EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000010238 (Gene tree)
Gene ID: 109963274
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 49869 bases
Position: chrKV884759.1:289409-339277
Accession: 109963274
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000014577	Wyosine_form	PF08608.12	1.1e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000014884	-	5865	XM_020605643	ENSMALP00000014577	750 (aa)	XP_020461299	UPI0009B4D8DE

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000010238	tyw1	96	59.366	ENSG00000277149	TYW1B	98	59.780	Homo_sapiens
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.764	ENSG00000198874	TYW1	98	67.490	Homo_sapiens
ENSMALG00000010238	tyw1	100	84.820	ENSAPOG00000014391	tyw1	100	84.820	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	82.158	ENSACIG00000007325	tyw1	100	81.981	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000010238	tyw1	100	85.486	ENSAOCG00000016792	tyw1	100	85.486	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000010238	tyw1	100	85.486	ENSAPEG00000015939	tyw1	100	85.486	Amphiprion_percula
ENSMALG00000010238	tyw1	91	85.169	ENSATEG00000006856	tyw1	94	84.875	Anabas_testudineus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	66.758	ENSANAG00000037051	-	98	66.484	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000010238	tyw1	100	84.000	ENSACLG00000018688	tyw1	100	84.000	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000010238	tyw1	96	74.931	ENSAMXG00000004157	tyw1	99	76.657	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.769	ENSBTAG00000008446	TYW1	98	67.493	Bos_taurus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.078	ENSCJAG00000004295	-	98	66.804	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	66.713	ENSCAFG00000010867	-	98	67.813	Canis_familiaris
ENSMALG00000010238	tyw1	93	62.089	ENSCAFG00020005367	-	94	65.809	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.995	ENSCHIG00000019510	-	98	67.631	Capra_hircus
ENSMALG00000010238	tyw1	86	66.921	ENSTSYG00000008236	-	98	66.717	Carlito_syrichta
ENSMALG00000010238	tyw1	85	63.863	ENSCAPG00000013569	-	100	64.019	Cavia_aperea
ENSMALG00000010238	tyw1	95	64.883	ENSCPOG00000011182	-	99	64.578	Cavia_porcellus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.582	ENSCCAG00000026643	-	98	67.353	Cebus_capucinus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.078	ENSCATG00000043677	-	98	67.166	Cercocebus_atys
ENSMALG00000010238	tyw1	96	66.074	ENSCLAG00000006321	-	99	65.800	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000010238	tyw1	87	71.220	ENSCSAG00000018274	-	98	71.403	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000010238	tyw1	100	65.879	ENSCPBG00000014896	-	99	71.612	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000010238	tyw1	79	58.418	ENSCING00000004125	-	97	58.081	Ciona_intestinalis
ENSMALG00000010238	tyw1	74	69.054	ENSCSAVG00000005712	-	100	55.111	Ciona_savignyi
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.215	ENSCANG00000033209	-	98	67.078	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000010238	tyw1	69	75.973	ENSCGRG00001003679	Tyw1	87	75.973	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000010238	tyw1	100	80.585	ENSCSEG00000005810	tyw1	98	80.452	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000010238	tyw1	91	79.529	ENSCVAG00000001054	tyw1	96	79.234	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	76.072	ENSDARG00000062987	tyw1	95	76.796	Danio_rerio
ENSMALG00000010238	tyw1	96	68.176	ENSDNOG00000024165	-	98	68.038	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000010238	tyw1	81	65.686	ENSDORG00000014772	Tyw1	88	65.686	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000010238	tyw1	57	72.685	ENSEBUG00000004494	tyw1	91	72.685	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000010238	tyw1	96	68.082	ENSEASG00005008818	-	99	68.044	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	62.121	ENSECAG00000023164	-	99	62.050	Equus_caballus
ENSMALG00000010238	tyw1	59	80.412	ENSEEUG00000005950	-	61	79.592	Erinaceus_europaeus
ENSMALG00000010238	tyw1	99	74.699	ENSELUG00000008449	tyw1	98	72.769	Esox_lucius
