EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000010706 (Gene tree)
Gene ID: 109965003
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10879 bases
Position: chrKV884782.1:634163-645041
Accession: 109965003
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000015250	SYF2	PF08231.12	2.1e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000015563	-	4004	XM_020608680	ENSMALP00000015250	241 (aa)	XP_020464336	UPI0009B39BBE

Gene Model

Click here to download ENSMALG00000010706's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
malb03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMALG00000010706's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	ENSG00000117614	SYF2	96	76.349	Homo_sapiens
ENSMALG00000010706	syf2	100	90.456	ENSAPOG00000001174	syf2	100	90.871	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000010706	syf2	93	82.143	ENSAMEG00000010115	-	91	81.696	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000010706	syf2	81	82.653	ENSAMEG00000010134	-	100	82.143	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000010706	syf2	99	89.496	ENSACIG00000023688	syf2	94	89.076	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000010706	syf2	93	91.071	ENSAOCG00000010912	syf2	69	90.625	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000010706	syf2	100	91.701	ENSAOCG00000022046	syf2	99	91.026	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000010706	syf2	100	91.701	ENSAPEG00000018858	syf2	92	91.286	Amphiprion_percula
ENSMALG00000010706	syf2	90	93.119	ENSATEG00000007745	syf2	100	90.871	Anabas_testudineus
ENSMALG00000010706	syf2	83	81.592	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	81.095	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000010706	syf2	69	69.048	ENSACAG00000026777	-	100	68.452	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000010706	syf2	85	81.951	ENSACAG00000013653	-	100	81.463	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000010706	syf2	90	83.410	ENSANAG00000032473	SYF2	90	82.727	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000010706	syf2	100	89.627	ENSACLG00000019916	syf2	100	89.627	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000010706	syf2	100	82.988	ENSAMXG00000004051	syf2	100	82.573	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000010706	syf2	99	77.366	ENSBTAG00000001651	SYF2	98	79.741	Bos_taurus
ENSMALG00000010706	syf2	87	51.659	WBGene00019402	syf-2	90	51.415	Caenorhabditis_elegans
ENSMALG00000010706	syf2	90	83.410	ENSCJAG00000046570	SYF2	90	82.727	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	ENSCAFG00000012895	-	95	78.571	Canis_familiaris
ENSMALG00000010706	syf2	97	73.820	ENSCAFG00000030331	-	97	73.391	Canis_familiaris
ENSMALG00000010706	syf2	76	74.317	ENSCAFG00020021094	-	95	73.770	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	ENSCAFG00020021091	-	95	78.571	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000010706	syf2	100	76.639	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	77.500	Capra_hircus
ENSMALG00000010706	syf2	100	76.230	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	75.820	Carlito_syrichta
ENSMALG00000010706	syf2	83	81.910	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	81.407	Cavia_aperea
ENSMALG00000010706	syf2	100	77.143	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	76.735	Cavia_porcellus
ENSMALG00000010706	syf2	90	83.410	ENSCCAG00000022459	SYF2	90	82.727	Cebus_capucinus
ENSMALG00000010706	syf2	98	77.215	ENSCATG00000026917	SYF2	95	77.637	Cercocebus_atys
ENSMALG00000010706	syf2	100	77.551	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	77.143	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000010706	syf2	91	80.909	ENSCSAG00000000948	SYF2	90	81.364	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000010706	syf2	69	65.269	ENSCHOG00000005273	-	91	64.671	Choloepus_hoffmanni
ENSMALG00000010706	syf2	93	83.186	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	80.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000010706	syf2	88	53.991	ENSCING00000003017	-	89	53.991	Ciona_intestinalis
ENSMALG00000010706	syf2	88	50.704	ENSCSAVG00000006627	-	97	50.704	Ciona_savignyi
