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Description

Ensembl ID: ENSMALG00000009782 (Gene tree)
Gene ID: 109967779
Gene Symbol: tnpo1
Alias: Kapbeta2|karyopherin beta 2
Full Name: transportin-1
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 16228 bases
Position: chrKV884823.1:392860-409087
Accession: 109967779
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000013909	IBN_N	PF03810.19	1.6e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000014209	-	2670	XM_020613596	ENSMALP00000013909	889 (aa)	XP_020469252	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000009782	tnpo1	99	85.698	ENSMALG00000006232	TNPO2	99	85.698
ENSMALG00000009782	tnpo1	99	84.572	ENSMALG00000004721	tnpo2	99	84.910

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSG00000083312	TNPO1	100	93.782	Homo_sapiens
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	98.090	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	98.090	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.425	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	91.537	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000009782	tnpo1	87	97.028	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	97.028	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	97.978	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	97.978	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	97.978	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	97.978	Amphiprion_percula
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	97.865	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	97.865	Anabas_testudineus
ENSMALG00000009782	tnpo1	99	88.162	ENSAPLG00000009619	-	97	89.106	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.584	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	92.584	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	59.645	ENSANAG00000027118	-	99	59.978	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	82.472	ENSANAG00000025351	-	99	82.472	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.022	ENSANAG00000022453	-	99	92.022	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	95.506	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	95.506	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	93.946	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	93.498	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.472	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	92.472	Bos_taurus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.135	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	92.135	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000009782	tnpo1	96	92.415	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	92.415	Canis_familiaris
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	90.000	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	90.000	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	92.360	Capra_hircus
ENSMALG00000009782	tnpo1	99	88.801	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.101	Carlito_syrichta
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.022	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	92.022	Cebus_capucinus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	92.360	Cercocebus_atys
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.910	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	91.910	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	92.360	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000009782	tnpo1	94	80.691	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	80.810	Choloepus_hoffmanni
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.809	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	92.809	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000009782	tnpo1	99	75.645	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.084	Ciona_savignyi
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	92.360	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.247	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	92.247	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000009782	tnpo1	96	92.515	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	92.515	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	95.506	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	95.506	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.404	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	96.404	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	94.164	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	93.715	Danio_rerio
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	86.674	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	86.674	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000009782	tnpo1	93	92.651	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	92.642	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000009782	tnpo1	99	58.061	FBgn0035693	CG8219	99	57.497	Drosophila_melanogaster
ENSMALG00000009782	tnpo1	86	95.506	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.506	Echinops_telfairi
ENSMALG00000009782	tnpo1	94	84.405	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	84.405	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	92.360	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	92.360	Equus_caballus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	87.146	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.768	Esox_lucius
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	92.360	Felis_catus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.697	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	92.697	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.022	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	92.022	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.296	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	96.296	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.825	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	91.825	Gadus_morhua
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.910	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	91.910	Gallus_gallus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	95.852	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	95.852	Gambusia_affinis
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	95.393	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	95.393	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.697	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	92.697	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	92.360	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	77.578	ENSGGOG00000022535	-	98	77.578	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	97.303	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	97.303	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.910	ENSHGLG00000000970	-	99	91.910	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000009782	tnpo1	97	71.944	ENSHGLG00100000963	-	99	71.279	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000009782	tnpo1	96	92.056	ENSHGLG00100017090	-	99	92.056	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.472	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	92.472	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.180	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	96.180	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000009782	tnpo1	91	93.095	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	93.095	Labrus_bergylta
ENSMALG00000009782	tnpo1	96	85.930	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	85.930	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	93.708	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	93.708	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000009782	tnpo1	97	91.801	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	91.801	Loxodonta_africana
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	92.360	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.247	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	92.438	Macaca_mulatta
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	92.360	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	92.360	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	97.753	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	97.753	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.854	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	96.854	Maylandia_zebra
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.247	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	92.247	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	88.652	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.652	Microcebus_murinus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.247	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	92.247	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000009782	tnpo1	87	95.876	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	95.876	Mola_mola
ENSMALG00000009782	tnpo1	99	94.043	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	94.043	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.247	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	92.441	Mus_caroli
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.247	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	92.441	Mus_musculus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	92.565	Mus_pahari
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.022	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	92.193	Mus_spretus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	92.360	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000009782	tnpo1	96	92.084	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	92.084	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	92.360	Nannospalax_galili
ENSMALG00000009782	tnpo1	87	96.770	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	96.770	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	92.360	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000009782	tnpo1	90	88.139	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.115	Ochotona_princeps
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.685	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	91.685	Octodon_degus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.540	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	96.540	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000009782	tnpo1	92	93.293	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	93.293	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMALG00000009782	tnpo1	96	86.332	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	86.332	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000009782	tnpo1	87	95.720	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	95.720	Oryzias_latipes
ENSMALG00000009782	tnpo1	99	95.829	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	95.829	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000009782	tnpo1	99	96.167	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	96.167	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000009782	tnpo1	99	95.941	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	95.941	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	92.360	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.472	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	92.472	Ovis_aries
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	92.360	Pan_paniscus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	92.360	Panthera_pardus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	92.360	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	92.360	Pan_troglodytes
ENSMALG00000009782	tnpo1	94	81.215	ENSPTRG00000047731	-	100	81.215	Pan_troglodytes
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	92.360	Papio_anubis
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.001	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.001	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.697	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	92.697	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	93.490	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	93.490	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000009782	tnpo1	96	92.515	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	92.515	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	93.371	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	93.371	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.305	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	96.305	Poecilia_formosa
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.305	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	96.305	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.742	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	96.742	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.300	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	96.300	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.247	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	92.247	Pongo_abelii
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	ENSPCOG00000004254	TNPO1	99	92.360	Propithecus_coquereli
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.247	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	92.247	Pteropus_vampyrus
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ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.011	ENSXETG00000016812	tnpo1	99	91.011	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000009782	tnpo1	100	96.184	ENSXMAG00000005440	tnpo1	100	96.184	Xiphophorus_maculatus