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.538	ENSFCAG00000014262	-	98	66.575	Felis_catus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	63.462	ENSFALG00000013810	-	99	62.938	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000010238	tyw1	96	64.276	ENSFDAG00000013270	-	98	65.793	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000010238	tyw1	81	82.382	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	82.382	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	65.062	ENSGALG00000001110	-	98	66.529	Gallus_gallus
ENSMALG00000010238	tyw1	97	80.163	ENSGACG00000012692	tyw1	99	78.255	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000010238	tyw1	97	66.622	ENSGAGG00000022393	-	100	67.206	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000010238	tyw1	86	59.756	ENSGGOG00000001473	TYW1	98	59.604	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000010238	tyw1	100	83.733	ENSHBUG00000002640	tyw1	100	83.733	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000010238	tyw1	86	66.511	ENSHGLG00000012093	-	100	66.355	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000010238	tyw1	96	65.427	ENSHGLG00100011743	TYW1	98	65.565	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000010238	tyw1	97	67.901	ENSHCOG00000019949	tyw1	97	67.623	Hippocampus_comes
ENSMALG00000010238	tyw1	99	71.032	ENSIPUG00000016330	tyw1	100	72.619	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	65.887	ENSSTOG00000004067	-	90	66.025	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000010238	tyw1	95	65.690	ENSJJAG00000022959	Tyw1	98	66.022	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000010238	tyw1	99	79.867	ENSKMAG00000018599	tyw1	100	79.867	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	66.255	ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.575	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000010238	tyw1	99	70.933	ENSLOCG00000004035	tyw1	99	70.806	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.353	ENSMFAG00000035457	-	98	67.302	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.353	ENSMMUG00000030374	-	98	67.302	Macaca_mulatta
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.353	ENSMNEG00000041992	-	98	71.455	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.215	ENSMLEG00000039741	-	98	67.302	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000010238	tyw1	98	86.667	ENSMAMG00000016089	tyw1	99	86.152	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000010238	tyw1	92	85.196	ENSMZEG00005024386	tyw1	99	85.693	Maylandia_zebra
ENSMALG00000010238	tyw1	96	65.432	ENSMGAG00000002176	-	98	65.295	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.268	ENSMAUG00000002959	Tyw1	98	67.268	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.675	ENSMICG00000014374	-	99	67.813	Microcebus_murinus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	66.851	ENSMOCG00000017720	Tyw1	98	66.851	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000010238	tyw1	97	76.955	ENSMMOG00000005064	tyw1	99	76.639	Mola_mola
ENSMALG00000010238	tyw1	96	66.667	ENSMODG00000025697	-	98	66.894	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000010238	tyw1	96	66.574	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	99	66.574	Mus_caroli
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.452	ENSMUSG00000056310	Tyw1	99	67.452	Mus_musculus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.268	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	99	67.268	Mus_pahari
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.175	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	99	67.175	Mus_spretus
ENSMALG00000010238	tyw1	88	71.125	ENSMPUG00000016191	-	95	70.213	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000010238	tyw1	96	65.211	ENSMLUG00000013582	-	99	65.116	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	66.667	ENSNGAG00000002742	Tyw1	99	66.713	Nannospalax_galili
ENSMALG00000010238	tyw1	92	82.540	ENSNBRG00000016996	tyw1	97	83.138	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000010238	tyw1	96	66.529	ENSNLEG00000013210	-	97	66.529	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000010238	tyw1	88	54.795	ENSOPRG00000008734	-	87	55.136	Ochotona_princeps
ENSMALG00000010238	tyw1	96	58.645	ENSODEG00000014729	-	95	63.030	Octodon_degus
