EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000011343 (Gene tree)
Gene ID: 109960331
Gene Symbol: srpra
Alias: id:ibd1064|srpr|wu:fd12f02
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7949 bases
Position: chrKV884734.1:3251895-3259843
Accession: 109960331
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000016172	SRP54	PF00448.22	7.2e-48	1	1
ENSMALP00000016172	SRP54_N	PF02881.19	4.1e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000016499	-	2177	XM_020600347	ENSMALP00000016172	650 (aa)	XP_020456003	UPI0009B44E6C

Gene Model

Click here to download ENSMALG00000011343's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
malb03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMALG00000011343's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.389	ENSG00000182934	SRPRA	100	68.085	Homo_sapiens
ENSMALG00000011343	srpra	100	92.000	ENSAPOG00000017588	srpra	100	92.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.493	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	67.629	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000011343	srpra	100	86.308	ENSACIG00000021588	srpra	100	86.308	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000011343	srpra	100	92.000	ENSAOCG00000018884	srpra	100	92.000	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000011343	srpra	100	92.000	ENSAPEG00000022286	srpra	92	92.000	Amphiprion_percula
ENSMALG00000011343	srpra	100	88.957	ENSATEG00000023578	srpra	95	97.264	Anabas_testudineus
ENSMALG00000011343	srpra	94	67.891	ENSAPLG00000016079	SRPRA	99	69.870	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000011343	srpra	100	69.611	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	70.181	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.389	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	68.085	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000011343	srpra	100	88.154	ENSACLG00000000518	srpra	100	88.154	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000011343	srpra	100	72.769	ENSAMXG00000009975	srpra	100	72.462	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.333	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	68.030	Bos_taurus
ENSMALG00000011343	srpra	99	47.720	WBGene00009521	F38A1.8	99	47.561	Caenorhabditis_elegans
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.140	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	67.835	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000011343	srpra	100	67.021	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	66.313	Canis_familiaris
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.693	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	67.982	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.541	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	67.678	Capra_hircus
ENSMALG00000011343	srpra	82	78.437	ENSTSYG00000005187	SRPRA	91	85.802	Carlito_syrichta
ENSMALG00000011343	srpra	95	65.385	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	87.970	Cavia_aperea
ENSMALG00000011343	srpra	100	67.612	ENSCPOG00000014976	SRPRA	91	87.970	Cavia_porcellus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.541	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	68.237	Cebus_capucinus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.693	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	68.389	Cercocebus_atys
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.541	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	68.237	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.541	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	68.237	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000011343	srpra	54	87.245	ENSCHOG00000010015	-	73	87.245	Choloepus_hoffmanni
ENSMALG00000011343	srpra	100	69.127	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	68.684	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000011343	srpra	99	57.911	ENSCING00000008954	-	100	57.911	Ciona_intestinalis
ENSMALG00000011343	srpra	99	58.850	ENSCSAVG00000005602	-	100	57.511	Ciona_savignyi
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.541	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	68.237	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.693	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	67.982	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.693	ENSCGRG00000009892	Srpr	90	88.148	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000011343	srpra	100	86.830	ENSCSEG00000002374	srpra	100	86.677	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000011343	srpra	100	84.992	ENSCVAG00000019881	srpra	100	85.299	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000011343	srpra	100	77.744	ENSDARG00000061124	srpra	100	77.405	Danio_rerio
ENSMALG00000011343	srpra	100	67.820	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	66.916	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.845	ENSDORG00000016719	Srpr	100	68.541	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000011343	srpra	99	52.061	FBgn0010391	Gtp-bp	100	52.134	Drosophila_melanogaster
ENSMALG00000011343	srpra	100	67.322	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	66.415	Echinops_telfairi
ENSMALG00000011343	srpra	50	83.025	ENSEBUG00000002602	srpra	92	67.599	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000011343	srpra	100	69.102	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	67.629	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.798	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	67.629	Equus_caballus
ENSMALG00000011343	srpra	100	63.733	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	62.822	Erinaceus_europaeus
ENSMALG00000011343	srpra	100	85.933	ENSELUG00000017643	srpra	100	86.043	Esox_lucius
ENSMALG00000011343	srpra	100	69.347	ENSFCAG00000011274	-	100	67.576	Felis_catus
