EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000012056 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19069 bases
Position: chrKV884948.1:1333970-1353038
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000017341	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-47	1	9
ENSMALP00000017341	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-47	2	9
ENSMALP00000017341	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-47	3	9
ENSMALP00000017341	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-47	4	9
ENSMALP00000017341	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-47	5	9
ENSMALP00000017341	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-47	6	9
ENSMALP00000017341	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-47	7	9
ENSMALP00000017341	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-47	8	9
ENSMALP00000017341	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-47	9	9
ENSMALP00000017353	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-41	1	7
ENSMALP00000017353	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-41	2	7
ENSMALP00000017353	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-41	3	7
ENSMALP00000017353	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-41	4	7
ENSMALP00000017353	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-41	5	7
ENSMALP00000017353	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-41	6	7
ENSMALP00000017353	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-41	7	7
ENSMALP00000017341	zf-met	PF12874.7	4.5e-13	1	2
ENSMALP00000017341	zf-met	PF12874.7	4.5e-13	2	2
ENSMALP00000017353	zf-met	PF12874.7	1.2e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000017694	-	1266	-	ENSMALP00000017353	421 (aa)	-	-
ENSMALT00000017682	-	1602	-	ENSMALP00000017341	533 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000012056	-	79	47.945	ENSMALG00000012704	scrt1b	54	44.048
ENSMALG00000012056	-	97	39.100	ENSMALG00000005239	-	90	41.880
ENSMALG00000012056	-	98	47.059	ENSMALG00000006492	znf341	54	45.098
ENSMALG00000012056	-	80	35.165	ENSMALG00000022522	-	50	33.198
ENSMALG00000012056	-	99	44.000	ENSMALG00000011992	-	97	42.857
ENSMALG00000012056	-	81	35.616	ENSMALG00000001010	-	59	36.893
ENSMALG00000012056	-	97	47.727	ENSMALG00000020889	-	97	51.852
ENSMALG00000012056	-	97	41.011	ENSMALG00000004579	-	97	41.011
ENSMALG00000012056	-	95	47.619	ENSMALG00000015655	-	98	48.148
ENSMALG00000012056	-	99	38.144	ENSMALG00000021084	-	61	52.174
ENSMALG00000012056	-	96	35.371	ENSMALG00000008786	-	94	40.444
ENSMALG00000012056	-	97	47.111	ENSMALG00000005203	-	99	50.549
ENSMALG00000012056	-	99	41.124	ENSMALG00000004647	-	98	42.692
ENSMALG00000012056	-	99	39.416	ENSMALG00000010693	-	70	39.416
ENSMALG00000012056	-	79	41.096	ENSMALG00000013656	scrt2	71	41.096
ENSMALG00000012056	-	98	42.949	ENSMALG00000003906	-	99	42.949
ENSMALG00000012056	-	97	38.413	ENSMALG00000011756	-	64	35.467
ENSMALG00000012056	-	95	42.857	ENSMALG00000014761	-	88	41.667
ENSMALG00000012056	-	97	53.488	ENSMALG00000011493	-	83	53.488
ENSMALG00000012056	-	96	54.762	ENSMALG00000007812	-	96	54.762
ENSMALG00000012056	-	80	37.168	ENSMALG00000005785	snai1a	54	42.466
ENSMALG00000012056	-	81	32.609	ENSMALG00000021172	patz1	60	32.609
ENSMALG00000012056	-	98	46.367	ENSMALG00000011720	-	95	46.367
ENSMALG00000012056	-	96	35.556	ENSMALG00000006709	-	89	35.556
ENSMALG00000012056	-	99	37.698	ENSMALG00000012155	-	96	47.059
ENSMALG00000012056	-	96	38.516	ENSMALG00000003423	-	97	38.516
ENSMALG00000012056	-	98	41.228	ENSMALG00000022544	znf526	60	43.182