ENSMALG00000010238	tyw1	100	82.667	ENSONIG00000005872	tyw1	100	82.667	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000010238	tyw1	95	67.082	ENSOCUG00000003173	-	98	67.170	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000010238	tyw1	100	77.867	ENSORLG00000001393	tyw1	99	78.296	Oryzias_latipes
ENSMALG00000010238	tyw1	100	77.733	ENSORLG00020019361	tyw1	100	78.162	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000010238	tyw1	100	77.527	ENSORLG00015008095	tyw1	99	77.955	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000010238	tyw1	88	72.139	ENSOGAG00000016555	-	89	71.946	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000010238	tyw1	96	68.027	ENSOARG00000010673	-	99	68.027	Ovis_aries
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.867	ENSPPRG00000004945	-	98	67.175	Panthera_pardus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.956	ENSPTIG00000019545	-	98	67.036	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000010238	tyw1	96	62.380	ENSPTRG00000023076	TYW1B	97	62.517	Pan_troglodytes
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.078	ENSPANG00000019053	-	98	67.215	Papio_anubis
ENSMALG00000010238	tyw1	99	67.776	ENSPKIG00000006545	tyw1	99	68.127	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000010238	tyw1	94	78.440	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	78.582	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.082	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	67.082	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000010238	tyw1	100	78.940	ENSPFOG00000015855	tyw1	99	80.992	Poecilia_formosa
ENSMALG00000010238	tyw1	100	78.543	ENSPLAG00000000838	tyw1	100	78.808	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000010238	tyw1	100	78.808	ENSPMEG00000019437	tyw1	100	79.073	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000010238	tyw1	98	76.119	ENSPREG00000018773	tyw1	99	76.391	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.125	ENSPPYG00000017514	TYW1	98	67.263	Pongo_abelii
ENSMALG00000010238	tyw1	96	53.022	ENSPCOG00000015294	-	86	60.766	Propithecus_coquereli
ENSMALG00000010238	tyw1	100	83.867	ENSPNYG00000022381	tyw1	100	83.867	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000010238	tyw1	96	75.762	ENSPNAG00000009001	tyw1	98	76.625	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.129	ENSRNOG00000024352	Tyw1	98	67.129	Rattus_norvegicus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.031	ENSRBIG00000039619	-	98	67.125	Rhinopithecus_bieti
ENSMALG00000010238	tyw1	96	66.848	ENSRROG00000039780	-	98	67.078	Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000010238	tyw1	87	39.640	YPL207W	-	51	51.659	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.078	ENSSBOG00000025873	-	98	66.255	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000010238	tyw1	97	65.811	ENSSHAG00000010346	-	100	65.726	Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000010238	tyw1	99	70.784	ENSSFOG00015001054	tyw1	100	70.651	Scleropages_formosus
ENSMALG00000010238	tyw1	98	85.442	ENSSMAG00000020514	tyw1	100	84.533	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000010238	tyw1	100	87.401	ENSSDUG00000001552	tyw1	100	87.401	Seriola_dumerili
ENSMALG00000010238	tyw1	100	87.268	ENSSLDG00000003554	tyw1	100	87.268	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000010238	tyw1	96	65.698	ENSSPUG00000002715	-	98	66.391	Sphenodon_punctatus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.350	ENSSSCG00000007733	-	99	67.350	Sus_scrofa
ENSMALG00000010238	tyw1	87	66.313	ENSTGUG00000003428	-	98	66.818	Taeniopygia_guttata
ENSMALG00000010238	tyw1	100	81.067	ENSTRUG00000016107	tyw1	98	81.067	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000010238	tyw1	88	84.281	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	84.281	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000010238	tyw1	96	67.857	ENSUMAG00000015343	-	100	67.845	Ursus_maritimus
ENSMALG00000010238	tyw1	96	66.437	ENSVVUG00000016457	-	98	67.125	Vulpes_vulpes
ENSMALG00000010238	tyw1	96	68.182	ENSXETG00000010094	tyw1	98	68.819	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000010238	tyw1	100	77.733	ENSXMAG00000013125	tyw1	99	79.674	Xiphophorus_maculatus