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	99	81.429	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000009611	SMARCA2	89	83.163	ENSHCOG00000015348	-	95	88.297	Hippocampus_comes
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	83.099	ENSIPUG00000011060	smarca2	97	85.745	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.679	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	99	80.974	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.576	ENSJJAG00000010867	Smarca2	99	80.796	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	90.310	ENSKMAG00000015844	-	99	90.310	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	81.166	ENSLOCG00000011499	smarca2	99	81.137	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	78.359	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	79.414	Loxodonta_africana
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.494	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	99	80.670	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	81.180	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	99	81.467	Macaca_mulatta
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.381	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	99	81.017	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.763	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	99	80.673	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	92.947	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	96.235	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	92.437	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	98	92.566	Maylandia_zebra
ENSMALG00000009611	SMARCA2	73	65.654	ENSMGAG00000005160	-	100	65.786	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	81.250	ENSMICG00000005162	SMARCA2	99	81.589	Microcebus_murinus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	81.164	ENSMOCG00000001611	Smarca2	99	81.053	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	88.551	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	99	88.551	Mola_mola
ENSMALG00000009611	SMARCA2	95	78.693	ENSMODG00000003578	SMARCA2	99	79.974	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	80.418	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	99	80.140	Mus_caroli
ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	80.470	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	80.878	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	99	80.587	Mus_pahari
ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	80.418	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	90.909	Mus_spretus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	80	84.173	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	93	84.579	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	75.048	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	75.265	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.740	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	79.937	Nannospalax_galili
ENSMALG00000009611	SMARCA2	91	78.231	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.582	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.421	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	99	79.082	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000009611	SMARCA2	91	75.505	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	99	73.282	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000009611	SMARCA2	80	80.366	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	99	76.583	Ochotona_princeps
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.585	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	79.722	Octodon_degus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	90.038	ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	90.226	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.261	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	99	80.294	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	89.352	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	90.044	Oryzias_latipes
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	89.345	ENSORLG00015006289	SMARCA2	99	90.044	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	90.784	ENSOMEG00000009736	-	99	90.784	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000009611	SMARCA2	80	85.056	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.241	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.281	ENSOARG00000013265	SMARCA2	99	80.712	Ovis_aries
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	78.780	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	99	79.207	Pan_paniscus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	96	81.316	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	99	81.518	Panthera_pardus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.092	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	99	80.513	Pan_troglodytes
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	76.212	ENSPANG00000025121	SMARCA2	99	76.553	Papio_anubis
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	84.391	ENSPKIG00000018469	-	98	84.204	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000009611	SMARCA2	95	78.906	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	99	79.500	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	83.761	ENSPMGG00000013696	-	99	83.825	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.222	ENSPEMG00000019821	Smarca2	99	80.064	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000009611	SMARCA2	94	69.236	ENSPMAG00000005337	-	78	74.021	Petromyzon_marinus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.477	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	99	80.897	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	89.206	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	99	89.143	Poecilia_formosa
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	88.771	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	98	88.759	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	89.230	ENSPMEG00000001815	-	99	88.987	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	89.653	ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	89.781	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	80.774	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	99	81.133	Pongo_abelii
ENSMALG00000009611	SMARCA2	75	74.648	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	76	74.648	Procavia_capensis
ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	79.276	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	99	79.471	Propithecus_coquereli
ENSMALG00000009611	SMARCA2	90	83.065	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	93	82.581	Pteropus_vampyrus
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	86.869	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	99	86.815	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	84.260	ENSPNAG00000014635	smarca2	98	84.684	Pygocentrus_nattereri
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