ENSMALG00000011343	srpra	80	64.030	ENSFCAG00000030894	-	99	61.842	Felis_catus
ENSMALG00000011343	srpra	99	66.718	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	67.435	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.237	ENSFDAG00000016229	SRPRA	92	83.217	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000011343	srpra	100	86.790	ENSFHEG00000016959	srpra	100	86.943	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000011343	srpra	100	81.846	ENSGMOG00000013244	srpra	100	81.231	Gadus_morhua
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.939	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	70.213	Gallus_gallus
ENSMALG00000011343	srpra	100	88.154	ENSGAFG00000000453	srpra	100	88.154	Gambusia_affinis
ENSMALG00000011343	srpra	100	83.920	ENSGACG00000006550	srpra	100	83.846	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000011343	srpra	100	69.578	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	68.986	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.389	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	68.085	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000011343	srpra	100	88.000	ENSHBUG00000000119	srpra	100	88.000	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000011343	srpra	100	67.164	ENSHGLG00000001597	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000011343	srpra	100	67.164	ENSHGLG00100006449	SRPR	94	88.636	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000011343	srpra	100	85.605	ENSHCOG00000010749	srpra	100	85.911	Hippocampus_comes
ENSMALG00000011343	srpra	94	76.136	ENSIPUG00000000867	srpra	99	75.935	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.237	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	67.933	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.341	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	67.781	Jaculus_jaculus
ENSMALG00000011343	srpra	100	86.043	ENSKMAG00000002280	srpra	100	86.810	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000011343	srpra	100	89.708	ENSLBEG00000009608	srpra	100	89.862	Labrus_bergylta
ENSMALG00000011343	srpra	100	67.678	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	68.437	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000011343	srpra	100	76.748	ENSLOCG00000002733	srpra	100	75.878	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000011343	srpra	100	67.776	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	67.927	Loxodonta_africana
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.693	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	68.389	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.693	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	68.389	Macaca_mulatta
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.693	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	68.389	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.693	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	68.389	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000011343	srpra	100	87.846	ENSMAMG00000000473	srpra	100	88.154	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000011343	srpra	100	88.154	ENSMZEG00005013432	srpra	100	88.154	Maylandia_zebra
ENSMALG00000011343	srpra	94	67.840	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	69.481	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.693	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	67.982	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.389	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	67.421	Microcebus_murinus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.389	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	67.678	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000011343	srpra	100	80.521	ENSMMOG00000005019	srpra	100	77.645	Mola_mola
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.223	ENSMODG00000004576	-	100	67.171	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.493	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	86	89.394	Mus_caroli
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.741	ENSMUSG00000032042	Srpr	86	88.636	Mus_musculus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.389	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	86	88.636	Mus_pahari
ENSMALG00000011343	srpra	100	65.167	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	64.348	Mus_spretus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.541	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	67.270	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000011343	srpra	100	67.378	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	67.378	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.541	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	67.068	Nannospalax_galili
ENSMALG00000011343	srpra	100	87.692	ENSNBRG00000017311	srpra	100	87.692	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000011343	srpra	99	65.138	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	67.624	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000011343	srpra	94	67.524	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	67.203	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000011343	srpra	100	64.492	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	64.091	Ochotona_princeps
ENSMALG00000011343	srpra	100	67.115	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	67.474	Octodon_degus
ENSMALG00000011343	srpra	100	87.692	ENSONIG00000005324	srpra	100	87.692	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.845	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	68.541	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000011343	srpra	100	84.308	ENSORLG00000014676	srpra	94	95.385	Oryzias_latipes
