EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000016211 (Gene tree)
Gene ID: 109964468
Gene Symbol: eefsec
Alias: zgc:123265
Full Name: eukaryotic elongation factor%2C selenocysteine-tRNA specific
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 50666 bases
Position: chrKV884777.1:238096-288761
Accession: 109964468
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000023255	GTP_EFTU	PF00009.27	3.1e-30	1	1
ENSMALP00000023274	GTP_EFTU	PF00009.27	3.4e-30	1	1
ENSMALP00000023261	GTP_EFTU	PF00009.27	3.6e-30	1	1
ENSMALP00000023255	MMR_HSR1	PF01926.23	2e-06	1	1
ENSMALP00000023261	MMR_HSR1	PF01926.23	2.3e-06	1	1
ENSMALP00000023274	MMR_HSR1	PF01926.23	2.4e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000023722	-	2572	XM_020607775	ENSMALP00000023274	579 (aa)	XP_020463431	-
ENSMALT00000023709	-	1795	-	ENSMALP00000023261	566 (aa)	-	-
ENSMALT00000023703	-	1572	-	ENSMALP00000023255	523 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSMALG00000016211's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSMALG00000016211's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.652	ENSG00000132394	EEFSEC	97	62.226	Homo_sapiens
ENSMALG00000016211	eefsec	99	89.878	ENSAPOG00000015931	eefsec	98	89.878	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000016211	eefsec	81	64.560	ENSAMEG00000015165	EEFSEC	88	63.938	Ailuropoda_melanoleuca
ENSMALG00000016211	eefsec	63	91.353	ENSACIG00000022407	eefsec	96	95.257	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	90.925	ENSAOCG00000008603	eefsec	98	90.925	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000016211	eefsec	99	90.750	ENSAPEG00000017090	eefsec	98	90.750	Amphiprion_percula
ENSMALG00000016211	eefsec	99	92.131	ENSATEG00000002753	eefsec	98	91.197	Anabas_testudineus
ENSMALG00000016211	eefsec	81	67.890	ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	67.890	Anas_platyrhynchos
ENSMALG00000016211	eefsec	99	63.919	ENSANAG00000032691	EEFSEC	97	61.720	Aotus_nancymaae
ENSMALG00000016211	eefsec	98	91.845	ENSACLG00000024565	eefsec	97	94.231	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000016211	eefsec	98	75.977	ENSAMXG00000002260	eefsec	96	74.603	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.741	ENSBTAG00000030962	EEFSEC	96	70.472	Bos_taurus
ENSMALG00000016211	eefsec	97	33.915	WBGene00008133	efsc-1	92	33.716	Caenorhabditis_elegans
ENSMALG00000016211	eefsec	99	63.553	ENSCJAG00000005387	EEFSEC	97	61.383	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000016211	eefsec	98	64.771	ENSCAFG00000004135	EEFSEC	79	62.647	Canis_familiaris
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.545	ENSCAFG00020004811	EEFSEC	97	62.647	Canis_lupus_dingo
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.056	ENSCHIG00000021838	EEFSEC	97	62.779	Capra_hircus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.385	ENSTSYG00000012922	EEFSEC	97	63.069	Carlito_syrichta
ENSMALG00000016211	eefsec	81	58.409	ENSCAPG00000000084	EEFSEC	95	56.327	Cavia_aperea
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.672	ENSCPOG00000024352	EEFSEC	93	71.429	Cavia_porcellus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.351	ENSCCAG00000031336	EEFSEC	97	62.121	Cebus_capucinus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.469	ENSCATG00000019414	EEFSEC	97	62.057	Cercocebus_atys
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.794	ENSCLAG00000006973	EEFSEC	93	71.032	Chinchilla_lanigera
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.286	ENSCSAG00000008599	EEFSEC	97	61.889	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000016211	eefsec	98	69.275	ENSCPBG00000014356	EEFSEC	86	69.187	Chrysemys_picta_bellii
