EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000012129 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5901 bases
Position: chrKV884948.1:1361263-1367163
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000017381	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-35	1	6
ENSMALP00000017381	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-35	2	6
ENSMALP00000017381	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-35	3	6
ENSMALP00000017381	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-35	4	6
ENSMALP00000017381	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-35	5	6
ENSMALP00000017381	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-35	6	6
ENSMALP00000017381	zf-met	PF12874.7	4.4e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000017722	-	1053	-	ENSMALP00000017381	350 (aa)	-	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000012129	-	80	44.978	ENSMALG00000021985	-	80	44.978
ENSMALG00000012129	-	72	31.073	ENSMALG00000006800	-	54	31.073
ENSMALG00000012129	-	88	42.798	ENSMALG00000008786	-	87	42.683
ENSMALG00000012129	-	74	48.000	ENSMALG00000012116	-	95	48.000
ENSMALG00000012129	-	80	40.722	ENSMALG00000014761	-	64	40.722
ENSMALG00000012129	-	71	43.925	ENSMALG00000021084	-	81	36.620
ENSMALG00000012129	-	80	48.421	ENSMALG00000011992	-	91	48.421
ENSMALG00000012129	-	71	42.353	ENSMALG00000004034	gfi1b	56	42.353
ENSMALG00000012129	-	63	46.429	ENSMALG00000013592	-	91	44.915
ENSMALG00000012129	-	83	42.128	ENSMALG00000001085	-	93	43.511
ENSMALG00000012129	-	90	41.711	ENSMALG00000000710	-	81	38.272
ENSMALG00000012129	-	89	48.230	ENSMALG00000001487	-	99	48.230
ENSMALG00000012129	-	75	34.426	ENSMALG00000013321	-	67	33.471
ENSMALG00000012129	-	93	47.826	ENSMALG00000013323	-	96	42.254
ENSMALG00000012129	-	92	42.991	ENSMALG00000010369	-	90	42.991
ENSMALG00000012129	-	94	36.797	ENSMALG00000008638	-	68	36.797
ENSMALG00000012129	-	89	44.262	ENSMALG00000018062	-	87	44.262
ENSMALG00000012129	-	81	41.423	ENSMALG00000009834	-	71	39.683
ENSMALG00000012129	-	92	45.455	ENSMALG00000008930	-	78	45.455
ENSMALG00000012129	-	93	42.259	ENSMALG00000003906	-	99	42.259
ENSMALG00000012129	-	76	34.010	ENSMALG00000021172	patz1	53	34.010
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ENSMALG00000012129	-	89	41.818	ENSMALG00000012757	-	91	41.818
ENSMALG00000012129	-	85	41.139	ENSMALG00000007403	-	87	40.336
ENSMALG00000012129	-	76	35.909	ENSMALG00000019991	-	96	36.652
ENSMALG00000012129	-	92	52.800	ENSMALG00000014911	-	80	52.800
ENSMALG00000012129	-	90	44.444	ENSMALG00000007051	-	99	44.444
ENSMALG00000012129	-	91	44.444	ENSMALG00000012721	-	94	44.444
ENSMALG00000012129	-	62	35.065	ENSMALG00000004265	-	83	35.065
ENSMALG00000012129	-	89	48.551	ENSMALG00000019254	-	72	48.551
ENSMALG00000012129	-	93	42.460	ENSMALG00000005562	-	85	42.460
ENSMALG00000012129	-	90	41.463	ENSMALG00000000252	-	93	45.575
ENSMALG00000012129	-	71	36.538	ENSMALG00000012704	scrt1b	51	36.538
ENSMALG00000012129	-	77	46.715	ENSMALG00000003448	-	98	46.715
ENSMALG00000012129	-	77	32.364	ENSMALG00000019842	ZNF319	89	34.646
ENSMALG00000012129	-	76	45.614	ENSMALG00000006492	znf341	55	45.614
ENSMALG00000012129	-	95	43.820	ENSMALG00000000494	-	83	43.820
ENSMALG00000012129	-	83	45.402	ENSMALG00000004647	-	95	49.010
ENSMALG00000012129	-	97	42.471	ENSMALG00000007812	-	98	42.471
ENSMALG00000012129	-	61	49.333	ENSMALG00000002956	-	77	45.977
ENSMALG00000012129	-	83	57.762	ENSMALG00000011969	-	78	57.762
ENSMALG00000012129	-	73	36.816	ENSMALG00000004996	-	72	36.816
ENSMALG00000012129	-	74	44.358	ENSMALG00000004984	-	95	44.622
ENSMALG00000012129	-	60	31.250	ENSMALG00000013521	-	68	31.250
ENSMALG00000012129	-	74	43.966	ENSMALG00000012155	-	97	41.739
ENSMALG00000012129	-	73	44.920	ENSMALG00000010700	-	87	44.920
ENSMALG00000012129	-	92	47.973	ENSMALG00000008942	-	73	47.973
ENSMALG00000012129	-	94	49.242	ENSMALG00000003975	-	92	46.667
ENSMALG00000012129	-	77	31.271	ENSMALG00000005901	znf319b	72	35.036
ENSMALG00000012129	-	84	46.635	ENSMALG00000005203	-	93	46.635
ENSMALG00000012129	-	97	41.603	ENSMALG00000012043	-	99	44.019
ENSMALG00000012129	-	97	46.000	ENSMALG00000012056	-	98	46.000
ENSMALG00000012129	-	79	43.810	ENSMALG00000003588	znf236	60	44.860
ENSMALG00000012129	-	73	50.265	ENSMALG00000020889	-	96	46.259
ENSMALG00000012129	-	76	43.602	ENSMALG00000003423	-	99	43.602
ENSMALG00000012129	-	68	46.739	ENSMALG00000018277	-	99	46.739
ENSMALG00000012129	-	74	43.011	ENSMALG00000010959	-	94	45.000
ENSMALG00000012129	-	74	48.936	ENSMALG00000004216	-	61	47.982
ENSMALG00000012129	-	79	47.368	ENSMALG00000003294	-	99	47.368
ENSMALG00000012129	-	80	39.662	ENSMALG00000013934	prdm5	73	39.662
ENSMALG00000012129	-	81	45.714	ENSMALG00000005239	-	95	45.604
