EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000013152 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-34d22.5
Alias: -
Full Name: si:dkey-34d22.5
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1600 bases
Position: chrKV884699.1:2359408-2361007
Accession: ZDB-GENE-131121-578
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000018827	MMR_HSR1	PF01926.23	9.5e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000019200	-	677	-	ENSMALP00000018827	222 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSMALG00000013152's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMALG00000013152's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	76	38.462	ENSMALG00000015762	rab12	64	39.241
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	96	31.776	ENSMALG00000022348	-	89	31.776
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	75	33.735	ENSMALG00000014929	rab5aa	75	33.735
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	79	40.909	ENSMALG00000006985	-	85	40.909
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	80	39.362	ENSMALG00000007664	rab9b	85	39.362
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	97	32.432	ENSMALG00000022187	rab11bb	95	32.432
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	91	32.195	ENSMALG00000004053	RAB7A	93	32.195
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	78	30.508	ENSMALG00000001189	dnajc27	64	30.508
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	97	41.743	ENSMALG00000003956	-	96	41.743
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	75	32.530	ENSMALG00000002696	rras	79	32.530
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	82	30.601	ENSMALG00000013806	rab36	76	30.601
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	71	31.210	ENSMALG00000017903	rheb	84	30.323
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	52	39.316	ENSMALG00000010254	RAP2B	96	39.231
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	76	42.262	ENSMALG00000009813	rab18a	80	42.262
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	81	38.333	ENSMALG00000015854	rab6ba	82	38.333
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	69	31.373	ENSMALG00000010781	kras	86	31.325
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	76	44.643	ENSMALG00000021928	rab15	77	44.643
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	79	41.143	ENSMALG00000012003	rab1ab	85	40.909
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	73	39.634	ENSMALG00000010549	rab41	75	39.634
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	57	33.333	ENSMALG00000018837	rabl3	56	33.333
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	82	35.676	ENSMALG00000018436	RAB29	78	35.676
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	85	36.082	ENSMALG00000012630	rab33a	86	36.082
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	89	52.020	ENSMALG00000018973	RAB39B	92	52.020
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	73	35.802	ENSMALG00000015154	rab25a	77	35.802
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	97	33.333	ENSMALG00000003050	rab11a	95	33.333
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	76	41.667	ENSMALG00000005069	rab18b	80	41.667
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	75	41.916	ENSMALG00000016038	RAB15	77	41.916
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	67	42.763	ENSMALG00000003712	zgc:101559	63	42.763
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	73	39.634	ENSMALG00000017417	rab6bb	76	39.634
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	76	30.000	ENSMALG00000022582	-	79	30.000
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	77	40.116	ENSMALG00000014727	si:dkey-16l2.16	79	40.116
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	77	31.250	ENSMALG00000013514	rab38b	79	31.250
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	77	43.275	ENSMALG00000020807	-	84	43.275
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	71	35.669	ENSMALG00000002136	rab23	73	34.416
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	78	32.184	ENSMALG00000011273	hrasb	88	32.749
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	67	40.667	ENSMALG00000022693	rab33ba	61	40.667
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	79	41.143	ENSMALG00000021129	zgc:171927	81	41.143
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	91	33.816	ENSMALG00000021949	rab11ba	93	33.816
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	68	39.869	ENSMALG00000021944	-	92	44.660
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	85	54.497	ENSMALG00000012723	RAB39B	88	54.497
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	75	32.934	ENSMALG00000005944	rabl2	71	32.934
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	52	38.793	ENSMALG00000015576	-	87	38.760
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	95	31.754	ENSMALG00000016715	rab34a	77	31.754
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	78	33.143	ENSMALG00000018499	rab34b	65	33.143
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	75	31.737	ENSMALG00000014149	rhebl1	89	31.737
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	97	33.182	ENSMALG00000004093	rab11al	95	33.182