ENSMALG00000016211	eefsec	98	60.116	ENSCSAVG00000002208	-	100	60.067	Ciona_savignyi
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.706	ENSCANG00000031492	EEFSEC	97	61.993	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.549	ENSCGRG00001018089	Eefsec	97	63.122	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.991	ENSCGRG00000010063	Eefsec	94	70.356	Cricetulus_griseus_crigri
ENSMALG00000016211	eefsec	99	89.403	ENSCSEG00000003008	eefsec	98	89.513	Cynoglossus_semilaevis
ENSMALG00000016211	eefsec	99	87.958	ENSCVAG00000005381	eefsec	98	87.958	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000016211	eefsec	98	78.558	ENSDARG00000004696	eefsec	98	76.977	Danio_rerio
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.750	ENSDNOG00000008925	EEFSEC	97	63.311	Dasypus_novemcinctus
ENSMALG00000016211	eefsec	81	51.481	ENSDORG00000000264	Eefsec	85	71.429	Dipodomys_ordii
ENSMALG00000016211	eefsec	98	51.267	FBgn0034627	eEFSec	95	51.346	Drosophila_melanogaster
ENSMALG00000016211	eefsec	97	55.952	ENSETEG00000007406	EEFSEC	81	62.705	Echinops_telfairi
ENSMALG00000016211	eefsec	80	75.000	ENSEBUG00000015029	eefsec	94	51.970	Eptatretus_burgeri
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.392	ENSEASG00005006786	EEFSEC	97	63.514	Equus_asinus_asinus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.392	ENSECAG00000016565	EEFSEC	97	63.514	Equus_caballus
ENSMALG00000016211	eefsec	98	82.979	ENSELUG00000016632	eefsec	96	80.423	Esox_lucius
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.328	ENSFCAG00000006153	EEFSEC	97	63.529	Felis_catus
ENSMALG00000016211	eefsec	80	68.129	ENSFALG00000007901	EEFSEC	97	66.253	Ficedula_albicollis
ENSMALG00000016211	eefsec	81	63.182	ENSFDAG00000010243	EEFSEC	97	60.612	Fukomys_damarensis
ENSMALG00000016211	eefsec	98	89.515	ENSFHEG00000007155	eefsec	98	88.133	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000016211	eefsec	98	77.778	ENSGMOG00000007705	eefsec	97	77.601	Gadus_morhua
ENSMALG00000016211	eefsec	98	69.333	ENSGALG00000038684	EEFSEC	97	67.478	Gallus_gallus
ENSMALG00000016211	eefsec	98	89.320	ENSGAFG00000021692	eefsec	98	86.842	Gambusia_affinis
ENSMALG00000016211	eefsec	98	91.279	ENSGACG00000000793	eefsec	98	90.426	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000016211	eefsec	98	68.893	ENSGAGG00000002059	EEFSEC	96	66.667	Gopherus_agassizii
ENSMALG00000016211	eefsec	85	64.642	ENSGGOG00000001445	EEFSEC	96	61.840	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000016211	eefsec	98	91.068	ENSHBUG00000008917	eefsec	99	90.684	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.543	ENSHGLG00000000094	EEFSEC	95	68.667	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.543	ENSHGLG00100011393	EEFSEC	93	63.122	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000016211	eefsec	98	85.243	ENSHCOG00000004193	eefsec	98	83.187	Hippocampus_comes
ENSMALG00000016211	eefsec	98	76.023	ENSIPUG00000017291	eefsec	98	75.337	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000016211	eefsec	81	65.525	ENSSTOG00000019802	EEFSEC	97	62.628	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	89.189	ENSKMAG00000019907	eefsec	98	88.656	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000016211	eefsec	98	90.291	ENSLBEG00000017908	eefsec	98	88.215	Labrus_bergylta
ENSMALG00000016211	eefsec	83	72.707	ENSLACG00000013137	EEFSEC	93	70.243	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000016211	eefsec	98	78.958	ENSLOCG00000014535	eefsec	96	76.543	Lepisosteus_oculatus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	63.619	ENSLAFG00000001997	EEFSEC	97	61.130	Loxodonta_africana
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.469	ENSMFAG00000042128	EEFSEC	97	62.057	Macaca_fascicularis
