EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000012008 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 27534 bases
Position: chrKV885042.1:14015-41548
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	1	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	2	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	3	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	4	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	5	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	6	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	7	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	8	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	9	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	10	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	11	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	12	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	13	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	14	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	15	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	16	17
ENSMALP00000017153	zf-C2H2	PF00096.26	1e-90	17	17
ENSMALP00000017153	zf-met	PF12874.7	1.1e-13	1	2
ENSMALP00000017153	zf-met	PF12874.7	1.1e-13	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000017492	-	2028	-	ENSMALP00000017153	675 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000012008	-	81	47.782	ENSMALG00000004413	-	98	47.782
ENSMALG00000012008	-	85	48.511	ENSMALG00000010959	-	98	52.381
ENSMALG00000012008	-	88	56.338	ENSMALG00000008930	-	84	48.684
ENSMALG00000012008	-	80	45.349	ENSMALG00000021084	-	62	38.506
ENSMALG00000012008	-	80	31.013	ENSMALG00000006800	-	51	31.013
ENSMALG00000012008	-	81	48.110	ENSMALG00000013323	-	90	48.110
ENSMALG00000012008	-	85	34.462	ENSMALG00000013321	-	75	32.283
ENSMALG00000012008	-	87	36.675	ENSMALG00000019842	ZNF319	95	34.317
ENSMALG00000012008	-	87	71.212	ENSMALG00000012155	-	98	68.103
ENSMALG00000012008	-	82	51.429	ENSMALG00000018277	-	96	51.429
ENSMALG00000012008	-	82	44.503	ENSMALG00000004279	-	78	44.503
ENSMALG00000012008	-	88	56.164	ENSMALG00000019254	-	54	56.164
ENSMALG00000012008	-	83	54.167	ENSMALG00000006887	-	96	55.667
ENSMALG00000012008	-	81	47.552	ENSMALG00000014911	-	70	47.552
ENSMALG00000012008	-	85	43.011	ENSMALG00000005785	snai1a	67	43.011
ENSMALG00000012008	-	95	32.143	ENSMALG00000017304	hinfp	50	32.143
ENSMALG00000012008	-	87	67.473	ENSMALG00000001085	-	97	67.473
ENSMALG00000012008	-	81	45.695	ENSMALG00000000252	-	82	45.724
ENSMALG00000012008	-	84	41.971	ENSMALG00000000494	-	88	39.313
ENSMALG00000012008	-	88	57.209	ENSMALG00000008942	-	52	57.209
ENSMALG00000012008	-	93	57.823	ENSMALG00000005239	-	100	55.449
ENSMALG00000012008	-	82	41.603	ENSMALG00000011720	-	87	40.755
ENSMALG00000012008	-	85	36.364	ENSMALG00000008638	-	61	36.364
ENSMALG00000012008	-	85	40.458	ENSMALG00000018074	-	70	41.824
ENSMALG00000012008	-	80	37.143	ENSMALG00000013656	scrt2	57	37.143
ENSMALG00000012008	-	84	58.716	ENSMALG00000012721	-	80	58.716
ENSMALG00000012008	-	82	61.224	ENSMALG00000003423	-	99	58.935
ENSMALG00000012008	-	82	41.772	ENSMALG00000019991	-	96	41.772
ENSMALG00000012008	-	84	62.745	ENSMALG00000007051	-	99	57.051
ENSMALG00000012008	-	93	65.823	ENSMALG00000004984	-	96	65.823
ENSMALG00000012008	-	85	58.621	ENSMALG00000003975	-	97	52.920
ENSMALG00000012008	-	81	33.661	ENSMALG00000013934	prdm5	90	39.301
ENSMALG00000012008	-	84	57.047	ENSMALG00000004647	-	96	57.047
