EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSMALG00000016407 (Gene tree)
Gene ID: 109952759
Gene Symbol: twistnb
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Monopterus_albus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3194 bases
Position: chrKV885181.1:77781-80974
Accession: 109952759
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSMALP00000023537	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	5.4e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSMALT00000023986	-	1146	XM_020587988	ENSMALP00000023537	381 (aa)	XP_020443644	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
malb03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSMALG00000016407	twistnb	81	42.857	ENSG00000105849	TWISTNB	89	42.813	Homo_sapiens
ENSMALG00000016407	twistnb	100	61.266	ENSAPOG00000011796	twistnb	100	61.266	Acanthochromis_polyacanthus
ENSMALG00000016407	twistnb	98	61.697	ENSACIG00000020400	twistnb	100	61.364	Amphilophus_citrinellus
ENSMALG00000016407	twistnb	99	61.168	ENSAOCG00000024200	twistnb	99	61.168	Amphiprion_ocellaris
ENSMALG00000016407	twistnb	99	61.675	ENSAPEG00000016750	twistnb	99	61.675	Amphiprion_percula
ENSMALG00000016407	twistnb	94	69.210	ENSATEG00000017956	twistnb	99	69.430	Anabas_testudineus
ENSMALG00000016407	twistnb	95	58.355	ENSACLG00000022280	twistnb	89	58.886	Astatotilapia_calliptera
ENSMALG00000016407	twistnb	57	55.251	ENSAMXG00000035868	twistnb	64	55.251	Astyanax_mexicanus
ENSMALG00000016407	twistnb	81	42.718	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	89	42.138	Bos_taurus
ENSMALG00000016407	twistnb	81	42.492	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	53	55.249	Callithrix_jacchus
ENSMALG00000016407	twistnb	81	42.767	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	91	39.528	Cavia_porcellus
ENSMALG00000016407	twistnb	90	41.159	ENSCATG00000035621	TWISTNB	93	41.813	Cercocebus_atys
ENSMALG00000016407	twistnb	81	42.532	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	93	41.813	Chlorocebus_sabaeus
ENSMALG00000016407	twistnb	81	42.532	ENSCANG00000038759	TWISTNB	89	42.508	Colobus_angolensis_palliatus
ENSMALG00000016407	twistnb	93	56.499	ENSCVAG00000014324	twistnb	66	63.670	Cyprinodon_variegatus
ENSMALG00000016407	twistnb	98	51.804	ENSELUG00000000098	TWISTNB	97	50.923	Esox_lucius
ENSMALG00000016407	twistnb	94	57.650	ENSFHEG00000013318	twistnb	96	56.593	Fundulus_heteroclitus
ENSMALG00000016407	twistnb	94	55.108	ENSGAFG00000018309	twistnb	96	54.301	Gambusia_affinis
ENSMALG00000016407	twistnb	70	61.194	ENSGACG00000006425	twistnb	74	68.116	Gasterosteus_aculeatus
ENSMALG00000016407	twistnb	81	42.857	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	89	42.508	Gorilla_gorilla
ENSMALG00000016407	twistnb	95	58.090	ENSHBUG00000020155	twistnb	89	58.621	Haplochromis_burtoni
ENSMALG00000016407	twistnb	81	41.956	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	54	56.284	Heterocephalus_glaber_female
ENSMALG00000016407	twistnb	81	41.956	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	54	56.284	Heterocephalus_glaber_male
ENSMALG00000016407	twistnb	95	50.478	ENSHCOG00000010590	twistnb	95	50.361	Hippocampus_comes
ENSMALG00000016407	twistnb	92	46.027	ENSIPUG00000004117	twistnb	95	45.405	Ictalurus_punctatus
ENSMALG00000016407	twistnb	100	55.216	ENSKMAG00000001591	twistnb	100	56.218	Kryptolebias_marmoratus
ENSMALG00000016407	twistnb	100	60.000	ENSLBEG00000024225	twistnb	100	59.645	Labrus_bergylta
ENSMALG00000016407	twistnb	94	41.176	ENSLACG00000010508	TWISTNB	53	56.122	Latimeria_chalumnae
ENSMALG00000016407	twistnb	81	42.812	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	55	55.738	Loxodonta_africana