ENSMALG00000016211	eefsec	80	62.903	ENSMMUG00000018663	EEFSEC	97	60.124	Macaca_mulatta
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.286	ENSMNEG00000028574	EEFSEC	97	61.889	Macaca_nemestrina
ENSMALG00000016211	eefsec	82	63.371	ENSMLEG00000041771	EEFSEC	90	60.606	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000016211	eefsec	98	92.233	ENSMAMG00000023964	eefsec	98	90.052	Mastacembelus_armatus
ENSMALG00000016211	eefsec	65	90.476	ENSMZEG00005009380	eefsec	97	94.231	Maylandia_zebra
ENSMALG00000016211	eefsec	73	65.327	ENSMGAG00000007243	EEFSEC	100	65.327	Meleagris_gallopavo
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.121	ENSMAUG00000011197	Eefsec	98	68.182	Mesocricetus_auratus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.736	ENSMOCG00000017748	Eefsec	98	68.182	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000016211	eefsec	60	94.118	ENSMMOG00000021820	eefsec	96	90.602	Mola_mola
ENSMALG00000016211	eefsec	99	67.286	ENSMODG00000008034	EEFSEC	81	67.286	Monodelphis_domestica
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.613	MGP_CAROLIEiJ_G0028627	Eefsec	99	67.578	Mus_caroli
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.736	ENSMUSG00000033216	Eefsec	99	67.578	Mus_musculus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.985	MGP_PahariEiJ_G0022366	Eefsec	99	67.578	Mus_pahari
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.736	MGP_SPRETEiJ_G0029640	Eefsec	99	67.578	Mus_spretus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.364	ENSMPUG00000017340	EEFSEC	93	62.081	Mustela_putorius_furo
ENSMALG00000016211	eefsec	81	62.613	ENSMLUG00000004261	EEFSEC	97	59.717	Myotis_lucifugus
ENSMALG00000016211	eefsec	98	91.262	ENSNBRG00000002387	eefsec	97	94.231	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.103	ENSNLEG00000014303	EEFSEC	97	61.720	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000016211	eefsec	80	67.130	ENSMEUG00000005747	EEFSEC	97	63.825	Notamacropus_eugenii
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.760	ENSOPRG00000011276	EEFSEC	97	62.628	Ochotona_princeps
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.177	ENSODEG00000002928	EEFSEC	98	66.792	Octodon_degus
ENSMALG00000016211	eefsec	79	90.887	ENSONIG00000019038	eefsec	97	89.247	Oreochromis_niloticus
ENSMALG00000016211	eefsec	79	66.511	ENSOANG00000009108	EEFSEC	97	64.570	Ornithorhynchus_anatinus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.129	ENSOCUG00000016517	EEFSEC	97	63.032	Oryctolagus_cuniculus
ENSMALG00000016211	eefsec	98	86.745	ENSORLG00000001377	eefsec	96	89.883	Oryzias_latipes
ENSMALG00000016211	eefsec	98	86.550	ENSORLG00020000729	eefsec	96	89.883	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000016211	eefsec	98	86.745	ENSORLG00015001986	eefsec	98	85.639	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000016211	eefsec	81	83.916	ENSOMEG00000010071	eefsec	86	80.550	Oryzias_melastigma
ENSMALG00000016211	eefsec	82	63.596	ENSOGAG00000014084	EEFSEC	97	63.596	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000016211	eefsec	71	62.694	ENSOARG00000004600	EEFSEC	100	62.694	Ovis_aries
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.286	ENSPPAG00000030936	EEFSEC	97	61.889	Pan_paniscus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.636	ENSPPRG00000002846	EEFSEC	97	63.484	Panthera_pardus
ENSMALG00000016211	eefsec	83	64.192	ENSPTIG00000013855	EEFSEC	89	61.811	Panthera_tigris_altaica
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.286	ENSPTRG00000015353	EEFSEC	97	61.889	Pan_troglodytes
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.469	ENSPANG00000017041	EEFSEC	97	62.057	Papio_anubis