ENSMALG00000012008	-	85	33.871	ENSMALG00000022544	znf526	71	39.844
ENSMALG00000012008	-	92	55.285	ENSMALG00000007812	-	98	51.724
ENSMALG00000012008	-	91	46.316	ENSMALG00000011992	-	89	43.537
ENSMALG00000012008	-	85	39.631	ENSMALG00000014761	-	72	39.631
ENSMALG00000012008	-	84	34.080	ENSMALG00000002274	-	98	34.217
ENSMALG00000012008	-	83	42.063	ENSMALG00000012129	-	83	42.063
ENSMALG00000012008	-	97	83.223	ENSMALG00000005562	-	83	83.223
ENSMALG00000012008	-	81	53.271	ENSMALG00000013592	-	69	50.420
ENSMALG00000012008	-	94	45.783	ENSMALG00000007314	e4f1	60	45.783
ENSMALG00000012008	-	88	53.293	ENSMALG00000003906	-	93	53.293
ENSMALG00000012008	-	81	42.069	ENSMALG00000014672	gfi1ab	51	42.069
ENSMALG00000012008	-	88	46.715	ENSMALG00000007403	-	91	53.846
ENSMALG00000012008	-	88	55.426	ENSMALG00000015655	-	99	55.556
ENSMALG00000012008	-	80	39.560	ENSMALG00000005901	znf319b	72	37.470
ENSMALG00000012008	-	81	47.761	ENSMALG00000004265	-	89	47.761
ENSMALG00000012008	-	84	40.594	ENSMALG00000001010	-	68	40.594
ENSMALG00000012008	-	84	50.350	ENSMALG00000021985	-	80	48.496
ENSMALG00000012008	-	81	38.544	ENSMALG00000009834	-	70	38.516
ENSMALG00000012008	-	80	70.408	ENSMALG00000012116	-	99	70.408
ENSMALG00000012008	-	88	60.526	ENSMALG00000020889	-	99	53.704
ENSMALG00000012008	-	81	47.345	ENSMALG00000005203	-	93	47.345
ENSMALG00000012008	-	81	35.744	ENSMALG00000010693	-	62	38.421
ENSMALG00000012008	-	81	43.367	ENSMALG00000018062	-	85	42.174
ENSMALG00000012008	-	82	37.963	ENSMALG00000006709	-	90	30.168
ENSMALG00000012008	-	84	58.400	ENSMALG00000008496	-	89	58.400
ENSMALG00000012008	-	81	60.140	ENSMALG00000003448	-	98	60.140
ENSMALG00000012008	-	85	76.000	ENSMALG00000012757	-	76	76.000
ENSMALG00000012008	-	84	39.161	ENSMALG00000003588	znf236	69	39.161
ENSMALG00000012008	-	80	37.696	ENSMALG00000004996	-	77	37.696
ENSMALG00000012008	-	88	48.402	ENSMALG00000000710	-	66	48.402
ENSMALG00000012008	-	85	53.425	ENSMALG00000011493	-	83	53.425
ENSMALG00000012008	-	85	42.254	ENSMALG00000004034	gfi1b	63	42.254
ENSMALG00000012008	-	81	34.742	ENSMALG00000021172	patz1	54	34.742
ENSMALG00000012008	-	84	52.577	ENSMALG00000005554	-	95	47.500
ENSMALG00000012008	-	88	41.026	ENSMALG00000012056	-	97	36.203
ENSMALG00000012008	-	82	46.341	ENSMALG00000003294	-	100	46.341
ENSMALG00000012008	-	85	75.000	ENSMALG00000012043	-	98	75.000
ENSMALG00000012008	-	84	62.025	ENSMALG00000019139	-	95	54.430
ENSMALG00000012008	-	81	42.373	ENSMALG00000005342	wt1a	50	42.373
ENSMALG00000012008	-	88	55.000	ENSMALG00000004200	-	52	55.000
ENSMALG00000012008	-	96	38.806	ENSMALG00000021318	snai2	85	38.806
ENSMALG00000012008	-	81	46.333	ENSMALG00000011756	-	60	44.483
ENSMALG00000012008	-	81	47.826	ENSMALG00000002956	-	95	47.826
ENSMALG00000012008	-	84	49.754	ENSMALG00000010369	-	84	49.754
ENSMALG00000012008	-	81	71.970	ENSMALG00000004579	-	95	61.576
ENSMALG00000012008	-	88	53.049	ENSMALG00000001487	-	93	54.012
ENSMALG00000012008	-	83	50.000	ENSMALG00000010700	-	94	50.000
ENSMALG00000012008	-	85	37.432	ENSMALG00000011860	-	57	37.432
ENSMALG00000012008	-	84	41.538	ENSMALG00000006454	zbtb47b	86	39.791
ENSMALG00000012008	-	96	55.160	ENSMALG00000004216	-	92	55.160
ENSMALG00000012008	-	80	37.647	ENSMALG00000012704	scrt1b	56	37.647
ENSMALG00000012008	-	84	36.449	ENSMALG00000011969	-	77	35.401
ENSMALG00000012008	-	80	44.643	ENSMALG00000012856	-	52	44.643
ENSMALG00000012008	-	83	40.360	ENSMALG00000008786	-	89	40.360