ENSMALG00000012129	-	98	41.667	ENSMALG00000011720	-	100	38.854
ENSMALG00000012129	-	91	46.400	ENSMALG00000018074	-	87	46.400
ENSMALG00000012129	-	93	38.537	ENSMALG00000015655	-	99	45.490
ENSMALG00000012129	-	83	42.063	ENSMALG00000012008	-	83	42.063
ENSMALG00000012129	-	93	44.690	ENSMALG00000019139	-	98	44.690
ENSMALG00000012129	-	70	33.981	ENSMALG00000001010	-	60	33.981
ENSMALG00000012129	-	79	40.773	ENSMALG00000011860	-	56	40.773
ENSMALG00000012129	-	84	31.148	ENSMALG00000019558	si:dkey-89b17.4	70	31.148
ENSMALG00000012129	-	73	42.708	ENSMALG00000012856	-	55	42.708
ENSMALG00000012129	-	72	37.500	ENSMALG00000013656	scrt2	50	37.500
ENSMALG00000012129	-	75	43.956	ENSMALG00000004579	-	94	40.945
ENSMALG00000012129	-	91	49.550	ENSMALG00000008496	-	98	49.550
ENSMALG00000012129	-	90	34.286	ENSMALG00000022544	znf526	53	34.286
ENSMALG00000012129	-	73	43.825	ENSMALG00000011756	-	59	43.825
ENSMALG00000012129	-	76	39.474	ENSMALG00000006454	zbtb47b	84	38.725
ENSMALG00000012129	-	90	37.209	ENSMALG00000021318	snai2	82	37.209
ENSMALG00000012129	-	75	43.333	ENSMALG00000005554	-	94	40.609
ENSMALG00000012129	-	82	31.818	ENSMALG00000002274	-	98	31.818
ENSMALG00000012129	-	75	42.604	ENSMALG00000004279	-	75	44.144
ENSMALG00000012129	-	77	40.120	ENSMALG00000011493	-	75	37.427
ENSMALG00000012129	-	75	47.525	ENSMALG00000006887	-	91	47.525
ENSMALG00000012129	-	76	49.162	ENSMALG00000004413	-	98	49.007

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000012129	-	75	39.286	ENSAPOG00000013499	-	67	39.286	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012129	-	73	39.496	ENSAPOG00000013493	-	79	39.496	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012129	-	96	45.817	ENSAPOG00000001054	-	98	45.817	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012129	-	78	51.613	ENSAPOG00000020116	-	67	51.613	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012129	-	83	54.762	ENSAPOG00000018586	-	79	54.762	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012129	-	67	37.698	ENSAPOG00000018492	-	71	37.698	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012129	-	80	42.174	ENSACIG00000023794	-	76	38.628	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012129	-	94	44.195	ENSACIG00000010647	-	99	47.959	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012129	-	80	46.429	ENSACIG00000022293	-	95	46.429	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012129	-	95	46.094	ENSACIG00000004041	-	99	46.094	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012129	-	76	63.953	ENSACIG00000007034	-	71	63.953	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012129	-	93	39.286	ENSAOCG00000020624	-	86	39.286	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012129	-	98	44.815	ENSAOCG00000022459	-	97	45.418	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012129	-	97	45.038	ENSAOCG00000015369	-	98	49.490	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012129	-	92	35.669	ENSAOCG00000013578	-	95	40.458	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012129	-	71	37.273	ENSAOCG00000010954	-	57	37.273	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012129	-	80	85.714	ENSAOCG00000012903	-	78	85.714	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012129	-	79	47.660	ENSAOCG00000013934	-	59	47.660	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012129	-	92	46.535	ENSAOCG00000013951	-	77	41.139	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012129	-	91	38.246	ENSAOCG00000019475	-	83	39.298	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012129	-	91	45.344	ENSAOCG00000018484	-	94	46.970	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012129	-	83	54.422	ENSAPEG00000018471	-	79	54.422	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012129	-	97	52.542	ENSAPEG00000008020	-	97	49.600	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012129	-	75	37.847	ENSAPEG00000005678	-	81	40.385	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012129	-	75	38.246	ENSAPEG00000016462	-	67	39.298	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012129	-	94	46.215	ENSAPEG00000012236	-	71	46.215	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012129	-	92	46.040	ENSAPEG00000012229	-	67	46.040	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012129	-	80	85.714	ENSAPEG00000018460	-	78	85.714	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012129	-	92	44.792	ENSAPEG00000011020	-	96	49.143	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012129	-	87	42.254	ENSAPEG00000009515	-	99	39.216	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012129	-	91	46.215	ENSAPEG00000013031	-	97	46.183	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012129	-	78	47.619	ENSATEG00000007325	-	87	44.388	Anabas_testudineus