ENSMALG00000016211	eefsec	98	79.110	ENSPKIG00000005220	eefsec	97	78.832	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000016211	eefsec	98	69.656	ENSPSIG00000015135	EEFSEC	98	68.985	Pelodiscus_sinensis
ENSMALG00000016211	eefsec	98	86.214	ENSPMGG00000020300	eefsec	98	85.413	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.922	ENSPEMG00000013677	Eefsec	98	68.561	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSMALG00000016211	eefsec	99	67.917	ENSPMAG00000006779	eefsec	99	67.910	Petromyzon_marinus
ENSMALG00000016211	eefsec	79	66.432	ENSPCIG00000020494	EEFSEC	97	63.598	Phascolarctos_cinereus
ENSMALG00000016211	eefsec	98	89.515	ENSPFOG00000003748	eefsec	98	87.086	Poecilia_formosa
ENSMALG00000016211	eefsec	99	89.382	ENSPLAG00000018012	eefsec	98	87.896	Poecilia_latipinna
ENSMALG00000016211	eefsec	98	89.320	ENSPMEG00000001202	eefsec	98	87.086	Poecilia_mexicana
ENSMALG00000016211	eefsec	98	89.709	ENSPREG00000012235	eefsec	98	87.719	Poecilia_reticulata
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.103	ENSPPYG00000013436	EEFSEC	97	61.720	Pongo_abelii
ENSMALG00000016211	eefsec	99	57.435	ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	57.435	Procavia_capensis
ENSMALG00000016211	eefsec	99	62.731	ENSPCOG00000023432	EEFSEC	97	60.374	Propithecus_coquereli
ENSMALG00000016211	eefsec	61	75.385	ENSPVAG00000007070	EEFSEC	55	75.385	Pteropus_vampyrus
ENSMALG00000016211	eefsec	98	91.456	ENSPNYG00000005726	eefsec	97	93.846	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000016211	eefsec	98	76.953	ENSPNAG00000016724	eefsec	98	74.956	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.242	ENSRNOG00000012954	Eefsec	96	70.916	Rattus_norvegicus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	64.652	ENSRBIG00000032635	EEFSEC	97	62.162	Rhinopithecus_bieti
ENSMALG00000016211	eefsec	80	62.673	ENSSBOG00000031478	EEFSEC	97	59.917	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000016211	eefsec	79	66.432	ENSSHAG00000014760	EEFSEC	97	63.598	Sarcophilus_harrisii
ENSMALG00000016211	eefsec	98	78.378	ENSSFOG00015021109	eefsec	96	76.910	Scleropages_formosus
ENSMALG00000016211	eefsec	98	91.262	ENSSMAG00000001454	eefsec	97	91.150	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	91.463	ENSSDUG00000007924	eefsec	98	91.463	Seriola_dumerili
ENSMALG00000016211	eefsec	99	91.304	ENSSLDG00000024985	eefsec	100	91.304	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSMALG00000016211	eefsec	58	69.474	ENSSARG00000003789	-	55	71.739	Sorex_araneus
ENSMALG00000016211	eefsec	79	68.140	ENSSPUG00000004191	EEFSEC	97	66.250	Sphenodon_punctatus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	91.274	ENSSPAG00000001320	eefsec	98	91.729	Stegastes_partitus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.370	ENSSSCG00000011619	EEFSEC	98	65.314	Sus_scrofa
ENSMALG00000016211	eefsec	99	68.053	ENSTGUG00000007895	EEFSEC	97	66.667	Taeniopygia_guttata
ENSMALG00000016211	eefsec	99	90.116	ENSTRUG00000010327	eefsec	98	88.616	Takifugu_rubripes
ENSMALG00000016211	eefsec	98	88.911	ENSTNIG00000003225	eefsec	98	87.148	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.434	ENSTTRG00000000994	EEFSEC	97	62.755	Tursiops_truncatus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	65.273	ENSUAMG00000017283	EEFSEC	97	63.149	Ursus_americanus
ENSMALG00000016211	eefsec	81	64.706	ENSVVUG00000018372	EEFSEC	90	64.920	Vulpes_vulpes
ENSMALG00000016211	eefsec	89	69.102	ENSXETG00000002066	eefsec	99	69.328	Xenopus_tropicalis
ENSMALG00000016211	eefsec	98	89.320	ENSXCOG00000019916	eefsec	98	86.491	Xiphophorus_couchianus
ENSMALG00000016211	eefsec	99	89.189	ENSXMAG00000001839	eefsec	98	87.709	Xiphophorus_maculatus