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000012008	-	81	50.234	ENSG00000267041	ZNF850	89	50.234	Homo_sapiens
ENSMALG00000012008	-	81	38.947	ENSAPOG00000022113	-	82	37.984	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012008	-	85	56.024	ENSAPOG00000003666	-	97	54.660	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012008	-	96	37.562	ENSAPOG00000008386	-	97	37.811	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012008	-	83	36.795	ENSAPOG00000004417	-	96	36.795	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012008	-	83	57.762	ENSAPOG00000004628	-	99	58.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012008	-	83	40.000	ENSAPOG00000007596	-	91	40.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012008	-	83	40.411	ENSAPOG00000007629	-	93	40.411	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012008	-	85	51.852	ENSAMEG00000007611	-	100	54.639	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000012008	-	85	41.935	ENSACIG00000023313	-	91	40.690	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012008	-	87	53.687	ENSACIG00000013604	-	100	53.687	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012008	-	83	51.010	ENSACIG00000019710	-	75	51.010	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012008	-	82	41.216	ENSACIG00000006377	-	68	41.216	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012008	-	88	59.167	ENSACIG00000016932	-	62	59.167	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012008	-	80	40.878	ENSACIG00000021986	-	91	40.878	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012008	-	97	52.959	ENSACIG00000006172	-	99	52.959	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012008	-	86	37.477	ENSAOCG00000001341	-	95	37.477	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012008	-	81	38.737	ENSAOCG00000012653	-	82	38.259	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012008	-	84	38.415	ENSAOCG00000022283	-	90	38.415	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012008	-	94	55.298	ENSAOCG00000022675	-	96	55.298	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012008	-	81	40.870	ENSAOCG00000004559	-	88	40.870	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012008	-	84	39.048	ENSAOCG00000001615	-	87	39.048	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012008	-	85	41.438	ENSAOCG00000004564	-	88	41.438	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012008	-	90	43.201	ENSAOCG00000022079	-	85	45.146	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012008	-	82	41.379	ENSAOCG00000001327	-	90	41.379	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012008	-	97	46.257	ENSAPEG00000012926	-	91	48.703	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012008	-	88	55.172	ENSAPEG00000004189	-	87	50.000	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012008	-	85	39.394	ENSAPEG00000002888	-	99	39.394	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012008	-	99	54.400	ENSAPEG00000016118	-	99	54.491	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012008	-	85	38.486	ENSAPEG00000002661	-	96	38.486	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012008	-	82	36.029	ENSAPEG00000012599	-	96	36.029	Amphiprion_percula
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ENSMALG00000012008	-	85	41.812	ENSAPEG00000002558	-	88	41.812	Amphiprion_percula
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