EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000012595 (Gene tree)
Gene ID: 109974342
Gene Symbol: srprb
Alias: wu:fk57h10|zgc:111820|zgc:92746
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2719 bases
Position: chrKV885016.1:622475-625193
Accession: 109974342
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000018063	MMR_HSR1	PF01926.23	4.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000018412	-	816	XM_020624497	ENSMALP00000018063	271 (aa)	XP_020480153	UPI0009B48DA7

Gene Model

Click here to download ENSMALG00000012595's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
malb03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMALG00000012595's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000012595	srprb	63	30.409	ENSMALG00000004269	-	88	30.409
ENSMALG00000012595	srprb	59	31.250	ENSMALG00000017258	arf2b	83	31.250

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000012595	srprb	100	87.004	ENSAPOG00000021219	srprb	100	87.004	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012595	srprb	97	87.218	ENSACIG00000014621	srprb	100	87.218	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012595	srprb	100	87.004	ENSAOCG00000017265	srprb	100	87.004	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012595	srprb	100	87.004	ENSAPEG00000024541	srprb	88	87.004	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012595	srprb	100	84.727	ENSATEG00000014016	srprb	100	84.727	Anabas_testudineus
ENSMALG00000012595	srprb	100	86.957	ENSACLG00000016748	srprb	100	86.957	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000012595	srprb	97	69.549	ENSAMXG00000044118	srprb	100	69.549	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000012595	srprb	100	81.455	ENSCSEG00000017194	srprb	100	81.455	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000012595	srprb	97	85.714	ENSCVAG00000004221	srprb	100	85.714	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012595	srprb	92	73.307	ENSDARG00000030949	srprb	94	73.307	Danio_rerio
ENSMALG00000012595	srprb	92	82.731	ENSELUG00000009740	srprb	92	82.731	Esox_lucius
ENSMALG00000012595	srprb	97	88.346	ENSFHEG00000006004	srprb	100	88.346	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000012595	srprb	99	82.222	ENSGMOG00000002081	srprb	100	82.222	Gadus_morhua
ENSMALG00000012595	srprb	96	85.171	ENSGAFG00000012593	srprb	99	85.171	Gambusia_affinis
ENSMALG00000012595	srprb	99	85.609	ENSGACG00000009891	srprb	100	85.609	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000012595	srprb	100	86.957	ENSHBUG00000002145	srprb	100	86.957	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000012595	srprb	98	81.579	ENSHCOG00000007732	srprb	99	81.579	Hippocampus_comes
ENSMALG00000012595	srprb	97	65.543	ENSIPUG00000004177	srprb	100	65.543	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000012595	srprb	97	86.466	ENSKMAG00000020736	srprb	100	86.466	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000012595	srprb	100	85.818	ENSLBEG00000021483	srprb	100	85.818	Labrus_bergylta
ENSMALG00000012595	srprb	91	74.089	ENSLOCG00000009740	srprb	91	69.373	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000012595	srprb	100	89.091	ENSMAMG00000011876	srprb	100	89.091	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000012595	srprb	94	88.417	ENSMZEG00005016621	srprb	100	88.417	Maylandia_zebra
ENSMALG00000012595	srprb	99	85.978	ENSMMOG00000012550	srprb	100	85.978	Mola_mola
ENSMALG00000012595	srprb	75	86.408	ENSNBRG00000004699	srprb	88	86.408	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000012595	srprb	100	87.273	ENSONIG00000003788	srprb	82	87.273	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000012595	srprb	99	83.395	ENSORLG00000006430	srprb	99	83.395	Oryzias_latipes
ENSMALG00000012595	srprb	100	82.909	ENSORLG00020003413	srprb	100	82.909	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000012595	srprb	100	82.909	ENSORLG00015000166	srprb	100	82.909	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000012595	srprb	100	83.273	ENSOMEG00000012735	srprb	100	83.273	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000012595	srprb	92	72.400	ENSPKIG00000013147	srprb	95	72.400	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000012595	srprb	99	79.026	ENSPMGG00000014061	srprb	97	79.026	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000012595	srprb	96	85.551	ENSPFOG00000011347	srprb	95	85.551	Poecilia_formosa
ENSMALG00000012595	srprb	94	87.209	ENSPLAG00000001156	srprb	100	87.209	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000012595	srprb	94	86.434	ENSPMEG00000012169	srprb	100	86.434	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000012595	srprb	94	85.659	ENSPREG00000001449	srprb	100	85.659	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000012595	srprb	100	86.957	ENSPNYG00000005911	srprb	100	86.957	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000012595	srprb	93	74.308	ENSPNAG00000009983	srprb	95	74.308	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000012595	srprb	94	73.438	ENSSFOG00015019355	srprb	96	73.438	Scleropages_formosus
ENSMALG00000012595	srprb	100	87.273	ENSSMAG00000013202	srprb	100	87.273	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000012595	srprb	100	89.455	ENSSDUG00000018746	srprb	94	89.455	Seriola_dumerili
ENSMALG00000012595	srprb	100	89.091	ENSSLDG00000020560	srprb	100	89.091	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000012595	srprb	100	86.643	ENSSPAG00000008898	srprb	100	86.643	Stegastes_partitus
ENSMALG00000012595	srprb	100	82.545	ENSTRUG00000022463	srprb	100	82.545	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000012595	srprb	95	81.609	ENSTNIG00000007725	srprb	99	81.609	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000012595	srprb	94	87.209	ENSXCOG00000012585	srprb	100	87.209	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000012595	srprb	94	86.822	ENSXMAG00000028725	srprb	100	86.822	Xiphophorus_maculatus