EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000012761 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC109956983
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9128 bases
Position: chrKV884711.1:3578393-3587520
Accession: 109956983
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000018340	MMR_HSR1	PF01926.23	3.9e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000018691	-	1293	XM_020594511	ENSMALP00000018340	431 (aa)	XP_020450167	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	61.136	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	98	60.682

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	60.909	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	98	60.455	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	90.433	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	98	90.433	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	61.609	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	98	61.609	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	89.749	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	98	89.749	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	61.136	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	98	60.455	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	91.116	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	98	91.116	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	60.909	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	98	60.227	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	91.116	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	98	91.116	Amphiprion_percula
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	61.364	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	98	60.909	Anabas_testudineus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	89.066	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	98	89.066	Anabas_testudineus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	99	59.132	ENSACAG00000028632	-	97	58.447	Anolis_carolinensis
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	60.633	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	98	60.181	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	89.977	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	98	89.977	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	80.227	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	98	80.000	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	61.036	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	98	60.586	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	80	61.080	ENSCING00000020807	-	93	61.080	Ciona_intestinalis
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	98	55.684	ENSCSAVG00000009987	-	96	55.814	Ciona_savignyi
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	59.589	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	97	59.268	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	87.016	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	93	87.129	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	61.591	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	98	61.136	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	87.927	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	98	87.927	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	61.591	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	73.469	Danio_rerio
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	81.591	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	81.591	Danio_rerio
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	81	56.901	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	95	56.901	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	99	77.854	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	98	77.854	Esox_lucius
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	60.091	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	98	59.637	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	87.699	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	98	87.699	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	91	54.613	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	54.613	Gadus_morhua
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	60.909	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	98	60.455	Gambusia_affinis
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	87.927	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	88	87.927	Gambusia_affinis
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	82	67.222	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.596	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	59	91.860	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	91.860	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	60.860	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	98	60.407	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	90.433	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	98	90.433	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	98	59.318	Hippocampus_comes
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	99	83.333	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	95	83.333	Hippocampus_comes
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	98	60.698	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.698	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	86	58.621	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	83	58.621	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	76.888	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	98	76.888	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	60.682	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	98	60.227	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	88.383	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	98	88.383	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	87.927	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	98	88.155	Labrus_bergylta
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	61.731	ENSLACG00000004899	-	98	61.731	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	99	69.655	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	96	69.655	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	99	61.468	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	96	62.069	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	99	72.831	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	97	71.918	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	98	60.880	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.417	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	90.205	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	98	90.205	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	60.407	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	98	59.955	Maylandia_zebra
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	90.205	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	98	90.205	Maylandia_zebra
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	58.277	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	97	57.859	Mola_mola
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	91.076	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	98	91.076	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	98	60.648	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.185	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	91.116	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	98	91.116	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	60.633	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	98	60.181	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	85.616	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	98	85.616	Oryzias_latipes
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	61.136	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	98	61.136	Oryzias_latipes
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	60.909	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	98	60.909	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	88.155	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	98	88.155	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	61.364	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	98	61.364	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	88.383	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	98	88.383	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	89.066	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	88.479	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	61.364	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	98	61.364	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	76.136	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	98	75.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	60.455	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	98	60.682	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	58.998	ENSPKIG00000023918	-	96	58.542	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	84.055	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	98	84.055	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	60.860	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	98	60.633	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	61.818	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	98	61.818	Poecilia_formosa
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ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	61.818	ENSPLAG00000019794	si:ch211-11k18.4	98	61.818	Poecilia_latipinna
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ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	61.818	ENSPMEG00000024198	si:ch211-11k18.4	99	61.806	Poecilia_mexicana
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ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	60.860	ENSPNYG00000017099	si:ch211-11k18.4	98	60.407	Pundamilia_nyererei
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