ENSMALG00000016407	twistnb	90	41.159	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	93	41.813	Mandrillus_leucophaeus
ENSMALG00000016407	twistnb	95	58.355	ENSMZEG00005007561	twistnb	89	58.886	Maylandia_zebra
ENSMALG00000016407	twistnb	78	43.522	ENSMOCG00000003458	Twistnb	53	58.480	Microtus_ochrogaster
ENSMALG00000016407	twistnb	100	58.163	ENSMMOG00000020085	twistnb	100	57.908	Mola_mola
ENSMALG00000016407	twistnb	50	55.263	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	57	55.263	Mus_caroli
ENSMALG00000016407	twistnb	50	54.737	ENSMUSG00000020561	Twistnb	58	54.737	Mus_musculus
ENSMALG00000016407	twistnb	50	54.737	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	58	54.737	Mus_spretus
ENSMALG00000016407	twistnb	95	57.447	ENSNBRG00000008652	twistnb	95	59.043	Neolamprologus_brichardi
ENSMALG00000016407	twistnb	90	41.570	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	89	42.638	Nomascus_leucogenys
ENSMALG00000016407	twistnb	80	41.195	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	91	41.194	Ochotona_princeps
ENSMALG00000016407	twistnb	85	59.941	ENSORLG00000004005	twistnb	83	57.065	Oryzias_latipes
ENSMALG00000016407	twistnb	100	55.000	ENSORLG00020002579	twistnb	98	56.298	Oryzias_latipes_hni
ENSMALG00000016407	twistnb	89	59.091	ENSORLG00015013403	twistnb	87	56.555	Oryzias_latipes_hsok
ENSMALG00000016407	twistnb	52	53.234	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	57	53.500	Otolemur_garnettii
ENSMALG00000016407	twistnb	90	41.570	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	89	42.945	Pan_paniscus
ENSMALG00000016407	twistnb	81	43.548	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	91	40.673	Panthera_pardus
ENSMALG00000016407	twistnb	81	42.857	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	89	42.813	Pan_troglodytes
ENSMALG00000016407	twistnb	90	41.159	ENSPANG00000015736	TWISTNB	93	41.813	Papio_anubis
ENSMALG00000016407	twistnb	54	61.165	ENSPKIG00000025635	twistnb	53	61.165	Paramormyrops_kingsleyae
ENSMALG00000016407	twistnb	98	56.589	ENSPMGG00000019023	twistnb	94	54.545	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSMALG00000016407	twistnb	90	42.197	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	54	54.696	Pongo_abelii
ENSMALG00000016407	twistnb	95	58.355	ENSPNYG00000002674	twistnb	95	58.886	Pundamilia_nyererei
ENSMALG00000016407	twistnb	93	45.706	ENSPNAG00000011956	twistnb	58	56.019	Pygocentrus_nattereri
ENSMALG00000016407	twistnb	85	41.796	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	92	41.813	Rhinopithecus_bieti
ENSMALG00000016407	twistnb	85	41.796	ENSRROG00000040155	TWISTNB	93	41.813	Rhinopithecus_roxellana
ENSMALG00000016407	twistnb	81	41.935	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	54	55.249	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSMALG00000016407	twistnb	50	60.000	ENSSFOG00015012788	twistnb	52	61.932	Scleropages_formosus
ENSMALG00000016407	twistnb	100	62.155	ENSSMAG00000012792	twistnb	100	61.153	Scophthalmus_maximus
ENSMALG00000016407	twistnb	100	66.162	ENSSDUG00000007038	twistnb	100	65.316	Seriola_dumerili
ENSMALG00000016407	twistnb	82	36.086	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	63	47.179	Sphenodon_punctatus
ENSMALG00000016407	twistnb	100	62.016	ENSSPAG00000005871	twistnb	100	62.791	Stegastes_partitus
ENSMALG00000016407	twistnb	88	54.885	ENSTNIG00000017778	twistnb	56	74.595	Tetraodon_nigroviridis
ENSMALG00000016407	twistnb	82	43.653	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	55	56.085	Tupaia_belangeri
ENSMALG00000016407	twistnb	94	56.787	ENSXCOG00000020199	twistnb	95	56.787	Xiphophorus_couchianus