ENSMALG00000010706	syf2	98	67.932	ENSCANG00000037322	SYF2	94	68.354	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000010706	syf2	100	77.366	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	77.366	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000010706	syf2	81	83.163	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	82.915	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000010706	syf2	91	89.954	ENSCSEG00000000117	syf2	96	87.446	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000010706	syf2	100	89.212	ENSCVAG00000019543	syf2	100	88.797	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000010706	syf2	100	82.573	ENSDARG00000004706	syf2	100	82.158	Danio_rerio
ENSMALG00000010706	syf2	99	77.366	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	76.955	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000010706	syf2	95	80.603	ENSDORG00000001274	Syf2	94	80.519	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000010706	syf2	91	53.182	FBgn0033556	CG12343	97	53.182	Drosophila_melanogaster
ENSMALG00000010706	syf2	86	68.750	ENSETEG00000015729	SYF2	100	64.655	Echinops_telfairi
ENSMALG00000010706	syf2	82	59.091	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.586	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000010706	syf2	97	70.886	ENSEASG00005004232	-	98	70.886	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000010706	syf2	100	77.642	ENSEASG00005004224	-	100	77.642	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000010706	syf2	99	77.778	ENSECAG00000012023	-	99	77.366	Equus_caballus
ENSMALG00000010706	syf2	95	80.172	ENSECAG00000010440	-	97	80.172	Equus_caballus
ENSMALG00000010706	syf2	70	69.767	ENSEEUG00000015084	SYF2	93	69.767	Erinaceus_europaeus
ENSMALG00000010706	syf2	100	85.477	ENSELUG00000003465	syf2	99	85.062	Esox_lucius
ENSMALG00000010706	syf2	99	78.750	ENSFCAG00000010324	-	81	78.333	Felis_catus
ENSMALG00000010706	syf2	91	82.727	ENSFCAG00000043095	-	89	82.273	Felis_catus
ENSMALG00000010706	syf2	85	80.000	ENSFALG00000000460	SYF2	89	78.995	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000010706	syf2	100	77.049	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	76.639	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000010706	syf2	94	76.652	ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.211	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000010706	syf2	90	89.352	ENSGMOG00000019138	syf2	96	88.889	Gadus_morhua
ENSMALG00000010706	syf2	93	80.717	ENSGALG00000013639	SYF2	93	76.667	Gallus_gallus
ENSMALG00000010706	syf2	100	86.722	ENSGAFG00000019435	syf2	100	86.307	Gambusia_affinis
ENSMALG00000010706	syf2	93	90.135	ENSGACG00000007305	syf2	100	86.722	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000010706	syf2	93	83.628	ENSGAGG00000010670	SYF2	96	81.092	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	ENSGGOG00000012796	SYF2	96	76.349	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000010706	syf2	100	89.212	ENSHBUG00000020477	syf2	100	89.212	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000010706	syf2	100	77.959	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	77.551	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000010706	syf2	92	73.423	ENSHGLG00000004304	-	93	73.094	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000010706	syf2	100	77.959	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	77.551	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000010706	syf2	100	87.967	ENSHCOG00000012904	syf2	78	87.552	Hippocampus_comes
ENSMALG00000010706	syf2	100	83.402	ENSIPUG00000019859	syf2	100	82.988	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000010706	syf2	61	76.871	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	76.871	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000010706	syf2	89	78.140	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	82.000	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000010706	syf2	100	89.627	ENSKMAG00000013856	syf2	100	89.212	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000010706	syf2	100	89.212	ENSLBEG00000014425	syf2	100	90.041	Labrus_bergylta
ENSMALG00000010706	syf2	96	77.922	ENSLACG00000012064	SYF2	97	78.355	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000010706	syf2	100	82.988	ENSLOCG00000002728	syf2	95	82.573	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000010706	syf2	100	77.236	ENSLAFG00000023150	-	100	76.829	Loxodonta_africana
ENSMALG00000010706	syf2	76	55.135	ENSLAFG00000030814	-	100	55.135	Loxodonta_africana