ENSMALG00000012056	-	88	38.144	ENSMALG00000002274	-	99	38.144
ENSMALG00000012056	-	93	50.000	ENSMALG00000007051	-	99	46.890
ENSMALG00000012056	-	86	40.152	ENSMALG00000014672	gfi1ab	52	39.306
ENSMALG00000012056	-	95	32.609	ENSMALG00000019991	-	96	37.097
ENSMALG00000012056	-	98	58.537	ENSMALG00000000494	-	91	42.629
ENSMALG00000012056	-	98	55.263	ENSMALG00000003975	-	96	55.263
ENSMALG00000012056	-	96	50.455	ENSMALG00000010369	-	90	49.537
ENSMALG00000012056	-	89	35.874	ENSMALG00000016121	-	52	35.874
ENSMALG00000012056	-	97	41.237	ENSMALG00000004413	-	96	49.153
ENSMALG00000012056	-	99	44.771	ENSMALG00000014911	-	67	48.297
ENSMALG00000012056	-	98	37.828	ENSMALG00000007403	-	88	44.318
ENSMALG00000012056	-	96	59.459	ENSMALG00000011860	-	58	59.459
ENSMALG00000012056	-	98	37.000	ENSMALG00000001085	-	97	37.000
ENSMALG00000012056	-	81	35.268	ENSMALG00000004996	-	86	33.750
ENSMALG00000012056	-	95	37.778	ENSMALG00000006454	zbtb47b	85	37.778
ENSMALG00000012056	-	97	36.203	ENSMALG00000012008	-	88	41.026
ENSMALG00000012056	-	81	46.429	ENSMALG00000018277	-	95	46.429
ENSMALG00000012056	-	97	39.862	ENSMALG00000018074	-	72	47.619
ENSMALG00000012056	-	89	53.165	ENSMALG00000008496	-	77	53.165
ENSMALG00000012056	-	98	53.488	ENSMALG00000000252	-	95	53.488
ENSMALG00000012056	-	99	34.081	ENSMALG00000008638	-	73	34.081
ENSMALG00000012056	-	95	50.000	ENSMALG00000019558	si:dkey-89b17.4	68	33.981
ENSMALG00000012056	-	98	40.371	ENSMALG00000001487	-	97	42.647
ENSMALG00000012056	-	96	39.320	ENSMALG00000012116	-	99	40.449
ENSMALG00000012056	-	98	37.912	ENSMALG00000005562	-	72	40.741
ENSMALG00000012056	-	96	40.517	ENSMALG00000004279	-	85	40.517
ENSMALG00000012056	-	97	42.599	ENSMALG00000012043	-	97	40.936
ENSMALG00000012056	-	97	30.925	ENSMALG00000019842	ZNF319	92	35.556
ENSMALG00000012056	-	98	32.308	ENSMALG00000013934	prdm5	75	33.333
ENSMALG00000012056	-	98	46.000	ENSMALG00000012129	-	97	46.000
ENSMALG00000012056	-	98	45.024	ENSMALG00000010959	-	95	45.972
ENSMALG00000012056	-	81	43.750	ENSMALG00000002956	-	97	43.750
ENSMALG00000012056	-	96	37.553	ENSMALG00000005554	-	93	35.349
ENSMALG00000012056	-	98	39.297	ENSMALG00000006887	-	99	46.429
ENSMALG00000012056	-	97	42.857	ENSMALG00000012721	-	91	39.759
ENSMALG00000012056	-	83	36.691	ENSMALG00000021318	snai2	85	36.620
ENSMALG00000012056	-	98	48.052	ENSMALG00000003588	znf236	76	48.052
ENSMALG00000012056	-	96	49.587	ENSMALG00000005696	-	54	49.587
ENSMALG00000012056	-	97	34.118	ENSMALG00000013321	-	78	30.141
ENSMALG00000012056	-	99	60.417	ENSMALG00000013323	-	91	60.417
ENSMALG00000012056	-	97	38.889	ENSMALG00000004984	-	91	42.157
ENSMALG00000012056	-	97	40.580	ENSMALG00000003294	-	100	44.601
ENSMALG00000012056	-	98	38.438	ENSMALG00000004216	-	66	41.870
ENSMALG00000012056	-	82	32.362	ENSMALG00000005901	znf319b	75	34.694
ENSMALG00000012056	-	96	44.545	ENSMALG00000019139	-	82	57.895
ENSMALG00000012056	-	95	36.735	ENSMALG00000011969	-	85	33.702
ENSMALG00000012056	-	90	48.837	ENSMALG00000012757	-	98	48.837
ENSMALG00000012056	-	95	40.288	ENSMALG00000004034	gfi1b	77	39.080
ENSMALG00000012056	-	96	52.459	ENSMALG00000012856	-	85	52.459
ENSMALG00000012056	-	99	43.723	ENSMALG00000018062	-	75	39.227
ENSMALG00000012056	-	94	37.778	ENSMALG00000012840	-	51	37.778
ENSMALG00000012056	-	81	45.946	ENSMALG00000013592	-	78	45.946
ENSMALG00000012056	-	90	41.250	ENSMALG00000007314	e4f1	56	43.529
ENSMALG00000012056	-	90	43.284	ENSMALG00000000710	-	77	43.284
ENSMALG00000012056	-	82	59.459	ENSMALG00000008930	-	96	35.664