ENSMALG00000012129	-	80	47.059	ENSATEG00000005519	-	94	46.250	Anabas_testudineus
ENSMALG00000012129	-	92	52.529	ENSATEG00000010560	-	99	52.529	Anabas_testudineus
ENSMALG00000012129	-	74	46.639	ENSACLG00000022505	-	96	41.818	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000012129	-	81	44.633	ENSACLG00000006697	-	70	43.000	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000012129	-	73	39.916	ENSACLG00000017941	-	64	39.916	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000012129	-	92	46.383	ENSACLG00000025251	-	98	45.489	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000012129	-	93	45.020	ENSACLG00000024957	-	98	45.020	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000012129	-	96	56.877	ENSACLG00000006702	-	77	56.877	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000012129	-	92	46.215	ENSACLG00000024491	-	97	46.215	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000012129	-	82	83.663	ENSCSEG00000019029	-	96	77.209	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000012129	-	81	39.303	ENSCSEG00000005983	-	94	40.217	Cynoglossus_semilaevis
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ENSMALG00000012129	-	95	51.799	ENSSPAG00000022865	-	98	47.791	Stegastes_partitus
ENSMALG00000012129	-	97	40.780	ENSSPAG00000020165	-	99	46.215	Stegastes_partitus
ENSMALG00000012129	-	73	40.299	ENSSPAG00000005402	-	76	37.367	Stegastes_partitus
ENSMALG00000012129	-	93	43.874	ENSSPAG00000007454	-	96	43.874	Stegastes_partitus
ENSMALG00000012129	-	97	49.004	ENSSPAG00000007231	-	99	47.410	Stegastes_partitus
ENSMALG00000012129	-	76	61.607	ENSTRUG00000022076	-	80	67.179	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000012129	-	77	41.880	ENSTRUG00000024073	-	63	41.880	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000012129	-	82	46.073	ENSTNIG00000018984	-	99	46.188	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000012129	-	77	46.400	ENSXETG00000017175	-	100	46.400	Xenopus_tropicalis
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ENSMALG00000012129	-	92	50.000	ENSXCOG00000007981	-	98	40.079	Xiphophorus_couchianus
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ENSMALG00000012129	-	92	40.339	ENSXCOG00000007368	-	93	47.857	Xiphophorus_couchianus
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ENSMALG00000012129	-	81	72.289	ENSXCOG00000019401	-	99	66.084	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000012129	-	74	44.393	ENSXCOG00000019481	-	81	44.393	Xiphophorus_couchianus
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ENSMALG00000012129	-	80	46.541	ENSXCOG00000003451	-	92	47.561	Xiphophorus_couchianus
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ENSMALG00000012129	-	78	36.410	ENSXCOG00000013870	-	72	36.410	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000012129	-	96	51.196	ENSXMAG00000024433	-	100	51.196	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	91	51.429	ENSXMAG00000022511	-	84	51.429	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	92	48.309	ENSXMAG00000022418	-	94	51.634	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	81	57.721	ENSXMAG00000022214	-	78	57.721	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	92	40.826	ENSXMAG00000023875	-	96	49.693	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	80	76.512	ENSXMAG00000024684	-	74	76.512	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	92	47.982	ENSXMAG00000022807	-	99	49.038	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	75	46.552	ENSXMAG00000019797	-	82	46.552	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	87	37.979	ENSXMAG00000024393	-	66	37.979	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	72	38.043	ENSXMAG00000026531	-	78	38.043	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	95	40.909	ENSXMAG00000025241	-	97	42.537	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	93	39.552	ENSXMAG00000022711	-	95	43.556	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	74	43.689	ENSXMAG00000013144	-	67	36.604	Xiphophorus_maculatus
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ENSMALG00000012129	-	93	50.450	ENSXMAG00000019638	-	93	50.450	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	75	41.951	ENSXMAG00000026568	-	98	38.049	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	91	38.750	ENSXMAG00000028351	-	75	33.333	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	80	46.829	ENSXMAG00000024693	-	98	44.615	Xiphophorus_maculatus
ENSMALG00000012129	-	77	37.500	ENSXMAG00000021009	-	56	42.751	Xiphophorus_maculatus
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ENSMALG00000012129	-	91	51.570	ENSXMAG00000023130	-	98	46.614	Xiphophorus_maculatus