ENSMALG00000010706	syf2	98	77.215	ENSMFAG00000041831	SYF2	95	77.637	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000010706	syf2	90	81.106	ENSMMUG00000002968	SYF2	100	75.000	Macaca_mulatta
ENSMALG00000010706	syf2	98	77.215	ENSMNEG00000030180	SYF2	95	77.637	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000010706	syf2	98	77.215	ENSMLEG00000030248	SYF2	95	77.637	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000010706	syf2	100	90.456	ENSMAMG00000010403	syf2	98	90.871	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000010706	syf2	100	89.627	ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.212	Maylandia_zebra
ENSMALG00000010706	syf2	83	81.500	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	81.000	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000010706	syf2	100	78.189	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	78.189	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000010706	syf2	83	82.500	ENSMICG00000016191	SYF2	100	82.000	Microcebus_murinus
ENSMALG00000010706	syf2	100	77.778	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	77.778	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000010706	syf2	99	87.448	ENSMMOG00000002396	syf2	99	87.029	Mola_mola
ENSMALG00000010706	syf2	93	78.222	ENSMODG00000013951	-	98	78.222	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000010706	syf2	100	78.189	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	78.189	Mus_caroli
ENSMALG00000010706	syf2	100	78.189	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	78.189	Mus_musculus
ENSMALG00000010706	syf2	100	78.189	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	78.189	Mus_pahari
ENSMALG00000010706	syf2	100	78.189	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	78.189	Mus_spretus
ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	ENSMPUG00000015802	-	89	82.273	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000010706	syf2	99	75.610	ENSMPUG00000015801	-	99	75.203	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000010706	syf2	100	76.763	ENSMLUG00000001885	SYF2	96	76.349	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000010706	syf2	100	78.138	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	78.138	Nannospalax_galili
ENSMALG00000010706	syf2	100	79.592	ENSNBRG00000010720	syf2	99	79.592	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	ENSNLEG00000035185	SYF2	100	75.820	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000010706	syf2	100	76.230	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	75.820	Ochotona_princeps
ENSMALG00000010706	syf2	100	68.163	ENSODEG00000014338	-	100	67.755	Octodon_degus
ENSMALG00000010706	syf2	93	81.614	ENSODEG00000017664	-	93	81.166	Octodon_degus
ENSMALG00000010706	syf2	100	89.627	ENSONIG00000008213	syf2	100	89.627	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000010706	syf2	84	81.773	ENSOANG00000009552	SYF2	100	81.281	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMALG00000010706	syf2	90	83.410	ENSOCUG00000013050	SYF2	95	78.903	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000010706	syf2	96	88.745	ENSORLG00000028820	syf2	99	88.312	Oryzias_latipes
ENSMALG00000010706	syf2	100	86.307	ENSORLG00020018333	syf2	100	85.892	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000010706	syf2	100	86.307	ENSORLG00015014665	syf2	100	85.892	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000010706	syf2	100	88.797	ENSOMEG00000013911	syf2	100	88.382	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000010706	syf2	99	78.992	ENSOGAG00000009962	SYF2	95	78.571	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000010706	syf2	99	76.327	ENSOARG00000006348	-	99	75.918	Ovis_aries
ENSMALG00000010706	syf2	81	56.633	ENSOARG00000006269	-	100	56.633	Ovis_aries
ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	ENSPPAG00000036579	SYF2	96	76.349	Pan_paniscus
ENSMALG00000010706	syf2	91	82.727	ENSPPRG00000001651	-	89	82.273	Panthera_pardus
ENSMALG00000010706	syf2	99	78.992	ENSPPRG00000001638	-	95	78.571	Panthera_pardus
ENSMALG00000010706	syf2	91	82.727	ENSPTIG00000007036	-	89	82.273	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000010706	syf2	90	83.410	ENSPTIG00000005711	-	80	82.648	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	ENSPTRG00000000352	SYF2	96	76.349	Pan_troglodytes