ENSMALG00000012056	-	98	38.750	ENSMALG00000009834	-	84	32.884
ENSMALG00000012056	-	97	40.670	ENSMALG00000010700	-	93	45.882
ENSMALG00000012056	-	96	53.659	ENSMALG00000021985	-	88	40.164
ENSMALG00000012056	-	96	47.015	ENSMALG00000003448	-	99	45.251

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000012056	-	97	32.267	ENSAPOG00000005023	-	87	35.685	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012056	-	97	35.714	ENSACIG00000016117	-	85	39.080	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012056	-	83	40.404	ENSACIG00000013946	-	69	40.404	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012056	-	81	58.974	ENSACIG00000008611	-	51	58.974	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012056	-	96	44.000	ENSAPEG00000010602	-	88	40.248	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012056	-	98	37.462	ENSBTAG00000053591	-	99	36.658	Bos_taurus
ENSMALG00000012056	-	98	43.478	ENSCING00000021875	-	97	53.488	Ciona_intestinalis
ENSMALG00000012056	-	97	36.364	ENSCING00000022017	-	94	45.763	Ciona_intestinalis
ENSMALG00000012056	-	97	33.333	ENSCING00000024222	-	95	37.500	Ciona_intestinalis
ENSMALG00000012056	-	86	34.848	ENSCSAVG00000009217	-	100	35.907	Ciona_savignyi
ENSMALG00000012056	-	98	60.526	ENSCVAG00000002305	-	86	60.526	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012056	-	96	42.105	ENSCVAG00000011469	-	93	42.544	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012056	-	96	39.306	ENSCVAG00000012216	-	89	39.564	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012056	-	99	44.444	ENSCVAG00000002488	-	85	44.444	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012056	-	98	39.293	ENSCVAG00000020119	-	79	40.088	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012056	-	97	44.269	ENSCVAG00000009103	-	94	41.606	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012056	-	98	40.171	ENSCVAG00000001369	-	86	39.294	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012056	-	99	40.331	ENSCVAG00000003428	-	100	40.331	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012056	-	98	43.636	ENSCVAG00000006460	-	87	43.636	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012056	-	97	41.320	ENSCVAG00000000227	-	72	41.320	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012056	-	92	42.714	ENSCVAG00000000419	-	95	38.571	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012056	-	96	63.158	ENSCVAG00000011213	-	99	48.649	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012056	-	80	39.726	FBgn0038765	CG4424	63	35.211	Drosophila_melanogaster
ENSMALG00000012056	-	98	40.194	ENSEBUG00000008272	-	66	44.152	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000012056	-	96	40.317	ENSEBUG00000011751	-	71	44.574	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000012056	-	96	42.943	ENSEBUG00000008273	-	82	45.481	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000012056	-	98	40.141	ENSEBUG00000005785	-	70	41.638	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000012056	-	96	42.614	ENSEBUG00000005099	-	68	42.614	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000012056	-	96	47.742	ENSEBUG00000014227	-	53	49.727	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000012056	-	99	38.781	ENSEBUG00000006092	-	63	46.117	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000012056	-	98	31.026	ENSEBUG00000009436	-	93	38.596	Eptatretus_burgeri
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ENSMALG00000012056	-	98	46.222	ENSXMAG00000026295	-	88	56.061	Xiphophorus_maculatus
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