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	96	37.327	ENSMALG00000012506	rab9a	94	37.327
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	91	32.195	ENSMALG00000016312	RAB7A	93	32.195
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	80	35.955	ENSMALG00000004112	rab25b	84	35.955
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	73	39.024	ENSMALG00000020364	-	76	39.024
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	98	35.616	ENSMALG00000022118	rab14	96	35.616
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	79	39.773	ENSMALG00000021144	rab1ba	86	39.773
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	70	30.573	ENSMALG00000012930	si:ch73-116o1.2	79	31.361
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	75	33.735	ENSMALG00000011693	rab22a	84	33.735
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	87	30.392	ENSMALG00000017553	rasl11a	77	30.392
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	76	35.119	ENSMALG00000019758	rras2	81	35.119
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	78	40.805	ENSMALG00000010438	rab30	84	40.805
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	95	36.574	ENSMALG00000015936	RAB9A	90	36.574
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	75	33.133	ENSMALG00000006052	rab5c	73	33.133
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	87	39.896	ENSMALG00000004342	rab2a	99	37.037

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	82.432	ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	82.432	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	83.784	ENSATEG00000010784	si:dkey-34d22.5	86	83.784	Anabas_testudineus
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	59.459	ENSCPBG00000011236	-	99	59.459	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	75.225	ENSCSEG00000019183	si:dkey-34d22.5	100	75.225	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	79.279	ENSCVAG00000017064	si:dkey-34d22.5	100	79.279	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	83	50.000	ENSDARG00000100379	si:dkey-34d22.2	98	50.000	Danio_rerio
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	86	62.500	ENSFALG00000001373	-	89	62.500	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	80.269	ENSFHEG00000012041	si:dkey-34d22.5	100	80.269	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	86	63.021	ENSGALG00000000994	-	90	63.021	Gallus_gallus
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	81.081	ENSGAFG00000008183	si:dkey-34d22.5	100	81.081	Gambusia_affinis
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	94	58.654	ENSGAGG00000004918	-	99	58.654	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	99	69.231	ENSHCOG00000015692	si:dkey-34d22.5	99	69.231	Hippocampus_comes
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	84.234	ENSKMAG00000012778	si:dkey-34d22.5	100	84.234	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	99	80.995	ENSLBEG00000002926	si:dkey-34d22.5	100	80.995	Labrus_bergylta
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	98	57.339	ENSLACG00000012674	si:dkey-34d22.5	99	57.339	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	98	70.507	ENSLOCG00000003467	si:dkey-34d22.5	98	70.507	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	80.180	ENSMMOG00000006846	si:dkey-34d22.5	100	80.180	Mola_mola
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	99	82.353	ENSORLG00000014099	si:dkey-34d22.5	99	82.353	Oryzias_latipes
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	99	81.900	ENSORLG00020020277	si:dkey-34d22.5	99	81.900	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	99	81.900	ENSORLG00015000142	si:dkey-34d22.5	99	81.900	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	91	84.653	ENSOMEG00000017958	si:dkey-34d22.5	99	81.900	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	97	71.296	ENSPKIG00000021209	si:dkey-34d22.5	99	71.296	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	90	63.317	ENSPSIG00000006606	-	98	63.317	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	99	79.186	ENSPMGG00000001298	-	99	79.186	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	93	60.194	ENSPCIG00000022399	-	92	60.194	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	81.982	ENSPFOG00000014499	si:dkey-34d22.5	100	81.982	Poecilia_formosa
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	81.982	ENSPLAG00000007773	si:dkey-34d22.5	100	81.982	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	81.982	ENSPMEG00000012932	si:dkey-34d22.5	100	81.982	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	89	61.929	ENSSHAG00000008520	-	88	61.929	Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	99	66.818	ENSSFOG00015012088	rab42	98	66.818	Scleropages_formosus
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	86.036	ENSSLDG00000002646	si:dkey-34d22.5	100	86.036	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	99	84.163	ENSSPAG00000012955	si:dkey-34d22.5	99	84.163	Stegastes_partitus
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	90	51.500	ENSXETG00000020622	rab39a	96	51.500	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	81.081	ENSXCOG00000008410	si:dkey-34d22.5	100	81.081	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	81.081	ENSXMAG00000029317	si:dkey-34d22.5	100	81.081	Xiphophorus_maculatus