ENSMALG00000010706	syf2	98	77.215	ENSPANG00000008139	SYF2	95	77.637	Papio_anubis
ENSMALG00000010706	syf2	100	81.743	ENSPKIG00000008130	syf2	100	81.328	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000010706	syf2	95	80.342	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	79.915	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000010706	syf2	95	89.083	ENSPMGG00000008755	syf2	89	88.646	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000010706	syf2	100	76.132	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	77.366	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000010706	syf2	91	82.648	ENSPCIG00000014235	SYF2	100	75.697	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000010706	syf2	96	88.745	ENSPFOG00000004116	syf2	95	88.312	Poecilia_formosa
ENSMALG00000010706	syf2	96	88.312	ENSPLAG00000006691	syf2	99	87.879	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000010706	syf2	100	84.232	ENSPMEG00000011684	syf2	99	85.281	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000010706	syf2	100	86.722	ENSPREG00000003009	syf2	100	86.307	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000010706	syf2	100	77.178	ENSPPYG00000001713	SYF2	96	76.763	Pongo_abelii
ENSMALG00000010706	syf2	100	54.098	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	53.689	Propithecus_coquereli
ENSMALG00000010706	syf2	93	72.646	ENSPVAG00000005841	SYF2	91	72.646	Pteropus_vampyrus
ENSMALG00000010706	syf2	93	91.964	ENSPNYG00000004979	syf2	100	89.212	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000010706	syf2	100	82.573	ENSPNAG00000015570	syf2	100	82.158	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000010706	syf2	100	78.189	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	78.189	Rattus_norvegicus
ENSMALG00000010706	syf2	98	75.949	ENSRBIG00000042970	SYF2	95	75.949	Rhinopithecus_bieti
ENSMALG00000010706	syf2	98	77.215	ENSRROG00000001347	SYF2	95	77.637	Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	ENSSBOG00000020184	SYF2	90	82.273	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000010706	syf2	93	80.717	ENSSHAG00000015630	-	89	80.269	Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000010706	syf2	85	81.643	ENSSHAG00000007152	-	100	81.159	Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000010706	syf2	95	84.716	ENSSFOG00015023647	syf2	95	84.279	Scleropages_formosus
ENSMALG00000010706	syf2	100	88.797	ENSSMAG00000009867	syf2	100	88.382	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000010706	syf2	100	88.797	ENSSDUG00000013072	syf2	100	89.212	Seriola_dumerili
ENSMALG00000010706	syf2	100	88.797	ENSSLDG00000012677	syf2	100	89.212	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000010706	syf2	100	60.000	ENSSARG00000012889	SYF2	100	59.592	Sorex_araneus
ENSMALG00000010706	syf2	99	77.778	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	77.366	Sphenodon_punctatus
ENSMALG00000010706	syf2	100	91.286	ENSSPAG00000009626	syf2	100	90.871	Stegastes_partitus
ENSMALG00000010706	syf2	99	76.955	ENSSSCG00000037481	SYF2	99	76.543	Sus_scrofa
ENSMALG00000010706	syf2	62	52.632	ENSTGUG00000001126	SYF2	90	50.543	Taeniopygia_guttata
ENSMALG00000010706	syf2	100	86.307	ENSTRUG00000001499	syf2	95	85.294	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000010706	syf2	93	87.892	ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.444	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000010706	syf2	100	57.377	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	56.967	Tupaia_belangeri
ENSMALG00000010706	syf2	90	82.488	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	75.510	Tursiops_truncatus
ENSMALG00000010706	syf2	93	82.589	ENSUAMG00000002897	SYF2	90	82.143	Ursus_americanus
ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	ENSUMAG00000013108	SYF2	90	81.696	Ursus_maritimus
ENSMALG00000010706	syf2	100	76.327	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	75.918	Vicugna_pacos
ENSMALG00000010706	syf2	85	81.553	ENSVVUG00000027181	-	100	75.100	Vulpes_vulpes
ENSMALG00000010706	syf2	90	82.949	ENSVVUG00000027175	-	95	78.571	Vulpes_vulpes
ENSMALG00000010706	syf2	98	76.050	ENSXETG00000022797	syf2	95	75.630	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000010706	syf2	100	87.967	ENSXMAG00000022698	syf2	100	87.552	Xiphophorus_maculatus