EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000010535 (Gene tree)
Gene ID: 109958622
Gene Symbol: skiv2l
Alias: fb70b07|wu:fb70b07
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13139 bases
Position: chrKV884722.1:3497897-3511035
Accession: 109958622
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000015059	rRNA_proc-arch	PF13234.6	7.2e-30	1	1
ENSMALP00000015059	DEAD	PF00270.29	7.8e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000015367	-	3582	XM_020597422	ENSMALP00000015059	1193 (aa)	XP_020453078	-

Gene Model

Click here to download ENSMALG00000010535's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
malb03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMALG00000010535's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000010535	skiv2l	72	49.791	ENSMALG00000002917	mtrex	87	49.791

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.886	ENSG00000204351	SKIV2L	99	59.903	Homo_sapiens
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.320	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	83.320	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.235	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	59.259	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	82.846	ENSACIG00000016719	skiv2l	100	82.927	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	84.307	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	84.566	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	84.227	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	84.227	Amphiprion_percula
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	86.500	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	86.500	Anabas_testudineus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	60.931	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	61.702	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.967	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	59.984	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	85.124	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	85.124	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	78.381	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	78.543	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.723	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	99	59.742	Bos_taurus
ENSMALG00000010535	skiv2l	91	40.898	WBGene00008502	skih-2	93	41.230	Caenorhabditis_elegans
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.967	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	59.984	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.561	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	99	59.581	Canis_familiaris
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.561	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	99	59.581	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.886	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	99	59.903	Capra_hircus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.561	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	99	59.694	Carlito_syrichta
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.705	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	99	59.643	Cavia_porcellus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.805	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	59.903	Cebus_capucinus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.886	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	59.984	Cercocebus_atys
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	60.032	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	59.968	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	60.049	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	60.064	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000010535	skiv2l	89	57.923	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	99	58.124	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000010535	skiv2l	92	50.614	ENSCING00000005576	-	97	50.614	Ciona_intestinalis
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.886	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	59.533	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	60.228	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	99	60.161	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	84.078	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	84.403	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.655	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	83.655	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	78.737	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	78.737	Danio_rerio
ENSMALG00000010535	skiv2l	91	63.709	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	92	63.802	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000010535	skiv2l	92	44.957	FBgn0039117	tst	95	45.043	Drosophila_melanogaster
ENSMALG00000010535	skiv2l	69	73.418	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	73.418	Echinops_telfairi
ENSMALG00000010535	skiv2l	90	54.286	ENSEBUG00000013680	-	98	53.327	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000010535	skiv2l	92	61.700	ENSEASG00005015534	SKIV2L	98	61.821	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000010535	skiv2l	93	59.552	ENSECAG00000021823	SKIV2L	95	59.694	Equus_caballus
ENSMALG00000010535	skiv2l	53	71.146	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	71.146	Erinaceus_europaeus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	80.720	ENSELUG00000000181	skiv2l	96	87.267	Esox_lucius
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.967	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	99	59.984	Felis_catus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	58.795	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	58.842	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	84.054	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	84.054	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	78.444	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	78.444	Gadus_morhua
ENSMALG00000010535	skiv2l	78	56.517	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.567	Gallus_gallus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	84.295	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	84.375	Gambusia_affinis
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.413	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	83.413	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.886	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	99	59.903	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	84.013	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	84.013	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.659	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	99	59.904	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	57.792	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	99	57.979	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	79.551	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	79.385	Hippocampus_comes
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	78.365	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	78.653	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	59.984	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	59.984	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000010535	skiv2l	55	61.905	ENSLACG00000002986	-	60	61.905	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.805	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	59.936	Loxodonta_africana
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.967	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	99	60.064	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.967	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	99	60.064	Macaca_mulatta
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	60.049	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.064	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.805	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	59.903	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	86.013	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	86.013	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	85.124	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	85.124	Maylandia_zebra
ENSMALG00000010535	skiv2l	69	47.277	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	95	47.712	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.902	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	59.839	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	60.049	ENSMICG00000046331	SKIV2L	99	60.145	Microcebus_murinus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	58.680	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	58.629	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	82.609	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	82.609	Mola_mola
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	60.209	ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.321	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.706	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	99	59.564	Mus_caroli
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.869	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	99	59.726	Mus_musculus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	60.277	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	99	60.210	Mus_pahari
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.706	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	99	59.564	Mus_spretus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.202	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	99	59.340	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.398	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	99	59.420	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.660	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	83.660	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.265	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	59.289	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000010535	skiv2l	78	62.500	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	61.947	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.967	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.903	Ochotona_princeps
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.967	ENSODEG00000017516	SKIV2L	99	59.903	Octodon_degus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	84.423	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	84.423	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	60.293	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	99	60.306	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.387	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	83.387	Oryzias_latipes
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.307	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	83.307	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.146	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	83.146	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	82.853	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	82.853	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.659	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	99	59.679	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	56.111	ENSOARG00000002411	-	99	56.167	Ovis_aries
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.385	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	59.408	Pan_paniscus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.967	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	99	59.984	Panthera_pardus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.561	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.581	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.967	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	99	59.984	Pan_troglodytes
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	58.947	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	59.054	Papio_anubis
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	75.060	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	75.060	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	81.427	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	81.590	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	60.065	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	99	60.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	60.080	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	99	60.080	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.814	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	83.894	Poecilia_formosa
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.881	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	83.881	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.974	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	84.054	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	81.072	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	81.154	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.561	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	59.581	Pongo_abelii
ENSMALG00000010535	skiv2l	71	62.162	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	70	62.162	Procavia_capensis
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	60.212	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	99	60.225	Propithecus_coquereli
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	60.374	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	99	60.386	Pteropus_vampyrus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	82.257	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	82.257	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	79.660	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	79.695	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	60.114	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	99	60.048	Rattus_norvegicus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.109	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	59.135	Rhinopithecus_bieti
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.967	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	60.064	Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	38.183	YLR398C	-	95	38.260	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.967	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	59.984	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	59.646	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	58.876	Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	77.760	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	77.760	Scleropages_formosus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.814	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	83.814	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	85.931	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	85.931	Seriola_dumerili
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	82.131	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	82.131	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	59.023	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	59.023	Sphenodon_punctatus
ENSMALG00000010535	skiv2l	94	84.277	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	84.635	Stegastes_partitus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	60.064	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.064	Sus_scrofa
ENSMALG00000010535	skiv2l	71	90.909	ENSTRUG00000000966	skiv2l	88	90.909	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	80.353	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	80.513	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000010535	skiv2l	92	61.963	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	61.963	Tupaia_belangeri
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	56.225	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.280	Tursiops_truncatus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.479	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	59.501	Ursus_americanus
ENSMALG00000010535	skiv2l	92	61.646	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	98	61.646	Ursus_maritimus
ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.561	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	59.423	Vulpes_vulpes
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	57.303	ENSXETG00000010932	skiv2l	99	57.510	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.601	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	83.682	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000010535	skiv2l	99	83.413	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	83.494	Xiphophorus_maculatus