ENSMALG00000011343	srpra	100	84.308	ENSORLG00020009240	srpra	100	83.385	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000011343	srpra	100	84.154	ENSORLG00015015405	srpra	100	83.231	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000011343	srpra	100	85.077	ENSOMEG00000005872	srpra	100	84.154	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.389	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	67.169	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000011343	srpra	100	65.857	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	65.706	Ovis_aries
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.389	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	68.085	Pan_paniscus
ENSMALG00000011343	srpra	100	69.347	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	67.576	Panthera_pardus
ENSMALG00000011343	srpra	100	69.196	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	67.424	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.389	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	68.085	Pan_troglodytes
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.693	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	68.389	Papio_anubis
ENSMALG00000011343	srpra	100	77.252	ENSPKIG00000016106	srpra	100	76.947	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000011343	srpra	94	69.775	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	68.659	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000011343	srpra	100	83.436	ENSPMGG00000001393	srpra	100	82.848	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.541	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	67.830	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000011343	srpra	99	60.850	ENSPMAG00000009559	srpra	99	61.422	Petromyzon_marinus
ENSMALG00000011343	srpra	100	67.564	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	67.580	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000011343	srpra	100	88.615	ENSPFOG00000003114	srpra	100	88.615	Poecilia_formosa
ENSMALG00000011343	srpra	100	88.462	ENSPLAG00000007323	srpra	100	88.462	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000011343	srpra	100	88.462	ENSPMEG00000015658	srpra	100	88.462	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000011343	srpra	100	88.462	ENSPREG00000004937	srpra	100	88.462	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000011343	srpra	89	85.526	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	85.526	Pongo_abelii
ENSMALG00000011343	srpra	61	89.922	ENSPCAG00000003801	-	63	89.922	Procavia_capensis
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.541	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	67.421	Propithecus_coquereli
ENSMALG00000011343	srpra	100	67.732	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	67.732	Pteropus_vampyrus
ENSMALG00000011343	srpra	100	88.154	ENSPNYG00000012371	srpra	100	88.154	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000011343	srpra	100	78.528	ENSPNAG00000013476	srpra	100	78.528	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.389	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	67.830	Rattus_norvegicus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.541	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	68.237	Rhinopithecus_bieti
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.437	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	68.134	Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000011343	srpra	52	40.496	YDR292C	-	54	41.471	Saccharomyces_cerevisiae
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.237	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	67.933	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000011343	srpra	94	66.938	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	66.396	Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000011343	srpra	100	72.350	ENSSFOG00015008837	srpra	100	72.546	Scleropages_formosus
ENSMALG00000011343	srpra	100	77.217	ENSSMAG00000002783	srpra	100	75.613	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000011343	srpra	100	91.705	ENSSDUG00000013920	srpra	92	91.705	Seriola_dumerili
ENSMALG00000011343	srpra	100	91.398	ENSSLDG00000008601	srpra	93	91.398	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000011343	srpra	82	82.927	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	82.927	Sorex_araneus
ENSMALG00000011343	srpra	100	69.665	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	69.207	Sphenodon_punctatus
ENSMALG00000011343	srpra	100	91.411	ENSSPAG00000005103	srpra	100	91.411	Stegastes_partitus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.693	ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.722	Sus_scrofa
ENSMALG00000011343	srpra	94	66.505	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	67.317	Taeniopygia_guttata
ENSMALG00000011343	srpra	100	85.692	ENSTRUG00000006856	srpra	100	84.769	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000011343	srpra	100	80.845	ENSTNIG00000010316	srpra	100	80.392	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.892	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	67.424	Tursiops_truncatus
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.589	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	67.727	Ursus_americanus
ENSMALG00000011343	srpra	96	62.520	ENSUMAG00000002269	SRPRA	100	61.838	Ursus_maritimus
ENSMALG00000011343	srpra	69	89.922	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	89.922	Vicugna_pacos
ENSMALG00000011343	srpra	100	68.693	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	68.079	Vulpes_vulpes
ENSMALG00000011343	srpra	100	62.085	ENSXETG00000003920	srpra	100	61.725	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000011343	srpra	87	94.595	ENSXCOG00000001286	srpra	99	95.679	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000011343	srpra	100	87.846	ENSXMAG00000028401	srpra	100	87.385	Xiphophorus_maculatus